Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287379
Help
Entry
DDB_G0287379 CDS
T00245
Name
(RefSeq) RabGAP/TBC domain-containing protein
KO
K20242
ecotropic viral integration site 5 protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0287379
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Rab11 associated proteins
DDB_G0287379
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank
Ank_2
RabGAP-TBC
Ank_4
Ank_3
RabGap-TBC_2
Ank_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626109
NCBI-ProteinID:
XP_637278
dictyBase:
DDB_G0287379
UniProt:
Q54KE5
LinkDB
All DBs
Position
5:233763..237245
Genome browser
AA seq
1076 aa
AA seq
DB search
MADAAIVSDIYIEKMSNTDYSTSSTTTSDTTDLTISTDSFSMPQQQQQQPIPIPIPIPIP
IPILNNGNNSTTATTQAINNNLNLNNNLIGSPKRLLSSQSLSSQQLQSPSAPQQPKTYPL
HEAAYKGEYDRLVSLILFTQGKISASIKSPSGSPQSSRHNHHNHHHTPTSPSSQNSSSGS
SSSNNNSNGSLNQHYQQDFTGINSLDDKGTTALHHAAFNGHKQCVKLLLASNAYTDVPDI
DGCTPLHNAAFNGYKTVMQLLLDAGADVNSHDIDFNTALHKTSFTGYHKCAELLIERGSQ
VEARDNHGITPLIKSASSKNFKCLSVLIERGGANVNSKDNSNSSALHQACYKGSDRSVSL
LIQKGAEVNCFDKEGYTPLHNAVFNGFEECAKILLDKGANPDQRALDGCSPLHYAASNGF
EGCLNLLIRRNCKLDITDVKRGRTALHYAANKGHIGCVEILLRAGADSNIKDLSNKTPKN
LTKDLQIISLLSTPIEELKKHKKSKKGNSKVNSPVYQSPRIDGAPQQQTTTTTTTTTTTT
TTTSNQSPLSQQQLLVESLSSSSSNIQEDKNLSQQIPTPTITTTQPPQQPQQQQPQQTPP
QQYIISVESNVHSPSSLSMTKEEGSIQHSPLQSQSSPTDDGSSFHSRTPSTDSISTVTTT
MSNLTTSSATAILANANSNNNNNNHNNHNNTTPNNNNTTSSSSSNNNNNNTNSNSTTTTT
TSSLNNSTSPDTTLKLDKYGFVKGNNPNGGLNDEEVKTKKMEKIEKKWVKLIKFEVSFTS
HKIRERLPKGIPSSVRGMAWKKLFETTSIKNKAKVTYAELLTKPLPQGIHIQIQKDLDRT
FPKHSFFQEKGGMGQQILSNILTAFSIYNPEVGYCQGMGFITCLLLIYMAEEDAFWSLIQ
LTERYGMSEMWKPDFPYLQTCFSILDNLLEAHFPQLFLHFQKQNVFTPLFASQWFICLLI
YNLPFSYIVRIWDLFLYDGLVIIFASCLSLFKIYEDHLLKMEFEEIVNLLKFSNGEDKNI
KADVSTFMKLVVHYRSKIRHTIKDGLIKDPNEHRINNNNNNSTISNNGNNINNNHH
NT seq
3231 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagatgcagccattgtatcagatatttatatagaaaagatgtcaaatacagattat
tccacatcaagtacaacaacttctgatacaacagatttaactatctccacagatagtttt
tcaatgcctcaacaacaacaacaacaaccaataccaataccaataccaataccaatacca
attcctatattaaacaatggtaataattcaacaacagcaacaacacaagcaattaataat
aatttaaatttaaataataatttaattggatcaccaaagaggttattgtcaagtcaatca
ttatcatcacaacaattacaatcaccaagtgcaccacaacaacctaaaacctatccatta
catgaagcagcatataaaggtgaatatgatagattggtttcattgattttatttacacaa
ggaaaaatatcggcaagcattaaatcaccttcaggttcaccacaatcttcacgtcacaat
catcataatcatcatcataccccaacctctccatcatcccaaaatagcagtagcggcagc
agcagcagcaataataatagtaatggatcattaaatcaacattatcaacaagattttaca
ggtataaatagtttagatgataaaggtacaacagcattacatcatgctgcattcaatgga
cataaacaatgtgtaaaattattattggcaagtaatgcctacactgatgtacccgatatt
