Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0288449
Help
Entry
DDB_G0288449 CDS
T00245
Symbol
rpc2
Name
(RefSeq) RNA polymerase III, second largest subunit
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
DDB_G0288449 (rpc2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ddi03021
]
DDB_G0288449 (rpc2)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
DDB_G0288449 (rpc2)
Transcription machinery [BR:
ddi03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
DDB_G0288449 (rpc2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_3
Intein_splicing
RNA_pol_Rpb2_5
Hint
PT-HINT
TFIIA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626608
NCBI-ProteinID:
XP_636731
dictyBase:
DDB_G0288449
UniProt:
Q54IZ9
LinkDB
All DBs
Position
5:1494028..1499084
Genome browser
AA seq
1608 aa
AA seq
DB search
MDPESVGYCNNPDFLHKGSMDELYNISKLTDDIKPVEEKWKLVPAFMKCRGLVKQHIDSF
NFFINVEMKKIVKANERLTAENDPSYFVRFTDINVGSPTSTEDNLDSVQLTPQRCRLRDM
TYSAPIFVNIEYTRNKQIISKRDVHIGNIPIMLRSSNCVLSKKTPEQMAALGECPMDPGG
YFIVRGQEKVILNHEQLSKNRIIIEMDSKGLPSASVTSSTHERKSRTGVTLKNEKLYLKH
NTFGEDIPVAIVLKGMGVETDQEMAQLVGSDDVFLNAITPSLEECQKCGVHTAAQALDYL
GSRIKVFRRPYGVQNKKTKSEEARDILAGVVLNHVPVRRYNFRLKVIYLSLMIRRIIMAS
KDKSCLDDKDYYGNKRIELSGQLISLLFEDCFKKFQSELKKSVDQAIAKANRAENLDLPK
LIRTDTITNGFTHAISSGQWNLKRFRMERSGVSQVLSRLSYISCMGMMTRIQSQFEKTRK
VAGPRSLQPSQWGMLCPSDTPEGEACLHPDTIITMSNGQQKPIRQLKDGDSIITLDPITM
EAHSTRIYSHFIKSSSQYGKQLLKITTITGKEIICTNDHRFLTSNGNWKQSKDLLLNDKL
FLISSSNQLEFNNNNNENNNENNNDIIEILNENQLINQGVVPIKIIQELKSIELLPLLNN
NEKLITISRIIGSIDKIGSNKQNEPIIQYQFNLISDFDQFLKDLQYLGFINPIYKLNEEQ
QQQQQQKIDHQQQQQQQVEQQQKSIIIDFIGSSFGYFIQSLLNEKNWIEKSNNQFVKKEF
LSSFISNVNRIQFNIIEEINQQNNDSNFKILLNYKQQKQQQNEKEERAVVDHDNEIFNIK
SLQILLNQFNVISSIDFEESNLIIINSSLKKFIDLINIKFNQKLNNQIIQIREYLNYINY
NNNNNNNEEINIKKKDFGYFKKLKIKRNSFEIEIEKIEQLNYQDCPEISDFTTESDYHSM
ISNGFVSHNCGLVKNFALMSHVTTDDSEGPLLRLAYNLGVQDILLVTGEELNSRNAYLVL
LNGQIIGIHNSPDYFVTTLRKMRRAGRIREFVSICKNKAQQTISVACDGGRLCRPVIIVD
DQRPRLTQEHIEDLKDGLRTFDDFIREGIIEYLDVNEENDSFLAWREAAIQPWTTHLEIE
PFTMLGCVAGLIPYPHHNQSPRNTYQCAMGKQAIGAIAYNQLTRIDTLLYLLVHTQRPLC
QTRTIDLLNWYKLPAGHNATVAVMSYSGYDIEDALVMNKASLDRGFGRCIVLKKQVTSIK
KHGNDTSDRIFPPTPNDLRQPKYGLLDSDGIAKPGELAQKGQILVNKYSPLNTIDATPNP
ELIPDSAYKSSYMGYKYDNPAFIDKVLLTSGDDEQLLIKMLMRSTRRPELGDKFSSRHGQ
KGVCGIIVKQEDMPFSDLGICPDIIMNPHGFPSRMTIGKMIELLAGKAGVLSGKFGFGTC
FGGDRVENISKVLISKGFSYGGKDYVTSGVTGEPLACFIFFGPIFYQKLKHMVMDKMHAR
ARGPTVTLTRQPTEGRARGGGLRLGEMERDCLIGYGASALIMERLMISSDRFTVYACKNC
GFLGYEGYCQYCKSSVDISTIQIPYACKLLFQELQAMNIVPRLKLVDS
NT seq
