Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0282115
Help
Entry
DDB_G0282115 CDS
T00245
Name
(RefSeq) C3HC4-type zinc finger-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
zf-C3HC4
zf-C3HC4_4
zf-RING_UBOX
zf-C3HC4_2
zf-C3HC4_3
TRAF3_RING
zf-RING_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623416
NCBI-ProteinID:
XP_640361
dictyBase:
DDB_G0282115
UniProt:
Q54SZ4
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(5399711..5404710)
Genome browser
AA seq
1640 aa
AA seq
DB search
MVDNNIIEKVKDEVEKVDEPIKSKNPQENVYKRTYENIGNSSRRSKPLDINLETLLNDNK
KKTVKKIKKEDKSDINSSSNTIKINEEVSELKPTKTGLNDSTNEIESEKKDTPSTSTSIT
STNSTTTSTTTTPPISNVISVDSTDNEDYQPKKEIKKKNNKKVKNKKSKEEECIIINEKK
EINIDQEEEDQPTQEVDYSITNSSSSLISPTKSNSILNIKVIASKTEETTVKPIKPRLVI
RNELEIRTKHLNDYEWGKKMNEVMGLDNTQIPSTLKASFRNRSGGSFLKALAMAKDYLER
NNKQIKRDISFLNTDPEIGNEDDEFIDLENDSDNNNNDDLDDLNEIEDLNKISDNSDEDE
YEEELEEEDQEELVEDGDEDEALLEKEADDEDDFKEIGSGGGGGGVIDDIIKNTPTKKQS
QKGVDFNSSIVLDDNDDMVGGNSGNKNEIVIDLDDDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNGNTTTPIKPTKITPTKTKQSPQLKSKSPLSKSVSPVSSSTKKVKKQQI
VELESSDDDLDDLLKPTIMDSLFKGFDYTTSKKTTTTTTTTTTTTSTSLNNNNNNNNNNH
NNDNDDDSEESIKRLIDRSLDDLDSKRLIDFRTPSRSNSTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNESIEIDNDDDKDWFKDINKRLVTNYNNQGDSKEWLLLLKS
IDQCPLLIDTKCKNIINGEKLYFRYEPEKLPKSFLPKTENRLPFTCYSQESKEFYGFLGF
PSVDLNALILPLIRKNYIRLGGTAILTSYTQGRIQGYSLVDIYYSHEGQIIDRVDRTTPN
VIDESDFIDSQYIKVCRKLLDCLLLGPSQFPNILNGDGNSGNGGGNKNEINPRDLFVKKA
LLTTEAPDSLKSQLKHHQKEGLWWMLGREQKPFITYNMSVEEYWRLYKTSPIVGEAASVE
FYYNCICDKISLTPPKSKHKIAGGLLCDEMGLGKTVMSIALIMSNHPVFSTHRQQKEAYD
EIKDQLRNRNQQLRSFQKSVPKPKATLIICPPSLVSQWKSEIKKHLKPDYFNKLEIFEYH
GANRKKKLSGVDLNLMDIVITTHNTFGIEFKKYEEDMQSAYTNNANGNDGSIPLPALLTI
HWWRVIIDESQVCKIKTLIFKGLQNLDAIHKWCLSGTPISNYLDDIYPSLHFLNCYPIAQ
DLKTWRKLIDRPKNLELLKKVINPILLRREKSEILDFKLPKKNKEIVYLDFNENEADDYD
TLFSVAQETLQKISCRGGILKNYATVLALLLRLRQCCDHFHLIRHIDTSTDVICNSCKDI
AVNPVKNHCGHDFCLDCFEDLVRNPDNNNNRVSLCPECDSELILQDNTNGDDSNNKNNGK
SIKKIANLNNSKKSKTNLSKKSQYLDIERQDQLYNQTERQFQNELHNRLNQLIERQRENQ
EAKQMSKIDSLFSTKVKTLLGDIQNDLIDNEDNADEKCLIVSQWTSMLDLIEESLKQNHW
VKNTHYVRYDGRCSHQQKDKAIKQLNEDDDVRVMLVSLKSGGVGLNLTRANRVYMVDPWW
NEASEVQAEGRVHRIGQTREVFVKRYIMNNSIEIRILELQESKNEIANALLSDDYDPTKP
FKNFKLNVEDIKLLFKGFKK
NT seq
4923 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtggataataatattattgaaaaagttaaagatgaagtagaaaaagtagatgaacca
ataaaatctaaaaaccctcaagaaaatgtatataaaagaacatatgaaaatattggaaat
tcttcaagaagaagtaaaccattagacattaatttagagacacttttaaacgacaataaa
