Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0292788
Help
Entry
DDB_G0292788 CDS
T00245
Symbol
pex6
Name
(RefSeq) AAA ATPase domain-containing protein
KO
K13339
peroxin-6 [EC:3.6.4.-]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04146
Peroxisome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
DDB_G0292788 (pex6)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0292788 (pex6)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Autophagy
Pexophagy
Other pexophagy associated proteins
DDB_G0292788 (pex6)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
PEX6_4th
AAA_16
RuvB_N
AAA_5
AAA_14
AAA_lid_3
AAA_22
nSTAND3
TIP49
NPHP3_N
AAA_28
RNA_helicase
AAA_33
TsaE
AAA_18
nSTAND_NTPase5
AAA_7
AAA_17
IstB_IS21
ATP-synt_ab
Mg_chelatase
DUF7353
ATPase
AAA_25
PhoH
Vps4_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628853
NCBI-ProteinID:
XP_629463
dictyBase:
DDB_G0292788
UniProt:
Q54CS8
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(<2034271..>2037983)
Genome browser
AA seq
1201 aa
AA seq
DB search
MIGLFKDEWFNISILNDNLFLKRYCYESNNNNNNNNTLYTIIVPFDKSINPSQFDPSTIN
DYFIFLYKNTKKINLNSINKLQYKSNKKEILVSFDITYIHNSNNNNNNNNNKLKSVLISN
SCSKKLNLFNNDIVHLKPIKKKLTVLQRVVLLANDNESFIESSNPSESSSSTTTINSKYL
VNEEFRNYLVENSILFQSPNNIVIENHQKHKSFSYKVLECFPLLQGTVSNSTTIIIISPD
DKILNTLPSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKEEEVEEEEVEVEEEEKDN
KLKLNNNLRLSNFIIHPIINISNNTTTKNEDIGDSNNLFHFTPSSKGILSNNKKFINISQ
LKSIPTEIDFEFDISKEYDYLVDCLVSLNTLKSLNLFNGSWIKIKNITNNNNNNNNKEYE
IAIRIFSITSSLKLKDQVLYLPPISIFNLNIDYKNFLKLSNYEIISNQFELILLKSNKPN
INNNNNNDSFPINYPTANRIKISRIKNQNSSGYKSYSHQLEKYFQKKRLLKQNDIIVIST
KVNNEEELINSNNSNNNNNYNNNNNNNNNNNLVYFKVEIILCNQFENINGNQIYLIDKNT
TSIIQEGSSNSMVPSKIESFYWRGGDQEESKDNSMVPLELIYENEFKTIVDLISPFLMGD
KFSFDFNCTLLLNGPQGVGKRTLLNRVAKQMGIHVYEVDCYKLYDFVESKKDWNIRNVLE
QASNSTPTLLILKNFEVLEQTAQSMQQEKKESNLSQTLINILKDINDSNTSNINSNKYPL
IITVTVNSMDELSNKVRNWFKHEITLNSPDENQRFKILKYLTKNLPIDIGNTVSIKNLSI
RTASFLNSNLRALIQRSSINALKRVLSIQQMMNDEIKPIEIYNCGFLVMGDDIQKSLSEM
QEYQSSSIGAPKIPNVSWDDVGGLANVKSEIMDTIQLPLEHPHLFASGIGKRSGILLFGP
PGTGKTLLAKAIATECSLNFLSVKGPELINMYIGESEKNIREIFNKARQAKPCVIFFDEL
DSLAPSRGNGADSGGVMDRVVSQLLAELDGMQKSSDVFIIGATNRPDLLDSSLMRPGRLD
RLLYLGISSEKENQFKILQALTRKFNLADDVDLRKVVENCPMNLTGADFYALASDAMSNA
FHERITASINGEINEEEQNQKLIVYQNHFIKAVNSLVPSVSLDELEYYHKVQKQFSGNNK
S
NT seq
3606 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattggtttatttaaagatgaatggtttaatatatctatattaaacgataatttattt
ttaaagagatattgttatgaaagcaataataacaataacaataataatacactttataca
ataatcgtaccatttgataaatcaattaatccatcccaattcgatccttcaacaattaat
gattatttcatatttttatataaaaatacaaaaaaaataaatttaaatagtataaataaa
ttacaatataaaagtaataaaaaagagatactagtatcatttgatattacttatattcat
aatagtaataataataacaataataataataataaacttaaatcagtattaatttcaaat
agttgttcaaagaaattgaatttatttaataatgatattgttcatttaaaaccaattaaa
aagaaattaacagtattacaaagagtagttttattagcaaatgataatgaatcatttatt
gaatcttcaaatccatccgaatcatcatcatcaacaacaacaataaattcaaaatattta
gttaatgaagaatttagaaattatttagtagagaattcaatattatttcaaagtccaaat
aatatagttatagaaaatcatcaaaaacataaatcattttcatacaaagtgttggaatgt
