Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289947
Help
Entry
DDB_G0289947 CDS
T00245
Name
(RefSeq) EGF-like domain-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3781
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627416
NCBI-ProteinID:
XP_636001
dictyBase:
DDB_G0289947
UniProt:
Q54GR8
LinkDB
All DBs
Position
5:3490340..3495445
Genome browser
AA seq
1563 aa
AA seq
DB search
MKNFNQIFLLFILIAVIAIGKSNSAKITSYSVISQSYYTENPNNPSETGCNTVFDLTFNY
EYGLNIIFTSVVSDEPNLVLLSSSTIVSNSTLSTFRLTSRIKVPGLVTATFTGKYNTNTN
SKIKGDIGITCLLQPTPTDLHISVPSNQSTPINRKGQNTFDVAILVGQPPTDSLNFKIKN
EVSSPFTLSYDQFSNNKFILKFELEYPTQITDNPSIEIEPQSTSGSTITKYKTFFVYPLI
KKSLNSNFINGAIYPTSSSTIESKEVFAYSTFQSLSDDGESVPTFFDGLGSMSVAFPVGS
SSSNSNFLAIIKPIRSSSYSNLTLLLTNENLVVSEFKPWIESKTLTFDNNNSPIVIGNYY
FSKLSWADATTGLPIDYKIDTLSKSVEQKYMPYWCIESFNSATYQTTFSHSLMVPNGFEA
STFNLMGVTFFNKTSHISYTSLPNSINSQPPVITDIILKSSSKVLGFSITSDQTFSHLII
NDKLIMTAINIVNGNLKNGYFELSINNNFIKSMSKSPFTIKTCNVLFSCSEFQYNSTDYN
TQFPSLSLPQYEKLSFSDIKSISFLKNDINTTNSIINNSIYLESDSINSLEADTILFKLD
DYNHNEFKAFSWNSQLNLFQCNFSIPANYYSGLIFYSILFDDYEYSYSSLLSLFGPSSTT
LRVSSTTPDMMPPIVASVTSKPSTTIVLSSSNYQQNEFGWDIVIEEGVNGFDHGEFNITS
KFDTIGYQFKFTQSDLVNGNLLKIRIKQPDIVCLTQEYSITSAYLVDKQGYKTSSSSSSS
SSSSSSSKSSKSEISALFKVSNSNQLTIKVQCPDSNGSGYNSTNIDSILPYLSSFSINSN
ISYMDIQNQVLSIAFQIKDNESGLSTRHNPTIYLEDTLGNIIFSTVGSGMVVLESSSHSR
SYKCNITLPFGFGFPGGVSVSIYGIVDKFMNAKGYSSTSLKQTVDIINGGDTSKFNPIVD
TPYNETSPLAPYIPQPIYNSQSKTLQFVIYGSFVGLKPSDIIVKVSKKKSTTNTPILIRT
LLSNSDDSDDGDFPYTVVEMTDSKVVLNVNITDAANDLDAESLDVSFLIGDQTPILYNIE
NPAIVTTSGASSTSLTTVTTGTSQTTSTSQTTGGTTNGASTTDGSATGDSTTSASTVTTS
PTSTTDGSQTTSPTSTTDGSQTTSPTSTSGDSTTSASTTTPTSTTTGGSSTATSTSSGGS
SSTSTSTSSSSSSVPDCSSLSNCGGSSQGNCVADNTCSCINSWIGVDCNSKPLKGVSINV
NPNAPSASLDQDDGSGVKLSSLINLYQIREIDSVTNKIIYQYDLQDKWVPVKQASPIPNT
FIYSNTLSNAKSSVIYAKIAIYDKQSTFEFAGQQYSINPNSIKFTINITNYKVDNVLNNL
ELIMQAQLNSSQTDDICSKKEVVKGSGSDQLSVQLNNKSLYCRFLNSALLDGVTVVNNLT
HVDLNSELQALVEPNSGQYYYGIVLPVFENFVLIDPDFSLLLQSNSVSSEDGLCTGGGGS
VKVLNGGQIAGIVIGGVAFVAIAGIAISTFVFRTHRFSSMTMSIRSWNAKRRHSKSFKLK
NFQ
NT seq
4692 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactttaatcaaatatttttattatttattttaatagcggttatcgctattggt
aaatcaaattcagcaaaaatcacaagttattcagttattagtcaatcatattataccgaa
aatccaaataatccatcagaaactggttgtaatactgtatttgatttaacatttaattat
gaatatggattaaatattattttcacatcagttgtatcagatgaacccaatttggtttta
