Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0283957
Help
Entry
DDB_G0283957 CDS
T00245
Symbol
msh4
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein
KO
K08740
DNA mismatch repair protein MSH4
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
DDB_G0283957 (msh4)
Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
Eukaryotic type
Meiosis-specific proteins
Others
DDB_G0283957 (msh4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_IV
MutS_II
MrpH_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624350
NCBI-ProteinID:
XP_638826
dictyBase:
DDB_G0283957
UniProt:
Q54QB8
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(1370478..1373603)
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MNNGISKNISFYKKINYTHNKPPAPHIPQQPQFLNNTQKNNDTIINNNNNADNDDIECIY
DDYEFDDDDNNNDNDNDNDKADKNSYNNYIYKEITLNDFGDENDNESDLDDLDFDFEPTI
IKNIENNKTSAINSKSFEQTSKSNHKLINYNPICKDIDENDLLLISKPKINIPMKTPPSL
SKNNNTNSKPMSSLLNSKKSTSTINTPKINKTFPNTIQNSLRKSGSVNNENNSINSNIIK
NKTKNHSGSIVAICENRTREIGYSSYNIESGEIETGQFCDSQTYFHLYTKLYILNPSIIV
IPPIEQNREMVKLIENAYPNVKIIPIIKKLFNENDGISLMNQYCLIDKISIIEKFTKDKV
LSLSSFNALIKYLEQDGIMFVKNCIRIKYSGSENSMQIDAETIKNLELIHSSKDGSRNCT
LYQSINNTSTSQGSRLLISAIVQPSNDFETIKHRQNAIKQLLSNQRVVFTLTPLLSKIQD
IDKTLLLFSQQNKQVTIKSIETSIKCFIDFKNIFELLPKISNLLNSGTICDNPMLNLIKG
KLNNETNNILIKESSKVLNVNLNFQLSKQDQQHQQKEQQQQQQQQVNKINYKIIMYIKDG
VNGLLDVCKKTYKEITDDINKLTKYYKEQFKLPQLKLQHCQTKGYYYSLPCKNKALFHLP
NVFVRSSYRNQKYYLFSEELTSLSRRSREVFEEIIILSAQSIEKLIEFYRSHISELYNIS
ESISLLDFLVSGALYSLQLDQSVCPEIFNGKGPLAIKSGYHPLQLKKSKKKESFSTCFVP
NDTLINETASFQLIHGCNMSGKSTYIQQVALLTIVAHIGYFLPAEFATVPIVDQIISRLG
TSDNIQSNASTFMTEMKEISYILENTTESSLVIIDELGRGTSNMDGSSIAWSISEHLSMI
GCYTLFVTHYQQLLNLATFYPNIRVYHFQVSKDDSSGLKYNYLFSEGVSSIDSYGVETAE
LAGIDSKVIQSAKTIRNLLESKSNNNQINPNTNNQSINQYHHPSRDSYQLLQKLLNLKFS
KLSDVQLKNYLLKLKEDFNFS
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataacggtatctcaaagaatatatctttttataaaaaaataaattatacccacaac
aaaccaccagcaccacacataccacagcaaccacaatttttaaataatactcaaaaaaac
aatgacacaataataaataataataataatgccgataatgatgatattgaatgtatatat
gatgattatgaatttgatgatgatgataataataatgataatgataatgataatgataaa
gctgataaaaattcctacaataattatatttataaagaaattacattaaatgattttggt
gatgaaaatgacaacgagagtgatttagatgatttagattttgattttgaaccaacaata
attaaaaatatagaaaataataaaacctcagcaatcaattccaaatcatttgaacaaact
tcaaaatcaaatcacaaacttataaactataatccaatttgtaaagatattgatgaaaat
gatttattattaatttcaaaaccaaaaattaatattccaatgaaaacccctccatcatta
tcaaaaaataataatactaactcgaaaccaatgagttcactcttaaattctaaaaaatcc
acttcaactataaatacaccaaagataaataaaacatttccaaatacaattcaaaattca
