Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0285875
Help
Entry
DDB_G0285875 CDS
T00245
Name
(RefSeq) BP28, C-terminal domain-containing protein
KO
K14550
U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
DDB_G0285875
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0285875
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
DDB_G0285875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BP28CT
U3snoRNP10
HEAT_EF3_N
UME
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8625328
NCBI-ProteinID:
XP_637976
dictyBase:
DDB_G0285875
UniProt:
Q54ML4
LinkDB
All DBs
Position
4:3748302..3755437
Genome browser
AA seq
2237 aa
AA seq
DB search
MTTSLDKQLLQVKEKIHYVDVSKKRDSLLFGAVEAANIDLDSVLAMGQEGLSELINIDSR
FKCFQLTLFSDNSKSFNRVLENKEENNKIDIEINKFLELQSNYFLLSSAHKSLEWLIRRY
RINEFNIDSIISSIIPYHESNIFAKFLSILRFEFNKKWQFLTGVQENKVYIPREYFIGVV
GSHPFFLEFIYSTIENYDKKDVMSKPLISFFTAFLIELLSANTTSYIRDTLSCLTKCLKS
KNSDLQLSSYMILSIIASKVTLSKDVIELLFKTTLKHCTNNFSQAFTFLMVLFQKQKFDS
LPNETLKTLVSIPALFEILLDFNSQEKSLDRVLLILFKYLSKSCIESAESYTLLSQLIEE
LVPISNQYHVLIFNTLTKSYLATTKNSSKDEVDESVINILRSLNSEVVQDEFKKLSNNNN
NNNNNNNNKQKLNEIIKLQKSVLQQKTITTSSSNTIFLKLQSNIPSERKEGLTLFKKEYC
SKTGKEKEETTTSTDFNSISKSFSSTIYQRLIDSDGSIVKEAWNLPSLNLIVSPKELLKA
SIEFFKVQSFLNDKKLLDTVLSTITSVVVNQSSNSSLTPDFVSILLPQLLDISTTTTTTA
TSIIKKLNKDIHPIFNNITSSNIESLIKSISTNLDKESNITFINQISKSTFSTFKSDIFI
ILILLNSIISCNNNNNNKKNNNNLIYQMFNIIVEISKSYLSKEESIITNINNLQEVYKII
NENNNNNFNLKQQISLICSLLSIAIDSLFTISPEQFMKQLQNSSLSSSSNTIEEKMIKEI
QNICKLIFNSKITNIDLVLRSIVKKFFGNQLVFFKFLSQFWEVNENSENQDITTIYQSLC
LSGILVNSKSFNRYLINNNQAVALIPYLLLLKNQDSSIRSTSLDSIQEIYKQIKSSSIEA
SSSTTTSNRLNFYTSNQPTIELKVLIKFLAQLVQYKNEITMDKTFLDSYFSKVLFNSQIS
SSSKASSSSDDDDDDDDDVDQDVSKMTKQDIELIGKFLISSSLLIESLSSRLTMLQSLQS
IKDDVTFVEVTINYISQLLENVKNATLTYDESLILDILLKRLGQTSVLTNPKTKKQSLSL
FISSLSISNELDLTIAGGGNDKPIKYTPLVALIGSINKSLLLTVPVKEQIGIVETVLSYF
FSESNQIKQLAKNTLLSVLVDATVILPMLLPEKQPQQQQQSTTSLPIPRYNSLFELIRLN
SSKINGISILVTPILSIIKKMETSIVENVEKDALEYCKQLAMASLGSIIDCSSVKDVKSL
ETSFDISIIIKCVESSNNLQTCSSALILLSNMASKFPQKLFKFMESIIKMIKFVLTNGDD
NFSFMILERFLIQLLPSLVKQGISLVQIFKLFLDSFSSIPKKFRLQLFNCICQSVAYKQL
HILFSLILTKKIQDLRIITNKLKHLDKDTIMSSDEQIKEEIDYEQFNEFISQFSDQIPVL
EMSTSLGSLCQSINLISIESGNCVEALSEEEEEICSLLSRNNSKDNRLLQANTLDFICER
LSSKLYLDSFSFDLTSQQKELVETKYLGAFENLLILLKKTTEYSEKTSNIKLNGSANSIS
IASGKDKFIKKLLSSINLCMDRYGQLLSVKGFISTITQLLNHSDSNVRRRSLVIFNEKIT
LVKDDLTQDQVNQFLSLIDSFTRIIDSQNETETNKQTSLLSFEILARNFSTTNATAFLSQ
IPIIIKSMGHSSHQVVSSSLICIATLCCELQAKTIPYIPQFFPVLLNTLTGSYKTNVEEE
NETRTLLQISCISSLEMMLNTISKFLSPYLPQLLNALLHPRLTSNSMLSGKLFAQVKRLL