ttatcatcaagtactattgtttcaaattcaactttaagtacatttagattaacttcaaga
attaaagtacctgggttagttactgccacatttactggaaagtataatacaaatacaaac
tcaaaaattaaaggtgatattggaataacatgtttactccaaccaacaccaactgactta
catatttctgtaccaagcaatcaatcaactccaattaatagaaaaggacaaaatactttt
gatgttgcaattttagttggccaaccaccaacagactcacttaattttaaaattaaaaat
gaagtatcatcaccattcacattatcatatgatcaattttcaaataataagtttatacta
aaatttgaacttgaatatccaacacaaataactgataatccatcaattgaaattgaacca
caatcaacaagtggttcaactattacaaagtataaaacattttttgtttatccattaatt
aaaaaatcattaaatagtaattttataaatggagcaatttatccaacatcatctagtaca
attgaatccaaagaagtctttgcatattcaacatttcaatctttatctgatgatggagaa
tcagtaccaacattttttgatggattaggatcaatgagtgttgcttttccagttggaagt
tcttcatcaaattcaaattttttagcaataattaaaccaattaggtcttcatcttattca
aatttaacattattattaacaaatgaaaatttagtagtttctgaatttaaaccatggatc
gaatcaaaaactttaacatttgacaataataattctccaatagttattggaaattattat
ttctcaaaattatcatgggcagatgctacaacaggattaccaattgattataagatagat
acattatcaaaaagtgttgaacaaaaatatatgccatattggtgtattgagtcatttaat
tcagcaacttatcaaactacattttcacattctttaatggtaccaaatggatttgaagca
tcaactttcaatttaatgggtgttacattctttaataaaacatcacatattagttataca
agtttaccaaattcaattaattctcagccaccagttatcactgatatcatattaaaaagt
tcatctaaagttcttggattttcaataacaagtgatcaaacatttagtcatttaatcatt
aatgataaattaataatgactgcaattaatattgtaaatggtaatttaaaaaatggttac
tttgaattatcaattaataataatttcataaaatcaatgtcaaaatcaccattcactatt
aaaacttgtaatgttttatttagttgttcagaatttcaatataattcaacagattataat
actcaatttccaagtttatctttaccacaatatgaaaaattatcatttagtgatataaaa
tcaattagtttcttaaaaaatgatattaatactacaaattcaataattaataattcaatt
tatttagaaagtgattcaataaattcattggaggcagatacaatattatttaaattggat
gattataatcataatgaatttaaagcatttagttggaattctcaattgaatttattccaa
tgtaattttagtataccagcaaattattattcaggtttaattttttattcaattttattt
gatgattatgaatatagttattcaagtttgttgagtttatttggaccaagttcaacaaca
ttaagagtttcatccactactcctgatatgatgccaccaatcgttgcttcagtaacatca
aaaccaagtacaacaattgtattaagttcaagtaattatcaacaaaatgaatttggttgg
gatattgttattgaagagggtgttaatggatttgatcatggtgaattcaatataactagt
aaattcgatacaattggttaccaatttaaatttactcaatcagatttagttaatggtaat
ttacttaaaattagaattaaacaaccagatattgtttgtttaacacaagaatattcaatt
acatctgcttatttagttgataaacaaggttataaaacatcatcatcatcatcatcatca
tcatcatcatcatcatcatctaaatcatctaaatcagagatctctgcattattcaaagtt
tcaaattcaaaccaattaacaattaaagttcaatgtccagatagtaatggtagtggttat
