Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293258
Help
Entry
DDB_G0293258 CDS
T00245
Name
(RefSeq) myotubularin-related protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Myotub-related
FERM_f0
PH-GRAM_MTMR6-like
DSPc
DUF3439
Crinkler
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629093
NCBI-ProteinID:
XP_629214
dictyBase:
DDB_G0293258
UniProt:
Q54C52
LinkDB
All DBs
Position
6:2612161..2616005
Genome browser
AA seq
1192 aa
AA seq
DB search
MIRTEERNKNNYNTFNGNNDNNNNNNNEIINKNNKNVINNNGSWVSSNKSFKNQFYLKET
LDSFSSNPVNEIIILRISIPELNVISLFKIDRDSTVKELLYQVISKKSLQMNVYSLYLMP
NKRVDFGMWLDDSKPLFLYELNDNDLVECKRRLITDFSNQFHIKVVFPEQMKSKTIHVDA
KMLVKDAINLINSKMDIQTQIPNQDINNYGLYSLILDTTTTNTPSTNTPSTSILMKDDDL
LSSYSMGSNMNVMEFRKKEIVVVSLFNYQNNNNNNNNNKNNNNNSSVSGGNGYQTLISST
LSTCKTTTTTTTITTINSNNMTNNNNNNKLPPPPVPKRSDLQSQQESPPPSPQLPPPPLP
PSPQQIPSPPSPPTLSIQIKSNVYDIINEIKEWLKLNFNIEITNQYKMMLLQSRQLKLWL
IDSKPLNSYHIRKNDSLYLFPKITEEVNLDEGICLKVRFSACNVVNDVNSSNTNSRLTTK
TLPGEVLILKIENVVMLNIVSRKPLFGDIYMTNFQLIFITREANKEYNIHLGVISKIDKV
SNKSKQTFCFLDLHCKDFRFIRLVFVSKDKSRKKLYLTLKHQCFPGIQTKLFSFYNKEVF
YYKQNNIKIGGGGGGGDCFISKIGDKINGWLIYNSEREYKRMNIKAGSGWRISTINNDFK
KCESYPKLIVVPETITDTQLVDVFIFRSKGRIPVLSWKHPSNGTTITRCSQPLVGLTGSR
CIDDELLIKQISSPTIIQQPQSQQQSSSPPPSFINYSSTTSTNSTPNLNQINNINDNFKS
LNNSGNSIVFNKRQSYISNSLSNLESSLVSNNNNNNSNINNNNNNNNVEKILNLLDARPK
VNAMSNKAFMGAGFENVSTFYSCCNIDFLNIGNIHVMRDSYEKLKSTCIDSLGGIKEIKN
SNNTNQDNNNNNFNLNNSNSNNNNNNTNVNSDNNNNNNIVRSESEEELSSFLLENETPIS
SIHSSDIIDNNEGYNGTNIKWFEGIESSRWFDHIILILKGSIRIVESIHKQCTSVLIHCS
DGWDRTPQLSSISMIMLDPYYRTLEGFIVLIEKEWLEFGHKFNDRIGQGDSKHLDERSPV
FVQFIECVYHIMEQFKNYFEFNSQVLVEILVNGLYSNRFGTFLYNTVREREINKVQLETA
SIWSLILSNYSFYINQNYTRMDKVLIPSIAIPYFSLWKDYYLKYLLSTTSIN
NT seq
3579 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagaactgaagaaagaaataaaaataattataacacctttaatggtaacaatgat
aataataataataataataatgaaataattaataaaaataataaaaatgttattaataat
aatggatcttgggtatcttcaaataaatcatttaaaaatcaattttatttaaaggaaaca
ttggattcattttcatcaaatccagttaacgagataattatattacgtatatcaatacca
gagttaaatgttatttcattatttaaaattgatagagattcaacagttaaggaattactt
taccaagttataagtaaaaaaagtttacaaatgaatgtttatagtttatatttaatgcca
aataaaagagttgattttggaatgtggttagatgattcaaaaccattgtttctatatgaa
ttgaatgataatgatttagttgaatgtaaaagaagattaattacagatttctcaaatcaa
tttcatattaaagttgtttttcctgaacaaatgaaatcaaaaacaattcatgttgatgca
aaaatgttagttaaagatgcaataaatttaataaattcaaaaatggatattcaaactcaa
attccaaatcaagatattaataattatggtttatattctttaattttagatacaacaaca
actaatacaccatcaacaaatacaccatcaacttcaattttaatgaaagatgatgattta
ttatcaagttattcaatgggtagtaatatgaatgtaatggaatttagaaaaaaagaaatt
gtagttgtatcattatttaattatcaaaataataataataataataataataataaaaat
aataataataatagtagtgttagtggtggtaatggatatcaaacattaatatcatcaaca
ttatcaacatgtaaaacaacaacaacaacaacaacaataacaacaataaatagtaataat
