Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280797
Help
Entry
DDB_G0280797 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14794
ribosomal RNA-processing protein 12
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0280797
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
DDB_G0280797
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
DDB_G0280797
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRP12_HEAT
HEAT_RRP12_N
HEAT_GCN1
TOR1L1_N
CMV_UL34
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622737
NCBI-ProteinID:
XP_641035
dictyBase:
DDB_G0280797
UniProt:
Q54UV2
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(<3760317..>3764888)
Genome browser
AA seq
1427 aa
AA seq
DB search
MSKTISELFPSLRENSSSETNKRLYAVLTAVTDLIRFNKAPINATSYFAIILKTITENKH
KENQTPDLLKLFSLILPQVSIPIIKNQSVNIILQMINILEKYVTQETTLNSTMSNDEQSL
VKSGTYILGYVLVLAESNQWSTPEYLRGYSYILKLSVNNQQSKIRQKAAEQVILVLNSIG
AIQTNAKGGGVHKHLANVTSQFSHEIFTNVTHETMGTAFYALNIVTEALCLLPPSLISLL
LEDIIKLTSLSNSPLTIACYKAIGSLFFKTNPLIGSHIQQLIEVLFQHPPSGIDYKSTVS
YTELLTQSYLYFVKLEPKLCNQHVHKYFSILMNNFGSDKAEITKCTMNGFKSVIYECINL
EVIQQGIYSFQQGSGNANRELSPLESIISTIESGLRLTFKSSWDLVLMIISALFEQLGPN
AYPIMNNTLAGLDQLYHSPEFHFQTHCRQVFIQVLSSIGPKNFLKILPLNLESHPNDKIK
INRNWLLPLMRDNIKYTQLSFFIEYFYPMAIAMKERGKQVEMDGRLVEAKNLEILYSQVW
DLLPGFLNHPLDSDVSFRVIARNLGVALSDEPGLRIVICAALTQMINKLKDTQITKPPVY
IPLRKQHHLVTQERATQLLKSVSVFSKNYLPILFNIFPTSNQDQRYYILNAIEALVSITD
SINLNTIFNSLITKLVEALTLEGIEKKPTQNSMDTTTTTTTTTTPKEKTKKYYLTDLTIG
FVKHLDEENIKVLYKIIKPQLKCSDPGLQKRSYKILVKICEYHESFILQNLTKIKALLVS
NLMQSPSTIKKTRLKCLREIIISLTKSSYNKHLLTEEELELVAINENEKQLENTTTTTTT
TTTTTTTTTTSTDNKPKVKVNIGWVQLKTKFIPSLIPEIILCTKETNVKCREIANELIIE
IGKVMCLISAKLVKPKKGVSMEDTITIAHNEAIHEYLQLMMAGLASITPHMVSASIVSIA
RVIHEFYRDINEEFVGQLVTTVLVLLASPHREIVKAVFGLVRVVIATFKDTKSIESQLEV
LVNGLAKWGGIDKNYFRTIVQILLERLIKRFGFDQIYQLVPEDFKKVVTNIRKKNEKKEK
AKELSRNGGGVDSNENMDENGDDSKSQKSKKNKKSKNTSGGGGDDDDEQMLASDEEHSDR
DHSEDDADIEEFLFNVKPKKTKKDTKDNFLIKEGEDPIDFLDRNAFSHLSAKAAADIVAK
QMFAKAAKNGGKLQNPFQLDEDGRMIIESSDSEDEGQKRKRERKKSFLDQVFEENEEAYE
RKAGYHVTKAKGLKNKFKQDNHDNSDYSDDDIDENLSRYNDDLKSNFTRRTNAKSVRGGG
GGAKSVMGGAKSVKSTRTTNNNNKNEGRIETATLRYNRVRGVDHLVNYQDRDNKSTKTVA
KTKGDNRKRDQKFEPYSYIKLDPKALNKRKGARPTSFTNVKKKGGKK
NT seq
4284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaacaatttcagaattatttccaagtttacgtgaaaactcaagttccgaaacc
aataaaagattatatgcagtattgacagcagtaacagatttaattagattcaataaagca
ccaatcaatgctacatcatactttgcaatcatattaaaaactattacagaaaataaacat
aaagaaaatcaaacaccagatttattaaaattattttctttaattttaccacaagtttca
attccaattattaaaaatcaatcagtaaatattattttacaaatgattaatatattggag
aaatatgttactcaagagacaacattaaattcaacaatgtcaaatgatgaacaatcatta
gttaaatcaggtacttatatattgggatatgtattggtattggcagaatcaaatcaatgg
tcaacaccagaatatttaagaggttattcatacattttgaaattatcagttaataatcaa
caatctaaaattcgtcaaaaagccgcagaacaagttatattggttttaaatagtattggt
gcaattcaaaccaatgcaaagggtggtggcgtacataaacatttggcaaatgttacatcc
caattctctcatgaaatctttacaaatgttactcatgaaactatgggtactgcattctat
gcattgaatatcgtcactgaagcattatgtttattaccaccatcattgatctcattacta
ttggaagatatcataaaattaacaagtctttcaaattcaccattaaccattgcttgttat
aaagcaatcggttcattattctttaaaactaatccattaattggttcacatattcaacaa
ttaattgaagtattatttcaacatccaccatcaggtattgattataaatcaactgtttct
tatactgaattattaactcaatcttatttatattttgtaaaattggaaccaaaattatgt
aatcaacatgttcataaatatttttcaattttaatgaataattttggatctgataaagca
gagattacaaaatgtacaatgaatggatttaaatcagtaatttatgaatgtataaatttg
