Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290943
Help
Entry
DDB_G0290943 CDS
T00245
Symbol
pks39
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
Epimerase
Methyltransf_23
ADH_zinc_N_2
PKS_DH_N
Methyltransf_11
Methyltransf_25
PS-DH
ADH_N
Methyltransf_31
PP-binding
Thiolase_N
Anamorsin_N
MC7
AMOP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627910
NCBI-ProteinID:
XP_635494
dictyBase:
DDB_G0290943
UniProt:
Q54FC8
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(4786202..4796077)
Genome browser
AA seq
3108 aa
AA seq
DB search
MTENIDKNDDDVAVIGIGLRFPSGNLKESISKPNQLFNELLNGLDGIVTTSERWSDNYYL
NGEVVSKFAGLLPLDEWKQFDPIFFAINPSYDNVSSIDPQQRLLLKCVWEALEDSGIDPI
SLRGTNTSTFIGSSTIDYNDLQKSPFETQNNIFGSTTHSIANRIGFSFDFRGENLTIDTA
CSSSSNAINCGYNSIKSNKSNVSIVGGVNFILNPYISKSFTQLDMLSPTGKCHTFSSDAD
GFVRSEGVGIVVLKKLKDAIKDSNNIYCVIKGSSSNIDGNFDKLNFYSPSKLSQCENIKL
AIKSTNGQINESDIDYCETHGTGTPTGDPIELEGISRAFNNKASTTNNNKQVLVGSFKSN
IGHTEACSGVASLIKCCLMFKNKLFLQNINFKEPNPLINFKEWGLKVVTEPIKFNENKPT
VMLINNFGITGSNVCLILSEFSGNSKSNDYQKMEIDNKFNEKKKYLIPLSSNSSTSLNNY
KLSIIKHLNSRSSSSSTTTSFEEFVYNQIKFKSTSLIQKSVIIASDWNEFQDENNQIKLE
NSDNLISNITVEKKKSPIIVMVLCGQGSQYNKMALSLYDNEPIFREYVNRFDKELFKYYG
YSVLDKLRSIEDKDLISIHQPILAQPATVIIQVSLYELYKHWGVSADIIIGHSLGEISSA
YCSGMIDFQTLCYLTYHRSVAQNRTTGTGKMLSVNISSDEFINSYQSTTKYESLEIACYN
SPTSIVIAGKEDLLNEIIKDFKSNDIFCAMLGSLSSFHTSSQQMIKDEVCSLNISSKQPS
IAIFSTVTTNLFNHQSSPFDADYVFDNIRQPVRFTQTITNLYKYAESNDMGNEITFIEVS
PHPTLQFYLNQMNSTQSSYFNSGKNITIYSPLNKKKNDYNEFLKTISLLYVNNNLNINFK
SQLINNNNNNNNNNYTNLFNNLPLYQWDDKEYFKITSFHEKIKSEGPSIHSLGNNTDSPY
PSYQTFIDIKKSPFQWLKGHQVSDKFYYPGMGHVHNLLSIYPNQDITISSLEFKSPLVLA
EGNRQCLQTSVTPLSKNEFNIKSHYKDQKTNQWILTSLGNFSLFKHNIIENNQPINIQTL
KDKCNFTSISKQDLYETIRIKTNLTYKGLFQGVKQCHIGNNCSLAIVSLNEIYIQKEYNH
LINNSNMNTLFNTAILDTCLHGVLCAVTQPVVLDRIEGFNFYSSNIPSSLNYRNNNNNNN
NINNNNNNNNNSNNTINEFYVYSEIRARTNFQTYSGSIKIILPNGTLLVDIGNVVCTIAA
SNPDSSLICKPNYIYTPHLQSKDSIINKPEQFKHLHRVNEFSFKNEENLFISNRLLLSLF
YKHINNRCPSINLESLETLEYDQFKQLYYNSLVNENLFKFIFEILKKYQNIPNINNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNEKLYI
KTTKIMAKQLFPLKDDDSITDTPQSLFESGYLDVFYKNSIVVQPLNSLLSEIIVETLKPI
LNEPIVFRILEAGGGTGSLSLLILEKICKLLNENNSTTSIIDIEFTWSDISASFFAEIKE
KFSSFTNHNSLNIIYRVLDLDKPLLDQDLKASYYDFVVMSNVMHVVKKLKPTLNEIHNIL
APNGQLLFVEPPYKSFFIDSIFGCFSQWWPSSDSDIELRPDRCCMKQEKWINLLNQCNYR
DTIMSGNDNLLFLVQTRKPTINEIISEQSISLDQLKSFNNIILFSSNNKNNKNDSFSIIQ
NLITLNQELKHKIININNYNEFQSWITNNQNIDNKTLIIFLKSIDSTVNTSNFKETTFEY
IQINQLILKLELSNNFKHLLLSLNSTTDNYLTSSIVGAARYFIEFPQLDLLTLNYDNVSI
ENNQQLLSLINYLINSNNNIQKEFTINNNIVYYERFCKRLNNIKSKFQSKSFETNKDNLY
IQLNSNLEYQLYSKKDELNSNEVEIEIKATGINYKDYLLHIGMIGTNLEIKYGKEIENGI
GFDNPKIGNDFSGIITRLGCNVKEFKVGDQVCGFGSKTNSSHIIVDSDSIYYKPLYYSHS
