Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0279417
Help
Entry
DDB_G0279417 CDS
T00245
Symbol
roco6
Name
(RefSeq) ROCO family protein kinase
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
COR
Roc
LRR_8
Ras
PH
LRR_4
LRR_1
Arf
MMR_HSR1
TniB
LRR_6
ANAPC4_WD40
PH_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622048
NCBI-ProteinID:
XP_641642
dictyBase:
DDB_G0279417
UniProt:
Q54WS5
LinkDB
All DBs
Position
3:2094570..2101013
Genome browser
AA seq
2147 aa
AA seq
DB search
MNSIHKQHYTINSNHYNESININSLLLNDLNDEKRTTSTNNKSNNNSNNNNNETLEDIIE
FNNNNCNGDMKYLDLSKRMIYSLELMMIPEIENRFQGDFKSISILNLNDNLLGEIPESLK
QLTQLISLSIRGNHILEIPLWFPEEFKLLRKLDVSHNAISSVPNTFNKFSILEDLNLSNN
YISYIHPSLFPEGIMRLNLSNNLFREVELPPWFESLLTLDISGNKLKHLGNLPFHLVRVS
IDDNHLESIDHKVILRNKDLALKFNQSFSDIVLERIYQCWYTGDPVLDLSGLGMCVVPPI
LGMLVHLTHLDLSGNCISVLPPELANLTELVRLDLSFNILTTLPLYIVSYKRLEHLDLQG
TLDTLVSPPRRIAETGKLIDIQRYFHDLFQGEPSYRVKLMIVGQENVGKTSLVKCLKMKK
KFSKNSDHLGTNVSTDGIDIDEIKFNLDIELPSNPSSNSLISNSLSNSSISSNNINSNNN
INVHSNGGGINSNGVNSNSQININSSSGNIHSNGGGVGNVNSSGGIHSNNSSGGGGGSNS
FLNNTNSNGTNNNSSNLNINTNSNNVNSSGGGNNYHPPVGTNTSMSNIQVIGSSGSNLGS
GSNLSIGGSNGNNNNNSGGSGTMVNQRVTMSIWDCAGQELYYTSHQMFLTDSALYVVVWN
LCKPEVNSRVEFWLHSIRSKAENAPILLIGTHLDDYLATHSESELDEILENIYSKYFRKF
RLKGISILSCSTGVGFDNFLDLLKKTVVELPSLKQSLPELYLKLEKLIIKKRSTLVPPVL
TWQSFSQMVLSNLDFHDEIHVKVATKALVPLGSISFFDEPGLDQYVFLDPQWLTGVFSSI
ITTKHKFIKDGVLKKSDLYQIWKPPHFIEDEGLHSLLINLLERFELMFPLDSDLVSLSSS
NGNNGNSYVNNNNNNNNNSNNNNNGSNKSSPFKTTPSSPSTLRLVDSKSKGSHSSNPILS
GNNSSSKNSTSTKRSISGSPLRSRSNSDLDLIGGGGGSPINGSSIDYSSKSNTLTPGLFN
ELNQKFIIPSQLPEIRPSFGLLWPSLDHSRVEFNRWIQLSFAPAGLFSRLLIRLLISKEF
DMKPILYWRNGVVVESQSGKSFLSTSTALIEMVPSYANCSSTIKISVRGDRRTGRGLSAK
LLRLIVEIADTLCTSWYHLETNQVIPCPHCINKPNCTLFSLSDCEAVASSGVWYLLCGDR
KINFETFVPDVAMSDFWGSGSKKFNYDQIKMHKEKRILSIKPASFGNNQIQFEVRVPPSP
PPPPVQQIINNGADDNITTTTLAVNNIKVLESGGSQPPSPRSGKDVTHELPIINRLEIIQ
PTSDESSLIQVEFDHNNQTLVISGTYKYGDLLEIEFESPKLIGRGASGKIYRANLNDTMV
AVKQLEVVGEDAPRIFSEFRREIHVMSDLKHSNVVNLLGFTLSPFTMVMEYIDCGDLHKF
LHSPIGDQLNGNWALILKLALDIAKGMEFLHSVTPPLLHRDLKSPNVLLSMKDGVYTAKV
GDFGLSSRMFIQALKHKLRNFPVGNITWVAPEILREEEYTVKSDVYAFGLILHELLTRKH
PYREFNYSMVSLQEDAIKNGLRPTISPSYTQTVTGHEYCGLIQDCWDSDIDRRPTFNKIV
KRIKQIIGRDVNNILMVNGVSVVSGIQSPNSLADSQPFHYHQQQQPSLNSTNQLQQQQYS
SVLTSPRSNLSDSSNSSQNIANKSLNNISATSLGDLGGNDENLGGQLQYSMRVPQPEAKV
NQLVWEVNSRRVWGGCESGEIIVWNAENGNQIFREQKLHPGPIRSLALVNQEDIWSAGGI
