Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289447
Help
Entry
DDB_G0289447 CDS
T00245
Symbol
myoH
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K10357
myosin V
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04814
Motor proteins
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04814 Motor proteins
DDB_G0289447 (myoH)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ddi03019
]
DDB_G0289447 (myoH)
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0289447 (myoH)
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
ddi03029
]
DDB_G0289447 (myoH)
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04812 Cytoskeleton proteins [BR:
ddi04812
]
DDB_G0289447 (myoH)
Messenger RNA biogenesis [BR:
ddi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Factors involved in mRNA localization
Cargo complex
DDB_G0289447 (myoH)
mRNA cycle factors
P-body specific factors
DDB_G0289447 (myoH)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Others
Actin-binding proteins
Myosins
DDB_G0289447 (myoH)
Mitochondrial biogenesis [BR:
ddi03029
]
Mitochondrial quality control factors
Mitochondrial dynamics
Retention of mitochondria
DDB_G0289447 (myoH)
Cytoskeleton proteins [BR:
ddi04812
]
Eukaryotic cytoskeleton proteins
Actin filaments / Microfilaments
Actin-binding proteins
Myosins
DDB_G0289447 (myoH)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Myosin_head
DIL
IQ
Myosin_N
Zeta_toxin
AAA_22
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627161
NCBI-ProteinID:
XP_001733030
dictyBase:
DDB_G0289447
UniProt:
P54696
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(2840200..2846157)
Genome browser
AA seq
1771 aa
AA seq
DB search
MMIDNNCGKEKVWVPNPEKGWINGDLIKEIPGEGWLVRDENGKEIKIEKDELRMQNPVIQ
EGIDDMTSLSHLHEAAVIHNLIKRYEINSIYTYTGSILIAINPYTKLPIYSKEMIESFCD
QPVSKLAPHVYSIAESAYREMLNFQKNQSILVSGESGAGKTETTKFLLQYFAAMGEKGNG
VNTSLISEEDIVEGNNIETQVIKSTPILEAFGNSKTLRNDNSSRFGKFIEIHFDKIKGTI
VGAKLETYLLEKSRIVKPPENERGYHIFYQLIKGFNNSCCLKNSSNNNKDEDSSSSSNNN
IDDLKSLLKCKASDFNYLISSGCDSIDGVDDSQVFIKTENALKVMGLSNDELIGIYKILL
SILHIGNIEFEKGKEEDSSIIKYGNSSFGESFSDDDAGGYNPLEISCKLLGCSVDSLKST
FCSRKMKAGNESYTINHTVEQASQARDSLSMFLYSRLFDWLVVRINQSIDKIGTEKKDNS
FLFIGILDIYGFESFESNSYEQFTINYANEKLQNQFNHQIFKLEQLEYEKEKIDWSYIEF
SDNQECIDLIEKKPLGILSILDEESQFPKSTPSTLCTKLYNNHSKSKNFEKPRFSQTHFI
IDHYAGKVEYDTNLFLEKNKDFIISEQVSALESSNWKFLTNLFQILSKKMNGGGGTSGGG
GAGGNKASSSAAGKSTFKFTSVSSQFKESLNSLMTTINSTNPHYIRCIKPNTEKRANLFD
NVMVLHQLRCSGVIEQLRISRSGYPSRLVYDNFIKRYKLIVAKDFKNDDDSNESKEWNSI
LKETDLNSSNGGTNNQIELKRKGAELMINKLSIDISSVQFGLTKLFFKSGIIANLELLRS
QTMINSATFIQKIWRGYTDRKAYTSTKHSSIYFQSLIRSYLQQLEYNSMVEENSAIHLQS
LIRTNELEKQFNQLLSTTIHFQSLLRRLEDSKEFNTLMDRIKKIVKIQSLWRSNLAKKQL
KLLKAEAKSLTNVVAEKNKLASKLGDIQSKLDMESQLAQKIKNENEQLSSQFSNIQIEKE
KLQKDFGNINLEKEELLLKYSALESEYHQYKQQNELIISKLKQHINDLEEKQHQHSYKNN
EVVGNTSFEGSTTTNNGVTSPPKSSPASPIRNSINSNSDTTISGSSDDSIDNTDSLILSP
KQHKGEDRKRNHEISSISPPRSRETIGHDDDDNNVDVIPRRQFNELEKEYKELKQMDETH
KQYIESLKLQITQLEEKVKKSSSHPRSLLPGIPSNINDSPKVVYTKSSITNDNSSSHHQQ
QQQQHNISPSNSITSTTSPINMMDSNIKSLSYKDFTNSQEIDAQQQLHQYHLNNGTNPAT