NILTKNVEFRLLLPAMFSAYEFAVQSENDLSLICLFDFVGDISANLGPKDIALHHKSIFK
FYLQCFEFRKKYKNRVKNADKVEDHIISSFMTLVMKLNENLFKPLFIKVLDWALNIQNGQ
QNGKHTDDDDEENGSDDEESDEDKPKKKKLVNGKSKSTKTQPEISKDNLLFFYKIVNSLA
SNLKTIFVPYFGYFFDDSIRQLQNIYSNIPFSQQPQQQPQQPTVNDNTTITLLNNNNNNN
NNNINNKRKKNQNITNTTTTNNNSNNNLNNSNNNNIDQDESILCFVISALEKCFMYDTDG
FLDKQKFEQILPALVNQLDNQMGTVESYKLRVSRYIAPTITQLAVVINQDLLWKHLNHTV
LMKTRSPYSIVRYSSMVVVQSLHKKMGEQLLILLPETIPFISELLEDSVPEVEQITQDVV
KIIETHLGAEESISSYL
NT seq
6714 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacatcattagataaacaattattacaagttaaagaaaagatacattatgtagat
gtatcaaagaaaagagattcattattatttggagcagttgaagcagccaatattgattta
gattcagtgttggcaatgggacaagaaggtttaagtgaattgataaatatagattcaaga
tttaaatgttttcaattgacattgttttccgataattcaaaatcattcaatagagtcttg
gagaacaaagaagaaaataacaaaattgatattgaaattaataaatttttagaattacaa
tcaaattatttccttttatcttccgctcataaatcattagaatggttaattcgtagatat
agaattaatgaattcaatatagattcaatcatctcctcaattataccttatcatgaatca
aatatttttgctaaatttttatcaattttaagatttgagtttaataaaaaatggcaattt
ttaacaggagtacaagaaaataaagtttatataccaagagaatatttcattggtgttgtt
gggtcacatccattctttttagaatttatttacagtacaattgaaaattatgataaaaaa
gatgtcatgtcaaaaccgttaatctcattttttaccgcttttttaattgaacttttatct
gcaaatactacatcatacattagagatactttatcatgtttaacaaaatgtttaaagagt
aaaaatagtgatttacaactttcaagttatatgatccttagtattattgcttcaaaggtt
acactttcaaaggatgtaattgaattattatttaaaactacattgaaacattgtaccaac
aattttagtcaagctttcaccttcttaatggttttattccaaaaacaaaagtttgattca
ttaccaaatgaaaccttaaaaactttagtatcaattccagcactttttgaaattttatta
gatttcaattcacaagagaaatcattagatagagtattattaattttatttaaatattta
tcaaagagttgcattgaatcagcagaaagttatacattgttaagtcaattaattgaggag
ttggttccaatttcaaatcaataccatgttttaatctttaatactttaacaaaatcatat
ttagcaactactaaaaattcaagtaaagatgaagttgatgaatcagttataaatatttta
agatcattaaattctgaagttgttcaagatgaatttaaaaaactttcaaataataataat
aataataataataataataataataaacaaaaactaaatgagattataaaattacaaaaa
tcagtacttcaacaaaaaacaattacaacatcatcatcaaatactattttcttaaaatta
caaagtaatataccatcagaacgtaaagaaggtttaacattatttaaaaaggagtattgt
tcaaaaacaggaaaagaaaaagaagagacaacaactagtactgatttcaatagtatttca
aaatcattttcatcaacaatttatcaacgtttaattgattctgatggttcaattgtaaag
gaagcttggaatttaccatcattaaatttaatagtttcaccaaaagaattattaaaagca
agtattgaattctttaaagttcaatcattcttaaatgataagaaattattagatacagtt
ttatcaacaataacaagtgtagttgtcaatcaatcttcaaattcttctttaacaccagat
tttgtttcaattttattaccacaacttttagatatttcaaccactaccactaccactgcc
acttcaataataaagaaattaaacaaagatattcatccaatttttaataatattacatca
tcaaatatagaatcattaattaaatcaatttcaacaaatttagataaagaatcaaatatt
