Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293130
Help
Entry
DDB_G0293130 CDS
T00245
Symbol
clcF
Name
(RefSeq) CLC 1/2 family protein
KO
K05011
chloride channel 2
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
ddi04040
]
DDB_G0293130 (clcF)
Ion channels [BR:
ddi04040
]
Chloride channels
Chloride channel (CLC)
DDB_G0293130 (clcF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Voltage_CLC
CBS
MgtE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629076
NCBI-ProteinID:
XP_629352
dictyBase:
DDB_G0293130
UniProt:
Q54C67
LinkDB
All DBs
Position
6:2574912..2577543
Genome browser
AA seq
809 aa
AA seq
DB search
MSTSKYSKMISSKHGYKKTRIKNNTSDSDLFNLVMPKADVVGFKSKQGGISRQAISWAKF
ARLNNFYIWLFLAAVGLLGSIYLVAVDLIFKYVVFSWREAFMSLTENYFLQYLSFIAWTV
ALATGSCFIIKKICPAAVGSGIPDLKSIFSGFWNPFVVAPMVLLWKTIGLLLSYGSGLSI
GKEGPYIHISATLANTLLSIKPFKSIAQNDTQRSQLLAACCALGVAATFGSPIGGVLFSI
EATGTFYLISNYWRAFFTATVGAVGIKILLSNPSNDLLESFRTHFADLNLASAQLIAFII
LGVLCGLLASLFISLYTKIYNWKKHNAELFKKITPFGEVIIVAAATAILSFPLKFLRLDH
ATAVHTMFTATPDSDNSEVLSELAVWTDSMPFNHGIILACFLYVVVKLVLTAVSITLPIP
YGIYIPLFAIGSAVGRFVGELMLVLFPNSKEIYPTGYAVVGAAALCGGATRTVSSAMIIL
ELTNDLTYMVPVLLGVVLSCGIGNLLNHSIYDCFLKNKNLPYLPFYKAKSDSLIARDVMK
RDLYYVCQNTTLSQISNLLKRVDEHSIPVVSSDNDLQLIGTISTTTLEEVIAYHERLHSY
SKSPLSLSDNGIDINDNDNNDNINNNQNNNNNNNNNNNNNNSNNQNNSLVSEAIEMNVLS
DSDNDENNNLIPNIPINDNNIIIQNNIRNNNNNNFSDNNNNYNNNNYNNNNNNNNDNNTN
NDNNINNNSNDINESISEETTIDLVQMELQNPWVVIDSSPFQIQETMPVRKIVFMFMMLG
GNILYVTNKGKLTGVVAKTELVHQNNNKH
NT seq
2430 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtacaagtaaatactcaaaaatgatatcaagtaaacatggatataaaaaaacaaga
attaagaataatacatcagattcggatttatttaatttggtaatgccaaaagcagatgtt
gttggatttaaatcaaaacaaggtggtatttcaagacaagctatatcatgggctaaattt
gcaagattaaataatttttatatttggttatttttagcggcagttggtttattaggatca
atttatttggtagcggtagatttaatatttaaatatgttgtattttcatggagagaagca
ttcatgagcttgacagagaattatttcttacaatatcttagcttcattgcatggactgtt
gcattggcgactggaagttgtttcatcattaaaaagatatgtcctgcagctgttggatcg
ggtataccagatttaaaatcaatattctctggattttggaacccattcgttgtggcacct
atggtgttgttatggaaaaccattggtttgctattatcttatggtagtgggttgtcaatt
ggtaaggagggaccatacattcatatcagtgcgacattggcaaatacattactctcaatt
aaaccattcaaatcaatcgctcaaaatgatactcaacgttctcaattgttggcagcatgt
tgtgctttgggtgttgccgctacatttgggtcacccattggtggagtattattctcaatt
gaggccactggtactttttatttaatttcaaactattggagagcatttttcacagctact
gttggtgcggtcggtattaaaatcctcttgtcaaatccttcaaatgatctattggaatct
tttcgtactcatttcgctgatttaaatcttgcaagtgctcaattaattgctttcatcatt
ttaggtgtactttgtggtttattagcttcattattcatctctctttatactaaaatttat
aattggaaaaaacataatgctgaactttttaaaaagataacaccatttggtgaagttata
attgtagcagcagcaacagcaattttaagttttccattaaaatttttaagattagatcat
gcgacagcagtacatacaatgtttacagcaacaccagatagtgataatagtgaggtatta
tcggagttggcagtttggaccgattcaatgccattcaatcatggtattattttagcatgt
tttttatatgtagttgtcaaattggtattaacagccgtctctattacattaccaattcca
tatggtatttatattccattgtttgcaattggttcagcagttggtagattcgttggtgaa
cttatgttggttttattcccaaattcaaaagagatttatccaactggttatgctgtggta
ggagcggctgcactttgtggtggtgccactagaaccgtaagttcagcaatgattattttg
gaattaacaaacgatttaacatatatggtaccagtattattgggtgtagtactttcttgt
ggtattggtaatctattaaatcattcaatctatgattgtttcctaaagaataagaattta
ccatatttaccattctataaagcgaaatccgatagtttaatagcacgagatgtaatgaaa
cgtgacctctactatgtttgtcaaaatacaactttatctcaaatttcaaatctcttaaag
agagtcgatgaacattcaattccagtagtttcctcagataatgatttacaattaattggt
actatctcaacaacaactttagaagaagtaattgcatatcatgaacgtttgcattcttat
tcaaaatcaccattatctttatctgataatggtattgatataaatgataatgacaataat
gataatattaataataatcaaaataataataataataataataataataataataataat
aatagtaataatcaaaataattcactagttagtgaagcaattgaaatgaatgttttatca
gattcagataatgatgaaaataataatttaataccaaatattccaattaatgataataat
attattattcaaaataatataagaaataataataataataattttagcgataataataat
aattataataataataattataataataataataataataataatgataataatacgaat
aatgataataatataaataataattcaaacgatataaatgagtcaatctcagaggaaaca
acaattgatttagttcaaatggagttacaaaatccttgggttgtcattgattcatcccca
ttccaaattcaagaaacgatgccagttagaaagatcgtttttatgtttatgatgttgggc
ggtaatattttatatgttaccaacaaaggaaaattaactggtgttgttgcgaaaacggaa
ttagtgcatcaaaataataataaacattaa
DBGET
integrated database retrieval system