Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0292340
Help
Entry
DDB_G0292340 CDS
T00245
Name
(RefSeq) patatin family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Patatin
zf-C3HC4_3
zf-C2HC5
Prok-RING_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628610
NCBI-ProteinID:
XP_629694
dictyBase:
DDB_G0292340
UniProt:
Q54DE7
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(1444957..1450121)
Genome browser
AA seq
1673 aa
AA seq
DB search
MVSNENKNKIKSQSLQNHTQTQNHTSQLYLYTSHNNFKNIINNRQPNQISSSNCNGSEFT
KTNFNKINNNNNNNNINNSVKNRIKEIENNIITQNNFNTINNINFFTKNKKSNSLPLIQD
PISTNSDPTLYLFFKKSDELLNYSNLFNPTSNENNENNIDSNNNNNKNNINKVHLPSHRH
SLSSNSVKNIIKEFENLKSPNLLSINNNNNDINIINNNNNNNNNNNNDNDNENKNSNNLN
NNINNINNNNINNNNNNIKNSNLTNNENNENIENNNINLQIINENDNGLIKNYNHNIDIC
LVSDNDNKNEDDEKDNINNNRKVNENVIVDVDENKELMDEPIPSPYLSSSDLNESLSTSI
SSPISTMDEISISLPSPIILNNVLTNNDIQEQQQQPQQEQIQAVQQSKPNEILTISEPYP
IPSPSLKRQITPIQLTPPRNRSISINICSSPQQPCSPLPSHPTPPSRSTSIVSNINLKSI
ESIINESLINQQKPIDNELKSNKTIIKPIINIGTINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNINNNN
NTSTPTTTTTTNSNNSNNNHSGSKKEENKLGKMKKIERMLTPSSLSYSYSSPTLPSPRLY
PVVHLYHYQITSATSSYTPTQNNAISSSYPSFKYLKNFDYDYLTIGNNYRYSTFSTSGSY
FTNNNSNNYNIGSSSSSSASNYNSKLLSNAYNSLESYLKSYFDLHYNLYKKQYQQQLQTI
DSTNTNNNGNANNGNNGFYLPSPLPTPRNIQPIIPITKVEIYEKSISEVMNRLVEVFLRF
NRRYEELISINSLNSSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTINNSKNNSNGSESNKKEISKQFND
VLINVSEYIQGFIPCNSTIINNGIMVSCDNPKSNHEFHHTKRNQMIIEKPTSFLSCWRFK
RQQNQLQQQKLKQQQQQQQSNSNSNTSTTTSNTSSSTNKIQQNKFKVPFTVSWSGDFQSV
ITFTDLSSFLNTELDKLSFNMINQYLDQVNNCDGKTDIINSTKVCFGCLLSVPSIECSPC
GHVICSYCSIEQNGNCTICPKDLTGVNAIKNNSNLNYYHNNNNNNNNTYYNNINNNNNIN
NNNNSLKPSMGIRVLSLDGCNNIDTLNSINNNNNINNNCTINNNNNINNNNNNINNNNNN
NLNNNNNNSNNNLNNNNNNNLNNNNNCNISSNFGFSKSGIVQCCILDEIEKQLYGIPISE
LFDYVIGSSSGGITLLALAANKTPNQTIDLFEKLSRKVFKSNSPIKINNYLFSKKNKYKS
DKFTKVLQHEFNNSHIHRYSLNNNQINNQNNQINQNNNHNNNNHYHHVHNFLHNNNHNNN
NNNNNNNNIFINSNIKVAVVSCLEENIIKTTNVVGGVNNSNNRSSIKLTPCIFSIGSNYN
KIPTVDGIKEIKNSSISDAAAATTAIPTLFPSYKFGNEKFRDGGNLTNNPCKLALEEIKT
IWPHNNIDLFSSIGSSNNTLLNNINNINNNNSNNNIIDNNNNNNFDNCGDLFNEMVNSYQ
NNNKSTTLFNRLNVELKPQTILASSIIDENLKSLLKSDVRSYLLNNQLFNSMCSRLLSSL
FYLDDLYLDNTSITGINQISGVIKCRLTTNKNLPTQIVNQLNVKSFTVGQGGDDLELLEV
NMLPFSIPFKITTSNNEIDIKCNLVGLNGKSGSNNTSISGCPFNLLNNKLYFK
NT seq
5022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatcaaatgaaaataaaaataaaattaaatctcaaagtctacaaaatcacacacaa
acccaaaatcatacatcacaactttatttatatacatcccataataattttaaaaatata
atcaataatcgccaaccaaatcaaatatcttcaagtaattgtaatgggagtgaatttaca
