Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290553
Help
Entry
DDB_G0290553 CDS
T00245
Name
(RefSeq) NOL1/NOP2/Sun family protein
KO
K21971
methyltransferase NSUN6 [EC:2.1.1.-]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
DDB_G0290553
Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Methyltransferases
DDB_G0290553
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Methyltr_RsmB-F
Methyltransf_31
PUA
FtsJ
RsmF-B_ferredox
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627719
NCBI-ProteinID:
XP_635647
dictyBase:
DDB_G0290553
UniProt:
Q54FX0
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(4265295..4266800)
Genome browser
AA seq
501 aa
AA seq
DB search
MKDLNHVLNEMKIMNFKKIGDDEYTNECLMEFKDIEVLNHLIKYYGKEHMERIQKSMTQT
FLYTTIRVNTMNTNKDKLLIDLSNHFKTNEKSIENQEIFTNFKSFNDILNNIENNNNDND
NNDEIKNQISKDTIFIKTIGPLIPKPIYPQIIVDLICGEAVLRGSNIFSIGVLGSNKYIK
KGNMVSVFVTIDSRVSKGEIFEDCFKEKCAFIGNGISLLDRDDYHQTRVGVAIEMTERLY
VCPPLNSVLEDKMFLQHLPSIYTVYQLEPKLGDKIIDMCAAPGGKTTLIASLIQQFEINN
NQNNQKYQNNNEIKTEIFALDKNKGKVKKIIDLCKRLSLDKYVTCLAKDSSKLTKENQQD
PLDKIRFQSNSFDKVLLDGPCSGLGSRPRLIESSSLVDLTNSSEFQKKLIDQAVSLLKPG
GILVYSTCSINPEENELNVSYLLNNYPEMKLIPQIPHISQPGLPNCGLTEQQCKLVSRFD
PSDSNIGTIGFFIAKFTKIKN
NT seq
1506 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagatttaaatcatgttttaaatgaaatgaaaattatgaattttaagaaaattgga
gatgatgaatatacaaatgaatgtttaatggaatttaaagatattgaagtacttaatcat
ttaattaaatattatggaaaagaacatatggaaagaattcaaaaatcaatgactcaaact
tttttatatacaacaatcagagttaatacaatgaataccaataaagataaattattaatt
gacctttcaaatcatttcaaaaccaatgaaaaatcaatagaaaatcaagaaatttttaca
aattttaaatcatttaatgatattttaaataatattgaaaataataataatgataatgat
aataatgatgaaattaaaaatcaaatttcaaaagatacaatatttataaaaacaattgga
ccattaataccaaaaccaatttatccacaaattattgttgatttaatttgtggtgaagca
gtattaaggggtagtaatatattttcaattggtgtattaggttcaaataaatatattaaa
aaaggtaatatggtatcagtatttgtaacaattgatagcagagtttcgaaaggtgaaata
tttgaagattgtttcaaagagaaatgtgcattcattggtaatggtataagtttattggat
agagatgattatcatcaaactagagttggtgttgcaattgaaatgactgaaagattatat
gtttgtccacctttaaattcagtattagaggataaaatgtttttacaacatttaccatca
atctatacagtttatcaattagaaccaaaattaggtgataaaattattgatatgtgtgct
gctccaggtggtaaaactacattaattgcatcattaatccaacaatttgaaattaataat
aatcaaaataatcaaaaatatcaaaacaataatgaaattaaaactgaaatatttgcatta
gataaaaataaaggaaaagttaaaaagattattgatttatgtaaaagattatcattagat
aaatatgtaacatgtttagcaaaagattcatcaaaattaacaaaagaaaatcaacaagat
ccattggataaaattagatttcaaagtaattcatttgataaagttttattagatggacca
tgttctggacttggatcacgtccacgtttaattgaatcaagtagtttagttgatttaaca
aattcatcagaatttcaaaagaaattaattgaccaagcagtttcattattaaaaccaggt
ggtattttagtttattcaacatgttcaattaatccagaagaaaatgaattaaatgtttca
tatcttttaaataattatccagaaatgaaattaattccacaaattcctcatatctctcaa
ccaggtctaccaaattgtggtttgactgaacaacaatgtaaattagtttcaagatttgat
ccatcagattcaaatattggtacaattggtttctttattgcaaaatttacaaaaataaaa
aattaa
DBGET
integrated database retrieval system
