Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0283535
Help
Entry
DDB_G0283535 CDS
T00245
Symbol
DG1104
Name
(RefSeq) DmX-like protein
KO
K24155
rabconnectin-3a
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04142
Lysosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04142 Lysosome
DDB_G0283535 (DG1104)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0283535 (DG1104)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
DDB_G0283535 (DG1104)
Endosome - Lysosome transport
Acidification regulators
Rabconnectin-3 complex
DDB_G0283535 (DG1104)
RAVE complex
DDB_G0283535 (DG1104)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rav1p_C
WD40
WD40_Prp19
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_EML_2
WD40_CDC20-Fz
Beta-prop_TEP1_2nd
WDR55
EIF3I
Beta-prop_EML
Beta-prop_CAF1B_HIR1
Beta-prop_IFT140_1st
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
WD40_MABP1-WDR62_2nd
ANAPC4_WD40
Beta-prop_HPS5
Beta-prop_DCAF12
Beta-prop_RIG_2nd
WD40_MABP1-WDR62_1st
Beta-prop_WDR35_TULP_N
Beta-prop_DCAF4
TPR_GEMI5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624150
NCBI-ProteinID:
XP_001733008
dictyBase:
DDB_G0283535
UniProt:
B0G145
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(837650..846384)
Genome browser
AA seq
2792 aa
AA seq
DB search
MKPSQIITGSANSNPLTFTYTIYEDDVYYSYSSGSNVYILKGVSLKVIQVLTGHQSDVTC
VSWLSNDTKLLTSSSHEIFLYVLNKERGLWEHVFTIPSQFEITALSWLQSNSFIVGGHSQ
IVKWKLDQQTIMKNYQINNGGGVSSGSGSSSANNNYNYNSTSSPNSTSSSSFGKNNSLDQ
EFSSTTTTNKINLNSSGNNTPTTSALNNNTQVRVNNEKFLQDQRIKEQKLFNKQAQIVWK
TDSSSPINNLSCSPDGSFFATCGKFDRLIKVWFLQKKSKAKLLAEEQQIKLQQEQLSLLL
QREELAKQKNRKGAYKEQFNKLTNKGPIYKANKIGFDEVVSSGGIGTGEDSNDINTELNK
RDKLQKEKEREKGGDANKNKEQQQQQQQPQKEEQSIEELQKQLNQLKEIFNKQKNKKFEG
ETYGFIYLPHPRSITWISWRNRKTSTHNILLTNCKDGVVRLWQQSPQSRRLQFNVSSIIP
SGSDIVDWVYSQNEDKFDIFNKNNEDNNINDEKNNSNSNNNNNAGGGFSGGKLSKSSSGT
TGTSLNSNSNNNNNSTDDSNSYLRSHDFKLHLTNPILLRQKDSLAKTKQIVDWIIVIKLD
GSLVLWKLRTDDSMTKQTSSLSIWINSQILSPQEIGPNRIISLYQPMSLTDNTPGSIKVC
FNSFNGAISSRRFYIQNQNQTQITNASPVSRCYGHKSTIKKLAASKNSPYLSSLDYQNNV
IIWNSTDSSKIQSPNYLIDIGSFPSYYSMTWSPNQKFCFFSNRDGIFVYYIEISQENYVK
SSLLSIGMIEESTLEDDWIDEVHIVDPLNLIYHYNSMDFDKNKVNNDSSRRNGGGGGESS
VLLPYQFFLIGLNKHSDKLYVWGVSVEKDFKYSSSSSPSILKSKLLATKEFERDSRISCI
CAAPKGIFDMTTINKMNKNQNEDFSDNDDDDNNDDNNNNNNNEKYNNEDRVVLTHPICIT
GSIDGYVSVFGITPKISFVKGGDSEEEIKFEDWTIGEMGGYHAYQQPVESVKAAYFGRFA
SKAFSTNPNPEIHIWELESHTPKLRLEDTIKFYIDSEIPQAITTTTTTTTTAIATPLNTP
QVIITSPTSGIGAFKSPPLTTTILLKASTNNVGVGTALAASSSSLAHEDIISCCFSFVSL
DDGSYSVAFGYGNQVKILNKPVDRVIGSYKRPWVQTHNYDDLTSPCSSLEWGKDLSLYVS
AGNQIMVFTKWSKLNNINDNLALSQFQTVGHDYNTKLNSIYHQHSELQRPLPMYHPKFLT
