Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0283369
Help
Entry
DDB_G0283369 CDS
T00245
Name
(RefSeq) regulator of chromosome condensation domain-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624052
NCBI-ProteinID:
XP_639119
dictyBase:
DDB_G0283369
UniProt:
Q54R64
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(587429..594000)
Genome browser
AA seq
2083 aa
AA seq
DB search
MSNQRKWSNNNSNYNKNSGGYQYNSDSPFSSYSSTSASPIMGRSNDNINSSIGNNNNNSS
KINVGGGGGGGGGSISTPQIGSFTQNYELFSMNKVFSINSAQQQIDNHSQQSSQDRKNDT
SNQFINSSSNNINNSNGLKKSTSSSSKSLSDHFVSSRDEHHFNKYGVLPQNSPYYQQQQL
QQQQQPTSILLLAQGGSDEHTFTAMYCSNDYLIFRYVGQSKVPFYKWLKWDKDPSKKIVS
MSFDPTAIWLLCLLNDTSCKVIPIYYDMCKKVGFMDENNKSSNNNKLNQVQQPRPSTTDK
TDRLSNWVSTTRLFKSSNVNKEKETNGFVSQSNLNNLTNGNSTSGGGGGYAHGLSKFKIP
QLTKKTAMGSNCLWWKTSNSVDYAIITTTSNNIYFVNLVDNSVYKHRFEHSIEKIEMVQS
DSETFLLIATKSNGYFQLLIEQKIDHHRYETIIQLGNQSQSSNSGSSSIGSGNNSGSSSS
IGRNGHDSNLLSRPSDFNIKTLFQTDRIPFDRILLVQKTNINSNNNNNNNVSPSSSSTSP
QPIGSGSMLINNNVSPSNYNNFYNNNNNNNYSYSNNNNNNNNNENLVVSFLKSTSKLEIY
EPLYLNKYPLFVYQLPPNTTNFFFTKYITIVSEIVTTLAPGSNEAIQRSNISVLSNLVAG
TASNSRYINNQSIMQTFQLAPGEVILGISKSLNNQTNNNFTINSNSSYYQSMLLQQQQQQ
QYQYGGIDNIEESMKYTKLPTVSLWTNFAIYELRQKRSPEEIFFELVSCNLEKSDGEALG
KTFGMDLLSCYETAADIKFDQGQYGRALDLYYLSGVRTNKLVFKFLEIGRMDIIMTHLKA
ILHQPDAFNVLDRKKISDILFQCYLQKLLTSRKEFKSLDTEFQHFLSTNQDYDVFNSLSL
LSKNGLLDYFFSVAHSRKIMPTALQMLIQTDILHLDSQNISFLQSAYSLELKSHSGGMIF
DCLPPKLQVKLIIDDQNSIPRYLRRLYHILNLLEEKELLDIAETFDPLLFAPPGQLNAKL
SKTNPTISQLYQIKQQQQLQQQQHLNIYNINNNNNNNNNNNNNSNLNNNINLNNNNNNNN
DNQIQYPNQIDDDFGENNSIPGRQSESIPIRDEEYFEFYIITLLNLVYQRRQKHGHHHHS
HHHGHHKSHHHHHHHHQNNKIENEQKDIPDNESDISTTTNTTTNTEDSEDDNIHSKSIKL
KPDPELMICPMPPLKNEKRAIKVSCGWDHVALISESGELFTWGKNQSGQLGHGLDIGKIQ
TTPKRLEFFRGKSPIIMVECGGEHSICVDSDYVVYSWGQDKFGQLGHGTKSVSQNRPKII
EDISGQKIQAIAAGFAHTIVLKKSGELYSFGYGDQGQLGHGSFVSKSIPTRIELNTIVGI
QHGGGKITQIACGFGHSVICSDNGEVYSWGLGKQGQLGHGNYESIARPRLIEALKGVTKI
SCGHFYTMATTDLKNVYSWGLGEHMKLGHGSDKNEATPRVVDFFIQKNVSKIVCGLNHTI
TLTYPGDLNNNSLSNDDDVNDFIDLAPSTSNSSSSSSLTNDNNNGRSGRLGLNENSQVSP
IYACGAGEHGKLGLGGDLKSPFFDKPIPTAIKGVNALNLIDISCGTDFTAMITSNGALYV
WGYGNFGQIGNGKTDDAWVPIRIPLTDSKANQSSLQSDNKKQRYSQEGLEDILRSNVHSY
RPFHILNKAKQFENYDIAAVIYDILGDPISTLEYRLLSLEKKNFEKDKELFVLFSLLSNY
FIKDYEYIHKQRQLQLQQLPLSISSSTTTSNSNSNISTPSNGTTPPTTPPLNSPKTIQKL
SSSENLDQLQSSNNIINNNSNNNSTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSTNTNNN
QNKEEERLLKYNLISMIFNYFKKKNLPINELENFLITNIDYFSELLSNVIQINFNSDLPL
ILHFSPIFYISTLKNYLQSLKNQSELEKKSQKVSDKILWQNINENLEKNLLQRSKIEIPT
LNQDIYSSFTASKNIPLIGEKDIAFTCNHFFSKRNFFGSTLPDFQSELQKLSIPSSQTLH
YITQEFNKKSISQSCPVCLFNSIRDIHNYDETKKDILKLFKLS
NT seq
6252 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaatcaaagaaaatggtcaaacaacaattcaaattataataaaaatagtggagga
taccaatacaatagcgattcaccattttcgtcatattcatcaacctctgcatcaccaata
atgggtagatctaatgataatattaattcaagtattggtaataataataataatagtagc
aagataaatgttggaggaggcggtggcggtggtggtggttcaattagtacacctcaaatt
ggatcatttacacaaaattatgaattattttcaatgaataaagtattctcaattaatagt
gctcaacaacaaattgataatcattcacaacaatcatcacaagatagaaagaatgataca
agtaatcaatttattaatagtagcagcaataatatcaataacagtaatggattaaaaaaa
