Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287801
Help
Entry
DDB_G0287801 CDS
T00245
Symbol
ncstn
Name
(RefSeq) gamma-secretase subunit
KO
K06171
nicastrin
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04519
Cadherin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04519 Cadherin signaling
DDB_G0287801 (ncstn)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ncstrn_small
Nicastrin
Peptidase_M28
DX
DUF7107
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626320
NCBI-ProteinID:
XP_637065
dictyBase:
DDB_G0287801
UniProt:
Q54JT7
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(<721592..>724251)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MKIKNYFIIVFIIIVLSTDVISSQSSIEDKMYTSLNSYPCTRIMTLNGQIGCSSSHGGDS
GILYLIDSDESYHNYFSYNQQKDIIVVFDSNYFNKTLVLEMYSKKKMNGALVLTDIGKTY
PYSPEDQYPIKQFGLYPDSNLNWNPNGDGFTYMNFPFPMFALELKTSIIIRNLSTINRDG
KYPAYGAELDSFMQGAINAETCLRRGFCEPVGGQSIWSSFSEVIDQSKPIILVMLPIDAT
AFFRDLATGTDQSGYALTVLLSMLNTLQGVDKTKWDKEVIFAMWNSERWGYVGSTNFVND
LLNFNCTSLDSNNQNSCSSPPMLDLTFEQIKFENIYAIIEFNQIGRPVNSGKKTPNKLDI
YNLVFHPNGGAGANQLMDVFSQSTQSYENSTIQFQKTTQNELPPCSSMSFIKEINKKSAP
NFIGTLVITDHDYQYNNPYFGDEQDNSGNINTTTSTLFDMVQVFSKSIDLLAGGNGTVKV
DDLFIREINVCLTQSITCNWVTKLMSTFPYNPIPNFYSGVYGVSPVNHITPIETRFIFRM
ATYLTQHRTNATNCTSDNDCDTSSSICVNKVCLYSNTHYHNAISLAFSFDNSKSSWTIVN
TSYPVFVESNWDYTTVRLFQVGSYANEIWFLVSGLIELLLSVGIIFYIKKYLSKRYKLL
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagattaaaaactattttataatagtttttataataatagttttatcaacagatgta
atatcatctcaatcatcgatcgaggataaaatgtatacttcattaaatagttatccatgt
actcgaattatgacattgaacggacaaattggttgttcatcatcacacggcggtgatagt
ggtattctttatttaattgatagtgatgaatcttaccacaattatttttcatataatcaa
caaaaagatattattgtagtatttgattcaaattattttaataaaacattagtattagaa
atgtattcaaaaaagaaaatgaatggcgcattagttttaacagatattggaaaaacatat
ccatattcaccagaggatcaatatccaataaagcaatttggactttatcctgatagtaat
ttaaattggaacccaaatggtgatggttttacctatatgaattttcctttcccaatgttt
gctttggaattaaaaacttctattattattagaaatttatcaacaattaatagagatggt
aaatatccagcatatggggcagaattagatagttttatgcaaggagcaattaatgcagag
acatgtttaagaagaggattttgtgaaccagttggtggacaaagtatttggtcatcattt
tcagaggtaattgatcaaagtaaaccaattatattagtaatgttaccaattgatgcaact
gcattctttcgtgatcttgcaactggtacggatcaatctgggtacgcattgacagtttta
ttatcaatgttaaacactttacaaggcgtcgataaaaccaaatgggataaagaggtaatt
tttgcaatgtggaattcagagagatggggttatgttgggtcaactaatttcgttaatgat
ttgttgaatttcaattgtacatcattggatagtaataatcaaaattcatgttcatcacca
ccaatgttggatttaacttttgaacaaatcaaatttgaaaatatctacgcaatcattgaa
ttcaaccaaataggtagaccagtaaatagtggtaagaaaactccaaataaattagatatt
tataatttagttttccatccaaatggcggtgctggcgctaatcaattaatggatgtattc
tcccaatctactcaatcctacgaaaatagtacaattcaattccaaaagacaactcaaaat
gaactaccaccatgttcaagtatgtcttttattaaagagataaataaaaaatcagcacca
aactttattggtacccttgttatcaccgatcatgattatcaatataataatccatatttt
ggtgatgaacaagataattctggtaatatcaatacaacaacatcaactctctttgatatg
gttcaagtattctcaaaatcaatcgatttattagctggtggtaatggtactgttaaagtt
gatgaccttttcattagagaaattaatgtttgtttaactcaatctattacttgtaattgg
gtaacaaaattaatgtcaacttttccatataatccaattccaaatttttattctggtgtt
tatggtgtaagcccagtaaatcatattaccccaattgaaacaagattcatttttagaatg
gctacctatttaacacaacaccgaacaaacgctaccaattgtacaagcgacaatgattgt
gatacttcaagtagtatatgtgtaaataaagtttgtttatattcaaacactcattatcat
aatgcaatttcattagctttttcatttgataactcaaaatcatcatggacaattgtaaat
acttcatatccagtttttgttgaaagcaattgggattatactacagttagattattccag
gttggttcatatgcaaatgaaatttggttcctggtatctggtttaatagaattactttta
tcagttggaataattttttatattaaaaaatatttatctaaaagatataaacttttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
