Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293002
Help
Entry
DDB_G0293002 CDS
T00245
Symbol
tagA
Name
(RefSeq) ABC transporter B family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
Peptidase_S8
ABC_tran
DUF4834
RsgA_GTPase
DUF3937
ABC_ATPase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629052
NCBI-ProteinID:
XP_629328
dictyBase:
DDB_G0293002
UniProt:
Q9GTN7
LinkDB
All DBs
Position
6:2501320..2506713
Genome browser
AA seq
1752 aa
AA seq
DB search
MNKKLFIFGLSLFLFLFIFNLSLSLKLSSKNNFYNHNHINNQIHRNNEGNNKLSKLIHLH
NDVIDTTISNRDNILFNKKSLNQKSKGSLFLVHLNGPIEKQVHNELIKQLDQLFNGGEII
HYIPDNTYLISMIGSDNNDNNNNNKIELINRLKELIPSIQWLKPLEPRLKISPLFKQNQF
QGDNQNEIDQLRIYYHENSNQQSNDIDNIISESSLTLVEKELISNNNNNNNNVLITVNLK
NSKLSLESIIYKISTRSLVYWIEPSSSKLIKHTPSNKFAHYSIQSGSASTTSTPIWDVIG
IKGDGEIVGCADTGIDINHCFFYDTNPIGSTHRKIISYSSGNGDQIDEIDGHGTHIVGTI
IGSTTVDPSVSEFSGGAPNSKVAFVDLQVGSGNGLSIQSNLTAIYQSTYDQNAKVHCDAW
NSNIGPFYTGVTEMIDRFQWDHPDFLVVRSAGNNVNFGFNSIYTLSQESTSKNSLVVGSS
NQPSSTYLSSIDYWDWDFIYNSIRTSVCTQGQSIYGITCSDVPTQTTSVDIQTQCCSNPI
LAKICCSTEIQQQYQTNSTVYSEFIPSLFSGVGPTSDGRLKPDLLAPGSPIISSRSLGPS
STINHCSPITSGIATSALIAMEGSSQAAAVATSAAVLVRQYYRDGYFINGKVNSSVGFQP
SASLVKATLINTASINVDSTLEYSQGFGNIQLSKLITTTNAQTTSLDIPSSIEKADPIIN
TGETNSYCFSLDSKADIDITLVWTDPAGSPLSTFTLVNNLDLALLAFVDGELSIYSGNSE
TIFKNTSQVIFDQLNNVEVIRIKDAPIGSYDVKIFGTNIVIPNQSYSVVIRTSGGTTLMK
ESECAQCFYDPNDDQSQMCEFDNGIGTQYCKDDNRFSKCVVYECNTGYVFDNGITKSCVT
TLALTLYDIVLLGIFGIIIVGAVIFVLVCYKSKSLDQNKYFSLSKDKGGDGNSIRSNSVA
GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNGKQSNIELNSVGGGDDGTPNGDDQ
QQQNNSPQYDEDGRLISGQEVEISIFEVISLGKPESKILGLALFLSFIDVALGLAVPLVA
ANIFDYLYAGETGKISTTILTFALIIIGMIIVQFLSGILLALAGHRIIARLRREMFASLL
KQDMAFFNERKTGELMSRLASDVSSVRSIISDSIPHMIIQIATIGGTLIMLFIISWKLSL
VVLCPLPILLVFSKFYGGYIEVISVKVQDALADAATHAAETLFNMKTVRWFSAEEREVAK
FSKLISVSYKIALKMTIWNGIYSSTSGIFEQLSVFILLWYGSSLVSNGDLTPSMLIAFNL
FLPFITGAVTQVASLYTTYKSYKGSSYRFFEIMQRVPDIQGEGGITRTKVRGDIQFNKVS
FAYSSNPDQLVLEKIDIKFEPGTITALIGPSGGGKSTMLSLIGRLYNIDGGSITLDGTNI
KDFNVPNLHEHISIVNQEPSLFSGSIAENIMFGKPTATRSEIIEACKQANAHDFITAMPE
GYDTLIGERGTALSGGQKQRIAIARTIIKNPTVLLLDETTSELDVESEKLVQDSIDKLVV
GRTVIIVAHRLTTILTADIIAVVSDSTISEMGTPEELLAKKGMFYDFVQIQYGKQGEELD
IQLPSNSRNTRNADKLRNRSETIKQIAKINNIIPIHRPQRGDDDNEDDENNSGQGSSRSP
PPMWRQAKKNANVNKSMLLTRRNTHVQHQSSSGGWQKGNVDDKLQRVLQKSRKKGFMNNQ
DHKDIKATLVLY
NT seq
5259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaattatttatttttggattatcattatttttatttttatttatatttaat
ttatcattaagtttaaaattatcatctaaaaataacttttataatcataatcatataaat
aatcaaattcatagaaataatgaaggtaataataaattatcaaaattaattcatttacat
aatgatgtaattgatacaaccatttcaaatagagataatattttatttaataagaaatct