EYMMAGKFGVVEKILKHVCQFLFEKYDDLNDLPKSPVFIPPLSIEEIIHFDEFTNSKSKK
TGTSDDMDRMNSIDKNNHNDRNDRNKDDDDDDDDDDDSDRDELENSNKFTKRQARKLSEI
LSSIKLGNLSSSEQIQLLAVTDTYGEIGEMRGGLDENGSRFILSAKVFQFLRRSLPPQDR
PISLSTTDILWALHSEAQETILSTCFPTDPDWDALKQIGAGLWIKSPSTLINVVEKLAKT
TYIQRRDPRECSLYYLALGKKGALVALHKASKDIKQVEFLSQDFTQAKWITAANKSAFLL
QSKHKYELAASLFLLAGQLKKAVNLLLQMQGDFQLALVISRLYEGENGECSRMIIEDHII
PLAKKTNDRSLLSICNWLLKKYEDAITCLIPSVSIDGDRKLDEDDNNQRGGGGGGYSLGV
SGNSTPIGMSSRNSMVSSPINRSTTGTNYSNATGTTLTTQVVSPISQQLRASQLGPSILY
FFRFLKNHVQLRQLSEDKKKEDEFLRTSSYSYFNSGCSLLALENIERLEASHPTILTDNQ
ERQEVEKLEKLKQQQQEKEKEKERLEKEKQKSNDLGLDFGGGGGGSGFFNKPSYDLGLDF
GGGGGSSSGFFSKPSNDLGLDFGSAPSKPTSSSYMGLDFNTPTQSNSNDLGLDFGSTPSK
PSTSSSYMGLDFNTPTQSSSSNSNNYGLDFGSTPSKPENSSSNYMGLDFNTPSQSSSSNN
YGLDFGAPSSTTTNNNNNNRWELLDTTFIPSKKEKLSLYSLIDNELKDKLVVKVLLETIM
ETREADNWDEEFKDFKESLEYLCKKNQVNSKRNLIQLTKYNNNNNNNSNNNEDGDEKAMD
ILELISISIIKSLLRFDDDNILMLMNSSASQPLLTVSLEIYQSIMSIDKRYHSHSLILST
VYMMLFLLGYGSQRFDVLLVLFKNKNTIQQFNQFIDQIKQLPIRSYKDTENNELIGAGDN
NNDDDDDFDMDDEDDDPNEILDKEELKRINDEKKLIYKFLKRFFDFLSLKYFKQCFDQLV
KALPYHQVFDSVNQRLSLWIGSSQSKLLHVPQKILDQFTNNTTKTTIENFLELLKSYKEF
NSTDQYQIWKILITNQKELLDHIILGIEITLPVDINGGNNNNNNSKVNKNNEPMPLKKVG
SQVQFGGGSGKIKFEEEIEIYKDSDLLQSFCLDPTSPELNVMAIATTRGIREIDHKQLVS
EIREEHDIDPSENLISSPSSSRDNKRPRITGKSVSSLNISKGKISTVFSGLRSSRQMDHN
IIVQCLESHPNSSFYLSGGIDGSVCLWQFGIPEVLTAYQLPQKPRIVRCKFNQSGTKFGA
CDMAGNILLWQFAAQEDTLKPFYSLQAHSKQCLDFTFLNSGSLLATAGISSSDSKSRDIC
LWDVLLPPNKSLIASYTDQENGASSIVYSPKRQTIIVGGKKGSLSLYDIRTHKQLESFKA
HHLNTKSLALDPFEEFVCSGSSDGNIKIWSLPSMTCLNTFEDAHKKQTFVRPTGVFKSPV
STYGVMQVRLENNGLFSCGSDGRVTKRSYYKL
NT seq
8379 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacccagtcaaattataacagggtcagcaaactctaatcctttaacatttacatat
acaatttatgaagatgatgtttattattcctattcatcaggatcaaatgtttatatattg
aaaggagtttcattgaaagttattcaagttttaacaggacatcaaagtgatgttacatgc
gtatcatggttatcaaacgatacaaagttattaacatcatcatcacatgaaatcttttta
tacgttttaaataaagaaagaggattatgggaacacgtattcacaataccaagtcaattt
gaaattacagctttatcatggttacaatcaaattcttttattgttggtggtcattcacaa
attgtaaaatggaaattagatcaacaaaccattatgaaaaattatcaaattaataatggt
ggtggtgttagtagtggtagtggtagtagttctgccaataataattataattataattca
acatcatcaccaaattcaacatcgtcatcgtcatttggtaaaaataatagtttagatcaa
gaatttagttcaacaacaacgactaataaaatcaatttaaatagtagcggtaataataca
ccaacaacgagtgcattgaataataatacacaagttagagttaataatgaaaagttttta
caagatcaaagaataaaagaacaaaaattatttaataagcaagcacaaatcgtttggaaa
actgatagttcaagtccaattaataatttatcatgttcacccgatggttcattctttgca
acttgtggtaaatttgatcgtttaattaaggtttggttccttcaaaagaaatcaaaagca
aagctattggcagaggagcaacaaattaaattacaacaagaacaattatcattactatta