aatagtacaaatattgattctattctaccttatttatcatcattttcaattaattcaaat
attagttatatggatattcaaaatcaagttttatcaattgctttccaaattaaagataat
gaaagtggtttatccactagacataatccaactatttacttggaagatacacttggtaat
attatttttagtacagttggtagtggtatggttgtattggaaagtagctcacattcaaga
tcttataaatgtaatattacattaccatttggttttggtttccctggtggtgtttcagtt
tcaatctatggtattgtagataaatttatgaatgccaaaggttatagttcaacaagttta
aaacaaaccgttgacattattaatggtggtgatacttcaaaattcaatccaatcgttgat
acaccatacaatgaaacttctccattagcaccatatatccctcaaccaatttataattca
caatcaaaaactttacaatttgttatttatggttcatttgttggcttaaaaccaagtgat
atcattgttaaagtttcaaaaaagaaatcaacaacaaatactccaattttaataagaact
ttattatcaaatagtgatgatagtgatgatggtgatttcccttacactgtagttgaaatg
acagattctaaagttgttttaaatgttaatattactgatgcagctaatgatttagatgct
gaatctttagatgttagttttttaattggtgatcaaactccaattctttacaatattgaa
aatccagctattgtcacaacttctggtgcttcttcaacctctctaacaacagtaacaaca
ggcacttctcaaacaacaagtacttctcaaacaacgggtggcactaccaatggtgcttca
actactgatggttcagcaactggtgattctacaacatcagcatcaacagtaacaacatca
ccaacctcaactactgatggcagtcaaacaacatcaccaacctcaactactgatggcagt
caaacaacatcaccaacctctacctcgggtgattctacaacatcagcatctacaacaaca
ccaacttcaactacaacaggtggttcatctactgcaacatcaacatcaagtggtgggtca
tcatcaacatcaacatcaacatcatcatcatcatcatcagttccagattgttcaagttta
tcaaattgtggtggttcaagtcaaggtaattgtgttgcagataatacatgtagttgtatt
aactcatggattggagtagattgtaattctaaaccattaaaaggtgtatcaataaatgtt
aatccaaatgcaccaagtgcttcattagatcaagatgatggatcaggtgttaaattatca
agtttaattaatctttaccaaattagagaaattgattcagttacaaataaaataatttat
caatatgatttacaagataaatgggtaccagtaaaacaagcatcaccaataccaaataca
tttatttattcaaatacattatcaaatgctaaaagttcagttatttatgcaaaaattgca
atttatgataaacaatcaacatttgaatttgcaggtcaacaatattcaattaatccaaat
tcaattaaatttacaattaatattacaaattataaagttgataatgtattaaataattta
gaattgattatgcaagcacaattaaattcatcacaaactgatgatatttgttcaaagaaa
gaagttgtcaaaggaagtggttcagatcaattatcagttcaattaaataataaatcatta
tattgtagatttttaaatagtgcattattagatggagttacagttgtcaataatttaact
catgtagatttaaattcagaacttcaagcattggttgaaccaaattctggtcaatattac
tatggtattgttttaccagtttttgaaaactttgttttaatagacccagatttttcttta
cttttacaatcgaattcagtttcaagtgaagatggtttatgtacaggtggtggaggtagt
gtaaaagtattaaatggtggacaaatagctggtattgttattggtggtgttgctttcgtt
gcgattgctggtattgctatctctacctttgtttttagaactcatcgtttcagttcaatg
acaatgtcaatcagaagttggaatgctaaaagacgtcattcaaaatctttcaaattaaag
aatttccaataa
DBGET
integrated database retrieval system
