Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0292398
Help
Entry
DDB_G0292398 CDS
T00245
Symbol
psmE4
Name
(RefSeq) proteasome activator complex subunit 4
KO
K06699
proteasome activator subunit 4
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03050
Proteasome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03050 Proteasome
DDB_G0292398 (psmE4)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03051 Proteasome [BR:
ddi03051
]
DDB_G0292398 (psmE4)
Proteasome [BR:
ddi03051
]
Eukaryotic proteasome
Regulatory particles
PA200
DDB_G0292398 (psmE4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT_PSME4_mid
PSME4_C
GCIP_C
CLASP_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628644
NCBI-ProteinID:
XP_629584
dictyBase:
DDB_G0292398
UniProt:
Q54DB2
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(1544203..1550722)
Genome browser
AA seq
1905 aa
AA seq
DB search
MITFKTHKDQQLNNEFISFKKEDVENTGYYRYKNCKEFQQSKRLTDEMVRDLQREKIQQT
TPPSYSSVVEQEKLDLVEEFFQSFDHSIMICNIGDINQLLHVFKHRIYEVQLQFTKQQYH
YLIPRLFDLFIQFRAEDLGNVIIEFLSLLFSRGKKLIELKVNWRPLYKIFKENCEISKQY
GSFDDHHSTIKLQQKFNVLIYNCQPFFGGDEVVDELLEEIGGYLVPHSNYIYFCANVLYL
FTPTYHFSTLTSIPKWVDLYLNYYWSWIDFNKDWDERWLFIFSRAIKFGVNIDWTPILPI
LYTKMLKALDLGVGSPSMAHLKPVKHKIPEIFRLTREDRMEFHSIGKIIACLINSKTEKP
AIQHFKTLISKIGLYFHPSNTGDWTTDLGEMTLSMSKSFLKRNKYIPYSELIIQEFLEII
YPSLTNALYSKKKNISLTIAKIMNEFSHVAPTYILPKIIDDFYSSVDREEVNRLIGGIEV
VSTCLHPILFSPQFPEGKTHLITFMEIMIKCLDPIYTNKASGTFKFFNKLFSSILISDEN
QYIDQCENQIEENVTLSTSLFQEWSINFVDATINFLLQSSTKKGNFKRETVPNIFFRETM
ELFFGALSNEIFKAVLARLKSVFTNIFEPEYYKQLGEFLKSSTLRDPIQSISVFLPVFVN
KLFIKHKITNGNNNNNNNNNNNCNNNYNSGIKYDIIGDLSDQELRLYITYIGYLVFKGGH
GLVEFKDQLIDILTVLMESDNKIVLKATSKVIRKLIFSLTRIYPLNTRVVPQTIVNRKEN
HIKYWGSTDLSTILPIEWFEPNENDINFAKLLIDKFLKGTNDKLSNYINSLRTNDESNNN
NNNNTYNRMKLLNLVKPIQSILRAATFLIKDTSNEIKQSKDEFRYQPKRSKFEHGEISFP
EFSTLKQEIFNNYKETIQYLESKNINEEINVLRVISKTLFVMFYCRGDIIDHTHDHLFEK
WKNHKKLKGRNYLVYKAFKSHLIRQKLNFQHMPITQLALDSMHFTLNLSVHNYRRVRETA
QKAFVNILNMFNGSYEIILPICIDRLLDMKSDPEIKGISFIFQAKSISRKLKGNTEWVKK
LQPMVAKQIDQKFKPNTRATFSELKKVLLIAKRLPILNYYQSKEMKSLNYYQGGDIVEDI
VSNNHYSCYQKGINLNSLTEQQKQLIEKASKSNKEKVDKNRSNLLIALENMVTLSKSSEK
NDSLPWRNHLFLLSSIIYYFSILFNPSPGLKDGFPYSEKYKDQEPIIKEVVLCIAKNSKC
DFPFSRIYCLHSIANILAVQSNKNIEFCYQNYFGDNRFSTQEKIDLEIYGSSVDFEKYLF
NLTKDDIITLLFTDGTNCTANSNAGRLFAYMSQDHEESSTNSFCQSMTNKNFTPSYPNTR
ASVSNKDFRSFNANYFFGLFQAVGGIKFIDTIKPIMEKLKGKSEKEDYFLLVEMLAGISR
YISINDDLLGDERENIFSWVSNIAFISLTGCSNECTEAWTSAIRFITHNIRFDKIEWFSN
LLFEVHKKTNNILAGSKSIKFLKAFLVEVTWKNKDLTEKLFEIAKTEFSNNYKQIRIEAM
RLLSLLIIYQSDFSVHPPIIPQKETSILQGFIDIISNSSPPSSGSNSPLSHVNNGTNGIA
TTNSADVTMIDNSNSNNNNNDNNNNSNNNNSKNSKNAIKENILLLIYFLNSKNPVLVRSA
PTLLKAIMSLTGDSNLEIAKDSSGCVYRMSQEFYFESGVIDQFITVLNQTLQSPSWKIRT
SILQFVQVFFFNHSFIFSNQQTDSIVNTVLALTKDPQIEIREKSKATLASILISFKSDSN
MVENLIKKAIKNLNVPDQSFIEKYSSLIILSSVVLAVPYNIPKYIPSVLQQLSRYSRNSH
YKTAASTISEFWRTHKESWEEDKRQFTEEEAETILSTKVAPSYFA
NT seq
5718 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataacatttaaaactcataaagatcaacaattaaataatgaatttatttcattcaag
