Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289867
Help
Entry
DDB_G0289867 CDS
T00245
Symbol
pex1
Name
(RefSeq) peroxin 1
KO
K13338
peroxin-1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04146
Peroxisome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
DDB_G0289867 (pex1)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0289867 (pex1)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Autophagy
Pexophagy
Other pexophagy associated proteins
DDB_G0289867 (pex1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
PEX-1N
AAA_lid_3
AAA_16
AAA_14
NACHT
Mg_chelatase
NPHP3_N
CDC48_2
RNA_helicase
DUF2457
AAA_5
RuvB_N
TIP49
PEX-2N
IstB_IS21
TsaE
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627359
NCBI-ProteinID:
XP_636032
dictyBase:
DDB_G0289867
UniProt:
Q54GX5
LinkDB
All DBs
Position
5:3340420..3344303
Genome browser
AA seq
1227 aa
AA seq
DB search
MELHVQLKHSTDCFVSLPPKIVHSLLLLSEKQSKSLGTLGLEITWYDKINKKENKGYVGW
AGGSTDPRFTDSIEMSQEMAQCLGGIKNEQKLKLKALNNIELAHSVQVEPLTSDDWEIME
VHQQYLEEQLLNQVNILYSGQIVPIWIHHKTIIKLKVTETLPTPVVKLSSNSEIIVAPKP
RNLPTTTTSSQQQQISKETLKPRFLQIKDFKIDYNNNNTFINEIYINKELLNQFQWNIGD
IIEISKVSKNNNKNNKKEKNNNGGDEEEDDDDNEEFDDDDDDDNNNNEDDTSKLQKQLDN
KNNNNKKNKKNNKTIYARVFINDKSNNQQVLIHRNIRTIGNFYINTIVRLKYTTSHSLPI
CPIGSILVKQVIWKQNSLSNLIKQQSSQKIYSVEQIKEQIKVWSNNNLSNNQRYPLLNGS
IVSINSNLDLSFNFNNLTSSIIPPTSSSSSSPSNNLDSQRSNNNNNNINNDQLNDITNNM
NNPYLSSIQQIGDIMSNLNTNNNQNNQNNNSNKLMNQFQMNNGIFMLSLEILSNDKLLKI
ESGGNNSIEKKKSLEDYNEIGDRLFQRIGGMEKQIKQAKEFLSLYMYKDLSVIREQLNTP
GVNGMIIAGSHGSGKSLLATSLGGYYSTDSRSNAFIIKLDCNQLKELKVENIRKQFNKLF
YKSCKESGNTLSATTSTNTTPPPIIIILESLDLILGTPNDQDPGSKIRCEQLVSHIKSLC
FKYQNRSSPIVMIATVISSQSLCQSIQIPELFGLTIELQAPTREERVEILERYLKYQGKQ
LKDQQSLNLMKFSASMEGYLGCDVEQIVDRSIHLSSIKEIENNNNNNDDNDDDNIIEFSI
IEKAKEGYTPITLKGIKLHSSEIKWQDIGGLDSVRAMLKETIEWPTKYPKLFQSSPLRLR
SGILLYGPTGCGKTLLASAIAGECGLNFISVKGPELLNKYIGSSEQGVRDVFSRASSAKP
CVLFFDEFDSIAPRRGHDNSGVTDRVVNQFLTQLDGVEGLTGVYVLAATSRPDLIDPALL
RPGRLDKSLYCNIPEFNERLDILTCLKSKMNLSPSISLEQLSTNTQYYTGADLRALMYNA
QLKSIHEWMNHLEEEKKRKRKEKEDQSNKNSSQQQDDFIIFQPKNNDNSISKSNLTFEEK
TNLQKQIDTIKSQFINSNTSTLNKSNLSNEQPPLITQSHIDLALKESSPSISESERKKYE
RIYNNFLKERGSVTGNKKEGVPKQTLA
NT seq
3684 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagttacatgttcaattaaaacatagtactgactgtttcgtttcacttccacctaaa
atagtacattcactgttattattatcagaaaaacaatcaaaatcattaggtacattagga
ttagaaataacatggtatgataaaattaataaaaaagagaataaaggatatgttggatgg
gcaggtggatcaacagatccaagattcacagattcaatagagatgagtcaagagatggca
caatgtttaggtggtataaagaatgagcaaaaattaaaactaaaagcattaaataatatt
gaattagctcattcagttcaagttgaaccattaacatcagatgattgggaaattatggaa
gttcatcaacaatacctagaagaacaattacttaatcaagttaatattttatatagtggt
caaatcgtaccaatttggattcatcataaaactataattaaattaaaagttactgaaact
ttaccaacaccagtagttaaattatcttcaaattctgaaattatagttgcaccaaaacct
agaaatttaccaacaacaacaacatcatcacaacaacaacaaatttcaaaagaaacttta
aaaccaagatttttacaaattaaagattttaaaatagattataataataataatacattt
ataaatgaaatttatataaataaagagttattaaaccaatttcaatggaatattggtgat
attatagaaatttcaaaagtttcaaaaaataataataaaaataataaaaaagaaaagaat
