Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0282421
Help
Entry
DDB_G0282421 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19022
AP-5 complex subunit beta-1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ddi03400
]
DDB_G0282421
DNA repair and recombination proteins [BR:
ddi03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AP-5 complex
DDB_G0282421
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AP5B1_middle
AP5B1_C
AP5B1_barrel
RR_TM4-6
PDCD7
DUF2828
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623566
NCBI-ProteinID:
XP_640040
dictyBase:
DDB_G0282421
UniProt:
Q54SJ9
LinkDB
All DBs
Position
3:5745445..5749806
Genome browser
AA seq
1398 aa
AA seq
DB search
MDSSSYSSNEWYTIIQNWRNQKYYIPTINIVQPQQSSSNLSSLVTQILSGDDSIQDHQDI
THSSISSNNNSSNSNNNNSNGSTNLMVDQLLKALKNEKDDILRINLLLFLQENSSILLED
DLKRFERVFSILQSLIFSQTDSYPIKSQVLTTITTVLICESLIKTNPKFIEIFIELLLDI
ISKINTSPDRLLKGSACNCLLEFELTYPCILSEFKPLIMSYCQQENTHLIQNYTVLLSAI
LQNVTLSTYEEANTIQNSIILSGGTINNNNNNNNSNNSSIISNNQNSIGSMFGTIVSPTT
NTLSLPLSSPLSQSYQQPPPQQQQQHSSIRSMMISPPTTTITSSSSSSSQMSTSFSQQQQ
QQQQSYSSSNNLNNFIGGGGGNSAQNSLNYGSSRRSALLPLPNIFTDSDPTLRNSTYSIP
PTVKFSPISLERINNNNEIFFRSRSSNLQPTNGSFKSQNTTSSSSSSSSNNNNNNNNVKL
SESFEKDIFKCASTIADQSAYLNQWGLVTIIQQLIPLIDLVSIPHNFFKNHLHLLYKLFF
TDNTLQFHIVLYLTLVFPDLYSQDEFDYCLKRLISIINDISLSLENRIFAIDWLLSLPNK
VLKNQQQQQPLSIFQFYPNFYPTSFDNIFLKEAKLYALCKCLSNSTLNISISPEINFGNK
IFFFFFFFFFFFFKKKSELLKSLICLEEFKHNNENSISTRIVFSNLLLLLSNFPTMMFGC
IEKYLCDILINYPQFLNVIICLSNGIQNQRTKINLFLSLCRMILQLKPLRFLQYLPLVER
VVVEDQIDPTSLLEKTFELVKRKKILTLGNWYIGNIILSICRRSLMYHNTIVVAKPLKLI
LSNLFSYFSNLEIRDRASFYQLLISHLPDDKIKTILNTLQNDETNVSGLLSTPLTSDKNK
LIKSVPNFISISQILDREISNSIQSTLLIYQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQSPTTPILDSSNNDDFEFSFQNYLSLLMDPTKLEAKI
IIPYQIRYKKHINNNNINNKINNNDKINNNNNNNNNNNGDGKNNNDNNNIDDDINKIKSG
SISNSSSLSGIGINIGIGIGNNTPLKVYALLIQLQQSPYYLPINPIRIPYLCHPNNDLLE
NNNYNYNNNSGNSGNSGNNSFNNLQTIEQQQQIVESKLKEFPYCYDIDLSFTPIYPIPTS
FSIKMVFNDDEGKTCKSDGSLISIQFSDLFMNVPIPWNLNSTIEEINQFQSKLFNLLWNT
NTPTTSQPIPMTNSVKQWNISRNLIKKIINLKLSKFLIINNNNNNDDNQKEKENIKVINR
QEESAINSNSNSNGCGEKLKIENDILNLLIFLPPQFHLLLKFDIGDDSTIVYVKTDYWRC
LVFLDQYLSSLINTFIIE
NT seq
4197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcatcatcatattcatcaaatgaatggtatactataatccaaaattggaggaat
caaaaatattatataccaactataaatatagtacaacctcaacaatcatcaagtaattta
tcaagtttagtaacacaaattttatcaggtgatgattcaatacaagatcatcaagatata
actcatagttcaattagtagtaataacaatagtagtaatagtaataataataatagtaat
ggtagtacgaatttaatggttgatcaattattaaaagcattaaagaatgaaaaagatgat
atattacgtattaatttattattattcttacaagaaaattctagtatcctattagaagat
gatttaaaaagatttgaaagagtattctcaatattacaatcattaattttctcacaaact
gatagttatccaattaaatcacaagtactcacaaccataacaaccgtattaatatgtgaa
agtttaattaaaactaatccaaaattcattgaaattttcattgaattattattagatata
attagtaaaattaatacaagtcctgataggttattaaaaggttcagcatgtaattgttta
ttagaatttgaattaacatatccatgtatattatcagaatttaaaccattgataatgagt
tattgtcaacaagagaatactcatttaattcaaaattatacagtactattatcagcaata
cttcaaaatgtaacactaagcacatatgaagaagcaaatacaattcaaaatagtatcatt
ttaagtggtggtacaataaataataataataataataataatagtaataattcatctata
atatcaaataatcaaaattcaattggttcaatgtttggtacaattgtatcaccaactaca
aatacattaagtttaccactttcttcaccattatcacaatcatatcaacaaccaccacca
caacaacagcagcaacattcatcaataagatcaatgatgatatcaccaccaacaacaaca
