Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0282303
Help
Entry
DDB_G0282303 CDS
T00245
Name
(RefSeq) RabGAP/TBC domain-containing protein
KO
K20133
USP6 N-terminal-like protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0282303
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endocytosis
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
DDB_G0282303
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RabGAP-TBC
RabGap-TBC_2
Ank_2
Ank
Ank_3
Ank_5
Ank_4
Serglycin
HTH_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623506
NCBI-ProteinID:
XP_640246
dictyBase:
DDB_G0282303
UniProt:
Q54SQ5
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(5610805..5613253)
Genome browser
AA seq
787 aa
AA seq
DB search
MDPSEETKSQTLPQDISNDNNNIIIEKEEKEIKENTNNNNTTTTTTNTITTNETINVEIE
NIPQPTIIQQQQINEGVEKYLNNSTAIKDNKDEIFDKILSIIKENNSNLLSQYLENLSGL
KNEKIIKDDDKEDDEDDEDDEKIEKKKQPQQKKSIRYSQENLNLYLEREKEIKENNKYFN
FKEILNKTIESTGKTLLYTSIESDCFNDIVLLLLKYGADPNKTVTLNENIDENTTTSSSG
SGSGSGSNNNNNNNLNNSNNEIDELLEYYKKSTKIESPIHLVIRNGDSTILNLLLDYNVD
VNQKDSLERTPIILSSANGKTECSRLLVLKGCKVNEIDKKQKTALHLAMDGGYDDIATTL
TQNGADISLRYHYKPLNRHNHTYRQSIQDYSDYKDIKILNKLDRFGNIQYGYNNSNDNNN
NNNNNNNNTNNNTSNNNTNNNTNNNTNEEINNEPPSPPIAPVPRKYTRRSTINSGLTSNI
SVLKNKKEIEKELERSIKWNAMIKRYNLNHKFTGKFKSRSIKGIPDRMRSEVWPLLSHAQ
EEKSRNPGLFNQLVNQHSANEIYIDLDVNRAYRNHIFFRERYGMGQVSLFNVLKVYSLYD
QGVGYTQGMSSIASLLVMYLSEEDAFWTLQSLMSRPEYSMRSMFLSGLPGLIRMSFVFEN
LLNHYFPAAKNALDNINLTTTLYSTKWFLIGFLDSFPFHISLRVWDLIFSEGYTIVYSIA
MALFRLNEKSILANKDSFEKCYNILRSFETFEIDEDIFIKYVIKHRISSKRIQYWEDKHA
ASLSSTN
NT seq
2364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccaagtgaagagacaaagtctcaaactttaccacaagatattagtaatgacaac
aataatataattattgaaaaagaagaaaaggagataaaggaaaatacaaataataataat
acaacaaccacaaccaccaatacaataacaacaaatgaaactataaatgtagaaatcgaa
aatataccgcaaccaacaattatacaacaacaacaaattaacgagggagtagaaaaatat
ttaaacaattcaacagcaataaaagataataaggacgaaatatttgataagattttatca
ataattaaagaaaataattcaaatttattaagtcaatatttagagaatttatctggttta
aaaaatgaaaaaataataaaagatgatgacaaggaagatgatgaagatgatgaagatgat
gagaaaatagaaaaaaagaaacaaccacaacaaaaaaaatccataagatattctcaagaa
aatttaaatctttatttagaaagagagaaagaaattaaagaaaataataaatattttaat
tttaaagaaattttaaataaaacaattgaatcaactggtaaaactttattatatacttca
attgaatctgattgttttaatgatatagtattattattattaaaatatggagctgatcca
aataaaactgtaacattaaatgaaaatatagatgaaaatactacaactagtagtagtggt
agtggtagtggtagtggtagtaataataataataataataatttaaataattcaaataat
gaaattgatgaattattagaatattataaaaaatcaacaaaaattgaaagtccaattcat
ttagtaattagaaacggtgattcaacaattttaaatttattattggattataatgttgat
gtgaatcaaaaggattcattggaaagaacaccaattatactatcaagtgcaaatggtaaa
actgaatgttcaagattattagtattaaaaggttgtaaagttaatgaaattgataaaaag
caaaaaacagcacttcatttagcaatggatggtggctatgatgatatagcaacaactcta
actcaaaatggtgctgatatctcccttagatatcattataaaccattaaatagacataat
catacctatcgtcaatcaatacaagattattcagattataaagatattaaaattttaaat
aaattagatcgttttggtaatattcagtatggttataataattcaaatgataataataat
aataataataataataataataatacaaataataatacaagtaataataatacaaataat
aatacaaataataatacaaatgaagaaattaataatgaaccaccatcaccaccaattgca
ccagtacctagaaaatatacaagaagatcaactattaatagtggattaacatcaaatata
agtgttttaaagaataaaaaagagattgaaaaagaattggaaagatcaattaaatggaat
gcaatgataaagagatataatttgaatcacaagtttacaggtaaatttaaatctagatct
attaaaggtatacccgatagaatgagatcagaggtttggccattgttatcacatgctcaa
gaagagaaatccaggaatccaggtttattcaatcaattggtgaatcaacattctgcaaat
gagatttatatagatttggatgttaatagagcttatagaaatcatatattttttagagaa
cgttatggtatgggtcaagtatcattattcaatgtcttgaaagtttattcactatacgac
caaggtgttggctatactcaaggtatgagttcgatcgcttctttattagtgatgtatcta
tcagaggaagatgctttttggactttacaatctttaatgtctagaccagaatattcaatg
agatcaatgtttttatcaggtttaccaggtctaataagaatgtcattcgtttttgaaaat
cttttaaatcattatttccccgctgctaaaaatgctttagataatattaacttaacaacc
accctttattcaacaaaatggttcctaattggtttcttagattctttcccatttcatatc
tccttgcgtgtttgggatttaatcttctctgaaggttatacaatagtttattcaattgca
atggctttatttagattaaatgaaaaatcaattttagcaaataaagatagttttgaaaaa
tgttataatattttaagatcatttgaaacatttgaaattgatgaagatatctttattaaa
tatgtaataaaacatagaattagttcaaaaagaattcaatattgggaagataaacatgcc
gcttcattatcatcaacaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system