Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0291245
Help
Entry
DDB_G0291245 CDS
T00245
Symbol
abcA6
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DDB_G0291245 (abcA6)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ddi02000
]
DDB_G0291245 (abcA6)
Transporters [BR:
ddi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DDB_G0291245 (abcA6)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
SMC_N
R1_ABCA1
Rad17
AAA_29
SbcC_Walker_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628157
NCBI-ProteinID:
XP_635211
dictyBase:
DDB_G0291245
UniProt:
Q8T6J1
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(313947..319147)
Genome browser
AA seq
1631 aa
AA seq
DB search
MEFGRQLKTLLKKNLLLKGKSKCSICCEIVFPIVIIGVLFAILALIKVTNSDYNSIDVTT
FSRRVGPENKLLYGSEGSLNNDQSGVIETMKEQVATARGLTVAEVQDFFMEINDRTLMES
FFKNYSMMVYGGVWFNSSTNGGGGGNNNDPIAAGGQFGYNIRLDSDDTADTSETGKVDGG
DSSIYLNDNFASIQVAMDQAIFGYFGLDMVLNISGRHYPDPYTELWQEWITGRDAIIKSA
GSVFITAALMMFSFRLVTDVVIEKETKIVEAMRMMSLNSLAYFSSWIITSLITSLPVTLL
IVVIFKGSQLIYSTSWGIVIITFVLYLITLLLLSFIFSIFFNNSKFCGLLSFVIVIAINI
CGIFVSKNEFSVSVKLLLSIFSPIAFSNSIYIMSVKDLTMILNLNWDYIVTENQSILMLG
IDIIIYIILIWYFEKVIPGEYGTKEKFYFLFTKNYWFGKKRSIGEIDDIESTFDSEDVET
IPLKVLKNSTISIRNLRKEFETGDGLRVAVNDLYLDMFEDQIHALLGPNGCGKSTTIGML
TGLISPTSGSAFIRGYDITSQMSKIRPYIGCCLQTDIIWSQLTVLEHLVIYASLKGVEGR
NIQREAERMATEVGLAEKMNAPAGSLSGGQKRKLCLGIAFIGRSKIIFLDEVTSGMDPVS
RRQVWDFLLKYKKGKTIILTTHYLEEADYLGDRIAIISQGKLRCDGTSLFLKNRFGQGYL
LTCNKKLENASNGFNTNQVSEFIKNFIPGASILTDSGAELSYRLPTESLSNFPQFFTEFD
LNLSKFSIQTYGISVTSLEEVFISLGQEDSKKLNNNANGNNEFNKQNEMESLKLAIATPS
DGINQIQQFKGLLIKRIQQSKKDARSFFLSIILPMALIIGSIILYKSMNDQKQVLFYNNS
TQPLTMSLSIYTDSDNTINVPMQLLNNELEWSNLFNNSPYFNKFKYINESINFNDYLIDN
YKLSIGAINFTNQPISIDDNNNGQSTNCSYIAYYNSDYIHSFPIHVNLINDALLRKFKNI
SISVTSMPFDHILTAFEISSSDINASAIIYFVFILMAGFSLMAGSFAGSIAQERTNRVKR
LLYVSGCKKHIYWLSNLVWDFFFAFIISILSCSILAGVIKGAFKEQFGSFLLCLILLSCA
IIPLGYLMSYKFQTYGKAVGAITAILFVFGLVFTIASLNVRIQAVVNQNSTTQKVADIID
LIFSIISPIFALNRIVFILSGFPGSTRLGTFKVDNYWSFDYLGTPLIVLAGHAVLWNVWI
LLLDYVPQIKGFFKNPKNLPAPSPPQDEDYDVSQERRRLLNMRPSEEPIQFKNLHKLFPG
SGKNPSKTAVYNSTLGIPRGQTFGLLGLNGGGKSTTLSMLSGEIVPSSGEISINGYDVIT
NREKALGNISMVFQFDALISLLSAREHLWLFSRIKGIKESQIENCVEAFIKMVDLTRIAN
SGCGGYSGGNKRKVSLSMAMLGNPSVCFLDEISCGCDAVVRRQLWDVISELGKDKSIILT
SHSMSEVEALCSRITIMKEGKYTCLNTIQGVKNRFGAGYSIDVKFKKEYLETGIQTILQS
IPNCTVLDQHDVMASFEVPNPPGNPIKLSNIFSILSNLPILDDYNVGQTSLESVFLKLTG
ANHDQRINLYD
NT seq
4896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttggaagacaattaaaaactttattaaaaaagaatcttttattaaaagggaaa