acttttataaatcaaatttcaaaatcaactttttcaacttttaaatctgatattttcata
atattaattttattaaattcaataataagttgtaataataataataataataagaaaaat
aataataatttaatttaccaaatgtttaatataatagtagaaatttcaaaatcatattta
tcaaaagaagaatcaatcataactaatattaataatttacaagaagtttataaaataatt
aatgaaaataataataataattttaatttaaaacaacaaattagtttaatttgttcatta
ttatcaatagcgattgattctttatttacaatttcaccagaacaatttatgaaacaactt
caaaattcatcgttatcatcttcatcaaatacaattgaggagaaaatgattaaagaaatt
caaaatatttgtaaattaatatttaatagtaaaattacaaatattgatttagtattaaga
agtattgtaaagaaattctttggtaatcaattagtattctttaaatttttatcacaattt
tgggaagtcaatgaaaatagtgaaaatcaagatattacaaccatttatcaatcactttgc
cttagtggaattttagtaaactcaaaatcattcaatcgttaccttataaataataatcaa
gcagtagctttaattccatatttattattattaaaaaatcaagattcctcaattagatca
acttcccttgattcaattcaagagatttataaacaaattaagtcttcatcaattgaagca
tcatcttcaacaacaacatcaaatagattaaatttctatacatcaaatcaaccaactatt
gaattaaaagttttaattaaattcttggctcaattggttcaatataagaatgaaattaca
atggataaaacatttttggatagttatttctcaaaagttttattcaattctcaaattagt
tcaagttctaaagcttcttcaagtagtgatgatgatgatgatgatgatgacgatgtcgat
caagatgtatcaaaaatgactaaacaagatattgaattaattggtaaattcttaatttca
agttcattacttattgaatcattatcaagtagattaacaatgttacaatcattacaatct
attaaagatgatgttacatttgttgaagttaccatcaactatattagccaattattggag
aatgttaaaaatgccactcttacatatgatgaatctttaattttagatatcctcttaaag
agattaggtcaaacatcagtacttacaaatccaaaaaccaagaaacaatcattatcatta
ttcatttcatctttatcaatttcaaatgaattagatttgactattgctggtggtggtaat
gataaaccaattaaatatacaccattggttgccttaattggttcaattaataaatcatta
ttattaactgtaccagttaaagaacaaattggtattgttgaaacagtactttcttatttc
ttctctgagagtaatcaaattaaacaattggcaaagaatactttattatccgtattagtc
gatgcaactgttattttaccaatgttattaccagagaaacaaccacaacaacaacaacaa
tctacaacatctttaccaattccaagatataattcattatttgaattgattagattaaat
tcatcaaaaattaatggtatttcaattttagtaacaccaattttatcaattattaaaaag
atggaaactagtattgttgaaaatgttgaaaaggatgcattggaatattgtaaacaattg
gctatggcatcacttggttcaattattgattgttccagtgtaaaggatgttaagagtttg
gaaacttcatttgatatttcaattataattaaatgtgttgaatcatcaaataatcttcaa
acttgtagtagtgcattaatattactctcaaacatggcttctaaattcccacaaaaatta
ttcaaatttatggaatcaattataaagatgattaaattcgtattgaccaatggtgatgat
aatttctcattcatgatcttggagagattcttaattcaattattaccaagtttggtcaaa
caaggtatttcattggttcaaatctttaaattattcttggattcgttctcttcaattcca
aagaaattccgtttacaattattcaattgtatttgtcaatcggtcgcttataaacagtta
catatattgtttagtttaattcttacaaagaagattcaagatttacgtattatcactaat
aaattgaaacatttagataaagataccataatgagctctgatgaacaaattaaagaagag
atcgattatgaacaattcaatgaattcatttcacaattctctgatcaaattccagtattg