ttaagaaaatctggttcagttaataatgaaaataattcaattaatagtaatataataaaa
aataaaactaaaaatcatagtggttcaattgttgcaatttgtgaaaatagaactagagaa
attggttactcttcatataatattgaaagtggtgaaattgaaactggtcaattttgtgat
tctcaaacttattttcatttgtatacaaaattatatattttaaatccttcaataatagtt
ataccaccaattgaacaaaacagagaaatggttaaattaattgaaaatgcatatccaaat
gtaaagattataccaattataaagaaactatttaatgaaaatgatggtatatcattaatg
aatcaatattgtttaattgataaaatatcaataattgaaaagtttacaaaagataaagtt
ttatcactatcaagtttcaatgcattaattaaatatttagaacaagatggtataatgttt
gtaaagaattgtattcgtataaagtattcaggaagtgaaaattcaatgcaaatagatgca
gaaacaataaaaaacttggaattaattcatagttctaaagatggtagtagaaattgtaca
ttatatcaatcaattaataatacatcaacatcacaaggttcaagactattaattagtgca
atagtacaaccatcaaatgattttgaaactattaaacatcgtcaaaatgcaattaaacaa
ttactttcaaatcaaagagttgtctttactttaacaccattattatcaaagattcaagat
atcgataaaaccttattactattttcacaacaaaataaacaagttacaataaaatcaatt
gaaacttcaattaaatgttttattgattttaaaaatatatttgaacttttaccaaaaatt
tcaaatctattaaatagtggtacaatttgtgataatccaatgttaaatttaattaaagga
aaattaaataatgaaacaaataatattttaattaaagaaagttcaaaagttttaaatgta
aatttaaattttcaattatcaaaacaagatcaacaacatcaacaaaaagaacaacaacaa
caacaacaacaacaagttaataaaattaattataaaattataatgtatataaaagatggt
gtaaatggtttattagatgtttgtaagaaaacctataaagaaattactgatgatattaat
aaattaacaaaatattataaagaacaatttaaattaccacaattaaaattacaacattgc
caaactaaaggttattattattcgttaccatgtaagaataaagcattatttcatttacca
aatgtatttgttcgttcaagctatagaaatcaaaagtactatttatttagtgaagaatta
acttcactatcaagaagaagtagagaagtatttgaagagattattatactttcagcacaa
tcgattgaaaagttaattgaattctatcgttcacatatttctgagctttataatatttca
gaatcaatttcattattagatttcttggtatctggtgcattatattcactacaattggat
caaagtgtttgtcctgaaatatttaatggtaaaggtccattggctattaaatctggttat
catccattacaattaaagaaatcaaagaaaaaagaatcattttcaacttgttttgtacca
aatgatactttaatcaatgaaacagcctcatttcaattaattcatggttgtaatatgtct
ggtaaatctacatacatccaacaagtagccctcttgactatagtagctcacattggttat
tttttacctgctgagtttgcaactgtaccaattgttgatcaaatcattagtagacttggc
acatcagataatattcaatcaaatgctagtacttttatgacggaaatgaaagaaatctct
tacatcttggagaatacaactgaaagtagtttggttattattgatgaattaggtagaggt
acctcaaatatggatggatcttcaattgcatggtcaattagtgaacatctatcaatgatt
ggttgttacactctctttgtaactcactatcaacaattactaaaccttgctacattttat
ccaaatattagagtttatcactttcaagtttccaaagatgattcgtctggtttaaaatat
aattatctctttagtgaaggtgtttcatcaattgatagttatggtgttgaaactgctgaa
ttggctggaattgattcaaaggtaattcaatctgctaaaacaataagaaatcttttagaa
tcaaaatcaaacaataaccaaatcaatccaaatacaaataatcaatccattaatcaatac
catcatccatctagagattcttatcaattacttcaaaaattattaaatttaaaattttca
aaactatctgatgttcaattaaaaaactatttattaaaattaaaagaagattttaatttt
agttaa
DBGET
integrated database retrieval system