ttaaatcaaaaatcaaagggaagtttatttttagtccatttaaatggaccaattgaaaaa
caagtacataatgaattaataaaacaattggatcaattatttaatggtggtgaaattatt
cattatattcctgataatacttatttaatatcaatgattggtagtgacaacaatgataat
aataataataacaaaattgaattaattaatagattaaaagaattaataccatcaattcaa
tggttaaaaccattagaaccaagattaaaaatttcaccattatttaaacaaaatcaattc
caaggtgataatcaaaatgaaattgatcaacttagaatttattatcatgaaaatagtaat
caacaatcaaatgatattgataatattatttcagaatcatcattaactttggttgaaaaa
gaattaatttcaaataataataataataataataatgttttaattacagttaatttaaaa
aatagtaaattatcattagaatcaataatttataaaatttcaacaaggtcattagtttat
tggattgaaccaagttcaagtaaattaattaaacatacaccaagtaataaatttgctcac
tattcaattcaaagtggtagtgcatctacaacttcaaccccaatttgggatgttattgga
attaaaggtgatggtgaaattgttggttgtgcagatactggtattgatattaatcattgt
ttcttttatgatacaaatccaattggttcgactcatagaaaaatcatttcttattcaagt
ggaaatggtgatcaaatcgatgaaattgatggtcatggtactcatattgttggtactatt
ataggctcaactactgtggatccaagtgtttcagaatttagtggtggcgctccaaattca
aaggttgcattcgttgatttacaagttggtagtggtaatggattatcaattcaatcaaat
ttaacagcaatctatcaatcaacctatgatcaaaatgcaaaagtacattgtgatgcatgg
aattcaaatattggtccattctatactggtgtcactgaaatgatagatagattccaatgg
gaccacccagatttccttgtagttagatcagcaggaaataatgtaaactttggtttcaat
tcaatctataccttatcacaagaatcaactagtaaaaattcattggtagttggtagttca
aatcaaccatcaagtacctatttatcatcaattgattattgggactgggatttcatttat
aattcaattagaacttcagtttgtactcaaggtcaatctatttatggtataacttgttca
gatgtaccaactcaaacaacctctgtcgatattcaaactcaatgttgttcaaatccaatt
ttggctaaaatttgttgttcaactgaaattcaacaacaatatcaaaccaattcaacagtt
tatagtgaattcattccaagtttatttagtggtgttggtccaacatctgatggtcgtttg
aaaccagatttattagcaccaggttcaccaattatttcatcacgttctttgggtccatca
tcaaccattaatcattgttcaccaattacatcaggtattgcaacatcggctttaatcgct
atggaaggttcaagtcaagcagctgctgtcgctacaagtgccgcagttttagttcgtcaa
tactatagagatggttattttattaatggtaaagttaattcatctgtgggattccaacca
tcagcatcattggttaaagcaaccttaatcaatactgcaagtattaatgttgattcaaca
ttagaatattcacaaggatttggtaatattcaactttcaaagttaatcacaactacaaat
gcccaaaccacatctttagacattccatcatcaattgaaaaagctgatccaataattaat
actggtgaaaccaattcatattgtttctcactcgatagtaaagcagatattgatataaca
ttggtttggacagatcctgccggttcaccattatcaacatttactttggtaaataatttg
gatttagctttacttgcatttgttgatggtgaactttcaatatattcaggaaatagtgaa
accattttcaaaaatacaagccaagtaattttcgatcaattaaataatgttgaagtcatt
agaattaaggatgcaccaattggtagttatgatgttaaaatatttggtacaaatattgta
attccaaatcaatcctattcagttgtaattagaacttccggtggtacaactttaatgaag
gaatcagaatgtgctcaatgtttctatgatccaaatgatgatcaatctcaaatgtgtgaa
tttgataatggtattggtacacaatattgtaaagatgataatagattttcaaaatgtgtc
gtctatgaatgtaatacaggttatgtctttgataatggtatcacaaagtcttgtgtaacc
accttggcattaacactctatgatattgtattattgggtatttttggtataattattgtt