STTNGSGNPLSQSSPTGSDKHIQQSTISDLVSALNFNNCQLESGKYLVDLIIKNHDSIVS
KYVPSEMGGIPEPAFILSRCFLKNIYDVDATVIGTPNSTNSGGGSGTGVLDPIETNVNIL
IYFCDKVEEVIYRDPKSNCSALCYWFSNFYTLFNIMETYNQDTKDQLSLNDQDKALIEKL
KITLQTMIVKAHKNVVKNITDYIQPILHKSLNDTTSEIDFMDPITNYLNQIQISLSLENC
YINNNLCKLLFEQLFSFINAMIFNEILLRKDLCCLRSSIPIKMNISELEHWVKLHHGKEW
SSSVCDKLRLLKEVVYILMIDKTQLQNDELRDEICPTLSIAQLKQLLTMYSPDVDSFEDP
IPLEILTSLMDSPKYNPDENILLDLSKIFTLKFINSNQTLSSSTSSENDLMATINLNALE
SVQYACDDLVSNIVKKNIEIVSLNNQKSIKK
NT seq
5316 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgattgataataattgtggtaaagaaaaagtatgggtaccaaatccagaaaaaggt
tggattaatggtgacttaataaaagaaatacctggtgaaggttggttagttagagatgaa
aatggaaaagaaattaaaattgaaaaagatgaattaagaatgcaaaatccagtaattcaa
gaaggaatagatgatatgacatcattatcacatttacatgaagcagcagtaatacataat
ttaataaaaagatatgaaattaattcaatttatacatatactggtagcatattgattgcg
attaatccatatacaaaattaccaatatatagtaaagaaatgattgaaagtttttgtgat
caaccagtttcaaaattagcaccacacgtttactcaattgcagaatcagcatatagagag
atgttaaattttcaaaagaatcaatcgattttagtatctggtgaatctggtgcaggtaaa
actgaaactactaaattcttattacaatatttcgcagcaatgggtgaaaaaggtaatggt
gtaaatacatcgttaatctctgaagaggatatagtcgagggtaataatattgaaactcaa
gttataaaatcaacaccgattctagaagcatttggtaattcaaaaacattacgtaatgat
aattcttcaagatttggtaaattcattgaaattcatttcgataaaataaaaggcacaata
gttggtgcaaaattagaaacttatttattggagaaatctagaattgtaaaaccaccagaa
aatgaaagaggttatcatatattttatcaattaattaaaggttttaataatagttgttgt
ttaaaaaatagtagtaataataataaagatgaagacagtagtagtagtagtaataataat
attgatgatttaaaatcattattaaaatgtaaagcatcagattttaattatttaatttca
agtggttgtgattcaattgatggtgttgatgattcacaagtttttataaaaactgaaaat
gctttaaaagtaatgggtttatcaaatgatgaattaattggaatttataagatattatta
tcaattttacatattggtaatattgaatttgaaaagggtaaggaagaagattcatccata
atcaagtatggaaattcatcatttggtgaatcatttagtgatgatgatgctggtgggtat
aatccattggaaatatcatgtaaattattaggttgttcagttgattcattaaagtcaacg
ttttgttcaagaaaaatgaaagctggtaatgaatcttatactataaatcatacagttgaa
caagcatcacaagcaagagattctttatcaatgtttttatattcaagattattcgattgg
ttagtggttaggattaatcaatcaattgataaaattggtactgaaaagaaagataattca
ttccttttcattggtattttagatatctatggttttgaatcatttgaatcaaattcttat
gaacaattcactatcaattatgcaaatgaaaaattacaaaatcaatttaatcatcaaatt
tttaaattggaacaattggaatatgaaaaagagaaaatcgattggtcatatattgaattc
tctgataatcaagagtgtatagatttaattgaaaagaaaccattgggtattttaagtatt
ttagatgaagaatctcaatttcctaaatcaactccatcaacactttgtacaaaattatat
aataatcattcaaaatctaaaaattttgaaaaaccaagattttctcaaactcattttata
attgaccattatgctggtaaagtggagtatgatacaaatttatttttagaaaagaataaa
gattttataatttcagaacaagttagtgccttagaatcaagtaattggaaatttttaaca
aatttatttcaaatcctatcaaagaaaatgaatggaggtggtggtacaagtggtggtggt
ggtgctggtggaaataaagcatcatcatcagctgctggtaaatcaacatttaaatttaca
tcagtatcatcacaatttaaagaatcattaaattcattaatgacaacaattaattctacc
aatccacattatataagatgtattaaaccaaatactgaaaaaagagcaaatctatttgat
aatgttatggtattacatcaacttcgttgtagcggtgtaattgaacaattgcgtataagt
agatctggttatccatcaagattagtttatgataatttcattaaacgttataaattaatt
gttgcaaaagattttaaaaatgatgatgattcaaatgaatcaaaggaatggaattcaata
ttaaaagaaactgatttaaatagtagtaatggtggtaccaataatcaaatagaattgaaa
