KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0284175
Entry
DDB_G0284175      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K08991  crossover junction endonuclease MUS81 [EC:3.1.22.-]
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03440  Homologous recombination
ddi03460  Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    DDB_G0284175
   03460 Fanconi anemia pathway
    DDB_G0284175
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ddi03400]
    DDB_G0284175
DNA repair and recombination proteins [BR:ddi03400]
 Eukaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    Other HR factors
     DDB_G0284175
SSDB
Motif
Pfam: ERCC4 WHD_MUS81 EME1-MUS81_C HHH_8 SAM_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 8624454
NCBI-ProteinID: XP_638710
dictyBase: DDB_G0284175
UniProt: Q54Q14
LinkDB
Position
4:<1653717..>1656680
AA seq 921 aa
MTNPNQFIIDALELIIKNRSSYHFQRNLKVAIDSIKLYPMPLKTKDDIKLLRGCGPTIVD
IIFQIIQSNKNNNNNNNNNNNNNNNNNITNNNNSDGGIPKELENYIAPESVKEFLISIDQ
SFVQYLPKLEEAGYNKLNFLKNLNEKAMDKLSIPLGHQTPILENAKILKLYYDYTKLNNN
SNNIINNYSLDGNMITLIGKPYIDIDDLKKKCSEDVFLKALSSLFNHKIKTIHVEHNEIT
AITESHSIPNTTYKIRFEISPDGTIVRDHCECRYLNSTRWCKHKVSVFLIFNENTGERGK
RLYCQSTSPTSPTSPTSPTSPTSPTPPKPSRPVTKLSPITSLTSKKSPNNNNNKKEYTPA
HRSGAWAILLALYDNEISNGNDNDRGKRYLLKEEILSNGNKYLSSGRMDTGGHWLSNKTL
IDHNLISKSGSPLQFILTKTGYELARKLKSFEDSSTDNKNKDDCDNNNIDNDNGSNSSKD
EGSDESCDNDNQITITTIDKRNPNWKTQLKNKTNNINNNNNNNNTNIVKNNNNNNNNNNN
NNNSNNKNNKRRDSDNNDNFSNGSEERLFLERELFNENWSDSDEELTQFMVDNTVFPNSK
VKELLYNEREVIIDNVLLIVDNREVMDKDQSDLLDKLRSSNIQLEIRKLPIGDFIFIAKC
RYNNNNNNNNNNDNDNDDNGNNNNNNNNNDIVINREPFELMYDIIIERKKLADLVSSRKD
GRYREQKQRIKTLKKFGLTNAIYLIEGDNSNGAIHTDIYEDSIMETLIEDEFIVQLTDGL
DLTKEYLLNLYDHFKKSKYRSLSTLRFADYEQIQQVSCSMKLKDLFALQLLQIDGVTPPK
AKAIINKYPTPRHLVEAYNNLINEIETSDEETLNQSKNSQDKLLENLTYSQRFNGKKLKI
GHDISKLISILYNDENQYQFD
NT seq 2766 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaaatccaaatcaattcataatagacgcattagaattaataatcaaaaataggagt
agttatcattttcaaaggaatttaaaagtagcaattgatagtattaaattatacccaatg
ccactgaaaacaaaagatgatattaaacttttaagagggtgtggtccgacaattgttgat
atcatttttcaaataattcaaagtaataaaaataataataataataataataataacaat
aacaataacaataataataatattaccaataataacaatagtgatggtggtattccaaaa
gaacttgaaaattatatagcaccagaatcagtaaaagaatttttaatatcaattgatcaa
agttttgttcaatatttaccaaaacttgaagaagcaggttataataaattaaatttctta
aagaatttaaatgaaaaggctatggataaattatcaataccattaggtcaccaaacacca
atattagaaaatgcgaaaattttaaaattatactatgattatacaaaactaaataataat
agtaataatattattaataattatagtttagatggtaatatgataactttaattggtaaa
ccatatattgatattgacgatttaaaaaagaaatgttcagaagatgtttttttaaaagca
ttaagttcattatttaatcataagattaagacgatacatgttgaacataatgaaataaca
gcaatcactgaaagtcattcaattcctaatacaacatataaaattagatttgaaatttca
cctgatggtacaatagttagagatcattgcgaatgtagatatctaaatagtacaagatgg
tgtaaacataaagtatcagtatttttaatatttaatgaaaatactggtgaaagaggtaaa
agactatattgtcaatcaacttcaccaacatcaccaacatcaccaacttcaccaacatca
ccaacatcaccaaccccaccaaagccatcaagaccagtaacgaaattatcaccaattaca
agcttaacatctaaaaaatccccaaataataataataataaaaaagaatatacaccagca
catagatcaggagcatgggcaattttacttgcattatatgataatgaaatatcaaatggt
aatgataatgatagaggtaaaagataccttttaaaagaagaaatattaagtaatggtaat
aagtatctttcatctggtagaatggatacaggtggacattggctttcgaataaaacatta
attgatcataatttaattagtaaatctggttcaccacttcaatttatattaacaaaaaca
ggttatgaattagcaagaaaattgaaatcatttgaagatagttccactgataataaaaat
aaagatgattgtgataataataacattgataatgataatggtagtaatagtagtaaagat
gaaggtagtgatgaaagttgtgataatgataatcaaataactatcactacaattgataaa
agaaatcccaattggaaaacacaattaaaaaataaaaccaataatattaataataataat
aataataataatacaaatattgttaaaaataataataataacaataataataataataat
aataataatagtaataataaaaataataaacgtcgtgatagtgataataatgataatttt
agtaatggtagtgaagaacgattatttttagaaagggaattatttaatgaaaattggagt
gattctgatgaagagttaactcaatttatggttgataatacagtgtttccaaattcaaag
gttaaagaattattatataatgaaagggaggtaataattgataatgttttattaattgta
gataatagagaagtaatggataaagatcaatcagatttattggataaacttagaagttca
aatattcaacttgaaattagaaaattaccaattggtgatttcattttcattgcaaaatgt
agatataataataataataataataataataacaatgataatgataatgatgataatggt
aataataataataataataataataatgatattgttataaatagagaaccatttgaatta
atgtatgatataataattgaaagaaagaaattagcagatttagtatcatctagaaaggat
ggtagatatagagaacaaaaacaaagaataaaaacattgaaaaagtttggattgacaaat
gcaatctatttgattgaaggtgacaattcaaatggtgcaattcatacagatatttatgaa
gactcaataatggagacattgatagaggatgaattcatagttcaattaactgatggattg
gatttaacaaaagagtatcttttgaatctttatgatcatttcaagaaatcaaagtatcgg
tcactttcgacattaagattcgcagattatgaacaaattcaacaagtatcatgttcaatg
aaattaaaagatttattcgctctacaattacttcaaatcgatggtgttacacctccaaaa
gcaaaagcaatcattaataaatacccaacaccaagacatttggttgaagcttataataat
ttaattaatgaaattgaaacaagtgatgaggaaactttaaatcaatcaaaaaattctcaa
gataaactattggaaaatttaacttattctcaaagatttaatggtaaaaaattaaaaatt
ggtcatgacatttcaaaattaatttcaattctttataatgatgaaaatcaatatcaattt
gattga

DBGET integrated database retrieval system