GPQQSTIRIWNAWRFNLDDQSGTKSDFITKKGRGGSTFGRKSWRLRWFVLSRFDKTLKYY
SKQTDKEPSCSLILEGAWLEEISPPGYKVSLHLIHPEKRTMEMEFKSESEKSSWLTAINR
VINQNIPLYEIALGKQMTSGSENDYITNLLSVGPNVWVSLKETPSILVYNVKSKELVTKI
SLNDDQSSDQWGKTGAVNMMLVNNFVWITGGSKLTQIDSQSYQLLEVHGNHYSKPITSMA
LVEKNVWISCEDESLSVWDGDTGSFIRKVGSPIGSPTKPTVYTKLLYFSGYVWACTQGSI
HIYCIHSLTCKKKVESKNHPNSIVDLIKVFQQTVWSCCGTNNVCIWS
NT seq
6444 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcaattcataaacaacattatacaataaatagtaatcattataatgaaagtata
aatataaattcattattattaaatgatttaaatgatgaaaaaaggacaacatcaaccaat
aataaaagtaataataatagcaataataataataatgaaacattagaagatataattgaa
tttaataataataattgtaatggtgatatgaaatatttagatttatcaaagagaatgatt
tattcattagaattaatgatgataccagagatagagaatagatttcaaggtgattttaaa
tcaatatcgatattgaatttaaatgataatttattaggagagataccagaatcattgaaa
caattgacacaattaatatcattatcgatccgaggcaatcatatattggagataccgtta
tggtttccagaggaatttaaattacttagaaaattggatgtatcacataatgcaatctcg
tcggtgccaaatacatttaataaattctcaatattggaggatttaaatctatcaaataat
tatatctcctatattcatccatcgctatttccagagggtataatgagattgaatctatcg
aataatctttttagagaggttgagctaccaccatggttcgagtcattgttgacattggat
attagtggtaataaattgaaacatttgggtaatttaccatttcatttggttagagtatca
atagatgataatcatttggaatcgattgatcataaggtgatcctacgtaataaggattta
gcattgaaatttaatcaatcatttagtgatatcgttttggaaagaatttatcaatgttgg
tatactggtgatccagtattggatttatcaggattaggtatgtgtgttgtaccaccgatc
ctaggtatgttggtacatttaactcatttggatctatcgggtaattgtatttcagtgtta
ccaccggaattggcaaatttaacagaattggttagattagatttaagttttaatatttta
acaacattaccactatacattgtatcctataagagattggaacatttggatctacaaggt
acccttgatacattggtatcaccaccacgtcgtatagcggaaactggtaaattaattgat
attcaacgttattttcatgatttatttcagggtgaaccatcttatcgtgttaaacttatg
attgtcggtcaagagaatgttggtaaaacaagtttagttaaatgtttaaaaatgaaaaag
aaattctctaaaaattctgatcatttaggtacaaatgtttcaaccgatggtattgatatc
gatgaaattaaatttaatttagatattgaattaccttcaaatccaagttcaaattcttta
atttcaaattcattatcaaatagttcaatctcttctaataatattaattcaaataataat
ataaatgttcattcaaatggaggaggtattaattcaaatggtgtaaattcaaatagtcaa
ataaatataaatagtagtagtggtaatattcattcaaatggtggtggtgttggtaatgtt
aactcatcaggtggtatacatagtaataattcatcaggtggtggtggtggttcaaatagt
tttttaaataatacaaattcaaatggtacaaataataatagtagtaatttaaatataaat
acaaatagtaataatgtaaattcaagcggcggcggcaataattatcatccaccagttggt
acaaatacttcaatgagtaatattcaagttattggaagttcaggtagtaatttaggttca
ggtagtaatttaagtataggtggtagtaatggtaataataataataatagtggtggtagt
ggtacaatggtaaatcaaagagttacaatgtcaatttgggattgtgcaggtcaagaactt