aataatggtggtgatgaagaagaagatgatgatgataatgaagagtttgacgatgatgat
gatgatgataataataataatgaagatgatacaagtaaattacaaaaacaattagataat
aaaaataataataataagaagaataagaagaataataaaacaatttatgcaagagtattt
ataaatgataaatcaaataatcaacaagtattaattcatagaaatattagaactattggt
aatttctatataaatacaattgttagattaaaatatacaacaagtcattcattaccaatt
tgtccaattggttcaattttagttaaacaagttatttggaaacaaaattcattatcaaat
ttaataaaacaacaatcatcacaaaaaatatattcagttgaacaaattaaagaacaaatt
aaagtttggtcaaataataatttatcaaataatcaaagatatccattattaaatggttca
atagtttcaattaattcaaatttagatttatcatttaattttaataatttaacatcatca
attattcctcctacatcatcatcatcatcatcaccttcaaataatttagattctcaaaga
tcaaataataataataacaatattaataatgatcaattaaatgatataactaataatatg
aataatccatatttatcaagtattcaacaaattggtgatattatgtcaaatttaaatact
aataataatcaaaataatcaaaataataattcaaataaattaatgaatcaatttcaaatg
aataatggtatatttatgttaagtttagaaattttatcaaatgataaattattaaagatt
gaaagtggtggtaataattcaattgaaaaaaagaaatcattagaggattataatgaaatt
ggtgatagattatttcaaagaattggtggtatggaaaaacaaattaaacaagctaaagag
tttttatcattatatatgtataaagatttatcagtaatacgtgaacaattaaatacacca
ggtgttaatggtatgatcattgcaggtagtcatggtagtggtaaatcgttattggcaact
tcattgggtggttattattcaacagattcaagatcaaatgctttcattataaaattagat
tgtaatcaattaaaagaattaaaagttgaaaatataagaaaacaatttaataaattattt
tataaatcttgtaaagaaagtggtaatactttatcagcaaccacatcaactaatactacg
ccaccaccaataataataattttagaatcattagatttaatattgggtacaccaaatgat
caagatccaggttcaaaaattagatgtgaacaattagtatcacatattaaatcattatgt
tttaaatatcaaaataggtcaagtccaattgttatgattgcaactgtaatctcatcacaa
tcattatgtcaatcaattcaaataccagaattatttggattaacaatcgaattacaagca
ccaacaagagaagaacgtgttgaaatacttgaaagatatttaaagtatcaaggtaaacaa
ttaaaagatcaacaatcattaaatttaatgaaattctctgcttctatggaaggttattta
ggttgtgatgttgaacaaattgttgatcgttcaatacatttatcttcaattaaagagatt
gaaaataataataataataacgatgataatgatgatgataatattattgaattttcaata
attgaaaaagcaaaagaaggttatacaccaataacattgaaaggtataaaattacatagt
tcagagattaaatggcaagatattggtggattggattcagttagagcaatgttaaaggaa
actattgaatggccaactaaatatccaaaattatttcaatcatcaccattacgtttaaga
tcgggtattctattatatggtccaactggttgtggtaaaactttattggcatctgcaatc
gccggtgaatgtggtttaaatttcatctctgtaaagggaccggaattgttgaataaatat
attggttcatccgaacaaggcgttagagatgttttctcaagagcatcttctgcaaaacct
tgtgttttatttttcgatgaattcgatagtattgcaccacgtagaggtcacgataattct
ggtgtcactgatagagtggtaaatcaattcctcactcaattggatggtgttgaagggtta
actggtgtttatgttttggcagcaactagtagacctgatttaatagatcctgcactacta
cgtcctggtagattagataaatcattatattgtaatataccagagtttaatgaacgttta
gatattctaacttgtttaaagagtaaaatgaatttatcaccatcaatatctcttgaacaa
ttgtcaacaaatactcaatattacactggtgctgatttaagagcattaatgtataatgct
caattaaaatcaattcatgaatggatgaatcatttagaagaagaaaagaaaagaaaaaga
aaagaaaaagaagatcaatcgaataaaaacagttctcaacaacaagatgattttattata
tttcaacctaaaaataatgataattcaatttcaaaatcaaatttaacatttgaagaaaaa
acaaatctccaaaaacaaattgatactattaaatctcaatttataaattcaaatacctct
actttaaataaatcaaatttatcaaatgaacaaccaccattaataactcaatctcatatt
gatttggctttgaaagaatcttcaccatctatctctgaatctgaaagaaaaaaatatgaa
agaatttataataattttttaaaagaaagaggatcagtcactggtaacaagaaagaagga
gtaccaaaacaaacattggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