VSASIPSIYITSLHSIYGIGNLKSNESILIHSAAGGVGLSSLDLLKSKQHQGYIFLTVGS
KDKEEYLINKYGSLITAIYSSRNKNYVYEIKNKLIELGEVEQHQQGVDLILNTLSSEFMS
PNFQCLNLSGRIVDLSITHLTPNDYMTNSHYKFNMGYNNVNVEDFPGKLIKSYLKKIIEM
INSNELELSVPIIEYSNNQFKDAIEYINQRKHIGKIIVNHSQDEFNRVYNNYQNNNNQII
MKHSYDISKLNIGKNIILTGQTGIVLEILKYLVKYSNHSIENIIILSKSKLKWELELLIN
QTKFKKDNIIKFHFNQIDIEDSNKVNQALNQLELNENITNIDSIIHFAFMNDIGDVQQVD
MNRLNNAHGAKTIGAINLHNQSINRSWNIKQFIMASSVASIVGSEQQCCYVSACNVIDSL
SKYRHSIGLPSLAINLGTISSTGFITRNNTIETMLKSSILNFLSPQLVISSLDLFIQNQH
QYPNYCMSDFKFKIIPSTNQYFSKFDFEINIVKKSNQIKSFFGGDGNNEIIHSTILNKIS
ELLSIDKSKINEDLQLTQYGTDSLVIVQLKNFIDNQLGHNIITIQQLQNNKINQSIEIIK
SALNKNNNIYNNKKNNNNNLVKKEQQSLDEFIKNETKLNESIISRPYSIKKILNNNNNSK
SIFLTGSTGFLGAYLLMELIKMNNISKIYCLIRNNSKLTNPIDVIINNLKKHQLIDMNKE
SPKRKTKIINHTGNISNDKLNSSDNSNNNNNQINEDQLIKIIPMIGDISKDKFGLTEQDY
LKLSNECDIIINSAADLNLKSNYEESKTINVNNVNQVIKLSVSNNSSQKLIVHFSSLAVF
INHPFKDEEDFEETNIVPNFNSTPIGYIQSKVISEKLLTNAAESRGIPSIIIRPPDIFSN
PITGIGHSNDFLSLLIKASKDIGYYPNIHKSIFSTPVTTIAKTTIDLIFNENSWNQNKSK
PISIYNFNGNSMEFKSFYRVLENNFKCKEIDFDEWIELVSKSNGKSSKRYSTFHIHKNQN
LLLTTFTINSLFKMSNSTKELLISIGSYNHQDWEINESMILNDIINNH
NT seq
9327 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagaaaatattgataaaaatgatgatgatgttgcagtgatcggtattggtttaaga
tttccaagtggtaatttaaaagaatctatttcgaaaccaaatcaattatttaatgaatta
ttgaatggattggatggaatcgttacaacatctgaaagatggtctgataattattactta
aatggtgaagtcgtttcaaagtttgctggtttacttccacttgatgaatggaaacaattc
gatccaatcttctttgccattaatccaagttatgataatgtcagttcaatcgatcctcaa
caaagattattattaaaatgtgtatgggaagcattagaagatagtggtattgatccaatt
agtttacgtgggactaatacaagtacatttatcggtagtagtactattgattataatgat
cttcaaaaatcaccattcgaaactcaaaataatatttttggttcaacaactcattccatt
gcaaatagaattggtttttcatttgattttagaggtgaaaatttaacaattgatacagct
tgttcaagttcatcaaatgcaattaattgtggatataattcaattaaatcaaataaatca
aatgtttcaattgttggtggtgttaattttatattaaatccatacatttcaaaatcattc
acacaattagatatgttaagtccaacaggtaaatgtcatacattttcatcggatgctgat
ggttttgttcgttcagaaggtgttggtatcgttgtattaaagaagttaaaagacgcaatc
aaagattcaaacaatatctattgtgtaatcaaaggatcaagttcaaatatcgatggtaac
tttgataaattaaacttttattcaccatcaaaactatctcagtgtgaaaatatcaaatta
gcaatcaaatcaaccaatggtcaaatcaatgaatcagatattgattattgtgaaactcat
ggtactggtactccaactggtgatccaatagaattagaaggtatatcaagagctttcaat
aataaagcatcaacaacaaataataataaacaagttttagttgggtcatttaaatcaaat
attggacatactgaagcatgttcaggagttgcatcattaattaaatgttgtttaatgttt
aaaaacaaactatttcttcaaaatattaatttcaaagaaccaaatccattaataaatttt
aaagaatggggattaaaagttgtaactgaaccaattaaatttaatgaaaataaaccaact
gtcatgttaattaataatttcggtataactggttcaaatgtttgtttaatattatctgaa
tttagtggtaatagtaaaagtaatgattatcaaaaaatggaaattgataataaatttaat
gaaaaaaagaaatatttaataccactctcaagtaattcatcaacatcattaaataattat
aaattatcaataattaaacatttaaattcgaggtcatcttcatcatcaacaacaacaagt
