Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293438
Help
Entry
DDB_G0293438 CDS
T00245
Symbol
abcB2
Name
(RefSeq) ABC transporter B family protein
KO
K05658
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1 [EC:
7.6.2.2
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DDB_G0293438 (abcB2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ddi02000
]
DDB_G0293438 (abcB2)
04147 Exosome [BR:
ddi04147
]
DDB_G0293438 (abcB2)
04090 CD molecules [BR:
ddi04090
]
DDB_G0293438 (abcB2)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
7. Translocases
7.6 Catalysing the translocation of other compounds
7.6.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
7.6.2.2 ABC-type xenobiotic transporter
DDB_G0293438 (abcB2)
Transporters [BR:
ddi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB1, 4, 5 subgroups
DDB_G0293438 (abcB2)
Exosome [BR:
ddi04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
DDB_G0293438 (abcB2)
CD molecules [BR:
ddi04090
]
Proteins
DDB_G0293438 (abcB2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
ABC_ATPase
AAA_22
RsgA_GTPase
AAA_29
nSTAND1
DUF3487
Bac_export_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629226
NCBI-ProteinID:
XP_629136
dictyBase:
DDB_G0293438
UniProt:
Q54BT3
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(2891271..2895850)
Genome browser
AA seq
1397 aa
AA seq
DB search
MSDKSNDGGENDSLPMDNININSIDDENNNDINNQDDNENNNNNNNNKNSDDNEENLKDY
KNKKEDFGNIKMDTIDDRPTNNGILSPIDITSDGGDSVKTLSTTQSKKLDEGEKKEGEVG
PQVPFFSLFRFAKPFDILLMIIGTIGALANGVSMPAISIVFGRLMNSFSPENLADPNFDL
VETVTSNAMYFIYIGCGVFVCSYVEVAFWMLAGERQAVRCRKAYLKAILKQEIGWYDVTK
SSELSTRISSDTLLFQEAIGEKIGNFLHHTSTFICGFIVGFVNGWQLTLVIFALTPLIAA
AGAFMTKMMADLTKKGQDAYAKAGGVAEEKIGSIRTVSTFSGEPFEVKRYTERLKEALDI
GTKKGIMNGIGIGLVFLVLFGTYSLSFWYGGKLIVDRKWNPVPDRPWQGGDVLTVFFSVI
MGAMALGQASPNVASFANGRGAAFKIYEVVDRNSKIDPFSTEGRSIEETVQGNIEYRNIG
FSYPSRPDVKIFNNFNLTIKKGTTVALVGDSGGGKSSVIGLLERFYDPDEGEVYLDGTNI
KEINIHSLRRNIGLVSQEPVLFANSIAENIRYGNENATMDQIIEACKTANAHDFISALPE
GYDTQVGEKGVQMSGGQKQRIAIARAMIKDPKILLLDEATSALDSQNELLVQQSIEKLMI
GRTTIVIAHRLSTIQDADQIAVVKGGAIVEIGTHPELYALNGVYTQLVNRQQKGGDDGDK
KKKKKSKESSKDESNNNIGPSSISIDKSIQSIGADSLETSTIGLVNDNDNKKKKKKEKKP
QEKSVPIGRILKLSRGDWPHFLIGLVGATLNGAIMPVFSIIFSEILGIFQEQDTDELTRR
SRNMALWFILLAVVAALANFIQIYCFTFIGEKLTFNLRRLSFESIMRQDIGWFDLTENST
GRLTANLATEATLVQGMTSQRLGLLIQNIVTIVAGLVIAFVSGWKLTLVVLACVPVIGFA
GKVEMDFFQGFSQKGKEAYAECGQVASEAIGGIRTVSSFTCENKILEKFRQCLQKPIQMS
FRKSNVSGLSFGFSQCTLFFIYTLTYWYGGKLVDSGEWPAKESTLETYCYNGEYANIGYT
DEATCIKSFTTTEGFSMMMRVFFAIIMSAMGVGQSMAFMPDLGKAKLAAVAIFSLIDRVS
EIDPFENKGQTLPEFKGDIEFKDIKFSYPSRPNKAVFQGFNLVIPHGKKVALVGNSGGGK
SSVISLLERFYNPSQGSITIDGVNIKDLNLNWLRGNMGLVGQEPFLFSGTIFENIIYGKP
DATMDEVVEAAKAANAHTFIESLPDAYHTQLGDKFTQLSGGQKQRVAIARAIIRNPKVLL
LDEATSALDTVSEKVVQVALDNVSKGRTSIVIAHRLSTVIDADLIVVVKEGKVVELGTHE
TLLAENGFYAELVSRQM
NT seq
4194 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgataaatcaaacgatggcggtgaaaacgattcacttcctatggataatattaat
ataaattcaattgatgatgaaaataataatgatataaataatcaagacgacaacgaaaat
aataataataataataataataaaaatagcgatgataatgaagaaaatttaaaagattat
aaaaataaaaaagaagattttggaaatattaaaatggatacaattgatgatagaccaact
aataatggtattttatcaccaattgatattacatcagatggtggtgattcagttaaaact
cttagtacaactcaatcaaaaaaattagatgaaggtgaaaaaaaagaaggtgaggttgga
ccacaagttccatttttttcattatttagatttgcaaaaccttttgatatattattaatg
atcattggtactattggtgctttggcaaatggtgtttcaatgccagccatttccattgta
tttggtcgtttaatgaattcattttcaccagaaaatttagcggatccaaattttgattta