ataacatcttcttcatcttcttcatcacaaatgtcaacatcatttagtcaacaacagcag
caacaacagcaatcatattcaagtagtaataatttaaataattttataggtggtggtggt
ggcaatagtgctcaaaattcattaaattatggtagtagtagaagatcggcactattacca
ttaccaaatatatttacagattcagatccaactttaagaaattcaacatattcaatacca
ccaactgttaaattttcaccaatttcattagaaagaattaataataataatgaaatattc
tttagaagtagaagtagtaatttacaaccaacaaacggatcgtttaaatcacaaaataca
acatcatcatcttcatcatcgtcatcgaataataataataataataataatgttaaatta
tcagaatcatttgaaaaggatatatttaaatgtgcatcaacaattgcagatcaatcagca
tatttaaatcaatggggattggtaactataattcaacagttaataccattaattgattta
gtttcaataccacataatttctttaagaatcatcttcatctattgtataaattattcttt
acagataatacattacaatttcatattgttttatatttaacgctagtattcccagatcta
tactctcaagatgaatttgattattgtttaaaacgtttaatttcaattattaatgatatt
tcattatcattagaaaatagaatatttgcaatcgattggttattatcattaccaaataaa
gttttaaaaaatcaacaacaacaacaaccattatcaatatttcaattttatccaaatttt
tatccaacttcatttgataatatatttttaaaagaagctaaattatatgcattatgtaaa
tgtttatcaaattcaactttaaatatttcaatttcaccagaaattaattttggtaataaa
attttttttttttttttttttttttttttttttttttttaaaaaaaaaagtgaattatta
aaatcattaatttgtttagaagaatttaaacataataatgaaaattcaatttcaactaga
attgtatttagtaatttattgttattattaagtaattttccaacaatgatgtttggttgt
attgaaaagtatttatgtgatatattaattaattatccacaatttttgaatgtaataata
tgtttatcaaatggtattcaaaatcaaagaacaaaaattaatttatttttatcattatgt
agaatgatattgcaattgaaaccattaagatttttacaatatttaccattagttgaaagg
gtagtagttgaagatcaaattgatccaacatcattattagagaaaacttttgaattggta
aagagaaagaagattttaacattgggtaattggtatattggtaatatcattctatcaatt
tgtagacgttcattaatgtatcataatacaattgtggttgctaaacctttgaaattgatt
ctatcgaatttgttttcctatttttcaaatctcgaaattcgtgatagagcttcattctat
caacttttaatctcacatttaccagatgataaaattaaaacaatcttaaatactcttcaa
aatgatgaaacaaatgttagtggtcttttatcaactcctttaacttctgataaaaataaa
ttaattaaatctgtaccaaatttcatttcaatctctcaaattttagatagagaaatttca
aattcaattcaatcaactttattaatttatcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaatcaccaactaccccaattttagatagtagtaataatgatgattttgaa
tttagttttcaaaattatttatcacttttaatggatccaacaaaattagaagcaaaaatt
attataccatatcaaattcgttataaaaaacatattaataataataatattaataataaa
attaataataatgataaaattaataataacaataataataacaataataataacggagat
ggtaaaaataataatgataataataatattgatgatgatattaataaaattaaaagtggt
agtataagtaatagtagtagtttaagtggtattggtattaatattggtattggtattggt
aataatacaccattaaaagtttatgcattattaattcaattacaacaatcaccatattat
ttaccaattaatccaattagaataccatatttatgtcatccaaataatgatttacttgaa
aataataattataattataataataatagtggcaatagtggtaatagtggtaataatagt
tttaataatttacaaacaattgaacaacaacaacaaattgttgaaagtaaattaaaagaa
tttccatattgctatgatattgatttatcatttacaccaatctatccaataccaactagt
ttctcaattaaaatggtttttaatgatgatgaaggtaaaacttgtaaatctgatggttct
ttaatatcaattcaattctctgatctttttatgaatgttccaataccttggaatttaaat
tcaaccatagaagaaataaatcaatttcaatcgaaattatttaatttactttggaataca
aatactccaacaacttctcaaccaattccaatgacaaattctgtaaaacaatggaacatt
tcaagaaatttaataaaaaaaattattaatttaaaattatcaaaatttttaatcatcaac
aacaataataataatgatgataatcaaaaagaaaaagaaaatattaaagtcattaatcga
caagaagaaagtgctatcaatagtaatagtaatagtaatggttgtggtgaaaaattaaaa
attgaaaatgatattttaaatttattaatatttttaccaccacaatttcatttattatta
aaatttgatattggcgatgattcaacaatcgtttatgttaaaactgattattggagatgt
cttgtatttttagatcaatacctatcatctttaattaatactttcataattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