ttcgaagaatttgtatataatcaaattaaattcaaatcaacatcattaattcaaaaatca
gttataatcgcaagtgattggaatgaatttcaagatgaaaataatcaaattaaattagaa
aatagtgataatttaatttcaaatattacagttgaaaaaaagaaatctccaatcatagta
atggtattatgtggtcaaggttcacaatataataaaatggcattatcattatatgacaat
gagccaatatttagagaatatgtaaatagattcgataaagagttattcaaatattatggt
tactcagttttagataaattaagatcaattgaagataaagatttaatatcaattcatcaa
ccaattttagcacaacctgcaactgttatcattcaagtatcactctatgaattatataaa
cattggggtgtttcagcagatattatcattggtcattctcttggtgaaatctcatcagca
tattgttcaggtatgattgattttcaaacattatgttacttgacttaccatagatcagta
gctcaaaatagaaccacaggtacaggcaaaatgttatcagttaatattagttcagatgaa
ttcattaatagctatcaatcgacaactaaatatgaatcattagaaattgcatgttacaat
tcaccaacatcaatcgttatcgcaggtaaagaagacttgttgaatgaaattatcaaagat
ttcaaatcaaatgatatcttttgtgcaatgttaggatcattatcatcatttcatacatca
agtcaacaaatgattaaagatgaagtatgttcattaaatatttcatcgaagcaaccatca
atagcaatattttcaacagttacaaccaatttattcaatcatcaaagctcaccattcgat
gcagattatgtatttgataatattcgccaaccagttcgtttcacacaaacaattacaaat
ctttacaaatatgccgaatcaaatgatatgggtaatgaaattacattcattgaagtttca
ccacatccaacattacaattttacttaaaccaaatgaactcaactcaatcaagttacttt
aatagtggtaaaaatattacaatctattcaccattaaataaaaagaagaatgattataat
gaattcttaaagacaatctctttattatatgtcaataataatttaaacattaatttcaaa
tcacaattaatcaataacaacaataacaataacaataataactatacaaacctatttaat
aatttaccactttaccaatgggatgacaaagaatactttaaaattacttcttttcatgaa
aagattaaaagtgaaggtccatccattcatagtcttggtaataatacagattcaccatat
ccatcatatcaaacatttatcgatatcaagaaatcaccatttcaatggttaaaaggtcat
caagttagtgataaattctattatccaggaatgggacatgttcacaatttattatcaatt
tatccaaatcaagatattacaattagctcattagaatttaaatcaccattagtattagca
gaaggcaatagacaatgtttacaaacatcagttacaccactatcaaagaatgaattcaat
attaaaagtcattacaaagatcaaaaaacaaatcaatggatattaacatctcttggtaat
ttcagtttattcaaacataatattattgaaaataatcaaccaattaatattcaaacatta
aaagataaatgtaattttacaagcatatcaaaacaagatttatatgaaactattagaatt
aaaacaaatttaacatacaaaggtttatttcaaggcgtaaaacaatgtcatatcggtaat
aattgttcattagcaatagtatcattaaatgaaatttatattcaaaaagaatataatcat
ttaataaacaatagcaatatgaatacattatttaacacagcaattttagatacttgttta
catggagtattgtgtgcagttacacaaccagtcgtacttgatagaattgaaggtttcaat
ttttattcttcaaatattccgtcatcattaaattatagaaacaacaacaataataataat
aatatcaataataataataataataataataatagtaataatacaattaacgaattttat
gtttactctgaaattagagcaagaaccaattttcaaacatattcaggatcaattaaaatc
atacttccaaatggtacattattagttgatattgggaatgtagtttgcactatagctgcc
tccaatcctgatagttctctaatttgtaaaccaaattatatctatacaccacaccttcaa
tcaaaagattcaatcattaataaacccgaacaattcaaacatttacatagagtcaatgaa
tttagtttcaaaaatgaagaaaatctattcatttcaaataggttattattgtcattattt
tataaacacattaataatagatgtccaagtatcaatttagaatcattagaaacattagaa
tatgatcaatttaaacaattatattacaatagtttagtaaatgaaaatcttttcaaattc