tctacatcttcatcatcgaaatcattatcagatcattttgtatcaagtcgtgacgaacat
cattttaataagtatggtgttcttccacaaaattcaccatattatcaacaacaacaattg
caacaacaacaacaaccaacttcaattctattattagctcaaggtggtagtgatgaacat
acttttactgcaatgtattgttcaaatgattatttaatatttagatatgttgggcaaagt
aaagtaccattttataaatggttaaaatgggataaagatccaagtaaaaagatagtatca
atgagttttgatccaacagcaatttggttattatgtttattgaatgatacatcatgtaaa
gtgattccaatttattatgatatgtgtaaaaaagttgggtttatggatgagaacaacaag
agcagtaataataataagttgaatcaagtacaacaaccacgtccatcaacaacagataaa
actgatcgtttatccaattgggtatcaacaaccagattatttaaatcatcaaatgtaaat
aaagaaaaagagactaatggttttgttagtcaatcaaatttaaataacttgacaaatggt
aatagtacgagtggtggtggtggtggttatgcacatggattatcaaaatttaaaatacca
caattaacaaagaaaacagcgatgggatcaaattgtttatggtggaaaacttcaaactct
gtagactatgcaattataaccacaacaagtaataatatttactttgtcaatttggttgat
aactctgtctataaacatagatttgaacattcaattgaaaagattgaaatggtacaaagt
gatagcgaaacttttttattaattgccacaaaatcaaatggttattttcaattattaatt
gaacaaaaaattgatcatcatcgttatgaaactataattcaattaggtaatcaatcacaa
tctagtaatagtggtagtagtagtattggtagtggtaataatagtggtagcagtagtagt
attggtagaaatggtcatgattctaatctattatcaagaccatcagattttaatattaaa
actttatttcaaactgatagaataccttttgatagaattttattagtgcaaaaaacaaat
ataaatagtaataacaataataataacaatgtatcaccatcatcatcatcaacttcgcca
caaccaattggtagtggtagtatgttaataaataataatgtatcaccatcaaattataat
aatttttataataataataataataataactatagctatagtaataataataataataat
aataataatgaaaatttagttgtttcatttttaaaatctacatcaaaacttgaaatttat
gaaccactttatttaaacaaatatccattatttgtttatcaattaccaccaaatacaacc
aatttcttctttacaaaatatataacaattgtatcagagattgtaactacattggcacca
ggctccaatgaagcaattcaaagatcaaatatatcagtattatcaaatttagttgcaggt
acagcaagtaattctagatatataaataatcaatcaattatgcaaacttttcaattggca
ccaggtgaagttattttaggtatttcaaaatcattaaataatcaaaccaataataatttc
actatcaatagtaatagtagctattatcaatcaatgctattacaacaacagcaacaacaa
caatatcaatatggtggtatagataatattgaagagtcaatgaaatatactaaattacca
actgtatcattatggactaattttgcaatttatgaattaagacaaaagagatcaccagaa
gagatattctttgaattggtatcatgtaatttagaaaagagtgatggtgaagcattgggt
aaaacatttggtatggatttattaagttgctatgagactgcagcagatattaaatttgat
cagggtcaatatggtagagcattggatctttattatctatcgggtgttagaacaaataaa
ttggtatttaaattcttggagattggtcgtatggatatcattatgactcatttgaaagca
atacttcatcaacctgatgcattcaatgtattggatcgtaaaaaaatctctgatatatta
ttccaatgttatcttcaaaaattattaacctcaagaaaggaattcaaatcattggataca
gaatttcaacattttctatcaaccaatcaagattatgatgttttcaattctctatcgtta
ttatcaaagaatggtttattagattatttcttctctgttgcacatagtagaaaaataatg
ccaactgcattacaaatgttgattcaaactgatatattacatttagattctcaaaatata
tcattcctccaatcagcctatagtttagaattaaaaagtcatagtggtggtatgatattc
gattgtttaccaccaaaattacaagttaaattaatcattgatgatcaaaattcaatacca
cgttatttacgtagattatatcatatattaaaccttttggaagagaaagaattactagat
attgctgaaacttttgatccattattatttgctccacctggtcaattaaatgcaaaacta
tcaaaaactaatccaacaatttcacaactttatcaaattaaacaacaacaacaattacaa
caacaacaacatttaaatatttataatattaataataataataataacaataataataat
aataataatagcaatttaaataataatatcaatttaaataataataataataataataat
gataatcaaattcaatatccaaatcaaattgatgatgattttggtgaaaataatagtata
ccaggtagacaatctgaatcaattccaattagagatgaagaatattttgaattttatatt