ggtgctgtaatatttgttttggtttgttataaatctaaatcattggatcaaaataaatat
ttttcattatcaaaagataaaggaggtgatggaaattcaataagatcaaatagtgttgct
ggaaataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataatagtaatggaaaacaatca
aatattgaattaaattcagttggtggtggtgatgatggtactccaaatggtgatgatcaa
caacaacaaaataactcaccacaatatgatgaagatggaagattaatttcaggtcaagaa
gttgaaatttcaatatttgaagtaatttcattaggtaaaccagaaagtaaaatcttgggt
ttagcattatttttatcattcattgatgttgcattaggtttagcagtaccattagtagca
gccaatattttcgattatttatatgcaggtgaaacgggtaaaatctcaacaactatttta
acatttgccttaattatcattggtatgattattgttcaattcttgtctggtattttatta
gctttggcaggtcacagaattattgcaagactacgtcgtgaaatgtttgcatcccttttg
aaacaagatatggcattctttaatgaaagaaaaactggtgaactaatgagtcgtttagca
agtgatgtatcatcagtacgttcaattatctctgatagtattccacatatgatcattcaa
attgctaccattggtggtacattaattatgttatttattatctcttggaagttatcattg
gttgtactttgtccattaccaattctattggttttctcaaaattctatggtggttatatt
gaagttatctctgttaaagttcaagatgctttggccgatgctgcaactcatgcagctgaa
actttattcaatatgaaaaccgttcgttggttctctgctgaagaaagagaagttgcaaaa
ttctcaaaacttattagtgtatcttataaaattgctttaaaaatgacaatttggaatggt
atttattcttcaacttctggtatttttgaacaattatcagtatttattttattatggtat
ggttcatcattagttagtaatggtgatttaacaccatcaatgctaattgcttttaattta
tttttaccatttattactggagcagttacacaagttgcatcattgtatacaacctataaa
tcctataaaggatctagttatagattctttgaaattatgcaacgtgtaccggatatccaa
ggagaaggtggtataactcgtactaaagttcgtggtgatattcaatttaataaggttagt
ttcgcatattcatcaaatcctgatcaactagttttggaaaagattgatatcaaatttgaa
ccaggtacaattacagcattaattggtccatcaggtggtggtaaatcaactatgctttca
ttgattggtagattatataatatcgatggtggttcaattacattggatggcacaaacatt
aaagatttcaatgtaccaaatcttcatgaacatatctcaattgtaaatcaagaaccatca
ttatttagtggctcaattgcagagaatattatgtttggtaaaccaactgcaacccgttca
gagattattgaagcatgtaaacaagcaaatgcccatgatttcatcactgcaatgccagaa
ggttacgatacattaattggtgaacgtggtacagctttatcaggtggtcaaaagcaacgt
atcgcaattgcacgtactatcatcaaaaatccaaccgttctcttattggatgaaaccact
agtgagttggatgtagaaagtgagaaattagttcaagattccattgataaattagtagta
ggccgtacagttatcattgtagctcatcgtcttacaacaattctaaccgctgatatcatt
gccgtagtaagtgattcaaccatctctgaaatgggtacaccagaggaattgttggcaaag
aagggtatgttttatgatttcgttcaaattcaatatggtaaacaaggtgaagaacttgat
attcaattaccaagtaatagtagaaatactagaaatgctgataaattacgtaatcgttct
gaaactatcaaacaaattgctaaaattaataatatcataccaattcatcgtccacaacgt
ggcgacgacgacaacgaagatgacgaaaataatagtggccaaggttcatcacgttcacca
ccaccaatgtggagacaagccaagaagaatgcaaatgttaataaatcaatgttattaact
cgtcgtaatactcatgtacaacatcaatcatcatcgggtggttggcaaaaaggtaatgtt
gatgataaacttcaaagagttttacaaaaatcaagaaagaaaggtttcatgaataatcaa
gaccataaagacattaaagcaacacttgtattatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