atttttgaaattttaaaaaaataccaaaatattccaaatatcaataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataatgaaaagttatatatt
aaaacaactaaaataatggcaaaacaattatttccattaaaagatgatgattccattaca
gatacaccacaatcattatttgaaagtggttatttagatgttttttataagaattcaata
gtagttcaaccattgaatagtttattaagtgaaattatagttgaaactctaaaaccaatt
ttaaatgaaccaattgtatttcgtatattagaagcaggtggtggtactggtagtcttagt
ttattaattttagaaaagatttgtaaattattaaatgaaaacaattcaacaacatcaatc
attgatattgaatttacatggagtgatatatctgcatcatttttcgctgaaattaaagaa
aagttctcatcatttacaaatcacaatagtttaaatattatctatcgtgtactagattta
gataaaccattattagatcaagatcttaaagcatcctattatgatttcgttgtaatgtca
aatgttatgcatgtcgttaagaaactcaaaccaacattaaatgaaattcataatatatta
gcaccaaatggtcaacttttatttgtagaaccaccatacaaatcattttttattgattca
atttttggttgtttttcacaatggtggccatcctctgatagtgatatcgaattaagacct
gatagatgttgtatgaaacaagagaaatggattaaccttttaaatcaatgtaattataga
gatacaataatgtctggtaatgataatttactatttttggttcaaactaggaaaccaaca
attaatgaaatcatttcagaacaatcaatatcattggatcaattaaaatctttcaataat
attattttatttagtagtaataataaaaataataaaaatgatagctttagcattatacaa
aatttaataacattaaatcaagaattaaaacacaaaattattaatattaataattataat
gaatttcaatcttggattacaaataatcaaaatatagataataaaacattaataatattt
cttaaatcaattgattcaacagtcaatacttcaaattttaaagaaaccacatttgaatac
attcaaattaaccaattaatattaaaattagaattatcaaataatttcaaacatttatta
ttatcgttgaattcaaccaccgataattatttaacatcatcaattgttggtgctgctcgt
tatttcattgaattcccacaactagatttattaactttaaattatgataatgtttcaatt
gaaaataatcaacaattattatcattaatcaattatttaatcaattcaaataataatatt
caaaaagaatttacaattaataataatatagtatactatgaaagattttgtaaaagatta
aataatattaaaagtaaattccaatctaaatcatttgaaaccaataaagataatttatat
attcaattaaattcaaatttagaatatcaattatatagtaaaaaagatgaattaaattca
aatgaagtagagatagaaattaaagcaactggtataaattataaagattatttattacat
atcggtatgataggtacaaatttagaaattaaatatggtaaagaaattgaaaatggtatt
ggttttgataatccaaaaattggtaatgactttagtggtataattacaagattaggttgt
aatgtaaaggaatttaaagttggtgatcaagtttgtggtttcggctcaaaaacaaatagt
tcacatattattgtagattccgattctatttattataaaccattatattatagtcattca
gtttcagcttcaattccatctatttatattacatcattacatagtatctatggtattggt
aatttaaaatcaaatgaatcaattttaattcattcggcagcaggtggtgttggtctatca
tctttagatttattaaagagtaaacaacatcaaggttatatatttttaactgtaggttca
aaagataaagaagaatacttaataaataaatatggatcattaattactgctatctattca
tctcgtaataaaaattatgtttatgaaattaagaataaattaatagaattaggtgaagtt
gaacagcatcaacaaggtgtagatttaatattgaatacattgtcatcagagtttatgagt
ccaaatttccaatgtttaaatttatcaggacgtatcgttgatttaagtattactcatctc
acaccaaatgattatatgacaaacagtcattacaaatttaatatgggttacaataacgta
aatgtcgaagatttccctggtaaattaattaaaagctatttaaagaaaattatcgaaatg
attaattcaaatgaattagagttaagtgtaccaatcattgaatattcaaataatcaattt
aaagatgcaattgaatatataaatcaaagaaaacatattggtaaaatcattgttaatcat
