Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290369
Help
Entry
DDB_G0290369 CDS
T00245
Name
(RefSeq) Arf guanyl-nucleotide exchange factor
KO
K18442
brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
DDB_G0290369
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0290369
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Endosome - Golgi transport
Arf GTPases and associated proteins
Arf GTPase associated proteins
DDB_G0290369
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sec7
Sec7-like_HUS
Sec7-like_HDS
DCB
BIG2_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627613
NCBI-ProteinID:
XP_635808
dictyBase:
DDB_G0290369
UniProt:
Q54G75
LinkDB
All DBs
Position
5:3976953..3983217
Genome browser
AA seq
1886 aa
AA seq
DB search
MDDSIALMFNNTLQKIYSQCSRKCIQLRESCKVAQDTIRDSPLFSASETKHDNKEYELLG
NKLFIAMKLACETKEPKIMIIALDCLDKMMLYGIIKANINDETSPPVNGEKKKLVESVVD
LIGSYFSFQNENVQLQIIKALLTSVTTPSCDVHDTCLMNSIKTSYNIYLVSTAKTVNCTA
ARSALFQMVDCVLQKFELVSQQKMHNPSPSSSSSSSSSSNTLLSNSNEEINTAYQSNLSD
VILLFRAFCKLSTKDIPDGLQPESHEMKSKLLSLELLSRILENPLPSLKLSEKFINSSIK
RYLSNSLLINGTNQHLPVFKLTLSLFLSLIIHFKEYLKEEIGLFFSKILLNVLSSTSCSA
KQKWLILPVLYEICKNPQTIVDIFVNYDCDPDRKDIFEKMVYELSRVAQGTITGDQRSST
SLDDQKFKTLGLECIVTIMKSLVDWSKELYQDSLISNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
TTTTTTTTSSSSSLNSSSDRNPTTKKRSSSNASNSEESTTTIDLSKLSPLEQGIYKFNQS
PKRGIEYLLKMKLVKETPEDIAQFIKSNTLTLEPKKIGEYLVQQNSFNFSVLFKYVELFN
FLSIPIDEALRNLLFGFLLHGENQCIDKIIEKFAEKYYHDNIGQESSVFSNAESVYLLSY
AIIILSTDLHNPSITTKLTKQEWIKMNSKINNKNDFEESFLFGIYDRLLKEPYKIINDDL
ALNSQDKLLRYNRESDYIAKQCQELIKAKLSKKSIFYKARNIEHVRPMFLLSWCYVLSTL
SVVLDDTKDRRVVQLCLEGFSYAIRVSCIFYMNVERSSFITSLSKFSLLDSIKEPTLKNI
ECVKTLLSIGISEGNYLQDSWTPILKAICILERFQLFNSVKQQILSSPNNIDNENNNNGE
SINIFSTTTTTSLTTTTYSSSSSPINNSPNTIINIVAGINNSPNLYIIENQIKRLIEENP
KELTFDSSIIERIFTNTSSLSDDSIVTFFRCLCEVSDDEINHYQRNYSLIKLVEVIEYNF
KRIRLVFYNIWEIVVQHFTKVGCNANIEIAQHAIDSLRQLANKYLEKQELTNYNFQNEFL
IPFQDIMKCNPSIIIKELVIRCVAQLSILKSKNIKSGWKTIINVFTLGSKVLNESIVQLS
FQGIDQLIQKNFQLIEDNFFINLIESCSSFSLPTVPYFEISIKSLELLLLLSKRLPTNST
TSSTSSLSTSTGLTISTIEKLLLPIIQGTSFAILHESEPVRKLSSALLFDLLNSRGSEFN
SEIWNRIIMKVITPIFQSIDLTKLNNEVTNNWLRQTFPILLNYLIDLFIQFNKELNQYYD
TFLTLLEPFICCWSELSVQVAIDYYANFISKCSPYFSNEFWCTSLIDSINRIIKKLLISK
SSPSSSSSSSSLSSLQQITSPLTNNNNNNNNNIPISAITPETPKKQNNNNNNNNNNINNN
NNCRSFSRTLLSLKPFLVIDEESSFIGKKMKSNVMKYEKTEPFLSIHNWNTIIKFQSLIN
KVYSELQLKVPIKFGVLLVKKWDLVFILSQRINSEQIFISHFGEQNTQNYECSTLSLLLS
LLFEMYIRPDTKKSSDSKNHEDYLQAKKRSKEVEDILSRFTIGILKENSLVVSNNLNNNN
NNNNVNSPITTTTSSSTSSSNTTTRIFNSTRMINIICQILQGFTRYNQKQFKKHQPSFFP
YCIDLSLHDNLQIRQSLSKLFERCKSDLPTIILSQSPPSPLTLDPIPTIGQKNNSQIQQQ
QQQEQQEQNLENASHYTVKDKVLIIEDNQNQNQNHNQNNNDDNITIKESNTSIEIIQADD
NDDDDNNNNDNNNNINEKRNDEDDNSNEIKQNDENEKIEIIQDDETEDLSNNTNNGISDD
FTPIETNENLTDIDGFVNINEEEDIL
NT seq
5661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgattcaatagcattgatgtttaataacacattgcaaaagatttatagtcagtgt
tcaagaaaatgtattcaattaagagaatcatgtaaagttgcacaagacactattagagat
