Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0284075
Help
Entry
DDB_G0284075 CDS
T00245
Symbol
elp1
Name
(RefSeq) IKI3 domain-containing protein
KO
K11373
elongator complex protein 1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
DDB_G0284075 (elp1)
Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Elongator complex
DDB_G0284075 (elp1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_ELP1_1st
A-sol_ELP1
Beta-prop_ELP1_2nd
TPR_ELP1
HB_ELP1
ANAPC4_WD40
TPR_GEMI5
Beta-prop_EML_2
Beta-prop_IFT140_1st
Beta-prop_WDR35_TULP_N
RMC1_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624401
NCBI-ProteinID:
XP_638731
dictyBase:
DDB_G0284075
UniProt:
Q54Q66
LinkDB
All DBs
Position
4:1525708..1529993
Genome browser
AA seq
1390 aa
AA seq
DB search
MKNITRLSEFNDLIVDGNGDFKLFSIDQQSNVVYFITENNQLIIYSPSTKKVSMRIELDE
QDILSEGAKVISIQFIPDLDAVCMASNKGDILMYSTSNGELECVGIIGSGITCMSWSPDY
ELFILATESETLIQMTKDWEMINEVSINSYLPGKPKTATTTTNNNNSKNINKIPIITWRG
DGQYFACSSYEEDIGKIQLRIWERSLQLHSMNESDVTGLENQISWRPNGSMIAVSQRLEQ
TRHDISFFERNGLKHGEFTLRSKGEIQSIQWSSDSEILGIQLYLEDEKRSVLQLWHRSNY
YWFLKQEIQCGDSNNNNTNERIVNIQWDLSSPIVRVLTQIGRFSEYRLCWDYDVSQGSSE
NNPTTVVMVDGNQLKLTPFRRLVVPPPMSAYSIELPDRLNCLGFSFNQSTYQLSVMVDQS
ILIYTPATLPPTPKATLPKIKSANGLLAPLPSDFKANLPNYSIAPTLTSRVVIDRSKLQL
HKIRHFLWLNASTFIGVESKTNQNSDSIVEIVFNVSSGELENIYRTSVSTKILRLTHHLQ
SLDQCLFESIDGYLHLYNCSTSASSGGNLEQPTSISPFIYQENIFKFPTPCPWFSSCTIN
QEDSVVGLNDRNKLYINQSLLCTDCNSFALHNKFLLFTTVSHVLRSVSLLAPPPTQPLTY
VPVSNVIGNYVGHKSQALQQQSNYDDSIRDVERGSRIVAVVPHDTRLVLQMPRGNLEAIS
PRSLTLATIREMINNHQYLSAFLTMRRNRIDMNFIYDHNPTDFIRHIEEFVDQIQQIDYL
NLFISSLRDEDTTKTLFIDLETKHLLPPTNVVKPSSIVVGKVNLVCDSLRKVFMEKDSIK
FNLPILTTYVKKSPPELDQVLRLIQSLRGEEINEQGETIVNRLAEESLDYIVFLVDVNKL
YDIALGTYDFELVIMVAQKSQKDPKEYIPFLQELQKMEKFYQRYSIDKYLSRWELALYNL
SRAGKKYQQDCLDLIISNKIYKEALVNYGGSAADSDDNLIEEKDEMFKKVLNIYGDYLLE
SNQFEDAAYLFLQANQEKKSINAFRDAGLWENAISQANKLSYTKEQLNQLVIELSEILKR
NSKFQQAAQCLEKFQLIDQAIHMYCEGYYFNEALLLSSSSSSSNQEEEQQIKIKKSLLDS
LSNQINEINNNFEKYEKMSTRIVIVRTNKLNYVPLLLPRGQGDFETGSMMSGMSGMFSEG
GMSVNSALSNVTTSSYVSTYSQQTGTFSTATKTRLKKKDKKQKPQKVRITGKEGSPYEED
YLVDQMKKLIPSSSQQESIGRIIKGLVLLGLFNDARQLSTLYQKYLNLIDSSLDDLSASA
TAILPENKKEKEREQRLQLEQLEEQQQQQQSQQQQQQQQTSTTSNNKIITLNIKQVVVSR
DKPNWNLTIF
NT seq
4173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatattacaagattgtcagaatttaatgacttaattgttgatggtaatggagat
tttaaattattttcaattgatcaacaaagtaatgtagtatactttataaccgagaataat
caattaattatttattcaccatcaaccaaaaaggtttcaatgagaattgaattagatgaa
caagatatattaagtgaaggtgctaaagtcatctcaattcaattcattcctgatttagat
gctgtttgtatggcttcaaataaaggtgatattttaatgtattcaacttcaaatggtgaa
cttgaatgtgttggtattattggatctggtattacatgtatgtcatggagtccagattat
gaattatttattttggcaacagagagtgaaacacttattcaaatgacaaaagattgggaa
atgattaatgaagtttcaattaattcatatttaccaggtaaaccaaaaacagcaacaaca
acaactaataataataattcaaaaaatataaataaaataccaattataacatggagaggt
gatggtcaatattttgcatgtagtagttatgaagaggatattggtaaaattcaattaaga
atttgggaaagatcattacaattacatagtatgaatgaatcagatgttacaggattagag
aatcaaatttcatggagaccaaatggttcaatgattgcagttagtcaaagattagaacaa
accagacatgatatatcattctttgaaagaaatggtttaaaacatggtgaatttacatta
agaagtaaaggtgaaattcaatcgattcaatggtcaagtgattcagagattttaggtatt
caattatatttagaggatgaaaaaagatcagtattacaattatggcatcgtagtaattat
tattggtttttaaaacaagagattcaatgcggtgatagtaataataataatactaatgaa
agaattgtaaatattcaatgggatttatcatcaccaattgttcgtgtattaacacaaatt