agaaagggtgctgaattaatgataaataaattatcaattgatattagttcagttcaattt
ggtttaactaaattattttttaagtcaggtattattgcaaatttggaattgttaagatca
caaaccatgataaacagtgcaacctttattcaaaaaatatggagaggttacactgataga
aaagcttacacaagtactaaacattcttcaatttatttccaatcattaattagatcatac
ttacaacaattggaatacaattcaatggttgaagagaattctgcaattcatttacaatca
ttgattcgtactaatgaattggagaaacaatttaatcaattgttatcaacaactattcat
ttccaaagtttattacgtcgtttagaagattctaaagaattcaatactctaatggacaga
attaaaaagattgtaaagattcaatcattgtggagatcaaatttggcaaagaaacaattg
aaattattgaaagctgaagctaaatcattaacaaatgtagttgctgaaaagaataaattg
gcttcgaaattgggtgatattcaatcaaaattagatatggaatcacaattggcacaaaag
ataaagaatgaaaatgaacaattatcttcacaattttcaaatatacaaattgaaaaagag
aaattacaaaaagattttggtaatattaatttagaaaaagaagaattacttttaaaatat
tcagctttagaatctgaatatcatcaatataaacaacaaaatgaattaataatttcaaaa
ttaaaacaacatattaatgatttagaagaaaagcaacatcaacattcatataaaaataat
gaagttgttggtaatactagttttgaaggtagtacaacaacaaataatggtgttactagt
ccaccaaaatcatcaccagctagtccaattagaaattcaataaattcaaatagtgataca
acaataagtggcagtagtgatgatagtattgataatactgatagtttaatattatcccca
aaacaacataaaggtgaagatagaaaaagaaatcatgaaatttcatcaatttcaccacca
agatcaagagaaactattggccatgatgatgatgataataatgttgatgttataccaaga
cgacaatttaatgaattagaaaaagaatataaagaattaaaacaaatggatgaaactcat
aaacaatatattgaatcattaaaacttcaaattacacaattggaagaaaaagttaaaaaa
tcatcaagtcatccacgttcattattacctggtattccttcaaatattaatgattcacca
aaagtagtttatactaaatcttcaattacaaatgataatagtagttctcatcatcaacaa
caacaacaacaacataatatatcaccatcaaatagtattacaagtacaacatcaccaatt
aatatgatggatagtaatattaaatcattatcatataaagattttacaaatagtcaagag
attgatgcacaacaacaattacatcaatatcatcttaataatggtaccaaccctgctaca
tctactaccaatggtagtggtaatccattaagtcaaagttcaccaactggtagtgataaa
catattcaacaaagtacaatttcagatttagtaagtgcattgaatttcaataactgtcaa
ttggaatctggtaaatatttagttgatttaatcataaagaatcatgattcaatagtttca
aaatatgtaccatctgaaatgggtggaatacctgaacctgcattcattttatcacgttgt
ttcttaaagaatatttatgatgttgatgcaacagttattggtactccaaatagcacaaat
agtggtggtggcagtggtactggtgtattagatccaatcgaaaccaatgtaaacatttta
atttatttctgtgataaagttgaagaagtaatttatagagatccaaaatcaaattgttca
gcattatgttattggttttcaaatttctatacattatttaatattatggaaacttataat
caagatacaaaagatcaattatcattaaatgatcaagataaagcattaattgaaaaatta
aaaattacacttcaaacaatgattgtaaaagctcataaaaatgttgttaaaaacatcact
gattatattcaaccaatacttcataaatcattaaatgatacaacttcagaaattgatttt
atggatccaattacaaattatttaaatcaaattcaaatttcattatcattagaaaattgt
tatattaataataatttatgtaaattattatttgaacaattattttcatttataaatgca
atgatatttaatgaaattttattaagaaaggatttatgttgtttgagaagtagtatacca
ataaagatgaatatttcagaattggaacattgggttaaattacatcatggtaaagaatgg
tcttcaagtgtttgtgataaattaagacttttgaaagaggtggtttacattttaatgatt
gataaaactcaattacaaaatgatgaacttcgtgatgaaatttgtccaaccttatcaata
gctcaattaaaacaattactaacaatgtattcaccagatgttgatagttttgaagatcca
atcccattagaaattttaacatcactaatggattcaccaaaatataatcctgatgaaaat
atcttattggatctttcaaaaattttcactttaaaattcataaattcaaatcaaacttta
tcatcctcaacctcttctgaaaatgatttaatggctactattaatttaaatgctttagaa
tcagttcaatatgcttgtgatgatttagtaagtaatattgttaaaaagaatattgaaatt
gtttctttaaataatcaaaaatcaattaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system