tctccattattcagtgcatctgaaactaaacatgataataaagaatatgaacttttaggt
aataaattatttatagctatgaaattagcatgcgaaactaaagaaccaaaaataatgata
attgcattagattgtttagataaaatgatgttatatggaattattaaagcaaatataaat
gatgaaacttcaccaccagtaaatggagagaaaaagaaattggtagagagtgttgtggat
ttaattggatcatattttagttttcaaaatgagaatgttcaacttcaaatcattaaagca
ttattaacatcagtaacaacaccatcatgtgatgtacatgatacttgtttaatgaattca
attaaaacttcatataatatctatttagttagtactgctaaaactgtaaattgtaccgct
gctagaagtgcactctttcaaatggttgattgtgttttacaaaaatttgaattggttagc
caacaaaaaatgcataatccatcaccatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcaaat
acattattatcaaattcaaatgaagaaataaatacagcatatcaaagtaatttatcagat
gttatattattatttagagcattttgtaaattatcaacaaaagatataccagatggatta
caaccagaatcacatgaaatgaagagtaaattattatcattggagttgttgagtagaata
ttggagaatccattaccatcattaaagttatcagagaaatttataaattcaagtataaag
agatacctatcgaattcattattgatcaatggtaccaatcaacatttaccagttttcaaa
ttaacattatcattgtttttatcattgataattcatttcaaagagtatttaaaggaagag
attggtttattcttttcaaagattctattaaatgttttatcatcaacgagttgttcagcg
aaacaaaaatggttaattttaccagtactatatgaaatttgtaagaatcctcaaactatt
gttgacattttcgtaaattatgattgtgacccagatagaaaggatatctttgagaaaatg
gtttatgaactctcaagagttgctcaaggtacaattacaggtgaccaacgttcttcaact
tctttagatgatcaaaaatttaaaactttaggtttagaatgtatagttacaattatgaaa
tctttagttgattggagtaaagaattatatcaagatagtttaataagtaataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
actacaaccaccactaccactacatcatcatcatcatcattaaattccagtagtgatcgt
aatccaactactaaaaaaagatcatcatcaaacgcatcaaattcagaggaatcaacaacc
acaattgatctttcaaaattatcaccattagaacaaggtatatataaatttaatcaatca
ccaaaaagaggaattgaatatttattaaaaatgaaattagttaaagaaacaccagaagat
atagcacaatttataaaatcaaatactttaacattagaaccaaaaaaaattggtgaatat
ttagttcaacaaaattcatttaattttagtgtattatttaaatatgtagaattatttaat
ttcttaagtattccaattgatgaagcattaagaaatttattatttggatttttattacat
ggtgagaatcaatgtattgataagattattgaaaagtttgcagagaaatattatcatgat
aatattggtcaagaatcatcagtattttcaaatgcagaatcagtttatttattatcctat
gcaatcattatactttcaaccgatttacataatccatcaatcactacaaaattaacaaaa
caagaatggattaaaatgaattcaaaaattaataataaaaatgattttgaagaatcattt
ttatttggaatttatgatagattattaaaagaaccatataaaattataaatgatgattta
gcattaaattcacaagataaattattaagatataatagagaatcagattatattgcaaaa
caatgtcaagaattaattaaagcaaaattatcaaagaaatcaatattttataaagctaga
aatattgaacatgtaagaccaatgtttttattatcatggtgttatgtattatctacatta
tcggttgtattggatgatacaaaggatagaagagttgttcaattatgtttagaaggtttt
tcatatgcaattagagttagttgtattttttatatgaatgttgaaagatcttctttcata
acatctttatcgaaattctcattattggattcaatcaaagaaccaacattaaaaaatatt
gaatgtgttaaaactttattatcaattggtatttctgaaggaaattatttacaagatagt
tggacaccaattttaaaagcaatttgtattttagaaagatttcaattatttaatagtgta
aaacaacaaatattatcatcccctaataatatagataatgaaaataataataatggagaa
tcaataaatattttctcaacaacaactacaacatcattaactacaactacatattcatca
tcatcatcaccaattaataatagtccaaatacaattataaatatagtagcaggtattaat
aatagtccaaatttatatataatagagaatcaaataaagagattaattgaagagaatcca