aaaaaaactgtaaaaaaaataaaaaaagaagataaaagtgatatcaatagtagtagtaat
acaattaaaatcaatgaagaagtatcagaattaaaacccacaaaaacaggattaaatgat
tcaactaatgaaatagaatctgaaaaaaaagatacaccatcaacttcaacttcaatcact
tccaccaattccacaacaacctcaacaacaacaacaccaccaatatcaaatgtaatatca
gtagattctacagataatgaagattaccaaccaaaaaaagaaattaaaaagaaaaacaat
aaaaaagtaaaaaataaaaaatcaaaagaagaagaatgtataataataaatgaaaaaaaa
gagatcaatattgaccaagaggaagaggaccagcctacacaagaggttgattattcaatt
acaaattcatcatcatcattaatatcaccaacaaaatcaaattcaatattaaatataaaa
gtgatagcatcaaaaacagaagaaacaacagttaaaccaatcaaaccaaggttagtaatt
agaaatgaacttgaaattagaacaaaacatttaaatgattatgaatggggtaaaaaaatg
aatgaagttatgggattggataatacacaaataccatcaacattgaaagcttcatttaga
aatcgtagtggtggtagttttttaaaagcattagctatggcaaaagattacttggaaaga
aataataaacaaattaaaagagatatatcatttttaaatactgatcccgagattggtaat
gaagatgatgaatttatagatttagaaaatgatagtgataataataataatgatgattta
gatgatttaaatgaaattgaagatttaaataaaatatcagataatagtgatgaagatgaa
tatgaagaagaattagaagaagaggatcaagaggaactagtagaagatggtgatgaagat
gaagcacttttagaaaaagaagcagatgacgaagatgattttaaagaaattggtagtggt
ggtggtggtggtggtgttattgatgatataataaaaaatacaccaactaaaaaacaatca
caaaaaggtgttgattttaattcatcaattgtattagatgataatgatgatatggttggt
ggtaatagtggtaataaaaatgaaatagtaatagatttagatgacgataacaacaacaac
aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac
aacaacaacaacaacaacaataacaacaacaacaacggtaatactaccacaccaataaaa
ccaactaaaataacaccaacaaaaacaaaacaatcacctcaattaaagagtaaatcacca
ttatcaaaatcagtatcaccagtatcatcatcaacaaagaaagttaaaaaacaacaaatt
gtagagttagaatcatctgatgatgatttggatgatttacttaaaccaactattatggat
tcattatttaaaggatttgattatacaacttcaaaaaaaactacaacaacaactaccacc
accaccactaccacctcaacctcacttaacaacaacaacaacaacaacaacaacaatcat
aataatgataatgatgatgatagtgaagagtcaattaaaagattaattgatagatcatta
gatgatttagatagtaaaagattaattgattttagaacaccatcaagatcaaattcaacc
acaacaactacaacaacaacaactaataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
gaatcaattgaaattgataatgatgatgataaagattggtttaaagatattaataaaaga
ttagtaacaaattataataatcaaggagattcaaaagaatggttattattattgaaatca
attgatcaatgtccattattgattgatacgaaatgtaaaaatattattaatggagagaaa
ttatattttagatatgaacctgaaaaattaccaaaatcatttttaccaaagactgaaaat
agattaccattcacatgctattcacaagagagtaaagagttttatgggtttttgggattt
ccaagtgttgatttaaatgcattaatattaccattaattagaaagaactatattagattg
ggtggaactgcaatattgacaagttatactcaaggtagaattcaaggttattcattggta
gatatttattattcacatgagggtcaaatcattgatagagtcgatagaactacaccaaat
gtaattgatgaaagtgatttcatcgatagtcaatatattaaagtttgtagaaaattatta
