Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0291438
Help
Entry
DDB_G0291438 CDS
T00245
Symbol
nol6
Name
(RefSeq) Nrap family protein
KO
K14544
U3 small nucleolar RNA-associated protein 22
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
DDB_G0291438 (nol6)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
DDB_G0291438 (nol6)
Ribosome biogenesis [BR:
ddi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
DDB_G0291438 (nol6)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nrap_D3
Nrap_D5
Nrap
Nrap_D4
Nrap_D2
Nrap_D6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628153
NCBI-ProteinID:
XP_635208
dictyBase:
DDB_G0291438
UniProt:
Q54EN2
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(304287..308310)
Genome browser
AA seq
1278 aa
AA seq
DB search
MVSEKRKTVSKKETISNKKNKIEKKQDDSIMSLGMDDDEYNFDDEKAVSYNDNFYNNNNN
QGSDDEGSDDNDFLEGEGSESEQEEQLDDSEAKVGRATILPEKSELEAKEFKNLKVKNVS
YLKQSVAPTNEEIQHLKETSDLYNSNLFRLQMVELFKEIKIDYSKLTSLESALHQLKSVI
EKIPSDQQVTITEANIEKIKLFDFNGGEGLSIQYSKPSQIDVVGSFMTRSVLKSNENVDL
MIEIPKSVFDSKDANDFKYFNKRNLYMLKIFNSVSKVSRFSDISFKNFNGDSNKQIIVIR
PKEDPKTGARTKFQIRIIPTIPNDLFNIYTKFHPNMSCLFFERNNFKIETFKEDDSKEIN
NLNNNNIIDSKNKKKSFDEIKRTPFYNNSILEDIFINDHMQLINEKCENAPVLIDTMLLI
KLWLKIKKIPTVNSFQLSMLLIHLYSIGKVNKSMSSYQAFRMVMVYICKEFQKKPIQFMK
LSSELTTTTTATATTVIKQNQYQDEFEKLYPVALIDNSGLLNIWSSISVWGFKQLIIEAR
LVIENLDSGNGFEEIFMTKFHFYQEYDMIISIKINKQLLANQQSLKVPTNDYYQQDTYLN
YRIYQLIKKSLTKRVTKINILKINDDDQENENDGDDDDEIKIIIGLKVNSENWLSVIDLG
PPADHVNASKFREFWGNKSQIRRFKDGSILEAVTWNPKNGSRHLVIEEIIKYTLNYHLQI
PTENVRSIVSELDQLIVSEQVQDHTLLVLSAKQKLISTIQSLGLPLSIEAYPSIDPALRY
TSILTTKDDRYLENQPISILLQFEQSQQWTKDVDSINALKQAFLLKIARELQSTPFQPRL
TDKYVDLCVDGFIFRCIAYYPKEIEFMREQWLLDGLDEQESLQRNSQHHTFIQSLHTTYS
SYGPTARIALRWIHSHLFSDFIDHQTVELLVASLYKVTENHYHNQNQNEKDSSSSYSLDT
SSIPKTPIMGFLRFLFLLYTFDFDEKPLIVDYLNSVDKNTQLSIKSTFDIQKKSQNPPLL
FIATEKDPLSMWFRKTTITNRQQWEKIKLFAQKSIELIESNYSSISFNWLSIFQPSFIEF
DAIFNLDESLIPNHSREISNLINNKNFNNNNNNTQTTNIPPPPTTTTTTTTIIQAKKPVF
RNISKKPQQQSQQPQQQNQNQNQNQNQNFNELYNNLQPGFNPVLILVQELKDRFSDYFTI
QYDLVGGNKFALKWKSEAFLPTPFKPSKSKYSIQITKDSNLIIPNIFEIINEIQMLGGKL
IKTFKLNQNSINLINEFN
NT seq
3837 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttctgaaaaaagaaaaacagtttctaaaaaagaaacaatttcaaataaaaagaat
aaaattgaaaaaaagcaagatgatagtattatgtcattaggcatggatgatgatgaatat
aattttgatgatgaaaaagcagtttcatataatgataatttttataataataataataat
caaggatcagatgatgaaggatcagatgataatgatttcttagaaggtgaaggatcagaa
tcagaacaagaagaacaattagatgatagtgaagcaaaagttggtagagcaacaatatta
ccagagaaatcagaattggaagcaaaggaatttaaaaatttaaaagtaaagaatgtatca
tatttgaaacaatcggtagcaccaaccaatgaagagattcaacatttgaaagagacttca
gatctttacaattccaatttatttagattacaaatggtagagttatttaaagagattaaa
attgattatagtaaattaacatcactagaatcggcattacatcaattgaaatcggttatt
gaaaagatcccatccgatcaacaagttacaatcactgaagcaaacattgaaaaaattaaa
ttattcgatttcaatggtggcgaaggcttgtccatccaatactcaaaaccatcgcaaatc
gatgtcgttggtagtttcatgacaagatcagtattaaagtccaatgaaaatgttgattta
atgattgaaattccaaaatcagtatttgattcaaaagatgccaatgattttaaatatttc
aataaaagaaatctttacatgttgaaaatctttaattcagtatcaaaggtttcacgtttt
tctgatatttcattcaaaaatttcaatggtgattcaaataaacaaatcattgtaattcgt