aaagaggatgttgagaatacaggatattatagatataagaattgtaaagaatttcaacaa
tctaaaagattaacagatgaaatggtgagggatttacaaagagaaaagattcaacaaaca
acaccaccttcctatagttcagttgtggaacaagagaaattagacttggtcgaagaattt
ttccaatcatttgaccattcaattatgatttgtaacattggtgatataaatcaattactt
catgttttcaaacatcgtatctatgaagttcaattacaatttacaaaacaacaatatcat
tatctaattccaagattatttgacttattcattcaatttagagctgaagatcttggtaat
gttataattgaatttttaagtttattattttctcgtggtaaaaaattaattgaattaaaa
gttaattggagaccactttataaaatttttaaagaaaattgtgaaatctctaaacaatat
ggttcatttgatgatcatcattctactattaaattacaacaaaaatttaatgttttaata
tataattgtcaaccattttttggaggtgatgaagttgttgatgaattattggaagagatt
ggaggatatttagtaccacattcaaattatatttatttctgtgcaaatgttttatattta
ttcacaccaacttatcatttttcaacgttgacatcaataccaaaatgggttgacctctat
ttaaattattattggagttggatagatttcaataaggattgggatgaacgttggttattc
atcttttcaagagcaattaaatttggcgtaaatattgattggacacccattttaccaatt
ctttatactaaaatgttgaaggctttggatttaggcgttggctcaccatcaatggcacac
ctaaaacctgtcaaacataaaataccagaaatctttagattaacacgtgaagatagaatg
gaatttcattcaattggtaaaatcattgcttgtttaattaattcaaaaactgaaaaacct
gcaattcaacattttaaaactttaatatcaaaaattggtttatactttcatccttcaaat
actggtgattggacaactgatttaggtgaaatgactttatcaatgtcaaaatcattttta
aaaagaaataaatatattccatattcagaattaattattcaagaatttttagaaattatt
tatccatctttaacaaatgcactttattcaaaaaaaaaaaatatatcattaacaattgct
aaaattatgaatgaattttcacatgttgcaccaacatatattttaccaaaaattattgat
gatttttattcatcagttgatagagaagaagtgaatagattaattggtggtattgaagtt
gtttcaacatgtttacatccaattttattttcaccacaatttccagagggtaaaactcat
ttaataacatttatggagataatgattaaatgtttggatccaatctatacaaataaggca
tctggtacttttaaattttttaataaattatttagttcaattttaatctctgatgaaaat
caatacattgatcaatgtgaaaatcaaattgaagaaaatgttacactttcaacttcatta
tttcaagaatggtcaattaattttgttgatgctacaattaatttcttattacaatcatca
actaaaaaaggtaattttaaaagagaaactgtaccaaatatattttttagagaaacaatg
gaattattttttggagcattatcaaatgaaatttttaaagcggtattagctagattaaaa
tcagtatttacaaatatatttgaaccagaatattataaacaattgggcgaatttttaaaa
tcttcaacattaagagatcctattcaatcaatttctgtatttttaccagtatttgtaaat
aaattatttatcaaacataaaataaccaatggtaataataataataataataataataat
aataattgtaataacaactataatagcggaataaagtatgatataattggtgatttatca
gatcaagaacttagattatatattacatatattggatatttagtatttaaaggtggtcat
ggtttggttgaatttaaagatcaattaattgatattttaacggtgttaatggaatctgat
aataagattgtattaaaagcaacttcaaaagtaattcgtaaattaatattctctctaact
cgtatttatccattaaatacaagagttgtaccacaaacaatcgttaatagaaaagagaat
catatcaaatattggggttcaacagatttatcaactatattaccaattgaatggtttgaa
ccaaatgaaaatgatatcaatttcgctaaattattaattgataaatttttgaaaggaaca
aatgataaattatcaaattatattaattctttaagaacaaatgatgaatcaaacaacaac
aacaataacaatacatataatagaatgaaattattaaatttagttaaaccaattcaaagt
attttaagagcagcaacatttttaattaaagatacaagtaatgagattaaacaatcaaaa
gatgaatttagatatcaaccaaagagatccaaatttgaacatggtgaaattagtttccca
gagttttcaacattaaaacaagagatttttaataactataaagaaaccattcaatattta
gagtcaaagaatattaatgaagagattaatgtacttagagtgatctcaaaaactttattt
gtaatgttttattgtaggggtgatataattgatcacactcatgatcatctatttgaaaaa