ggtcgttttagtgaatatcgtctttgttgggattatgatgtttctcaaggttcaagtgaa
aataatccaaccactgttgtaatggtagatggtaatcaattgaaattgacaccattccgt
cgtttggttgtcccaccaccaatgtcggcctactctattgaactacctgatagattgaat
tgtttgggtttttcattcaatcaaagtacctatcaattatcagtaatggtcgatcaatct
atactcatttatacaccagcaacactaccaccaacaccaaaggccacactaccaaagatt
aaatcggccaatggtttattagcaccattaccatcggattttaaagcaaacttaccaaat
tattcaattgctccaacattaacctctagagtggtaattgatagatccaaattacaactc
cacaaaattcgtcatttcctttggttaaacgcctcaacattcattggtgtcgagagtaaa
actaatcaaaattcagattcaatcgttgagattgttttcaatgtttctagtggtgaactc
gagaatatctatcgtacaagtgtttcaacaaagatcttacgtttaactcatcatttacaa
tcattggatcaatgtttatttgaaagtatagatggttatcttcacctttacaattgttca
acatcagcatcatcaggtggtaatttagaacaaccaacttcaatctcaccattcatctat
caagagaatatctttaagtttccaacaccatgtccatggttttcatcttgtacaatcaat
caagaggattcagtcgttggtttaaatgatagaaataaactttacatcaatcaaagttta
ctttgcacagattgtaattcatttgcacttcacaataaattcctattgttcaccacagta
tcacatgtacttagatcagtatcattattagcaccaccaccaactcaaccattaacctac
gtcccagtttcaaatgtaattggtaattatgtcggtcataaatcgcaagcattacaacag
caatcgaattacgatgattcaatcagagatgttgaaagaggttcacgtatcgttgcagtt
gtaccacacgatactcgtttagtacttcaaatgccaagaggtaatttagaggccatttca
ccacgttcactcactttagcaaccattcgtgaaatgattaacaaccatcaatacctttct
gccttcttaacaatgcgtagaaatcgtatcgatatgaactttatttacgatcataatcca
accgatttcattcgtcatattgaagagtttgttgaccaaattcaacaaatcgactattta
aatcttttcatctcttcattacgtgatgaagataccaccaaaaccctattcattgattta
gagactaaacatttattaccaccaaccaatgtggttaaaccatcctccatcgttgttggt
aaggttaatttagtatgtgactcattgcgtaaggtatttatggagaaggattcaatcaaa
ttcaatttaccaatccttacaacctatgtaaagaaatcaccacctgaattggatcaagtc
ttacgtttaattcaatcattacgtggtgaagaaatcaatgaacaaggtgaaaccatcgtt
aatcgtttggcagaggaatcattagattacattgttttcttggttgatgttaataaactc
tacgatattgctttgggtacatacgattttgaattggtgattatggttgctcaaaaatct
caaaaagatccaaaagaatatatcccattccttcaagaacttcaaaagatggagaaattc
tatcaacgttattcaatcgataaatatttatcacgttgggaattagcactttataatctt
tcaagagctggtaaaaaatatcaacaagattgtttagatttaattatttcaaataaaatt
tataaagaagcattagttaattatggtggtagtgctgccgatagtgacgataatttaatt
gaagaaaaagatgaaatgtttaaaaaagttttaaatatttatggtgattatttattagaa
tctaatcaatttgaagatgccgcctatttattcttacaagccaatcaagaaaagaaatca
atcaatgcatttagagatgcaggtttatgggaaaatgcaatctctcaagccaataaatta
tcctatacaaaggaacaattgaatcaattggtcattgaattatcggaaatcttaaaacgt
aattcaaaattccaacaagctgctcaatgtttagagaaattccaacttattgatcaagca
attcatatgtattgtgaaggttattattttaatgaagcattattattgtcatcatcatca
tcatcatctaatcaagaagaagaacaacaaattaaaattaaaaaatcattattagattca
ttatcaaatcaaattaatgaaattaataataattttgaaaaatatgaaaagatgtcaact
agaattgtaattgttcgtacaaataaattaaattatgtaccattgttattaccaagaggt
caaggtgattttgaaactggttcaatgatgtctggtatgagtggtatgtttagtgaaggt
ggtatgtcagttaatagtgctctatcgaatgttactacctcttcttatgtttcaacttat
tctcaacaaactggaaccttttcaaccgctactaaaactcgtttaaaaaagaaagataag
aagcaaaaacctcaaaaagttcgtatcaccggtaaagaaggttcaccatatgaagaggat
tatttagttgatcaaatgaagaaattaattccttcctcatctcaacaagaatcaattggt
cgtatcattaaaggtttggttcttttaggtctctttaatgatgctcgtcaattatcaact
ctttatcaaaaatatttaaatcttatcgattcttctttagatgatttatctgcttctgct
actgctatcttaccagaaaataaaaaagaaaaagaaagagaacaaagattacaattagaa
caattagaagaacaacaacaacaacaacaatcacaacaacaacaacaacaacaacaaact
tcaactacttctaataataagattataacattaaatattaaacaagtagtagtttcaaga
gataaaccaaattggaatttaacaattttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