tcaaaatgttcaatttgttgtgaaattgtttttccgattgtaattattggtgtattattt
gcaattttagctttaattaaagttacaaattctgattataactcaattgatgtaacaaca
ttttcaagaagagttggacctgaaaataaattattatatggtagtgaaggatcattaaat
aatgatcaaagtggtgtaattgaaacaatgaaagaacaagttgcaactgctagaggttta
acagtagcagaggttcaagattttttcatggaaattaatgatcgtactttaatggaatca
tttttcaaaaattattcaatgatggtttatggtggtgtttggtttaatagtagcactaat
ggtggtggtggtggtaataataatgacccaatagcagcaggtggccaattcgggtataat
attagattagatagtgacgatacagcagacacatcagaaactggtaaagttgatggaggt
gatagtagtatctatttaaatgataatttcgcatcgattcaagttgcaatggatcaagct
atttttggatactttggattggatatggtattaaatatatcaggtagacattacccagat
ccatatacagagctatggcaagaatggataacaggaagagacgcaattattaagtcagca
ggaagtgtgttcattacagcggcattgatgatgtttagttttaggctagttacagatgtt
gtaattgaaaaagaaactaaaattgtagaagcaatgagaatgatgtcattgaattcattg
gcgtatttcagttcatggattatcacaagtttaataacatcattgccagtcacactatta
attgttgtcatatttaaaggtagtcaattaatttattctacaagttggggtattgtaatc
ataacatttgtattatacttgataacattattattattatcatttatttttagtatattt
tttaataattccaaattttgtggtttattatcatttgtaattgtaattgcaattaatatt
tgtggtattttcgtttcaaaaaatgaatttagtgtttctgtaaaattattactttcaata
ttttcaccaattgcattttcaaattcaatttatattatgtctgttaaagatttaacaatg
attttaaatttaaattgggattatattgtaactgaaaatcaaagtattttaatgttagga
attgatattataatttatattatattaatttggtattttgaaaaagttataccaggtgaa
tatggtacaaaagagaaattttattttttatttacaaaaaattattggtttggaaagaaa
agaagtattggtgaaattgatgatattgaatcaacatttgatagtgaagatgttgagact
ataccattgaaagtattgaaaaattcaactatatcaattcgtaatttaagaaaagaattt
gaaactggtgatggattgagagttgcagttaatgatttatatttggatatgtttgaagat
caaattcatgcattgttaggacccaatgggtgtggtaaatcaacaacgattggtatgttg
acaggtttaatatcaccaactagtggaagtgcatttattcgtggttacgatattacaagc
caaatgtcaaagattagaccatacattggttgctgcttacaaactgatatcatttggtca
caattgacagtattggaacatttggttatttacgcatcattaaaaggcgttgagggtaga
aatattcaaagagaggctgaaagaatggcaacagaggttggattagccgagaaaatgaat
gcaccagctggtagtctttcaggtggacaaaaacgtaaactttgtttaggtattgcattt
attggtagatctaaaatcattttcttggatgaagtcacctctggtatggatccagttagt
agaagacaagtttgggattttctattaaaatataaaaaaggtaaaaccatcattcttaca
actcattatttagaggaggcagattatttaggtgatcgtattgcaattatttcacaaggt
aaattacgttgtgatggtacttcattatttttaaagaatagatttggtcaaggttatctt
ttaacatgtaataaaaaattagaaaatgctagcaatggtttcaatacgaatcaagtttca
gagtttattaaaaattttatacctggtgcatcaattttaacagattctggtgcagaacta
agttatcgtttaccaactgaatcattatcaaatttcccacaattttttacagaatttgat
ttaaatttatcaaaattttcaattcaaacttatggtatatcagtaacaagtcttgaagaa
gttttcatttcattaggtcaagaagattctaaaaaattaaataataatgctaatggtaat
aatgaattcaataaacaaaatgaaatggaatcattaaaattagcaattgcaacaccatca