aaaacgaattttaataaaattaataataataataataataataatattaataatagtgta
aaaaatcgaataaaggaaattgaaaataatattataactcaaaataattttaacaccatt
aataatataaatttttttactaaaaataaaaaatcaaactcactcccattaatccaagac
ccaatatcaacaaattctgaccccaccttatatttattttttaaaaaatctgatgaatta
ttaaattattcaaatttatttaaccctacaagtaatgaaaataatgaaaataatattgat
agtaataataataataataaaaacaatataaacaaagtccaccttccaagtcatagacat
agcttgtcatctaactctgttaaaaatattataaaagaatttgaaaatctaaaatctcca
aatttattatcaataaataataataataatgatattaatattataaataataataataat
aataataataataataataatgataatgataatgaaaataaaaatagtaataatttaaat
aataatattaataatattaataataataatattaataataataataataatataaaaaat
agtaaccttacaaataatgaaaataatgaaaatattgaaaataataatattaatttacaa
attataaatgaaaacgacaacgggttaattaaaaattataatcacaatattgatatatgt
ttagtgagtgacaatgataataaaaatgaagatgatgaaaaagataatataaataataat
agaaaagtaaatgaaaatgttattgttgatgttgatgaaaataaagaattaatggatgaa
ccaataccatcaccatatttatcatcaagtgatcttaatgaatcattatcaacatcaatt
tcatcaccaatatcaacaatggatgagatttcaatatctcttccatctccaattatttta
aataatgttctaacaaataatgatattcaagaacaacaacaacaaccacaacaagaacaa
atacaagctgttcaacaatcaaaaccaaatgaaattttaacaatttcagaaccttatcca
ataccatcaccttcattaaaaagacaaattactccaattcaattaactcctccaagaaat
agatcaatttcaattaatatatgttcatcaccacaacaaccttgttctccattaccatct
catccaactcctccatcaagatcaacatcaattgtatcaaatatcaatttaaaatcaatc
gaatcaattataaatgaaagtttaataaatcaacaaaaaccaattgacaatgaattaaaa
tcaaataaaacaattattaaaccaattattaatatcggtactattaataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataatattaacaataataac
aatacttctactcctacaactaccactactactaatagtaataatagtaataataatcat
agtggtagtaaaaaagaagaaaataaattaggaaaaatgaaaaaaattgaaagaatgtta
accccatcttcattatcatactcttactcatcaccaacattgccatcaccaagattatat
ccagttgtccacctctatcattatcaaattacatcagcaacttcatcatatacaccaaca
caaaataatgcaattagttcatcatatccttcatttaaatatttaaagaattttgattat
gattatttaacaattggtaataattatagatattcaacatttagtacaagtggtagttat
tttacaaataataattcaaataattataatattggttcatcctcatcttcatcagcatca
aattataatagtaaattattaagtaatgcatataattcattggaatcatatttaaaatca
tattttgatttacattataacctttataaaaaacaatatcaacaacaattacaaactatt
gattcaacaaatacaaataataatggtaatgctaataatggtaataatggtttttattta
ccatcaccattaccaacaccaagaaatattcaaccaataatcccaattactaaagttgaa
atttatgaaaaatcaattagtgaagtaatgaatagattagttgaggttttcttaagattt
aatagaagatatgaagaattaatctcaataaattctttaaactcctcaaataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataatacaatcaacaatagt
aaaaataatagtaatggtagtgaaagtaataaaaaagaaatttcaaaacaatttaatgat
gttttaattaatgtttcagaatatattcaaggttttattccatgtaattcaacaataatt
aataatggtattatggttagttgtgataatccaaaatcaaatcatgaatttcatcataca