tattatacaagtcatcaaatgtttttaacagattcagcattgtatgttgtagtttggaat
ctttgtaaaccagaagttaatagtcgtgttgaattttggttacattcaattcgttcaaaa
gcagagaatgcaccaatacttttaattggtactcatttagatgattatttagcaactcat
tccgaatcagagttggatgaaattttagagaatatctatagtaaatattttagaaagttt
agattaaagggtatttcaattctaagttgttcaactggtgttggattcgataatttcttg
gaccttttgaaaaagaccgtggtggaattaccatcattaaaacaatctctgccagaactt
tatttaaaacttgagaaattaatcattaaaaaacgttcaacattggtaccaccagtttta
acttggcaaagtttctcacaaatggtactttcaaatttggattttcatgatgaaattcat
gttaaagttgctactaaagcattggtaccattgggttcaatttctttctttgatgaacca
ggtctcgatcaatatgtatttttagatccacaatggttaacaggtgttttctcttcaatc
attacaacaaaacataaattcattaaagatggtgttttaaaaaaaagtgacctttatcaa
atttggaaaccacctcatttcattgaagatgaaggtttacattcacttttaattaattta
ttagaaagatttgaattaatgtttccattagatagtgatttagtttcattatcttcaagt
aatggtaataatggtaatagttatgtaaataataataataataataataataattcaaat
aataataataatggtagtaataaatcttcaccatttaaaacaacaccatcgtcaccatca
actttaagattagttgattcaaaatcaaaaggtagtcatagttcaaatccaattttaagt
ggtaataatagttcatcaaaaaattcaacatcaactaaaagatcaattagtggttcacca
ttacgttcaagatcaaattctgatcttgatttaattggtggtggtggtggttcaccaatt
aatggtagtagtattgattatagttcaaaatcaaatacattaacaccaggattatttaat
gaattaaatcaaaaatttataattccatcacaattaccagagataagaccatcatttggt
ttactttggccatcacttgatcattcgcgtgttgaatttaatcgttggattcaattatca
tttgcaccagctggtttatttagtagattattaattcgtttattaattagtaaagaattt
gatatgaaaccaattctttattggagaaatggtgtagttgttgaatcacaatctggtaaa
tcattcctttcaacctctactgctttaattgaaatggtaccaagttatgcaaattgtagt
tcaactattaaaattagtgttagaggtgatcgtcgtactggtagaggtttatcagcaaaa
cttttaagattaatcgttgaaattgctgatacactttgtacaagttggtatcatttagaa
acaaatcaagttataccatgtccacattgtattaataaaccaaattgtacattattttca
ttgagtgattgtgaagcagttgcaagtagtggtgtttggtatttactttgtggtgataga
aaaattaatttcgaaacttttgtaccagatgttgcaatgtctgatttttggggtagtggt
agtaagaaattcaattatgatcaaattaaaatgcataaagaaaaaagaattctatcaatt
aaacctgcatcatttggtaataatcaaattcaatttgaagttagagttccaccatcacca
ccaccaccaccagtacaacaaattattaataatggtgctgatgataatataacaacaact
acattggcagttaataatattaaagttttagaaagtggtggatcacaaccaccatcacca
agaagtggtaaagatgttacacatgaattaccaattattaatcgtttagaaattattcaa
ccaacaagtgatgaatcatcattaattcaagttgaatttgatcataataatcaaacttta
gttataagtggtacttataaatatggtgatttattagagattgaatttgaatcaccaaaa
ttaattggtagaggtgcatctggtaaaatttatcgtgcaaatttaaatgatacaatggtt
gcagttaaacaattagaagtggttggagaggatgcaccaagaattttctcagagtttaga