ccaaaagaagatccaaaaactggtgcaagaactaaatttcaaattcgtataattccaaca
attccaaatgatctttttaatatttatacaaaatttcatccaaatatgagttgtttattt
tttgaacgtaataattttaaaattgaaacttttaaagaagatgattcaaaagaaattaat
aatttaaataataataatataatagattctaaaaataagaaaaaatcatttgatgaaatt
aaaagaacaccattttataataattcaattttagaagatatttttataaatgatcatatg
caattaattaatgaaaaatgtgaaaatgcaccagtattaattgatacaatgttattaatt
aaattatggttaaagattaaaaagataccaacagttaatagttttcaattatcaatgtta
ttaattcatttatattcaattggtaaagttaataaatcaatgagttcatatcaagcattc
cgtatggttatggtttatatttgtaaagaatttcaaaagaaaccaattcaatttatgaaa
ctttcttcagagttaaccaccaccaccaccgccaccgccacaactgtaattaaacaaaat
caatatcaagatgaatttgaaaaattatatccagttgcattaattgataattcaggttta
ttaaatatttggtcatcaatttcagtttggggatttaaacaattaattattgaagcacgt
ttagtaattgaaaatttagattctggtaatggttttgaagagattttcatgacaaaattc
catttctatcaagagtatgatatgatcatttcaattaaaattaataaacaattattagct
aatcaacaatctttaaaagtgccaacaaatgattattatcaacaagatacttatttaaat
tatagaatttatcaattaattaaaaaatctttaacaaaacgtgttacaaaaattaatatt
ttaaaaattaatgatgatgatcaagaaaatgaaaatgatggtgatgatgatgatgaaatt
aaaattataattggattaaaagtaaattcagaaaattggttatcagttattgatttaggt
ccaccagctgatcatgttaatgcttcaaaatttagagaattttggggtaataaatcacaa
attcgtcgttttaaagatggttcaatccttgaagctgttacttggaatccaaagaatggt
tcacgtcatttagttattgaggagattataaagtatactttaaattatcatttacaaatt
ccaactgaaaatgttagatcaatagtatcagaacttgatcaattgattgtatctgaacaa
gttcaagatcatactttattggttttatcagcaaaacaaaaattaatttcaactattcaa
tcattaggtttaccattatcaattgaggcatatccttcaattgatcctgcattacgttat
acttcaatacttaccaccaaggatgatagatatttagagaatcaaccaatttcaattcta
ttacaatttgaacaaagtcaacaatggacaaaggatgttgattctataaatgcattgaaa
caagcattccttttgaaaattgcaagagaattacaatctacaccattccaaccaagatta
accgataaatatgttgatctttgtgttgatggtttcatattccgttgtattgcttattat
ccaaaagaaatcgagttcatgagagaacaatggctattggatggtttagatgaacaagaa
tcattacaaagaaattcacaacatcatacttttattcaatcattacataccacctacagt
tcatatggtccaaccgctcgtattgcattacgttggattcattcacatttattctctgat
ttcatcgatcatcaaactgttgaactattggttgcatcactttataaagtaactgaaaat
cactatcacaatcaaaatcaaaatgaaaaagactcctcctcctcctattctttagacact
tcatcaattccaaaaaccccaattatgggtttccttagattccttttccttttatatact
tttgatttcgatgaaaaacctttaattgtagattacttaaattcagtcgataagaatact
caactttcaattaaatcaacatttgatattcaaaagaaatctcaaaatccaccattactt
ttcattgcaactgaaaaagatcctctcagtatgtggtttagaaaaacaactattaccaat
cgtcaacaatgggaaaaaatcaaattatttgctcaaaaatcaatagaattaattgaatca
aattattcttcaatctcttttaattggttatcaatttttcaaccatcattcatcgaattt
gatgcaatctttaatttagatgaatctttaattccaaatcattcaagagaaatttcaaat
ttaattaataataaaaattttaataataataataataatactcaaactactaatatacca
ccaccaccaacaacaaccacaacaacaacaacaataattcaagcaaagaaaccagttttt
agaaatatttctaaaaaaccacaacaacaatcacaacaaccacaacaacaaaaccaaaat
caaaatcaaaatcaaaatcaaaattttaatgaattatataataatttacaacctggattt
aatccagttttaatattagttcaagaattaaaagatagattttcagattatttcacaatt
caatatgatttagttggtggtaataaatttgcattaaaatggaaatctgaagctttctta
ccaactccattcaaaccatcaaaatcaaaatactcaattcaaatcactaaagattcaaat
ttaataattccaaatatttttgaaattattaatgaaattcaaatgttgggtggtaaatta
attaaaacatttaaattaaatcaaaattcaattaatttaattaatgaatttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