gaaatgtcaacaagtttaggaagcctttgtcaatctattaatttaatctcaattgagtct
ggtaattgtgttgaagcgctatcagaagaggaggaagagatttgttcattactttcacgt
aataattcaaaggataatcgtttacttcaagccaatacattggatttcatttgtgaacgt
ttatcatcaaaactttatttggacagtttcagtttcgatttaactagtcaacaaaaagaa
ctcgtcgaaactaaatatctcggagcatttgaaaatcttttaatccttttgaaaaagacc
actgaatatagcgagaaaacatcaaatatcaaacttaatggtagtgccaatagtattagt
attgcaagtggtaaggataaattcataaagaaacttttatcctcaattaatctttgtatg
gatcgttatggtcaattacttagtgtcaaaggtttcattagtacaatcactcaattactt
aatcatagtgatagtaatgtacgtcgtcgttcattggttatctttaatgagaagattaca
ttggtcaaggatgatctcactcaagaccaagtcaatcaattcctctcactcattgattcg
ttcactcgtatcatcgatagtcaaaatgaaactgaaaccaataaacaaacatcactcttg
tcatttgaaattttagcacgtaatttctcgactaccaatgccaccgctttcctctcacaa
attccaatcatcattaagtccatgggtcatagcagtcatcaagtggtttcctcatctttg
atttgtatcgctacactttgttgtgaactccaagcaaagaccataccatacattccacag
ttcttccctgtcttattgaataccctcactggtagctataaaaccaacgttgaagaagag
aatgaaactcgtactctcttacaaattagttgtatcagttcattggagatgatgttgaat
acaatttcaaaattcctttcaccttatttaccacaattgttaaatgcattacttcatcca
cgtctcacaagtaatagtatgttatctggtaaattgtttgctcaagttaaacgtttatta
aatatcttaacaaagaatgtagaattccgtctcttattacctgcaatgttttctgcttac
gaatttgccgttcaatctgaaaatgatttatctttgatttgcttattcgatttcgttggt
gatatctctgcaaatttaggtccaaaagatattgcactccatcataagagtatctttaaa
ttctatttacaatgctttgaattccgtaagaaatataaaaatcgtgtaaagaatgctgat
aaagttgaagatcatatcattagttctttcatgacattagttatgaaattaaatgaaaac
cttttcaaaccattatttattaaagttttagattgggcattaaatattcaaaatggtcaa
caaaatggtaaacatactgatgatgatgatgaagaaaatggaagtgatgatgaagaaagt
gatgaagataaaccaaagaaaaagaaattggtgaatggtaaatcaaaatcaacgaaaact
caaccagagatttcaaaagataatttattattcttttataaaattgtaaattctttagca
tcaaacttaaaaactatttttgtaccatactttggatacttttttgatgattcaattcgt
caacttcaaaatatatatagtaatattccattttcacaacaaccacaacaacaaccacaa
caaccaactgtaaatgataacaccaccatcacacttttaaacaataataataataataat
aataataatataaataataagagaaagaagaatcaaaatataacgaatacaacaaccact
aacaataatagtaataataatttaaataatagtaataataataatattgatcaagatgaa
tcaattttatgttttgtaatttcagcattagagaaatgttttatgtatgatactgatgga
tttttagataaacaaaagtttgaacaaattttaccagcacttgttaatcaattagataat
caaatgggtacagttgaaagttataaattaagagtttcacgttacatcgccccaaccatc
actcaattggctgttgttatcaatcaagatctcttatggaaacatttgaatcatacagtt
ttaatgaaaacaagatcaccttattcaatcgttcgttactcttcaatggttgtagttcaa
tcacttcacaagaagatgggtgaacaactcttaatccttttaccagaaacaattcctttc
atctctgaattattagaagattcagttccagaagttgaacaaataactcaagatgtcgtt
aaaattattgaaactcatcttggtgcagaagaatcaatttcttcttatttataa
DBGET
integrated database retrieval system