ttcccattacttcaaggtactgtttcaaattcaacaactatcattatcattagtcctgat
gataaaattttaaatacattaccatcaaataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataaagaagaggaagtagaggaagaagaagtagaagtagaagaagaggaaaaagataat
aaattaaaattaaataataatttaagattatcaaattttattattcatccaataattaat
attagtaataatacaacaaccaaaaatgaagacataggtgactcaaataatttatttcat
ttcacaccaagttcaaaaggaattttatcaaataataaaaagtttattaatatttctcaa
ttaaagtcaataccaactgaaattgattttgaatttgatatttcaaaagaatatgattat
ttagttgattgtttagtttcattaaatactttaaaatctttaaatttatttaatggatct
tggattaaaattaaaaatataactaataataataataataataataacaaagaatatgaa
attgcaattagaatattttcaataacatcatcattaaaattaaaagatcaggttttatat
ttaccaccaatctcaatttttaatttaaatattgattataaaaactttttaaaattatca
aattatgaaataatttcaaatcaatttgaattaattttattaaaatcaaataaaccaaat
attaataataataataataatgatagttttccaattaattatccaacagcaaatagaatt
aaaatatcaagaattaaaaatcaaaattcaagtggttataaatcatattctcatcaatta
gagaaatattttcaaaaaaaaagattattaaaacaaaatgatataattgtaatatctaca
aaagtaaataatgaagaagaattaataaatagtaataatagtaataataataataattat
aataataataataataataataataataataatttagtttattttaaagttgaaataata
ctttgtaatcaatttgaaaatataaatggtaatcaaatttatttaattgataaaaataca
acatcaataattcaagaaggttcaagtaattcaatggtacccagtaaaattgaatcattt
tattggagaggaggggatcaagaagagtcaaaagataattcaatggtaccattagaatta
atttatgaaaatgaatttaaaactatagttgatttaatatcaccatttttaatgggtgat
aaattttcattcgatttcaattgtaccctattattaaatggtccacaaggtgttggaaaa
agaactttattaaatagagttgcaaaacaaatgggtattcatgtttatgaagttgattgt
tataaactttatgatttcgttgaatctaaaaaagattggaatattagaaacgtacttgaa
caagcttcaaattcaacaccaactttattaattttaaaaaattttgaagttttagaacaa
actgctcaaagtatgcaacaagaaaagaaagaatcaaatttatcacaaactttaattaat
attttaaaagatattaatgattcaaatactagtaatataaattcaaataaatatccatta
attataactgttactgttaattcaatggatgaattatcaaataaagttagaaattggttt
aaacatgaaattactttaaattcaccagatgaaaatcaaagatttaaaattttaaaatat
ttaacaaaaaatttaccaattgatattggtaatactgtatcaataaagaatttatcaatt
agaacagcatcatttttaaatagtaatttaagagcattaattcaaagatcatcaattaat
gcattaaagagagtattatcaattcaacaaatgatgaatgatgaaattaaaccaattgaa
atttataattgtggtttcttagtgatgggtgatgatattcaaaaatctttatcagagatg
caagaatatcaatcatcatcaattggtgctccaaaaataccaaatgtatcatgggatgat
gttggtggtttggcaaatgtaaagagtgaaattatggataccattcaattaccattagaa
catccacatttatttgccagtggtatcggtaagagatctggtattcttttatttggtcca
ccaggtactggtaaaactctattggcaaaagcaatcgcaactgaatgttcattgaatttc
ttatcggttaaaggcccagaattgatcaatatgtacattggtgaaagtgaaaagaacatt
agagaaatatttaacaaagcaagacaagccaaaccatgtgttatctttttcgatgaactg
gattctcttgcaccaagtagaggtaatggtgctgatagtggtggtgttatggaccgtgta
gtttctcaattactagctgaacttgatggtatgcaaaaatcatctgatgtattcatcatt
ggtgcaaccaacagacccgatttattagactcttccttaatgagacctggtagattagat
agattactctatttaggtataagctcagaaaaagaaaatcaatttaaaatacttcaagct
ctcactagaaaattcaatttagccgatgatgttgatcttagaaaagtcgttgaaaattgt
ccaatgaatcttactggtgctgatttctatgcattagcctctgatgcaatgtcaaatgct
tttcatgaaagaattactgcttcaatcaatggtgaaattaatgaagaagagcaaaatcaa
aaattaatagtttatcaaaatcatttcattaaagctgttaattctttagttccatctgtt
tctttagacgaactcgaatattatcataaagttcaaaaacaatttagtggtaataataaa
tcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