gacgggtgcacaccacttcacaatgcagcattcaatggatataaaacggtgatgcaattg
ttattggacgcaggtgccgatgtaaattcacacgatatagatttcaatacggcattacat
aaaacatcattcactggttatcacaaatgtgctgaacttttgattgaacgtggttctcaa
gttgaggcaagggataatcatggtatcactccattaattaaaagtgcttccagtaaaaac
tttaaatgtctatcggttttgattgaacgtggtggtgcaaatgtaaactcaaaagataat
agtaatagcagtgcacttcatcaagcttgttacaaaggtagtgatcgttcagtctcactc
ttaattcaaaaaggtgccgaagtcaattgtttcgataaagaaggctacacaccattacat
aatgcagttttcaatggctttgaagaatgtgcaaaaattctattagataaaggtgcaaat
cctgatcaaagagctttagatggttgctctcctttacattatgctgcttcaaatggtttc
gaaggttgtttaaatttattaattcgtcgtaattgtaaattagatataactgatgttaaa
agaggtagaacagcattacattatgcagcaaataaaggtcatattggttgtgttgaaata
ttattaagagcaggtgcagattcaaatattaaagatttatcaaataaaactccaaaaaat
ttaacaaaagatttacaaatcatatcattactttcaacaccaattgaagaattgaaaaaa
cataagaaatctaaaaaaggtaatagtaaagttaattcacctgtataccaatcaccacgt
attgatggtgctccacaacaacaaactactacaactacaactaccactacaactactaca
actacaacatctaatcaatcaccattatcacaacaacaattattggtggaatctttatca
tcatcttcttcaaatattcaagaggataagaatttatcacaacaaataccaacaccaaca
ataacaacaactcaaccaccacaacaaccacaacaacaacaaccacaacaaacaccacca
caacaatatattatttcagttgaatcaaatgtacattcaccatcatcattatcaatgaca
aaagaagagggatcaattcaacattcaccattacaaagtcaatcatcaccaactgatgat
ggttcatcatttcattctagaacaccatcaactgattcaatttcaacagttactacaaca
atgtcaaatttaacaacaagtagtgcaactgcaattttagcaaatgcaaattcaaataat
aataataataatcacaataatcacaataatacaactcctaataataataatacaacttct
tcttcttcttctaataataataataataatacaaattcaaattcaacaactacaactaca
acatcatcattaaataattcaacatcaccagatacaacattaaaacttgataaatatgga
ttcgttaaaggtaataatccaaatggtggattaaatgatgaagaagttaaaaccaaaaag
atggaaaagattgaaaagaaatgggttaaattgataaagtttgaagtttcattcacatct
cataagattcgtgaacgtttaccaaagggtataccaagttcagttcgtggtatggcatgg
aaaaaactatttgaaactacatcaatcaaaaataaagccaaagtaacctatgcagagtta
ttaaccaaaccgttaccacagggaattcatattcaaattcaaaaggatttagatcgtaca
ttcccaaagcatagtttctttcaagagaaaggtggaatgggtcaacaaattctttccaat
attttaacggctttttcaatctataatccagaggttggctactgtcagggtatgggtttc
atcacatgtttactcttgatttacatggcagaggaggacgcattttggtcactcattcaa
ctcaccgaacgttatggaatgtctgaaatgtggaaaccagatttcccttatcttcaaact
tgtttcagtatattggataacctattggaggcgcatttccctcaattgtttttacacttt
caaaagcaaaatgttttcacaccacttttcgcctctcaatggttcatttgtcttttgatc
tacaatttacccttctcctatatcgtccgtatttgggatctcttcctctatgatggactt
gtaattatatttgcctcttgtctttccctctttaaaatctacgaagatcatctcttgaaa
atggagtttgaagagattgttaacctcttaaaattctcaaatggtgaagataaaaatatt
aaagccgatgtttcaacctttatgaaattggttgtccattatcgaagtaaaattagacat
acaatcaaagatggtcttattaaagatccaaatgaacatcgtataaataataataataat
aatagtacaatttcaaataatggtaataatattaataataatcatcattaa
DBGET
integrated database retrieval system