caacgtgaggaattggccaaacaaaagaacagaaaaggtgcatacaaagagcaattcaat
aaactcaccaacaaaggcccaatctataaagcaaataaaattggttttgacgaggtggtt
agtagtggtggcattggcactggtgaagattcaaacgatatcaatactgaattaaataaa
agagataaattacaaaaagaaaaagaaagagaaaaaggtggtgatgctaataaaaataaa
gaacaacaacagcaacaacaacaaccacaaaaagaagaacaatcaattgaagaattacaa
aaacaattgaatcaattgaaagagattttcaataagcagaaaaataaaaaatttgaaggt
gaaacctatggtttcatttatttaccacatccacgttcaatcacttggatttcttggaga
aatagaaaaacttcaactcataatatcttattaacaaattgcaaagatggtgttgtccgt
ttatggcaacaatcaccacaatctagaagattacaatttaatgtttcaagtattatacca
tcaggttctgatattgttgattgggtttattctcaaaatgaagataaatttgatatattt
aataaaaataatgaagataataatataaatgatgaaaaaaataatagtaatagtaataat
aataataatgcaggtggtggttttagtggtggtaaattatcaaaatcttcaagtggaact
acaggtacatcattaaatagtaatagtaataataataataattcaacagatgattcaaat
tcatatttaagaagtcatgattttaaattacatttaacaaatccaattttattaagacaa
aaagattctttagcaaaaactaaacaaatagttgattggattattgttattaaattggat
ggttctttagtgttgtggaaattaagaacagatgattcaatgacaaagcaaacttcatca
ttatcaatttggattaatagtcaaattttatcaccacaagaaattggtccaaatagaatc
atctcattatatcaaccaatgtcattgactgataatactcctggttcaattaaagtttgt
tttaactcttttaatggtgcaatctcttcaagaagattttatattcaaaatcaaaatcaa
actcaaattacaaatgcatcaccagtatctagatgttatggtcataaaagtacaattaaa
aagttggcagcatctaaaaattcaccatatctttcatctttagattatcaaaataatgtt
attatttggaattcaacagattcaagtaaaattcaatcaccaaattatttaattgatatt
ggatcatttccatcatattattcaatgacatggtcaccaaatcaaaagttttgtttcttt
tcaaatagagatggtatatttgtatattatatagagattagtcaagagaattatgttaaa
tcatcattgttatcaattggtatgattgaagaatcaacattagaggatgattggattgat
gaagttcatatagttgatccattaaatttaatttatcattataattcaatggattttgat
aagaataaagttaataacgacagcagtagacgtaatggtggtggtggtggtgaaagtagt
gttttattaccataccaattctttttaattggtttgaataaacattcagataaattatat
gtttggggtgttagtgttgaaaaggatttcaaatattcttcatcatcctctccatcaatt
ttaaaatcaaaattattagcaacaaaagaatttgaaagggattcaagaatttcttgtatt
tgtgctgcaccaaaaggtattttcgatatgacaactattaataaaatgaataaaaatcaa
aatgaagattttagtgataatgatgatgacgataataatgacgataataataataataat
aataatgaaaagtacaataatgaagatagagtagttttaacacatccaatttgtattact
ggtagtattgatggttatgtatcagtatttggtataacaccaaaaatatcatttgtaaag
ggtggtgatagtgaagaagagatcaaattcgaagattggacaattggtgaaatgggtggt
tatcatgcatatcaacaaccagttgaatcagttaaagcagcttattttggtagatttgca
tcaaaagcattctctactaatccaaatccagaaattcatatttgggaattagaatcacat
acaccaaagttacgtttagaagataccattaaattttatatagatagtgaaataccacaa
gcaataacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaattgctacaccattaaatacacca
caagttataataacatcaccaacttcaggaattggtgcatttaaatcaccgccacttaca
actacaattttattgaaagccagtacaaacaatgttggtgtcggaacggcattagcggca
tcatcatcgtcattggcacatgaggatattattagttgttgttttagttttgttagttta
