Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280481
Help
Entry
DDB_G0280481 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K28416
DENN domain-containing protein 6
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0280481
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
DDB_G0280481
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Avl9
SPA
DENN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622581
NCBI-ProteinID:
XP_641200
dictyBase:
DDB_G0280481
UniProt:
Q54VA9
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(3429343..3431710)
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MNSIIGGTDPLSMIFKEEEIKKQQILLEKEEKEKQEQQQKKLNKDNIFKLEEEGKKLELS
TKVHIQHPNISTTSDNNSLLDPSNLTLNGKKKKWINSFCIINFDLEIGQVLDYSFPQVNF
KEEESTNLCFLSFPDSNSHLQGDIIYSFKLKETSSLGNGQCNFQYGYVFFRQEKDSSISR
GYLQKSVVLLSDESFVGLFKKVMEIVGPLYFDHGNTLLEVAYQNIMNWPELKLGQTYELP
ILGYILTFHVPHTRGTPHIIDPVVKQHQLGGGSGGGLSSSPSSSSGGGNIPTSNTTGVSP
SIWSEMKLVSNLKSIDIYGCFKSFTTKLWMLWELVLLGHPLLVISPNPPMCSDSVLALVS
LISPLHYCGDYRPYFTIHDTDFHKYTSFSHLSGTRPDDSNNNNNQDDSEYNNNNNNNGIP
PSILGVTNPFFLKALGNWPNILTIGTTQQRLGGFKKIKSSLPNIMSKDLLTRHVLDNKEK
ILSEYKPFISPDKSVLKKITESADDDIINEVLRTHFLQLTQKFLIPLERYFSLLLPLAKT
ISIFQRPPRLKPFIKEECLNKIMETDERFIIDNKSKEIELYKQFLDCVNFKQWLDDKRAQ
AIKHLNILYRKAILDADIHTLLRGKPISTATDLLKRVEDQLILEENLFQTSKEIKDKFKS
HIEIIRQYKNNCDNNNENNNNNILLTSPIKSTSLSSIALPPSSTTVTTKTTTTTK
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacagtattattggaggtacagatcctctatctatgatatttaaagaggaagaaatt
aaaaaacaacaaattttattagaaaaagaagaaaaagagaaacaagaacaacaacaaaag
aaactaaataaagataatatatttaaattagaggaagaaggtaaaaaattagagttatca
acaaaagttcatattcaacatccaaacatttcaacaacatctgacaataactcattatta
gatccaagtaatttaacattaaatggtaaaaaaaagaaatggattaatagtttttgtatt
ataaattttgatttagaaattggtcaagtattagattattcattcccacaagttaatttt
aaagaagaagaatcaacaaatttatgttttttatcatttccagattcaaattctcattta
cagggtgatattatatattcatttaaattaaaagagacaagtagtttaggtaatggtcaa
tgtaattttcaatatggttatgtattttttagacaagagaaagattcatcaataagtaga
ggttatttacaaaagtctgtagtattattaagtgatgaatcatttgttggtttatttaaa
aaggttatggaaatcgttggtccattatattttgatcatggtaatactctgctagaggta
gcttatcaaaatataatgaattggccagaattgaaattaggtcaaacttatgaattacca
attttaggttacattttaacttttcatgtaccacatacaagaggtacaccacatataatt
gatccagttgtaaaacaacatcaattgggtggtggtagtggtggtggtttaagcagttca
ccatcatcgtcatctggtggtggtaatataccgactagtaatacaacaggagtttcacca
tcaatatggagtgaaatgaaattagttagtaatttaaaatcaattgatatttatggttgc
tttaaaagttttacaactaaattatggatgctttgggaattggtattattaggtcatcca
ttattagtaatttcaccaaatccaccaatgtgttcagattcagttttagctttagttagt
ttaatttcaccattacattattgtggtgattatagaccatattttacaattcatgataca
gattttcataaatatacaagtttttcacatttatcaggtacaagacctgatgattcaaat
aataataataatcaagatgacagcgaatataataataataataataataatggtatacca
ccatcaattttaggtgtaacaaatccattctttttaaaagcattaggtaattggcctaat
attttaacgattggtacaacacaacaaagattaggtggtttcaagaaaattaaatcctct
ttaccaaatataatgtcaaaggatttattaactcgtcatgttttagataataaagaaaag
atactatctgaatataaaccatttatttcacctgataaatctgtattaaagaaaataact
gaatctgctgatgatgatattataaatgaagtacttcgtactcatttcttacaattaact
caaaaatttttaataccattagaaagatatttttctttattattaccattagcaaagaca
atatcaatatttcaaagaccaccaagattaaaaccatttattaaagaggaatgtttaaat
aagataatggaaactgatgaaagatttataattgataataaatcaaaagaaattgaattg
tataaacaatttttagattgtgtaaattttaaacaatggttagatgataaaagagcccaa
gcaattaaacatttaaatattctatatagaaaggcaattttagatgctgatattcataca
ttattaagaggtaaaccaatttcaaccgctactgatcttttaaaaagagttgaggatcaa
ttaattttagaggaaaatttatttcaaacttcaaaagaaattaaagataaattcaaatct
catattgaaataatacgacaatataaaaataattgtgataataataatgaaaataataat
aataatattctcttaacatcaccaataaaatcaacatcattatcatcaatcgcactacca
ccatcgtcaacaacagtaacaacaaaaactaccacaacaacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system