gatggtattaatcaaattcaacaatttaaaggtttattaattaaacgtattcaacaatct
aaaaaagatgcaagatcattctttttatcaattattttaccaatggcattaattattggt
tcaattattttatataaatcaatgaatgatcaaaaacaagttttattttataataattca
actcaaccattaacaatgtcattatcaatttatactgatagtgataacactattaatgta
ccaatgcaattattaaacaatgaattagaatggtcaaatttatttaataattcaccatat
tttaataaatttaaatatattaatgaatctataaattttaatgattatttaattgataat
tataaattatcaattggtgcaattaattttacaaatcaaccaattagcattgatgataat
aataatggtcaatcaacaaattgttcatatattgcatattataattcagattatattcat
tcatttccgattcatgttaatttaattaatgatgcattattaagaaaatttaaaaatatt
agtatttcagttacaagtatgccatttgatcatattttaacagcatttgaaatttcaagt
tcagatataaatgcatcagcaattatttattttgtatttattttaatggcaggtttttca
ttgatggcaggttcatttgctggtagtatagctcaagaacgtacaaatagagttaaaaga
ttattatatgtttcaggttgtaaaaaacatatttattggttatcaaatttagtttgggat
tttttctttgcatttataatttcaattttaagttgttcaattttagcaggagtgattaaa
ggtgcatttaaagaacaatttggttcatttttattatgtttaattttattaagttgtgca
attataccattgggttatttaatgtcttataaatttcaaacctatggtaaagcagttggt
gcaatcactgcaattttatttgtttttggtttagtatttacaattgcaagtttaaatgta
cgtattcaagctgtggtcaatcaaaatagtacaactcaaaaagttgccgatattattgat
ttgatattttcaattattagtccgatttttgcattgaatagaattgttttcattttatct
ggtttcccaggttcaactcgtttgggtacttttaaagttgataactattggtcatttgat
tatttaggtacaccattgattgttttggcaggtcatgcagtactttggaatgtttggata
ttactattggattatgtaccacaaattaaaggtttctttaagaatccaaagaatttacct
gcaccatcaccaccacaagatgaagattatgatgtatcacaagagagaagaagattacta
aatatgagaccatcggaagaaccaattcaatttaaaaatcttcataagctattcccaggt
tcaggtaaaaatccatcaaaaactgctgtatacaattcaacattgggtattccacgtggt
caaacatttggtttattgggtttaaatggtggtggtaaatcaactacactatcaatgtta
tctggtgagattgtaccttcaagtggtgaaatttcaatcaatggttatgatgttattacc
aatagagagaaagcacttggtaatatttcaatggtattccaatttgatgctctcatttca
ttattatcagctcgtgaacatctatggttattctctagaatcaaaggtattaaagagagt
caaattgaaaattgtgttgaagctttcattaaaatggttgatttaactcgtattgcaaat
agtggttgtggtggttattcaggtggtaataaaagaaaagtttcattatcaatggcaatg
ctcggtaatccatcagtttgtttcttggatgaaatttcttgtggttgtgatgctgttgtt
agaagacaactttgggatgtaattagtgaattaggtaaagataaatcaataattttaaca
agtcattcaatgagtgaagttgaagcattatgtagtcgtattacaattatgaaagaaggt
aaatatacatgtttaaatacaattcaaggtgtaaagaatcgttttggtgctggttattca
attgatgttaaatttaaaaaagaatatttggaaactggtattcaaacaatattacaatca
ataccaaattgtacagttttggatcaacatgatgttatggcaagtttcgaagtaccaaat
ccacctggaaatccaattaaattatcaaatatcttttcaattttatcaaatttaccaatt
ttagatgattataacgttggtcaaacatctttagaatcagttttcttaaaattaactggt
gcaaatcatgatcaacgtattaatttatatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