gaagtaattcaacaaggtatttattcattccaacaaggttcaggaaatgcaaatagagaa
ttatcaccattggaatcaattatttcaaccattgaaagtggtttaagattaacatttaaa
tcatcatgggatttagtattaatgatcattagtgcattatttgaacaattaggaccaaat
gcttatccaattatgaataatacattggctggtttagatcaattatatcattcaccagaa
tttcatttccaaactcattgtcgtcaagttttcattcaagttttatcttcaattggtcca
aagaatttcttaaaaattttaccattaaatttagaatctcatccaaatgacaaaattaaa
attaatagaaattggttattacctttaatgagagataatattaaatatacccaattatca
tttttcattgaatatttttatccaatggcaattgcaatgaaagaaagaggtaaacaagtt
gaaatggatggtagattagttgaagcaaagaatttggagatattatattcacaagtttgg
gatttattaccaggctttttaaatcatccattggattcagacgtttcatttagagtgatt
gctcgtaatttgggtgttgctttatccgatgaaccaggattacgtattgtaatttgtgca
gcattaacacaaatgatcaataaattaaaggatactcaaatcactaaaccaccagtttac
ataccattaagaaaacaacatcatttagtcactcaagaaagagctactcagttattgaaa
tcggtttcagtattctctaaaaactatttaccaattcttttcaatattttcccaacttca
aatcaagatcaacgttattacattttaaatgcaattgaagcattggtttcaatcactgat
tctataaatttaaatacaatttttaattcattaattacaaaattagttgaagcattaact
ttagaaggtattgaaaagaaaccaactcaaaattcaatggatactacaactacaactact
acaaccaccacaccaaaagaaaaaacaaagaaatattatttaacagatttaacaattggt
ttcgttaaacatttagatgaagagaatattaaagttttatataaaattattaaaccacaa
ttgaaatgttctgatccaggtttacaaaagagatcttataagattttagtaaagatttgt
gaatatcatgaaagttttattcttcaaaatttaacaaagattaaagcattattagttagt
aatttaatgcaatcaccatcaacaattaagaaaactcgtttaaaatgtttaagagaaatt
attatctccttaactaaatcttcatataataaacatttattaactgaagaagaattagaa
ttagttgctattaatgaaaatgaaaaacaattagaaaatactactacaactactacaact
actacaacaacaactactactacaactacaagtacagataataaaccaaaagttaaagtt
aatattggttgggtacaattaaaaactaaatttataccgtcattaattccagagattatt
ttatgtacaaaagaaactaatgttaaatgtagagagattgcaaatgaattaatcattgaa
attggtaaagttatgtgtttaatctctgcaaaattagtgaaaccaaagaaaggtgtatca
atggaggatacaatcaccatcgctcataacgaagcaattcatgaatatttacaattgatg
atggcaggtttagcatcgattactccacatatggtatcagcatcaattgtttcaatcgct
agagtcattcatgaattctatcgtgatatcaatgaagagtttgtcggtcaattggttaca
actgtacttgtgttattagcatcaccacatagagagattgtaaaagcagtgtttggttta
gttcgtgttgtaattgcaacttttaaagacacaaaatcaatcgaatctcaattggaagta
ctcgtcaatggtttagcaaaatggggtggtatcgataagaattactttagaactatcgtt
caaatccttttagaacgtttaattaaaagatttggtttcgatcaaatttatcaattagta
cctgaagatttcaaaaaagtagttacaaacattcgtaaaaagaatgaaaagaaagaaaaa
gctaaagaattatctagaaatggcggtggtgttgattcaaatgaaaatatggatgaaaat
ggtgatgatagtaaatcacaaaaaagtaaaaagaataaaaaatcaaagaatacttctggt
ggtggtggtgatgatgatgatgaacaaatgttagcatcagatgaagagcatagtgatagg
gatcatagtgaagatgatgctgatattgaggaattccttttcaatgttaaaccaaagaaa
actaaaaaagatactaaagataatttcctcatcaaagagggtgaagatccaattgatttc
ttggatagaaatgcatttagtcatttgtcagcaaaagcagccgctgatatcgttgcaaaa
caaatgtttgctaaagccgcaaagaatggtggtaaacttcaaaatccattccaacttgat
gaagatggtcgtatgattattgaatcatcagattctgaagatgaaggtcaaaagagaaag
agagagagaaagaaatccttcctcgatcaagttttcgaagagaatgaagaagcctatgaa
agaaaagcaggttatcatgtcactaaagcaaaaggtctcaaaaataaattcaaacaagat
aatcatgataattcagattattcagatgatgatatcgatgaaaatctttcacgttataat
gatgatcttaaatcaaatttcacaagaagaacaaatgctaaatctgttcgtggtggtggt
ggtggtgctaaatcagtcatgggtggcgctaaatcagttaaatcaactcgtactactaat
aataataataaaaatgaaggtcgtattgaaactgctacccttcgttataacagagttaga
ggtgttgatcatttagtaaattatcaagatcgtgacaataagagtactaaaactgtagct
aaaaccaaaggtgataatcgtaagagagatcaaaaattcgaaccatattcttatatcaaa
ttggatccaaaggctcttaataaacgtaaaggtgcaagaccaacctctttcactaatgtc
aagaaaaaaggtggaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
