Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293266
Help
Entry
DDB_G0293266 CDS
T00245
Symbol
gxcY
Name
(RefSeq) RhoGEF domain-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RhoGEF
PH
Arm
IQ_SEC7_PH
PH_16
SpoVAC_SpoVAEB
DUF3043
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629089
NCBI-ProteinID:
XP_629210
dictyBase:
DDB_G0293266
UniProt:
Q54C56
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(2602478..2605900)
Genome browser
AA seq
1076 aa
AA seq
DB search
MEKIRNTIERLHSSDVSIQENCLRILINISTENEYHNIILKLVGSKRFKELIQSNNEVIQ
MLSAWLLSHLGLKYENSEIILKWDLIEIIIKLLKESERENEDITEKVLWLMLNITLNYDN
SHLLLEYGIVEILIEFLKRKSNNYSMVILSCGILRNLLHKDSCGEYLDNQKIFCHSGIIQ
TINQMLIATTNRTSQREQQASNQMILSLIGLIHVLTIYHPLIRRILAISGILNQLVTLLS
SPSTPLPIKEQTIKILINLSLTEETERPILQAGAIMPLVDIVVSISSTTIELKSLCVSCL
ANLTSNADIRKVLRSNYLIDGLSELLKDKPNHTSQLLEAISLLIANLCIDEHCRFKISQS
DCGRDLIELINYPHGQVRDSILNALDNIKVPISFETQNELAMIEDMSDLDPFDSLSFQTT
CSNQNTLNSPGFRGSIFRFSKSTSPPNNNNNLTNSIDSSNSNSKSNSINNSTSNSASSLL
QSPIYQSQPQLPPPPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQFYINTPLQSPQQSPQVVQQHQQI
NNLPSLSIEQQSPQIKSQTTPQLQAQQQAQQQQIQSPQIQSQTIQQNIIEEQPQFQAQQQ
QQQQQQQQQQQQQQQQQQDEPNKLFRRGRIIKELIDTEQVYIHALSVCIKVYYNPLVVSP
TIPPIISLDLVETIFSNIDKVFRVSCEFLKKLRGMSDKKDVLELAHCLQWYWDQKDTIEE
LRTYINNFNKAMDCVHENRAKLPKFKEFLEKCQFSEQCKSETIDSYLIRPVQRVPRYILL
LTDLLNHTVDTLERVAIQDVLKRTKQITDQLNESKRKAENVSKTLLLQEKVIGLSEILFS
PNIYANKENAIINSGSSNSAGSSHHGSSNSIIYINGSSSNNNNNSLNTSINNNNISLNSS
INNNGLNMSNNNNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNLNTSSSNNVTTTTTTNLNIINRQLIKD
GLMMESRQKKVSKYRYFILFNDLLFITKQKKNKYSIYKTIPLIDLKVLEVPQSANNTETG
LYCFQINWSGDKSENGMVISTTEADKEDWIKELKESINCVKKNHLHNIMKSQLIFN
NT seq
3231 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaaaattaggaatacaattgaaagattacattcttcagatgtctcaattcaagaa
aattgtttaagaattttaattaatatatcaacagagaatgaatatcataatataatttta
aaattagttggaagtaaaaggtttaaagaattaatacaatcaaataatgaagttattcaa
atgctttcagcttggttattaagtcatttaggtttaaaatatgaaaatagtgaaattata
ttaaaatgggatttaattgaaattataataaaattattaaaagaaagtgaaagagagaat
gaagatataacggaaaaggtattatggttaatgttaaatattacattgaattatgataat
tctcatttattattagaatatggtatagttgaaatattgattgagtttttaaagagaaag
agtaataattatagtatggttatattatcatgtggtatacttaggaatttattacataaa
gattcatgtggagaatatttagataatcaaaagatattttgtcattcaggtatcattcaa
actataaatcaaatgttaatagccaccactaacaggacatcccaacgagagcagcaggcg
tccaatcagatgatattgtccttgattgggttgatacatgttttgaccatctaccatccc
ctaatccgtaggattctagccatatcaggcatattgaaccaattggttaccctgctatca
tccccttcaacgcctcttccaatcaaggagcaaaccataaagatcctaatcaacctttca