gatgatggtagctattcagttgcatttgggtatggtaaccaagtgaaaatcttaaataaa
ccagtggatagagtgattggtagttataagagaccatgggttcaaactcataactatgat
gatttaacctcgccatgtagtagcttagaatggggtaaagatctatcattgtatgttagt
gctggtaatcaaattatggtgtttacaaaatggtcaaaacttaacaacatcaatgacaac
ttagcattatcacaatttcaaacggttggtcatgattacaataccaaattgaattcaatt
tatcatcaacattctgaacttcaacgtcctttaccaatgtatcatccaaaattcttaact
gaatacatgatggctggtaaatttggtgttgttgaaaagatcttaaaacatgtttgtcaa
ttccttttcgaaaaatatgatgatttaaatgatttaccaaaatcaccagttttcatacca
ccattatcaattgaagagattattcatttcgatgaatttacaaattcaaaatcaaagaaa
actggtacttctgatgatatggatagaatgaattcaattgataagaataatcataatgat
cgtaatgatcgtaataaagatgatgacgatgacgacgacgacgacgacgatagtgatagg
gatgaattagaaaattcaaataaatttacaaaaagacaagcaagaaaattaagtgaaatt
ttatcatcaattaaattgggtaatctttcaagtagtgaacaaattcaattgttagcagtt
accgatacctatggtgaaattggtgaaatgagaggtggtctcgatgagaatggttcacgt
ttcatattgtcagcaaaggtattccaatttttacgtagatcattaccaccacaagatcgt
ccaatctcattgagtacaaccgatattctttgggcgttacattcagaggcacaagaaact
attctttcaacttgtttcccaaccgatccagattgggatgctttaaaacaaattggtgct
ggtttgtggattaaatcgccaagtaccttgataaatgtagtggaaaagttggcaaagaca
acctacattcaaagaagagacccaagagaatgttcattgtattatttagcattgggtaaa
aaaggtgcgttggttgcattgcataaagcttcaaaagatataaaacaagttgaattcctt
tcacaagatttcactcaagctaaatggatcactgctgcaaataaaagtgcattcctttta
caaagtaaacataaatatgaattggctgcttcattattccttttagcaggtcaattaaag
aaagctgtaaatcttttattacaaatgcaaggtgatttccaattggcattggttatctca
agattgtatgaaggtgagaatggcgaatgttcacgtatgatcattgaagatcatatcata
ccacttgcaaagaaaactaatgatcgtagtttattaagtatttgtaattggttattgaaa
aagtatgaagatgctataacatgtttaataccatcagtttcaatagatggtgatagaaaa
cttgatgaagatgataacaatcaacgtggtggtggtggtggtggttatagtttaggtgtt
tctggtaattcaacaccaattggtatgtctagtcgtaattcaatggtatcatcaccaatt
aatagatcaaccactggtacaaattactcaaatgctacaggtacaaccttaaccactcaa
gtggtatcaccaatctctcaacaattacgtgcttctcaattaggtccttccattttatat
ttcttccgtttcttaaagaatcatgttcaattacgtcaattatcagaggataaaaagaaa
gaagatgaattcttaagaactagttcttactcttatttcaatagtggttgttcattatta
gcacttgaaaatattgaaagattagaagcatctcatccaaccattttaactgataatcaa
gaacgtcaagaagttgaaaaattagaaaaattaaaacaacaacaacaagaaaaagaaaaa
gaaaaagaaagattagaaaaagaaaaacaaaaatcaaatgatttaggtttagattttggt
ggtggtggcggtggtagtggtttctttaataaaccgtcatatgatttgggtttagatttt
ggtggtggaggcggtagtagtagtggtttctttagtaaaccttcaaatgatttaggttta
gattttggtagtgcaccatcaaaaccaacttcatcatcttatatgggactagatttcaat
acaccaactcaatcaaattcaaatgatttaggattagattttggtagtacaccatcaaaa
ccatcgacttcttcatcttatatgggactagatttcaatacaccaactcaatcatcatca
tcaaattcaaataattatggtttagactttggtagtacaccatcaaaaccagaaaattca
tcatcaaattatatgggattagatttcaatacaccaagtcaatcatcatcttcaaataat