aaaagaaatcaaatgataattgaaaaaccaacttcatttttatcatgttggagatttaaa
agacaacaaaatcaattacaacaacaaaaattaaaacaacaacaacaacaacaacagtcc
aactcaaatagtaatactagtactacaacttcaaatacaagttcatctacaaataaaatt
caacaaaataaatttaaagtaccatttacagttagttggagtggtgattttcaatcagtt
ataacatttacagatttatcaagtttcttaaatacagaattagataaattatcatttaat
atgattaaccaatatcttgatcaagtaaataattgtgatgggaaaactgatataattaat
tcaactaaagtttgttttggttgtttattatcagtaccttcaattgaatgttcaccatgt
ggtcatgtaatttgttcatattgttcaattgaacaaaatggtaattgtacaatttgtcca
aaagatttaactggtgtaaatgctataaaaaataatagtaatttaaattattatcataat
aataataataataataataatacttattataataatattaataataataataatattaat
aacaataacaatagtttaaaaccatctatgggaataagagtactatcattagatggatgc
aataatattgacactttaaatagtatcaataataataataatataaataataattgtacc
attaataataataataatattaataataataataataatattaataataataataataat
aatttaaataataataataataatagtaataataatttaaataacaataataataataat
ttaaataataataataattgtaatattagtagtaattttggatttagtaaaagtggtata
gttcaatgttgtattttagacgaaattgaaaaacaactttatgggataccaattagtgaa
ttatttgattatgttattggatcatcaagtggtggtataactttgttagcattggccgct
aataaaacaccaaatcaaacaattgatctatttgaaaaactatcaagaaaagtatttaaa
tcaaatagtccaattaaaattaataattatctattttcaaaaaagaataaatataaatct
gataaatttacaaaagtattacaacatgaatttaataattctcatattcatagatactca
ttaaataataatcaaattaataatcaaaataatcaaattaatcaaaataataatcataat
aataataatcattatcatcatgttcataattttcttcataataataatcataacaataat
aataataataataataataataatatttttataaattcaaatattaaagttgcagtggta
tcatgtttagaagaaaatataattaaaactacaaatgttgttggtggtgttaacaattca
aataatcgatcatcaattaaattaacaccatgtatattttcaattggttcaaattataat
aaaattccaacagttgatggaataaaagaaattaaaaattcatcaatatcagatgctgcc
gctgcaactactgcaataccaactttatttccatcatataaatttggaaatgagaaattt
agagatggtggtaatttaacaaataatccatgtaaattagcattagaagagattaaaaca
atttggccacataataatattgatttattttcatcaattggtagtagtaataatacactt
ttaaataatattaataatattaataataataacagtaataataatattattgataataat
aataataataattttgataattgtggtgatttatttaatgaaatggtaaattcatatcaa
aataataataaatcaacaacattatttaatagattaaatgttgaattgaaaccacaaaca
atattagcaagttcaattattgatgaaaatttaaaatcattattaaagagtgatgttaga
tcatatttattaaataatcaattatttaattcgatgtgtagtagactattatcatctcta
ttttatttagatgatttatatttagataatactagtatcactggtataaatcaaattagt
ggtgttattaaatgtagattaacaacaaataaaaatttaccaactcaaattgtaaatcaa
ttaaatgttaaaagtttcaccgttggtcaaggtggtgatgaccttgaattattagaggtc
aatatgttacccttttcaattccattcaaaattacaacttcaaataatgaaatcgatata
aaatgtaatttggttggtttaaatggaaaatcaggttcaaataatacctcaatttcaggt
tgtccttttaatttattaaataataaattatattttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