gattgtttactccttggtccttcacaatttccaaatattttaaatggcgatggtaatagt
ggtaatggtggtggaaataaaaatgaaattaatccaagagatttatttgtaaagaaagca
ttattaacaactgaggcaccagattcactaaagagtcaattgaaacatcatcaaaaggaa
ggattgtggtggatgcttggtcgtgaacaaaaaccatttataacttataatatgtcggtt
gaagagtattggaggctttataaaacttcaccaatagtcggtgaagctgcaagtgtggaa
ttctattacaattgcatttgtgataagatcagtttaacaccaccaaagagtaaacataag
atagctggtggtttgctttgtgatgaaatgggtcttggtaaaaccgttatgtctatagca
ttaattatgtcaaatcatccagttttttcaacacatagacaacaaaaagaagcatacgat
gaaatcaaagaccaattaaggaatagaaatcaacagttacgtagttttcaaaagtctgta
ccaaaaccaaaagcaacattaataatatgtccgccatcattggtcagccaatggaaatcg
gaaataaagaagcatttaaaaccagactatttcaataaattggaaatttttgaatatcat
ggtgctaatcgtaagaaaaaactatcaggtgtcgatttgaatcttatggatattgtaatc
actacacataatacttttggtattgaattcaagaaatatgaagaggatatgcaaagtgca
tacactaacaatgccaatggcaatgatgggtccattccattgcctgcactactcacaatt
cattggtggagagttatcattgatgagtcgcaagtttgtaaaatcaaaacattaatcttt
aaagggttacaaaatttagatgcaattcataaatggtgtttatcaggtacacccatttca
aattatttagatgacatttatccatcattacattttttaaattgttatccaatagctcaa
gatttaaaaacttggagaaaattaattgatcgtccaaagaatttagaactattaaagaaa
gttattaatccaatcctattacgtcgtgaaaaatctgaaattttagatttcaaattacca
aagaaaaataaagaaattgtttatttagattttaatgaaaatgaagctgatgattatgat
acacttttctctgttgctcaagaaactttacaaaaaattagttgtagaggtggtatttta
aaaaattatgcaactgttttagcattacttttaagattaagacaatgttgtgatcatttt
catttaattagacatattgatacaagtactgatgtaatttgtaattcatgtaaagatatt
gcagtaaatccagtaaagaatcattgtggtcatgatttttgtttagattgttttgaagat
ttggttagaaatccagataataataataatagagtttcattatgtccagaatgtgattct
gaattaattttacaagataatacaaatggtgatgatagtaataataaaaacaatggtaaa
tcaattaaaaaaatagcaaatcttaataattcaaagaaaagtaaaacaaatttgtcaaaa
aagagtcaatatttagatattgaaagacaagatcaattatataatcaaacagaaagacaa
tttcaaaatgaattacataatagattaaatcaattgattgaaagacaaagagagaatcaa
gaagccaagcaaatgagtaaaatcgattcacttttttcaacaaaggttaaaacattgttg
ggtgatattcaaaatgatttaatagataatgaagataatgcagatgaaaaatgtttaatc
gttagtcaatggacgtcaatgttggatttaatagaggaatcgttgaagcagaatcattgg
gtaaagaatacacattatgtgcgttacgatggcagatgctctcatcaacaaaaggataaa
gcaattaaacaattgaatgaggatgacgatgttagagtgatgttagtctctttaaagagt
ggtggtgttggtttgaatttaactcgtgccaatagggtctatatggtcgatccttggtgg
aatgaggcaagtgaagttcaagcagagggtagagttcatcgtattggtcaaactagagaa
gtctttgtaaagagatacattatgaataattcaattgaaattagaattttagaattacaa
gaatcaaagaatgaaattgcaaatgcactattaagtgatgattatgatccaacaaaacca
ttcaaaaactttaaacttaatgttgaagatattaaattattatttaaaggttttaaaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