agtcaagatgagtttaatagagtttataataattatcaaaataataacaatcaaatcata
atgaaacattcatatgatatttcaaaattaaatattggtaaaaatattatactcactggt
caaactggtattgttttagaaatattaaaatatttggttaaatattcaaaccattcaatt
gaaaatattataatactttcaaaatcaaaattaaaatgggaattagaattattaatcaat
caaaccaaatttaaaaaagataatattattaaattccatttcaatcagatcgatattgaa
gattcaaataaagtcaatcaagcattgaatcaattagaattaaatgaaaatattacaaac
attgattcaattatccattttgcatttatgaatgatattggtgatgttcaacaagttgat
atgaatcgtttaaataatgcacatggtgctaaaacaattggagcaattaatcttcacaat
caatcaattaatcgttcatggaacatcaaacagtttataatggcatcatcagtggcttca
atagttgggtcagaacaacaatgttgttatgtcagtgcctgtaatgttatcgattcatta
tcaaagtatagacactcaattggactaccatctttagccattaatttaggtaccatatca
tcaactggattcataacacgtaataatacaattgaaacaatgttaaagagttcaatttta
aattttttatcacctcaactcgttattagttcattagatctattcattcaaaatcaacat
caatatccaaattattgtatgtcagatttcaaatttaaaattataccatcaacaaatcaa
tacttttcaaaatttgattttgaaattaatattgttaaaaaatcaaatcaaatcaaatct
ttctttggcggtgatggtaataatgaaattattcattcaacaattttaaataaaatcagt
gaattattatcaattgataaatccaaaatcaatgaagacctccaactcacacaatatggt
acggatagtttagtgattgtacaattaaagaattttatcgataatcaattaggtcataat
attatcacaattcaacaattacaaaacaataaaatcaatcaatcaattgaaattattaaa
tctgctcttaacaaaaataataatatttataataataaaaaaaataacaataacaattta
gttaaaaaagaacaacaatcacttgatgaatttattaaaaatgaaactaaattaaatgaa
tcaatcatttcaagaccatattcaattaaaaaaattttaaataataataataatagtaaa
tcaatattcttaacaggttcaacaggattcttaggtgcttatttattaatggaattaatt
aaaatgaacaatatatcaaaaatttattgtttaataagaaataattcaaaactaacaaat
ccaatcgatgtaattataaataatttaaagaaacatcaattaatagatatgaataaagaa
tcaccaaaaagaaaaacaaaaataatcaatcatacaggtaacatatcaaatgataaatta
aatagtagtgataatagtaacaataataataatcaaataaatgaagatcaattaattaaa
atcatcccaatgattggtgatatctcaaaagacaaatttggtttaactgaacaagattat
ttaaaactttcaaatgaatgtgatattattataaattcagcagcagatttaaatttaaaa
tcaaactatgaagaaagtaaaactataaatgttaacaatgttaatcaagttataaaatta
tcagtttcaaataatagctcacaaaaattaatagttcatttttcatcacttgcagtattc
attaatcatccttttaaagatgaagaggattttgaagaaacaaatatagttccaaatttt
aattctacaccaattgggtatattcaatctaaagttatttcagagaaattattaacaaat
gcagcagaatcaagaggtataccatcaatcattattagaccacctgatatattctcaaat
ccaataacaggtataggtcattcaaatgattttttatcacttttaatcaaagcttcaaaa
gatattggttattatccaaatattcataaatcgattttctcaactccagtcacaaccata
gctaaaacaacaattgatttaatattcaatgaaaacagttggaatcaaaataaatcaaaa
ccaatttcaatttataattttaatggtaattcaatggaatttaaatcattttatagggta
ttggaaaacaattttaaatgtaaagaaattgatttcgatgaatggattgaattagtttca
aaatcaaatggaaaatcatcaaaaagatattcaacattccacattcacaaaaatcaaaat
ttattattaacaacttttacaattaatagtttatttaaaatgtcaaatagcacaaaagaa
ttattaatttcaattggttcatataatcatcaagattgggaaattaatgaatcaatgatt
ttaaatgatattattaacaatcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