ttgaccgaagaaactgaacgaccaatattacaagcgggtgcgatcatgccattggttgat
attgtcgtatcgataagttccactacgatagagttgaaatcattgtgtgtgagttgttta
gccaatttaacatcaaatgctgatattagaaaagtgttgagatcaaattatctcatcgat
gggttatcggaattgttaaaagataaacccaatcatacaagtcaactattggaggcgata
tcattactcattgccaatctatgcattgatgaacattgtagatttaaaatctctcaatca
gattgtggccgtgatttgatagagttaataaattatccacatggtcaagttagagattca
attttaaatgcattggataatattaaagtaccaatctcttttgaaactcaaaatgaatta
gcaatgatagaggatatgtctgatttagatcctttcgatagtttaagttttcaaacaact
tgttcaaatcaaaatactctcaattcacctggttttagaggttcaatatttcgtttttca
aaaagtacttcaccaccaaataataataataatttaacaaattctattgattcatctaat
agtaatagtaaatcaaatagtattaataatagtacaagtaatagtgcaagtagtttactt
caatcaccaatatatcaatcacaacctcaattaccaccaccaccacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaattctatatt
aatactccattacaatcaccacaacaatcaccacaagtagtacaacaacaccaacaaatt
aataatttaccatccttatctattgaacaacaatcaccacaaattaaatcacaaacaaca
ccacaattacaagcacaacaacaagcacaacaacaacaaatacaatcaccacaaattcaa
tcacaaacaatacaacaaaatattattgaagaacaaccacaatttcaagctcaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagatgaa
ccaaataaattatttagaagaggtagaattattaaagaattaattgatacagaacaagtt
tatatacatgcattatcagtttgtattaaagtctattataatccattagtagtatcacca
actataccaccaattataagtttagatttagtagagacaatattttcaaatattgataaa
gtatttagagttagttgtgaattcttaaaaaagttaagaggaatgtcagacaagaaggat
gtattagagttggctcattgtttacaatggtattgggatcaaaaagataccattgaagaa
cttcgtacctatattaacaatttcaataaagcaatggattgtgtacatgaaaatcgtgca
aaattaccaaaatttaaagagtttctagagaaatgtcaattctctgaacaatgtaaaagt
gaaacaatcgatagttatttaattagacccgttcaaagagtaccacgttacattctactc
ttaactgatctattaaatcatacagttgatactttggaaagagttgcaattcaagatgtc
ctaaaaagaacaaaacaaatcactgatcaattaaatgaatcaaagagaaaagctgaaaat
gtttcaaaaactttattacttcaagaaaaggttataggtttatctgaaatattattctct
ccaaatatttatgcaaataaagaaaatgctataattaatagtggtagtagtaatagtgct
ggtagtagtcatcatggtagtagtaatagtataatttatataaatggtagtagtagtaat
aataataataatagtttaaatacaagtattaataataataatattagtttaaattcaagt
attaataataatggtttaaatatgagtaataataataataatagtaataataataataat
aataataataataataataataataataataataataatttaaatacaagtagttcaaat
aatgtaacaacaacaacaacaacaaatttaaatataattaatagacaattaattaaagat
ggattaatgatggaaagtagacaaaagaaagtttcaaaatatagatatttcatattattt
aatgatttattatttattactaaacaaaagaaaaacaaatatagtatttataaaactata
ccattgattgatttaaaggttttagaagttccacaatctgcaaataatacagagactggt
ttatattgttttcaaattaattggagtggagataaaagtgaaaatggtatggtaattagt
acaactgaagctgataaagaagattggattaaagaattaaaagaatctatcaattgtgta
aagaaaaatcatttacataatattatgaaatcacaattaatttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