4827 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccagaatcagttggatattgtaataatcccgactttcttcataaggggtcaatg
gatgaattatacaatatatcaaaattaacagatgatattaaaccagttgaagaaaaatgg
aaattagtaccagcatttatgaaatgtagaggtttagtaaaacaacatatagattcattt
aatttttttataaatgttgaaatgaaaaagattgttaaagcaaatgaaagacttacagca
gaaaatgatccttcatattttgtaagattcacagatattaatgttggatcaccaacatca
acagaggataatttagattcagttcaattaacaccacaaagatgtagacttagagatatg
acatattcagcaccaatctttgttaatatagagtatacacgtaataaacaaatcatatca
aagagagatgtacatattggtaatataccaattatgttacgtagtagtaattgtgtttta
tcaaagaaaacaccagaacaaatggcggcattgggtgaatgtccaatggatccaggtggt
tatttcatagttagaggacaagagaaggttattttaaatcatgaacagttatcaaagaat
cgtattatcattgagatggattcaaagggattgccatcggcatcggtaacttcatcaaca
cacgaacgtaaatcaagaactggtgtaacactaaagaatgagaaactctacttaaagcat
aacacctttggtgaagatataccagtggcaattgtgttgaaaggtatgggtgttgaaacc
gatcaagagatggcacagttggtggggtccgatgatgttttcctcaacgcaatcactcca
tcattggaggagtgtcaaaaatgtggtgtgcacactgccgcccaagcattggattatttg
ggtagtcgtattaaagttttccgtagaccttatggtgtgcaaaataaaaagacaaagtca
gaggaggctcgtgatattttagcgggtgtggtacttaatcatgtgccagtacgtcgttac
aatttcagattgaaggttatttatctctctcttatgattcgtcgtattattatggcatca
aaggacaagagttgcctcgacgataaagattactatggtaataaaagaatagagttatcg
ggtcaattgatatcactactctttgaagattgttttaaaaagtttcaaagtgaattaaag
aaatcagtggatcaagcaattgccaaagctaatcgtgcagagaatttagatttacccaaa
ttaattcgtaccgatacaatcaccaatgggttcacacatgcgatctctagtggtcaatgg
aatttaaaacgttttagaatggaacgttctggtgtatcacaagttttatcacgtctttcc
tatatctcttgtatgggtatgatgacacgtattcaatcacaatttgagaaaactcgtaaa
gtggctggtccacgttcacttcaaccatcacaatggggtatgttatgtccatccgataca
cctgaaggtgaggcttgtctacatcctgacacaataatcacaatgtccaatggtcaacaa
aaaccaatacgtcaattaaaagatggtgattcaatcatcactctagatccaatcactatg
gaagcacattcaactcgtatctattcacatttcattaaatcctcttcacaatatggtaaa
caattattaaaaataactacaatcactggtaaagaaatcatttgtacaaatgatcataga
ttcttaacttcaaatggtaattggaaacaatcaaaagatttattattaaatgataaatta
tttttaatttcttcatcaaatcaattagaatttaataataataataatgaaaataataat
gagaataataatgatataattgaaattttaaatgaaaatcaattaattaatcaaggagta
gtaccaattaagattattcaagaattaaaatcaattgaattattacctttattaaataat
aatgaaaagttaattacaatttcaagaattataggttcaattgataaaattggttcaaat
aaacaaaatgaaccaatcattcaatatcaatttaatttaatttcagattttgatcaattt
ttaaaagatttacaatatttaggttttataaatccaatttataaattaaatgaagaacaa
caacaacaacaacaacaaaaaatagatcatcaacaacaacaacaacaacaagtagaacaa
caacaaaaatcaattattatagattttattggtagttcatttggatattttattcaatca
cttttaaatgaaaaaaattggattgaaaaatcaaataatcaatttgttaaaaaagaattt
ttatcaagttttattagtaatgtaaatagaattcaatttaatattattgaagaaattaat
