Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290067
Help
Entry
DDB_G0290067 CDS
T00245
Symbol
cigB
Name
(RefSeq) B-box zinc finger-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FNIP
zf-B_box
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627473
NCBI-ProteinID:
XP_635907
dictyBase:
DDB_G0290067
UniProt:
Q94481
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(3642812..3646457)
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MIYQNKLINTIITSSIDNDNKIISTILNNNNNSIIDKLTKLNEYKNQILKLDNQTINNIK
NSFESIFSFGYIPNDVTDNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNDNNNNNNNNNNDNDNDNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNNNNLKLNNSINKNKFIKMSDHDFYIY
SENDESSILSGDFESLAFKDNCNILSKLTKLPNKVLLLNGFNQKLTKGIIPEGVKELYIS
NIKQELIIDSIPNTVTTVGLCDGFNQKLTKGIIPEGVKVLYIGNIKQVLIIDSIPNNVTT
VGLCDGFNQKLTKAHKMKESEDIIINNQNRCTLHPNKNLEFLCLDCKFMPCCSLCTSRKG
EHHGHKTDSLESSASNIHSLINDFKDNIYPKLIERKENDQILLKESNETFKEIQSQNDDN
NNLLKNEFKQIHNILSFVELDIEKQLSTNLDQNILINTIITSSINNDNKIISTILNNNNN
SIIDKLNYFTQINNQQDNDDNDDCYQIDTDTIELIKQYQNSLLILKNSNNINNLTKLKEY
NNQILKFDNQTINNIKNSFKSIYSFGDIPNDAIDYNINNNNNNNNNNNNNNNNELNNSNN
KNEFIKILNHNFYIYSESDESSFLTDDFESLAFKDNCNILSKLKKLPNNVLLLSGFNQKL
TKGIIPEGVKVLYIGDIKQELIIDSIPNTVTTVGLWYGFNQKLTKGIIPEGVKELRLGDI
KQELIIDSIPSTLTTVILCDGFNQKLTKGIIPEGVKVLYIGDIKQELIIDSIPNTVTRVR
LLDGFNQKLTKGIIPESVKELHIGNIKQELIIDSIPNTVTTITLCDGFNQKLTKGIIPEG
VKELYIGNLKQELIIDSIPNTVTTVRLCDGFNQKLTKGIIPEGVKELYIRDIKQELIIDS
IPNTVTTVILCDGFNQKLTKGIIPEWVKGLCLGDIKQELIIDSIPNTVTTVRLLDGFNQK
LTKGIIPESVKELYIDDIKQELIIDSIPNTVTTVRLLDGFNQKLTKGIIPEWVKELHIGD
IKQELIIDSIPNTLNNVYIYKSCKKLIYSFVPVNVKIVNI
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttatcaaaataaattgataaatacaattataacttcttcaatcgacaatgataat
aaaataatttcaacaattttaaataataataataattcaattattgataaattaacaaaa
ctaaatgaatataaaaatcagatcttaaaactcgataatcaaacaattaataatattaaa
aatagttttgaatcaatattctcttttggttatattcctaatgatgttactgataatagt
aataataataataataataataataataataataataataataataataataatagtaat
aatgataataacaataacaataacaataataataatgataatgataatgataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataacaatagtaataataataataataataatttaaagtta
aataactcaatcaataaaaataaattcattaaaatgtctgatcacgatttttatatatat
tcagagaatgatgaatcatctatattgtctggagattttgaaagtttagcattcaaagac
aattgtaacatcttatcaaagctaacgaaattaccaaacaaagttttgcttctaaatgga
ttcaatcaaaaattaaccaaaggtataataccagaaggtgttaaagagttgtatatatct
aatataaaacaagaattaattattgattcaattcctaatactgtaacaactgttggctta
tgtgatggattcaatcaaaaattaaccaaaggtataataccagaaggtgttaaagtgttg
tatataggtaatataaaacaagtattaataatcgattcaattcctaacaatgtgacaact
gttggcttatgtgatggattcaatcaaaaattaaccaaagcacacaaaatgaaagaaagt
gaagatataattataaataatcaaaataggtgtacacttcatccaaataaaaatttagaa
tttttatgtttggattgtaaatttatgccatgttgcagtctttgtacgtctcgtaaaggt
gaacatcatggtcataaaactgattcattagaatcatcagcatcaaatattcattcatta
attaatgattttaaagataatatctatccaaaattaattgaaagaaaagaaaatgatcaa
atattattaaaagaatcaaatgaaactttcaaagaaattcaatcacaaaatgatgataat
aataatttattaaaaaatgaatttaaacaaattcacaatatactttcatttgttgaattg
gatatcgaaaaacaactatcaacaaacttagatcaaaatatattgataaatacaattata
acttcttcaatcaacaatgataataaaatcatttcaacaattttaaataataataataat
tcaattattgataaattaaattattttacacaaattaataatcaacaagataatgacgac
aatgatgattgctatcaaattgatacagatactattgaattaattaaacaatatcaaaac
tcattattaatattaaaaaatagcaataatatcaataatttaacaaaactaaaagaatat
aataatcaaatcttaaaattcgataatcaaacaattaataatattaaaaatagttttaaa
tcgatatactcttttggtgatattcctaatgatgctattgattataacattaataataat
aataataataataataataataataataataataataatgagttaaataactcaaataat
aaaaatgaattcattaaaatattgaatcacaatttttatatatattcagagagtgatgaa
tcatcctttttgactgatgattttgaaagtttagcattcaaagacaattgtaacatttta
tcaaaactaaagaaattaccaaacaacgttttgcttctaagtggattcaatcaaaaatta
accaaaggtataataccagaaggtgttaaagtgttgtatataggtgatataaaacaagaa
ttaataattgattcaattcctaatactgtaacaaccgttggtttatggtatggattcaat
caaaaattaaccaaaggtataataccagaaggtgttaaagagttacgtttaggtgatata
aaacaagaattaataattgattcaattcctagtactctaacaactgttattttatgtgat
ggattcaatcaaaaattaaccaaaggtataataccagaaggtgttaaagtgttgtatata
ggtgatataaaacaagaattaataattgattcaattcctaatactgtaacacgtgttagg
ttattagatggattcaatcaaaaattaaccaaaggtattataccagaaagtgttaaagag
ttacatataggtaatataaaacaagaactaattattgattcaattcctaatactgtaaca
actattactttatgtgatggattcaatcaaaaattaaccaaaggtataataccagaaggt
gttaaagagttgtatataggtaatttaaaacaagaattaattattgattcaattcctaat
actgtaacaactgttaggttatgtgatggattcaatcaaaaattaaccaaaggtataata
ccagaaggtgttaaagagttgtatataagagatataaaacaagaattaataattgattca
attcctaatactgtaacaactgttattttatgtgatggattcaatcaaaaattaaccaaa
ggtataataccagaatgggttaaagggttatgtttaggtgatataaaacaagaattaata
atcgattcaattcctaatactgtaacaactgttaggttattagatggattcaatcaaaaa
ttaaccaaaggtataataccagaaagtgttaaagagttgtatatagatgatataaaacaa
gaactaataatcgattcaattcctaatactgtaacaactgttaggttattagatggattc
aatcaaaaattaaccaaaggtataataccagaatgggttaaagagttacatataggtgat
ataaaacaagaattaattattgattcaattcctaatacattaaataatgtctatatttat
aaaagttgtaaaaaattaatttattctttcgtccctgtaaatgtcaaaatagtaaacata
taa
DBGET
integrated database retrieval system