agagaaattcatgttatgtctgatcttaaacattcaaacgttgtaaatttattaggtttt
acattatcaccatttacaatggtaatggaatatatcgattgtggtgatcttcataaattt
ttacattcacctattggtgatcaacttaatggtaattgggctttaattttgaaattggct
ttagatattgcaaaaggtatggaatttcttcattcagttacaccaccattacttcatcgt
gatttaaagagtccaaatgttttactctcaatgaaagatggtgtttacactgcaaaagtt
ggtgattttggtttatcatcaagaatgtttattcaagctttgaaacataaattacgtaat
ttcccagttggtaatattacttgggttgcaccagaaattttaagagaagaagaatatact
gttaaatccgatgtttatgcatttggtttaattttacatgaacttttaacaagaaaacat
ccatatagagaatttaattattcaatggtatctcttcaagaggatgcaataaagaatgga
cttcgtccaactatttcaccatcttatactcaaactgttacaggtcatgaatattgtggt
ttaattcaagattgttgggatagtgatattgatagaagaccaacttttaataaaattgtt
aaaagaattaaacaaattattggtcgtgatgttaataatattttaatggtaaatggtgtt
tcagttgttagtggtattcaatcaccaaattcattagctgatagtcaaccattccattat
catcaacaacaacaaccaagtttaaattctacaaatcaattacaacaacaacaatattca
tcagttttaacatcaccaagatcaaatttatcagattcatcaaattcatcacaaaatatt
gcaaataaaagtttaaataatattagtgcaacaagtttaggtgatttaggtggtaatgat
gaaaatttaggtggtcaattacaatatagtatgcgtgtaccacaaccagaagcaaaagtt
aatcaattagtatgggaagtcaattcacgtcgtgtttggggtggttgtgaatctggtgaa
attatagtttggaatgcagagaatggtaatcaaattttccgtgaacaaaaattacatcca
ggtccaattagatcattggcattggtaaatcaagaagatatttggtcagcaggtggtatt
ggtccacaacaaagtacaattagaatttggaatgcttggcgttttaatcttgatgatcaa
tctggtacaaaatctgattttatcactaaaaaaggtagaggtggttcaacatttggtaga
aaatcttggagattacgttggtttgtcctatcaagatttgataaaaccttgaaatactat
agtaaacaaactgataaagaaccaagttgttcactcattttagagggtgcttggttagaa
gaaattagtccaccaggttataaagttagtcttcatttaattcatccagaaaaaagaaca
atggaaatggaatttaagagtgaatctgaaaaatcatcttggctaactgcaatcaatcgt
gttatcaatcaaaatataccactctatgaaattgcacttggtaaacaaatgacaagtggt
agtgaaaatgattatatcacaaatttactatcggttggtccaaatgtttgggtatcactt
aaagaaacaccatcaattttggtttataatgtaaagagtaaagaattggttacaaaaatc
tctttaaatgatgatcaatccagtgatcaatggggtaaaactggtgctgtaaatatgatg
ttggttaataatttcgtttggataactggtggttcaaaattgactcaaattgattcacaa
tcttatcaactcttggaagtacatggaaatcattattcaaaaccaatcacctcaatggca
ttggttgaaaaaaatgtttggatctcttgtgaagatgaatcactttcagtttgggatggt
gatactggttcctttattagaaaagttggttctccaattggttcaccaactaagccaacc
gtttacactaaacttttatatttcagtggttatgtttgggcttgtactcaaggttcaatt
catatttattgtattcattcattaacttgtaaaaagaaagttgaatcaaaaaatcatcca
aatagtattgtagatttaattaaagttttccaacaaactgtttggtcatgttgtggtaca
aataatgtttgtatttggtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