ataaccttactcaatttagtttatcaacgtcgtcaaaaacatggtcatcatcatcatagt
catcatcatggtcatcataaatctcatcatcatcatcatcatcatcatcaaaataataaa
attgaaaatgaacaaaaagatataccagataatgaatcggatatttcaacaacaacaaat
acaacaacaaatacagaggatagtgaagatgataatattcattctaaatcaattaaatta
aaaccagatccagaattaatgatttgtccaatgccaccattaaagaatgaaaagagagct
attaaagtatcatgtggttgggatcatgttgcattgattagtgaatcgggtgaacttttt
acttggggtaaaaatcaatcgggtcaattgggtcatggtttagatattggtaagattcaa
accacaccaaaacgtttagaattctttcgtggtaaatcaccaattataatggttgaatgt
ggtggtgaacatagcatttgtgtcgattcggattatgtagtttacagttggggccaagat
aaatttggtcaattaggtcatggtactaaatctgtctctcaaaatagaccaaagatcatt
gaagatatatcaggtcaaaagatacaagctatagctgcaggtttcgctcatacaatcgtc
ttaaagaaatctggtgaactttattcatttggctatggtgatcaaggtcaattgggtcat
ggctcattcgttagtaaaagtataccaactcgtatcgaattgaatactatagttggtatt
caacatggtggtggtaagataactcaaattgcatgtggttttggtcattccgttatttgt
agtgataatggtgaagtctatagttggggtttaggtaaacaaggtcaattgggtcatgga
aattatgaaagtattgcaagaccacgtctaattgaagctttgaaaggtgtaactaaaata
tcttgtggtcatttctatactatggcaacaaccgatttgaaaaatgtctatagttggggt
ttaggtgaacatatgaaacttggtcatggttccgataaaaatgaagcaactccacgtgtt
gttgactttttcattcaaaagaatgttagcaaaatagtttgtggtttaaatcatactatc
actttaacctatcctggtgatctcaataataattcattaagtaatgatgacgatgttaac
gattttattgaccttgctccttcaacttcaaattcatcatcatcatcatctttaacaaat
gataataataatggtcgtagtggtagattaggtttaaatgaaaattctcaagtatcacca
atttatgcttgtggtgcaggtgaacatggtaagttaggattaggtggtgatttgaaatca
ccattctttgataaaccaattccaactgcaattaaaggtgtaaatgcattgaatttaatt
gatataagttgtggtactgatttcacagctatgatcacttcgaatggtgcactttacgtt
tggggttatggtaatttcggtcaaattggaaatggaaaaactgatgatgcttgggtacca
attagaattccactaactgattcaaaagccaaccaaagttctttacaatctgataataag
aaacaacgttattctcaagagggtcttgaagacattcttagatctaatgttcattcctat
cgtcctttccatatcctaaataaagctaaacaatttgaaaattatgacatagcagctgta
atctatgacatattgggtgacccaatttcaacattagaatatagactactatcattggag
aaaaagaattttgaaaaggataaagaattatttgtattatttagtttactttcaaattat
ttcataaaggattatgaatacattcataaacaaagacaattacaattacaacaattacct
ttatccatttcttcttcaactacaacttcaaattcaaattcaaatatttcaactccttca
aatggcacaactccaccaacaactccacctttaaattcaccaaaaactattcaaaaatta
tcttcttctgaaaatttagatcaattgcaatcaagtaataatattattaataataatagt
aataataattcaacaacaaataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataacaattcaacaaatactaataataat
caaaacaaagaagaagaaagattattaaaatataatttaatttcaatgatttttaattat
tttaagaaaaagaatttaccaattaatgaattagaaaactttttaattacaaatatagat
tacttttcagagttactctcaaatgtcattcaaattaattttaattctgatttaccttta
attttacatttttcaccaatattttatatttcaactttaaaaaattatttacaatctttg
aaaaatcaatctgaacttgaaaagaaatcacaaaaagtatcagataaaattttatggcaa
aatattaatgaaaatttagaaaagaatttattacaaagaagtaaaattgaaataccaaca
ttaaatcaagatatttattcaagttttacagcgtcaaagaatattccattaattggtgaa
aaggatattgctttcacatgtaatcacttttttagtaaaagaaatttctttggttcaaca
ttaccagattttcaatctgaactccaaaaactatcaattccatcttctcaaacattgcat
tatataactcaagaatttaataagaagtcaatatcacaatcttgtccagtttgtttattc
aattcaattagagatattcataattatgatgaaactaaaaaagatattttaaaattattt
aagttgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system
