Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290181
Help
Entry
DDB_G0290181 CDS
T00245
Name
(RefSeq) HAT repeat-containing protein
KO
K14792
rRNA biogenesis protein RRP5
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0290181
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
DDB_G0290181
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_PRP39_N
HAT_PRP39_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_CNRKL1_C
Suf
TPR_14
S1
TPR_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627520
NCBI-ProteinID:
XP_635864
dictyBase:
DDB_G0290181
UniProt:
Q54GG4
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(3746723..3749553)
Genome browser
AA seq
909 aa
AA seq
DB search
MVEKVKKTATKPTTVTSTKKVITKPTTISPKSTTTSTTTKSIPKNEKIVNKKEINENDKF
KIGNKIEVCVKEIRDFEVITTFEDYIGKLHVCNIPLPDKEGESVLNSIKKGNTLNCFIVS
IEPTAKIITLTMFEQLKPQSKQFKVGQQVDAIVYGLTSVNEITCWISPTQIGTIEIISNF
KNISQFKSLKEKNTFVKCLIKSIGIDNKIYLSIGKESISNEKMKVGDIMIGLIKEVGNLS
IKVQLYNNLSGEVRLIDLNDELRTNPLSIYKTDTLIMVCVKSIGKEGILLSTYKSLLGLK
TWEMNPKYKHQRSVKRSITTDFTVGAQVWGFVIEKTQQIIRVELKGQLIAILQVEDVGPF
LLSSCDVGRLVRVVISSEPTIEGSLQVVKAHLHVDKTALTPKTIEVNDIIPLEIISIKNY
GLFVKNKKVSGLAHISELDDEPVDPEQIDKLYSVGEFVLGKCIGKEKNKEKGKTIFKFTL
KPEHFQSIDMEQYLKCNWDQEDPIEEIYQPLKPTKIISTLPIKSFLTQLSDLTTTINNNN
KNKNKLETIKEQEEEEEEEQVENKQDNDDDEFKSTSLINSILSKKRKEINDDEQIDEDEI
TDSKKKQKTEKNKNKNKLEQEIQEREDLLANNNVAPEGPQDFERMILGTPNSSYIWIKFM
SYYLGLSEINKAREIGERAIKKIIPTQVLEQRNIWIAMYNLENLYGTPDSLLKLFQRSIQ
YQDPKTMYLTIINILENTGKFERTEEYFKMLFKKDGKHSAKVWCRYGEFLLKCNNIEVFN
SILSRALEILPKKKQIKVINKFAQLEYKLGDIERGRTIFEGLVSNYPNRTDIWNIYLDME
LRDKESIKSSKELKEKIRMLFNRTIALKVSDRNIKQFFKRFLQFEKEFGSNFTTNEVKKL
AIKFVESNN
NT seq
2730 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtagaaaaagtaaaaaaaacagcaacaaaaccaactacagttacatcaacaaaaaaa
gttattactaaaccaactactatttctccaaaatcaactacaacatcaacaaccactaaa
tcaattccaaaaaatgaaaaaattgtaaataaaaaagaaattaatgaaaatgataaattt
aaaattggaaataaaattgaagtttgtgttaaagagattagagattttgaagttataact
acttttgaagattatattggtaaacttcatgtttgtaatattccattaccagataaagaa
ggtgaatcagtattaaattcaattaaaaagggtaatacactcaattgttttatcgtttca
attgaaccaactgcaaaaattatcactttaacaatgtttgaacaattaaaaccacaatct
aaacaatttaaagttggtcaacaagttgatgcaatcgtttatggtttaacctctgtaaat
gaaataacttgttggatttcaccaactcaaattggtacaattgaaattatttcaaatttt
aaaaatatttcacaatttaaatcattaaaagaaaaaaatacatttgttaaatgtttaatt
aaatcaattggtattgataataaaatttatttatcaattggtaaagaatcaattagtaat
gaaaaaatgaaagttggtgatataatgattggtttaattaaggaagttggaaatttatca
attaaagttcaattatataataacctaagtggtgaagttagattaatagatttaaatgat
gagctaagaactaatccactttcaatctataaaacagatacattgataatggtttgtgtt
aaatcaattggtaaagaaggtatattattatcaacttataaatcgttattaggtttgaaa
acttgggaaatgaatccaaaatataaacatcaacgttcagttaaacgttcaattactact
gattttacagttggtgcacaagtttggggttttgttattgaaaagactcaacaaatcatt
cgtgttgaattaaaaggtcagttgattgcaattttacaagttgaagatgttggtccattc
ttattgagtagttgtgatgttggtcgtttagtacgtgttgtaatttcaagtgaaccaaca
attgaaggttctttacaagttgttaaagcacatttacatgttgataaaactgcattaaca
ccaaaaacaattgaagtcaatgatattattccattagaaatcatttcaatcaaaaactat
ggtttatttgttaaaaataaaaaagtttcaggtttagctcatatctctgaattggatgat
gaacctgttgatccagaacaaattgataaattatattcagttggtgaatttgttttaggt
aaatgtattggtaaagaaaagaataaagaaaaaggtaaaacaatctttaaattcacttta
aaacctgaacattttcaatcaattgatatggaacaatatcttaaatgtaattgggatcaa
gaagatccaattgaagaaatttatcaacctttaaaaccaactaaaataatttcaacatta
ccaattaaatcatttttaactcaattatctgatttaacaacaacaataaataataataat
aaaaataaaaataaattagaaacaattaaagaacaagaagaagaagaagaagaagaacaa
gttgaaaataaacaagataatgatgatgatgaatttaaatcaacatcattaattaatagt
atattatcaaagaaaagaaaagaaattaatgatgatgaacaaattgatgaagatgaaatt
actgatagtaaaaagaaacaaaaaacagaaaaaaataaaaataaaaataaattagaacaa
gagattcaagagagagaagatttattagcaaataataatgttgcaccagaaggaccacaa
gattttgaaagaatgattcttggtacaccaaattcttcttatatttggattaaattcatg
tcttattatcttggattaagtgaaattaataaagctagagaaatcggtgaacgtgcaatt
aaaaagattataccaactcaagtattggaacaaagaaatatttggattgcaatgtacaat
cttgaaaatctttatggtacaccagattcattgttaaaattattccaacgttcaattcaa
tatcaagatccaaaaacaatgtatctcacaatcattaacattttggaaaacactggtaaa
ttcgaacgtaccgaagaatactttaaaatgcttttcaaaaaggatggtaaacatagtgca
aaggtttggtgtcgttatggtgaattcctcttaaaatgcaataacatcgaggttttcaat
tcaatcttatctcgtgcccttgaaattttaccaaaaaagaaacaaattaaagtcattaat
aaatttgctcaattggaatataaattgggtgatatcgaaagaggtcgtaccattttcgaa
ggtttggtttcaaattatccaaatagaaccgatatttggaatatctacttggatatggaa
ttacgtgataaagaatccatcaaatcaagtaaagaattaaaagaaaaaattagaatgcta
ttcaatcgtaccatcgctttgaaagtttctgatagaaatattaaacaattctttaaaaga
ttcttacaatttgaaaaagaatttggttcaaatttcactacaaatgaagttaaaaaatta
gctattaaatttgttgaatcaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