atgacaaataataataataataataaattaccaccaccaccagtaccaaaaaggtctgat
ttacaaagtcaacaagaatcaccaccaccatcaccacaacttccaccaccaccactacca
ccatcaccacaacaaattccatcaccaccatcaccaccaacattatcaattcaaattaaa
tcaaatgtttatgatattataaatgaaattaaagagtggttaaaattaaattttaatatt
gaaattacaaatcaatataagatgatgttattacaatcaagacaattaaaattatggtta
attgatagtaaaccattaaattcttatcatattagaaagaatgattcattatatttattt
ccaaagataacagaagaagttaatcttgatgaaggaatttgtttaaaagttagattctct
gcatgtaatgttgtaaatgatgtaaatagtagtaatacaaatagtagattaactacaaaa
actttacctggtgaagtattaattttaaaaattgaaaatgttgtaatgttaaatatagtt
tcaagaaaaccattatttggtgatatttatatgacaaattttcaattaatttttataact
agagaagctaataaagaatataatattcatttaggagtaatttcaaaaattgataaagtt
tcaaataaatcaaaacaaacattttgttttttagatttacattgtaaagattttagattt
attagattagtatttgtttctaaagataaatctagaaagaaattatatttaacattaaaa
catcaatgttttcctggtattcaaactaaactattttcattttataataaagaagtattt
tattataaacaaaataatataaaaattggtggtggtggtggtggtggtgattgttttatt
agtaaaattggtgataaaattaatggttggttaatttataattcagagagagaatataag
agaatgaatattaaagctggaagtggttggagaatttcaacaattaataatgattttaaa
aagtgtgagagttatccaaaattaatagttgtacctgaaacaatcactgatactcaattg
gttgatgttttcatatttagatcaaaaggtcgtatccctgtattatcttggaaacatcct
tcaaatggtacaacaattacaagatgttcacaacctttagttggtttaactggtagtaga
tgtattgatgatgaattattaattaaacaaatttcatcaccaacaataattcaacaacca
caatcacaacaacaatcttcatcacctccaccttcatttattaattattcatcaacaaca
tcaacaaactcaacaccaaatttaaatcaaattaataatattaatgataattttaaaagt
ttaaataattcaggaaacagtatagtttttaataaaaggcaatcatacatttcaaattca
ttatcaaatttagaatcatcattagttagtaataataataataataatagtaatattaat
aataataataataataataatgttgaaaaaatattaaatttattagatgctagaccaaaa
gttaatgcaatgagtaataaagcatttatgggagcaggatttgaaaatgtttcaacattt
tattcatgttgtaatatagatttcttaaatataggtaatattcatgtaatgcgtgattct
tatgaaaaattaaaatcaacttgtatagattcacttggtggtattaaagaaattaaaaat
agtaataatacaaatcaagataataataataataattttaatttaaataatagtaatagt
aataataataataataatacaaatgtaaatagtgataataataataataataatattgta
agaagtgaaagtgaagaagaattaagtagttttttattagagaatgaaacaccaattagt
agtattcatagtagtgatataattgataataatgaaggatataatggtacaaatattaaa
tggtttgaaggtattgaatcatctagatggtttgatcatattattttaatattaaaaggt
tcaattagaatcgttgaatcaattcataaacaatgtacatctgtattaattcattgtagt
gatggttgggatagaacacctcagctatcctctatatcaatgattatgttagacccatac
tatagaacattggagggtttcattgtgttgattgaaaaggaatggttggaatttggtcat
aaatttaatgatcgtattggtcagggtgattcaaaacatctagatgaaaggtcacctgta
ttcgttcaattcattgaatgcgtgtatcatataatggagcaatttaaaaattatttcgaa
ttcaatagtcaagtccttgttgaaatattagttaatggtttatattcaaataggttcggt
acatttttatataatactgtaagagaaagagaaatcaataaagtacaattggaaactgct
tcaatttggtctttaatcttatcaaattactctttttatattaatcaaaactatacaaga
atggataaagttttaataccttcaattgcaataccatattttagtctttggaaagattat
tatttaaaatatttattatcaacaacttcaataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system