aaggaattgacatttgatagtagtataattgaaagaatatttacaaatacaagttcatta
tcggatgattcaatagttacattctttagatgtttatgtgaagttagtgatgatgagatt
aatcattatcaaagaaactatagtttaattaaattggtagaggtgattgaatataacttt
aagcgtataagattggtattctataatatttgggagattgtagttcaacattttacaaag
gttggttgtaatgcaaatattgagattgctcaacatgcaatcgattcattaagacaattg
gcaaataaatatttggagaaacaagaattgacaaattataatttccaaaatgaattttta
ataccatttcaagatattatgaaatgtaacccttcgattatcatcaaagagttggtcatt
agatgtgtggcacaattgtcaatattaaagagtaaaaatatcaaatctggttggaaaacc
attatcaatgttttcacattgggatcaaaggttttaaatgagtccattgttcaattgtct
tttcaaggtattgatcaattgattcaaaagaatttccaattaattgaagataatttcttt
ataaacctaattgaatcttgttcatcattctctttaccaactgtaccttattttgaaatt
tcaattaaatctttagaattattattattattatcaaaacgtttaccaaccaatagtact
acatcatcaacatcatcattatcaacatcaacaggtttaacaatttcaacaattgaaaaa
ttattattaccaattattcaaggcacttcatttgcaattttacatgaaagtgaaccagtt
agaaaattatcatcagctttattatttgatcttttgaattcaagaggatctgaattcaat
agtgaaatttggaatagaatcattatgaaggttattacaccaatctttcaatctatcgat
ttaactaaattgaataatgaagtcacaaataattggttacgtcaaacttttccaatctta
ttaaattatttaattgatttgtttatacaattcaataaggagttaaatcaatattatgat
acttttttaactttattagaaccattcatatgttgttggagtgaattatctgttcaagtt
gcaattgattattatgctaatttcataagtaaatgttcaccttatttttcaaatgaattt
tggtgtacaagtttaattgattcaattaatagaattataaagaaattattaatttcaaaa
tcatcaccatcttcatcatcatcttcatcatcattatcatcattacaacaaataacgtca
cctttaacaaataataataataataataataataatataccaatatcagcaataacgcca
gaaacaccaaagaaacaaaataataacaataataataataataataatattaataataat
aataattgtagatcatttagtcgtacattattatcattaaaaccatttttagtaatagat
gaagaatcaagttttataggtaaaaaaatgaagagtaatgttatgaaatatgaaaagact
gaaccatttttatcaattcataattggaatacaataattaaattccaaagtcttataaat
aaggtttatagtgaattacaattaaaggttccaattaaatttggtgtattattagtaaaa
aaatgggatttagtattcattttatcacaacgtatcaattctgaacaaattttcatctct
cattttggtgaacaaaatactcaaaactatgaatgttcaacactttctttgttattgtca
ttattgtttgaaatgtatattagacctgatacaaagaaatcctctgatagtaaaaatcat
gaagattatcttcaagcaaagaaacgttcaaaagaagttgaagatattttatcaagattt
acaattgggatattaaaagaaaattctttagtagtttcaaataatcttaataataataat
aataataataatgtaaattcaccaataacaacaacaacatcatcatcaacttcatcatca
aatacaactactagaatatttaatagtactagaatgattaatattatttgccaaatttta
caaggttttacaagatataatcaaaaacaatttaaaaaacatcaaccatctttctttcca
tattgtatcgatttatcattacatgataatttacaaattagacaaagtttatcaaaatta
tttgaaagatgtaaatctgatcttccaactattattttatcacaatcaccaccatctcca
ttaactcttgatccaattccaaccattggtcaaaagaataattcacaaattcaacaacaa
caacaacaagaacaacaagaacaaaatttagaaaatgcttctcactatactgtaaaggat
aaagttttaattattgaagataatcaaaatcaaaatcaaaatcacaatcaaaataataat
gatgataatattactattaaagaatcaaatacttcaattgaaataattcaagctgatgat
aatgatgatgatgataataataataatgataataataataatattaacgagaaaagaaat
gatgaagatgataatagtaatgaaataaaacaaaatgatgaaaatgaaaaaattgaaata
attcaagatgatgaaaccgaagatttaagtaataatacaaataatggtatttctgatgac
ttcactccaatcgaaactaatgaaaatttaacagatatcgatggatttgttaacattaac
gaggaagaagatatattataa
DBGET
integrated database retrieval system