tggaagaatcataaaaagttaaagggtagaaattatttggtttataaagcattcaaaagt
catttaattcgtcaaaagttaaactttcaacatatgccaatcactcagttggcattggat
tcaatgcatttcactttgaacctttcagttcataattatcgtcgtgttagagaaaccgct
caaaaagcatttgtaaatatattgaatatgtttaatggttcctatgaaattattttacca
atttgtatagatcgtttattggatatgaaatccgatcctgaaattaaaggtattagtttt
atttttcaagctaaatcaatctcaagaaaacttaaaggtaatactgaatgggttaaaaaa
ttacaaccaatggtagcaaaacaaatcgatcaaaagttcaaaccaaacactagagccact
ttctctgaacttaaaaaggttttattaattgcaaagagattaccaattttaaattattat
caatctaaagaaatgaaaagtttaaattattatcaaggtggtgatattgttgaagatatc
gtttcaaataatcattattcttgttatcaaaaaggtatcaatttaaatagtctaactgag
caacaaaaacaattgattgaaaaagcatcaaaatcaaataaagaaaaagttgataagaat
agatcaaatcttttaattgcattagagaatatggttactttaagtaaatcaagtgaaaag
aatgatagtttaccatggagaaatcatttattccttttatcatcgatcatttattacttt
tcaattctttttaatccttcaccaggtttaaaagatggtttcccatatagtgagaaatat
aaagatcaagagccaatcattaaagaggtggtattatgtattgctaagaattcaaaatgt
gatttcccattcagtagaatctattgtttacattcaattgcaaatatattagccgtacaa
tcaaataaaaatattgaattttgttatcaaaattattttggtgataatcgtttctccact
caagagaaaattgacttggaaatttatggttcaagtgtagattttgaaaaatatcttttc
aatttaacaaaggatgacatcataaccttactatttactgatggtaccaattgtacagcc
aatagtaatgcaggtagattatttgcttatatgtcacaagatcatgaagaaagttcaacc
aattcattttgtcaatcaatgaccaataagaattttacaccatcttatccaaatacaaga
gcatccgtatcaaataaagatttccgttctttcaatgcaaactatttctttggtttattt
caagccgttggaggtattaaattcatcgataccattaaaccaataatggagaaattaaaa
ggtaaatctgaaaaagaggattactttttattggttgaaatgttggctggtatttcaaga
tatatctctatcaatgatgatctattaggtgatgaaagagagaatatcttttcttgggta
tctaatattgctttcattagtttaactggttgttcaaatgaatgtaccgaagcttggaca
agtgcaatccgtttcatcactcataatattagattcgataaaattgaatggttttcaaat
ttactctttgaagttcataaaaaaacaaataacattttagctggttcaaaatcaattaaa
ttcttaaaagctttcttggttgaagtaacttggaagaataaagatttaacagagaaatta
tttgaaatcgccaaaactgaattctcaaataattataaacaaattagaattgaagcaatg
agattattatctttattaatcatttatcaatcagatttctctgttcacccaccaattatt
ccacaaaaagaaacttcaatacttcaaggattcattgatattatttcaaattcatcacca
ccatcaagtggttcaaattctcctttatctcatgttaacaatggtactaatggtattgcc
accaccaatagtgctgatgttacaatgattgataatagtaatagtaataacaataataat
gataataataataatagcaataataataattctaaaaactcaaagaatgcaattaaagag
aacatattattattaatttattttttaaattctaaaaatccagtattggttagatctgca
ccaactctattaaaggcaattatgtctttaactggtgactcaaatttagagattgcaaaa
gattcatcaggttgtgtttatagaatgtcacaagagttttattttgaaagtggagttatt
gatcaattcattaccgttttaaatcaaacccttcaatcaccttcttggaaaattagaact
tcaattttacaatttgtacaagtatttttctttaatcattcttttatattttcaaatcaa
caaactgattcaattgttaatacagttttagcattaacaaaagatccacaaattgaaatt
cgtgaaaaatcaaaagcaacattggcttcaattttaatttcttttaaatctgactcaaat
atggttgaaaatttaattaaaaaagctattaaaaatttaaatgtaccagatcaaagcttc
attgaaaagtattcatcattaattattcttagttctgttgtattggcggtaccttataat
attccaaagtatataccatctgtgcttcaacaattatcaagatattcaagaaatagtcac
tacaaaactgcagcatccacaatttctgaattttggagaactcacaaagaatcttgggaa
gaagataagcgtcaattcactgaagaagaagcggaaacaattttgtccacaaaggttgca
ccttcttattttgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