tatggtttagactttggtgcaccatcatcaaccaccaccaataataataataataatagg
tgggagttgttagatacaacattcataccaagtaaaaaagaaaaactttcattatattca
ttgattgataatgaattaaaagataaattggttgttaaagttttacttgaaaccattatg
gaaactagagaagctgataattgggatgaggaatttaaagattttaaagaatcattagaa
tatttatgtaaaaagaatcaagttaattccaaaagaaatttaattcaattaactaaatat
aataataataataataataatagtaataataatgaagatggtgatgaaaaagcaatggat
atattagaattaatttcaatttcaataattaaatcattattaagatttgatgatgataat
attttaatgttaatgaattcatcagcatcacaaccattattaacagtttcattagagatt
tatcaatcaattatgtctattgataaacgttatcatagtcattcattgattttatcaaca
gtttatatgatgttatttttattaggttatggttcacaacgtttcgatgtgttattagta
ttattcaaaaataagaatactatccaacaatttaatcaattcattgatcaaattaaacaa
ttaccaattagatcttataaagatactgaaaataatgaattaattggtgctggtgataat
aataatgatgatgatgatgattttgatatggatgatgaagatgacgatccaaatgaaata
ttagataaagaagaattaaagagaattaatgatgaaaagaaattaatatataaattctta
aaaagattctttgatttcctttcattgaaatattttaaacaatgcttcgatcaattagta
aaggcattgccataccatcaagtattcgattcagtgaatcaacgtttatcactttggatt
ggttcatcacaatcaaaacttttacatgttccacaaaagattttagatcaattcaccaat
aatacaactaaaacaacaattgaaaactttttagaacttttaaaatcttataaagaattt
aattcaactgatcaatatcaaatttggaaaattttaattacaaatcaaaaagaattatta
gatcatattatacttggtattgaaattactttaccagtagatattaatggtggtaataac
aataataataatagtaaggtaaataaaaataatgaaccaatgccattgaaaaaagttggt
agccaagttcaatttggtggtggtagtggtaaaattaaatttgaagaagagattgaaatt
tataaggatagtgatttattacaatcattttgtttggatccaacttcaccagaattaaat
gttatggcaattgcaaccactcgtggtattagagagattgatcataaacaattggttagt
gaaattagggaagaacatgatatagatccatcagagaatttaattagttcaccatcttca
agtagagataataaaagaccacgtatcactggtaaatcagtttcatctttaaacatctcc
aaaggtaagattagtacggtattcagtggtttaagatcaagtagacaaatggatcataat
ataattgtacaatgtttagaaagtcatccaaactcttcattctatttatcgggtggtatc
gatggttcggtttgtttatggcaatttggtataccagaggtattgactgcctatcaactc
cctcaaaaaccaagaatcgttagatgtaaattcaatcaaagtggcactaaatttggtgca
tgcgatatggcgggtaatatcttgttgtggcaattcgcagctcaagaagataccttgaaa
ccattctattcacttcaagctcattctaagcaatgtttggatttcacatttttaaattct
ggaagtttattggcaactgccggtatcagtagtagtgatagcaaatctcgtgatatctgt
ctatgggatgtattattgccacctaataaatcattgattgcctcttacaccgatcaagag
aatggcgcatcctcaattgtttattctccaaaacgtcaaactatcatcgttggtggtaag
aaaggttcattgtcactctacgatattcgtactcataaacaattggaaagtttcaaagct
catcatttaaatactaaatcattggcattggatccattcgaagagtttgtttgctctggt
agtagtgatggtaacattaagatttggtccttaccatcgatgacttgtctcaataccttt
gaagatgctcataaaaaacaaacttttgttcgtccaacaggtgttttcaaatctccagtt
tcaacctatggtgtaatgcaagttagattagaaaataatggtttattctcttgtggttct
gatggtcgtgttacaaaacgttcatattataaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
