Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289367
Help
Entry
DDB_G0289367 CDS
T00245
Symbol
agnE
Name
(RefSeq) argonaut-like protein
KO
K02156
aubergine
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
DDB_G0289367 (agnE)
Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
DDB_G0289367 (agnE)
piRNA pathway
DDB_G0289367 (agnE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piwi
ArgoL1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627106
NCBI-ProteinID:
XP_636288
dictyBase:
DDB_G0289367
UniProt:
Q54HL3
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(2710003..2713807)
Genome browser
AA seq
1200 aa
AA seq
DB search
MSNKNNRNSNDNEQDEDEEYDYCEFPNVDFDSSSEGSNISSFTPWVPKNRINFKNLIVDN
PNINEETSINPVNTNNNQKSPQKGKVLGLGNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNN
NNNNNNYNSNNNSNNNFNNNNYNNNFNNFNNNNKNTKFHKKNNFGNQYNSNYKNPIYDSP
NQFSDGRGISPRGRAKQSSNFSDPRSVNYNSNSPTNNRTNLNSPQRSPSQPILSTTIKPS
QYVYTPINAKLSPYITPKPTPTSTSTPTSTPTSTPTTPTIPNTTTTTTTTTTTTTTTATK
TATTSPSSLSSMKTGNTTKPINNNKETSKSNENNLLSLKKALLPPIKNTSEIGIIDITKE
NQDRNEDIIIEKRDPPKLKDELYFNLPKPTNATLEGIPAEKLPILTNYFKLSFDPNIKSI
YKYKIKSLPRVNPKHSQRVEIIQTLVNNYPDIFKNEAFKYDGDFITMYSQSSFSNFSTNI
KGYEISISFEREVLINNEHKDESNKRDMESITFLNILTKSFFASLGFVKLGRHFYSKIMN
PISEYGVDICNGYISSVHTVESGVAMLLDITSKAIRSKSVLERMKELNMDRNKCENELQG
KIIFTKYNNRHYRVNRIAWEKTIDDQLNIKIGVPPSPTTTNVQNSGVKNDSPNTTPNTTP
NTTPKSSSIFTTPMTFAQYYELNYSLNPPIKDKEQPLLEVIITRNFRKETIFLVPELCIQ
TGIPQLLNIQDELNLSNEIDNRTIINPKDRFEILNQFKSDLRLHKQIQSQLLKWGVSIGE
PIKIESSQYKAQVISNSNINYLSNVVWSLIGTKNDIESNQRNIDQLTRDYCHLPLPNSVI
KVPDKSSSNEYLNYFSQELDRNSGIELFIIILPENDHSFIYKSIKNLSLLRNRAVITQCI
KSSKIKDRLNLISKPIASQIIAKMGKFPWSIDPTIFSNIPENTMVIGIDVTHNPEISYSV
AAFVASTNNCHTQFYHKINIQPFLKEILDSDFIFTAMKDSMNAYRLSHPNNKYPELVIVY
RDGVADGMLKKVKEQEVDFIKKAITSINEKILLMYVIVKKNTNTRFLNLKDSTNPPNGTM
VSTGITNPFWYDFYLVCQNTSKKSKSSVRPTNYHIIHNDANIPVDSFQFFTFQMSNLFFN
INNSVRTPAPCNYAHNLAYFIGKYFQTPQKLNDTVSNKPIVENIPEIPSDENLFNKLYFL
NT seq
3603 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaataaaaataatagaaattcaaacgacaatgaacaagatgaagatgaagaatat
gattactgtgaatttccaaatgttgactttgactcatcctctgaaggttcaaatatatca
tcattcactccctgggttccaaaaaatagaataaacttcaagaatttaattgttgataat
ccaaatataaacgaagaaacctctattaatccagttaatacaaataataaccaaaaatca
ccacaaaaaggaaaagtattgggccttggaaataattcaaataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataattcaaataat
aataataataacaataattataactcaaataataattcaaataataactttaataataat
aattataataataattttaataattttaataataataacaaaaatactaaatttcataaa
aaaaataattttggtaatcagtataatagtaattataaaaatccaatttatgatagtccc
aatcaattttccgatggaagaggtatttctccaagaggtagagccaaacaatcaagtaat
tttagtgatccaagatctgtgaattataattcaaatagtccaactaataataggacaaac
ttaaattcaccacaaaggtcaccttctcaaccgatactatctacaacaattaaaccttca
caatatgtgtacactccaataaatgcaaaattatcaccatatataacaccaaaaccaaca
ccaacatcaacatcaacaccaacatcaacaccaacatcaacaccaacaacaccaacaata
ccaaatactactaccacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacggcaacaaaa
acagcaacaacatcaccatcatcattatcatcaatgaaaacagggaacacaacaaaacca
ataaataataataaagaaacatcaaaatctaacgaaaataatttattatctttaaaaaaa
gcattattaccaccaattaaaaatacatctgaaattggaataatcgatattacaaaagaa
aatcaagatagaaatgaagatattattattgaaaaaagagatccaccaaaattaaaagat
gagttatattttaatcttccaaaaccaaccaatgcaacattggagggcattccagctgaa
aaattaccaattttaaccaattatttcaaattatcgtttgacccaaatataaaatctatt
tataaatacaaaataaaatcattaccaagagtaaatccaaaacattcacaaagagttgaa
atcattcaaacattagttaataattatccagatatttttaaaaatgaagcatttaaatat
gatggtgattttattacaatgtattctcaaagttcattttcaaatttttcaacaaatatt
aaaggttatgaaatttcaatatcatttgaaagagaagtattaattaataatgaacataaa
gatgaatcaaataaaagagatatggaatctataacttttttaaatattttaacaaaatcg
ttttttgcttcattaggatttgtaaaattgggtagacatttttattcaaaaataatgaat
ccaatatcagagtatggtgttgatatttgtaatggttatatatcaagtgttcatacagtt
gaaagcggtgttgcaatgctattggatattacatcaaaagctattagatcaaaaagtgtt
ttagaaagaatgaaagaattaaatatggatcgtaataaatgtgaaaatgaacttcaaggt
aaaataatatttacaaaatataataatagacattatagagtaaatagaattgcttgggaa
aaaacaattgatgatcaattaaatataaaaattggtgttccaccttcaccaacaacaact
aatgttcaaaattcgggagtaaaaaatgattcaccaaatactacaccaaatactacacca
aatactacaccaaaatcatcatcaatatttacaacaccaatgacatttgcacaatattat
gaattaaattatagtttaaatccaccaattaaagataaggaacaaccattattagaggtt
ataataactagaaattttagaaaagaaaccatttttttagtaccagaattatgtattcaa
actggaatccctcaattattaaacatacaagatgaattgaacttaagtaatgaaattgat
aatcgtacaataataaatccaaaagatagatttgaaattttaaatcaatttaaatcggat
ctacgtttacataaacaaattcaaagtcaattattaaagtggggcgtttcaattggtgaa
ccaattaaaattgaatcttcacaatacaaagctcaagtaatttcaaattcaaatataaat
tacctatcaaatgttgtttggtctttaattggtactaaaaatgatattgaaagcaatcaa
agaaatatcgatcaattgactagagattattgtcatttaccattaccaaattctgttata
aaagtaccagataaatcaagttcaaatgaatatttaaattatttttcacaagaattggat
agaaatagtggtattgaattatttattattattttaccagagaatgatcattcttttatt
tataaatcaataaagaatttatcactactaagaaatagagctgtaataactcaatgtatt
aaaagttcaaaaattaaagatcgtttaaatttaatttcaaaaccaattgcaagtcaaatc
attgcaaaaatgggtaaattcccatggtcgattgatcccacaatattttcaaatatacca
gagaataccatggtcattggtatcgatgtaactcataatccagagatctcctattcagtg
gctgcatttgttgcttcaactaataattgtcatactcaattttatcataaaattaatatt
caaccatttttaaaagagattttagatagtgatttcattttcaccgcaatgaaagattca
atgaatgcctatcgtttatctcatccaaataataaatatccagagctggtcattgtttat
agagatggtgttgctgatggtatgttaaaaaaagtgaaagagcaagaagttgatttcatt
aaaaaagcaattacttcaatcaatgaaaagattttattaatgtatgttattgttaaaaag
aatacaaacacaagatttttaaatttaaaagatagtaccaatccacccaatggtacaatg
gttagcactggtattaccaatccattttggtatgatttttatttggtttgtcaaaataca
agtaaaaaatcaaaatcttcagttagaccaacaaactatcatatcattcataatgatgcc
aatataccagtggactcttttcaattttttacttttcaaatgtcaaatttattctttaat
ataaataatagtgttagaacacctgctccttgtaattatgctcataatttagcttatttt
attggtaaatattttcaaactcctcaaaaattaaatgatacagtttcaaataaaccaata
gttgaaaatatcccagaaataccatctgatgaaaatttatttaataaattatatttttta
taa
DBGET
integrated database retrieval system