caacaaaataatgattcaaattttaaaattttattaaattataaacaacaaaaacaacaa
caaaatgaaaaagaagaaagagcagtagtagatcatgataatgaaatatttaatattaaa
tcattacaaattttattaaatcaatttaatgttatatcaagtattgattttgaagaatca
aatttaattataattaattcaagtttaaaaaagtttattgatttaattaatattaaattt
aatcaaaaattaaataatcaaattatacaaattagagaatatttaaattatataaattat
aataataataataataataatgaagaaattaatataaaaaagaaagattttggttatttt
aaaaaattaaaaattaaaagaaatagttttgaaattgaaattgaaaagattgaacaatta
aattatcaagattgtccagagatttcagattttacaacagaatcagattatcatagtatg
attagtaatggtttcgttagtcataactgtggtttggtaaagaattttgcattgatgagt
catgtaaccactgatgattcagaaggtcctttacttagattagcatacaatttaggtgta
caagatattctattggtaactggtgaagagttaaattcaagaaatgcatatttagtatta
ttaaatggtcagatcattggtattcataattcacccgattattttgtaactactctaaga
aagatgagaagagctggtagaattagagaatttgtttcaatttgtaagaataaggctcaa
caaactatttcagttgcatgtgatggtggaagattgtgtagacctgttattattgtagat
gatcaacgtccaagattaactcaagaacatattgaagatttaaaagatggtcttagaaca
tttgatgatttcattagagaaggtatcattgaatatttggatgtgaatgaagagaatgat
agtttcttggcatggagagaggcagctattcaaccatggacaacccatctcgagattgaa
ccattcacaatgttgggttgtgtagctggtttaattccatatccacatcataatcaatca
ccacgtaatacctatcaatgtgctatgggtaagcaagcaattggtgcaatcgcttacaat
caattgactcgtatcgatacattactctatctattggtacatactcaacgtccattatgt
caaacacgtacaatcgatctattgaattggtataaattaccagctggtcataatgccacc
gtggcggtaatgtcctactctggctatgatattgaagatgctttggtcatgaataaagcc
tcattggatcgtggtttcggtcgttgtatcgtattgaaaaaacaagttacctcaatcaaa
aaacatggtaatgatacatcggatcgtattttcccaccaactccaaacgatttgagacaa
ccaaaatatggtctcttggatagtgatggtatcgcaaaaccaggtgaactcgctcaaaaa
ggtcaaattttagtaaacaaatattcaccattgaataccatcgatgcaacaccaaatcca
gaactcataccagactctgcctataaatcaagttatatgggttataaatatgataatcct
gcattcatcgataaggtccttttgacaagtggtgatgatgaacaattactcattaaaatg
ttaatgagaagtactcgtcgtccagagttgggtgataaattctcttcacgtcatggtcaa
aaaggtgtttgtggtatcattgtcaaacaagaagatatgccattctctgatctaggtatt
tgtccagacattattatgaatcctcatggtttcccatctcgtatgactattggtaaaatg
attgaattgttggctggtaaagcgggtgtcttgagtggtaaatttggttttggtacttgt
tttggtggtgatcgtgttgaaaatatctccaaagtactcattagcaaaggtttcagttat
ggtggtaaagattatgttaccagtggtgtaactggtgaaccattggcatgtttcatcttt
ttcggaccaatcttttatcaaaaactcaagcatatggtcatggataaaatgcatgctcgt
gctcgtggtccaacagtaactctaacaagacaacctaccgaaggtagagcaagaggtggt
ggtcttcgtttaggtgagatggaaagagattgtctcattggttatggtgcttcagctctc
atcatggaaagattaatgatctcctctgatagattcacagtttatgcttgtaaaaattgt
ggtttccttggttatgaaggttattgtcaatattgtaagagtagtgtcgatatctcaaca
attcaaataccatatgcttgtaaattattattccaagaattacaagcaatgaatattgta
ccacgtcttaaactagttgattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
