Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0292886
Help
Entry
DDB_G0292886 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K22762
desumoylating isopeptidase 1 [EC:3.4.-.-]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ddi01002
]
DDB_G0292886
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ddi04121
]
DDB_G0292886
Peptidases and inhibitors [BR:
ddi01002
]
Cysteine peptidases
Family C97
DDB_G0292886
Ubiquitin system [BR:
ddi04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
UBL-specific proteases (ULPs)
DDB_G0292886
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_C97
PUL
LRAT
MUCL1
Atx10homo_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628933
NCBI-ProteinID:
XP_629414
dictyBase:
DDB_G0292886
UniProt:
Q54CK2
LinkDB
All DBs
Position
6:2214235..2215853
Genome browser
AA seq
494 aa
AA seq
DB search
MSQKVQLHVYDLSRGMAKTFSLPLLGRRIDAIYHTSIVVYGTEWYFGGGILRDIPFQTPH
GQPFEILELGETEIPKELFEEFLSGQTDRFRMDKYHLLENNCNHFTNECSNFLLGVGIPS
HIVDLPNEVMSTPFGAMLQPMINNFFSQQGWGNTMGPVNQQQQQQLPTTATTTNTTTTTT
TNTTTTIINNNNKVENHPKSNITHRHYKNSNKIQLILNSKSVLFEKSDVEAVFNKLKEFA
NKEFKGKENEQLLITQYEKESNQLKQIMKSVDVDTPISIETLKYFDGLLSTFSDDHQFPL
LEILRMLLLKNQSNQYYTNQSNPIISNILLKIQSKKLSKPSELLSFRVINNCFFSKSGIN
YLFNGNGNDNNNDNLNIVIESTIDALHSMDKILKRAVSTLAYNLSIHLSIDNSNHQEQAI
SLLGAIEHILSESDFSNEDPEISFRLLMALGTLIYCNDDLVEILKTLDFDFNKYLNSKEL
KISQLIKEIQSLLI
NT seq
1485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaaaaagttcaattacatgtttatgatctatcaagaggtatggcaaaaacgttc
tcattacctttattaggtcgacgaatagatgcaatttatcatacatcaatagttgtttat
ggaacagaatggtattttggtggtggtattttaagagatataccttttcaaactccacat
ggtcaaccatttgaaattttagaattaggtgaaactgaaataccaaaagaattatttgaa
gaatttttaagtggacaaacagatagatttagaatggataaatatcatttacttgagaat
aattgtaatcatttcacaaatgaatgtagtaatttcttattaggtgtcggcataccatca
catattgtagacttaccaaatgaagttatgagcacaccatttggtgcaatgttacaacca
atgattaataacttttttagtcaacaaggttggggtaatacaatgggtcctgtaaatcaa
caacaacaacaacaattaccaactacagctacaactacaaatactactaccactacaact
acaaatactacaactacaataattaataataataataaagttgaaaatcatccaaaatct
aatataacacatagacattataaaaattcaaataagatacaattaatattaaatagtaaa
tcagtgttatttgaaaagagtgatgttgaagcagtgtttaataaattaaaagaatttgct
aataaagaatttaaaggtaaagaaaatgagcaattattaattacccaatatgaaaaagaa
tctaatcaattgaaacaaattatgaaatcggtcgatgtggatacaccaatttcaattgaa
acattgaaatatttcgatggcttattatcgacattctctgacgaccaccaattcccatta
ttagaaatattaagaatgctattattaaagaatcaaagtaaccaatactacacaaatcaa
agtaacccaattatttctaatattctattaaaaattcaatctaaaaaattatcaaaacca
tcagaattattaagttttagagttataaataattgttttttttcaaaatctggtataaat
tatttatttaatggtaatggtaatgataataataatgataatttaaatattgttattgaa
tctactattgatgcattacatagtatggataaaattttaaagagagcagttagtacattg
gcttataatttatcaattcatttatctattgataattcaaatcatcaagaacaagcaatt
tcattattaggtgcaattgaacatattttatcggaatctgatttttcaaatgaagaccct
gaaatatcatttagattattaatggcattaggtacattaatatattgtaatgatgatctt
gttgaaattttaaaaactttagattttgattttaataaatatttaaattcaaaagaatta
aaaatttcacaattaattaaagaaattcaatcattattaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