gttgaaacagttacatcaaatgcaatgtattttatttatattggttgtggtgtttttgta
tgttcatatgttgaagtagcattttggatgttagcaggtgaacgtcaagcagttagatgt
agaaaagcttatttaaaagcaattcttaaacaagagattggttggtatgatgttacaaaa
tctagtgaactttcaactagaattagtagtgatactttattattccaagaagcaattggt
gagaaaattggtaatttcttacatcatacttcaacttttatttgtggttttattgttggt
tttgtaaatggttggcaattaactttagtaatttttgcattaacaccattaattgcagca
gcaggagcatttatgacaaaaatgatggcagatttaacaaagaaaggtcaagatgcatat
gcaaaagctggtggtgttgcagaagaaaagattggatcaattagaactgtttcaacattt
tcaggtgaaccatttgaagttaaacgttatactgaacgtttaaaggaagcattagatatt
ggtacaaagaaaggtataatgaatggtattggtattggtttagtatttttagtattattt
ggtacttattcgttatcattttggtatggtggtaaattaattgtcgatagaaaatggaat
ccagtaccagatagaccatggcaaggtggtgatgtattaactgtattcttttcagtgatt
atgggtgctatggcattaggtcaagcaagtccaaatgttgcatcatttgcaaatggtaga
ggtgcagcttttaaaatctatgaggttgttgatcgtaactctaaaatcgacccattctct
actgaaggtagatcaattgaagaaactgttcaaggtaatatagagtatagaaatattgga
ttctcttatccatcacgtccagatgttaaaattttcaataatttcaatttaaccattaaa
aaaggtacaaccgttgcattggttggtgatagtggtggtggtaaatcttcagtgattggt
ttattagaacgtttctatgatccagatgaaggtgaagtttatttagatggtacaaatatt
aaagagattaatattcattcactaagaagaaatattggtttagtatcacaagaaccagtg
ttatttgcaaattcaatcgctgaaaatatacgttatggtaatgaaaatgcaactatggat
caaattattgaagcttgtaaaaccgcaaatgctcatgatttcattagtgctttaccagag
ggttatgatactcaagttggtgaaaaaggtgttcaaatgtctggtggtcaaaaacaacgt
attgcaattgctcgtgcaatgattaaagatccaaagattctattattagatgaggccaca
tcggctttagattctcaaaatgaattattagtacaacaatcaattgaaaaattaatgatt
ggtcgtaccacaattgtaattgctcatcgtttatcaacaattcaagatgctgatcaaatt
gctgtagttaaaggtggtgcaatcgttgaaattggtactcatccagaattatatgcttta
aatggtgtttacactcaattggttaatagacaacaaaaaggtggtgatgatggtgataaa
aaaaagaaaaagaaatcaaaagaatcatcaaaagatgaaagtaataataatattggtcca
agtagtatttcaattgataaatcaattcaaagtattggtgccgatagtttagaaacttca
accattggtttagtaaatgataatgataataaaaagaaaaagaagaaagaaaaaaaacct
caagaaaaatctgtaccaattggtcgtatcttaaaattgagtagaggtgattggccacat
ttcttaattggtttggttggtgcaacattaaatggtgcaattatgccagtattttcaatt
atcttttcagagattttgggtattttccaagaacaagatactgatgaattgactcgtcgt
tcaagaaatatggcattatggtttattttattggcagttgttgcagctttggcaaacttt
attcaaatttattgtttcacattcattggagagaaattaacatttaatcttcgtagatta
tcatttgaatcaattatgagacaagatattggttggtttgatttaacagagaattcaact
ggtagattaacagcaaatcttgcaactgaagcaactttagttcaaggtatgacttcacaa
cgtcttggtttattaattcaaaatattgttacaattgttgctggtttagtaattgcattt
gttagtggttggaaattaactttggtggttttagcatgtgtacctgtaattggttttgca
ggtaaagttgaaatggatttcttccaaggtttctctcaaaaaggtaaagaggcttatgct
gaatgtggtcaagttgcatctgaagcaattggtggtattcgtacagtttcttcattcact
tgtgaaaataaaatcttggaaaagttccgtcaatgtcttcaaaaaccaattcaaatgagt
tttagaaaatcaaatgttagtggtttatcttttggtttctcacaatgtactctcttcttt
atttatacactcacctattggtatggtggtaaattagtagattcaggtgaatggccagca
aaagaatcaactttagaaacttattgttacaatggtgaatatgctaatattggctatacc
gatgaagctacttgtattaaatctttcactacaactgaaggtttttcaatgatgatgaga
gtattctttgcaattattatgtctgctatgggtgttggtcaatcaatggcatttatgcca
gatttaggtaaagctaaattagctgccgtagcaatctttagtcttatcgatagagtttca
gaaattgatccatttgaaaataaaggtcaaactttaccagagttcaaaggtgatattgaa
tttaaagatattaaattctcttatccatcacgtccaaataaagcagtattccaaggtttt
aatttagtcattccacatggtaaaaaagtagctttggttggcaatagtggtggtggtaaa
tcatcggttatctctttacttgaacgtttttataatccatctcaaggttcaatcactatt
gatggtgtaaatattaaagatttaaatttgaattggttaagaggtaatatgggcttagtt
ggtcaagaacctttcttatttagtggtacaatctttgaaaatattatctatggtaaacct
gatgcaacaatggatgaagttgttgaagctgcaaaagctgcaaatgctcatacttttatt
gaatcacttccagatgcttatcatactcaattaggtgataaattcactcaattatctggt
ggtcaaaaacaacgtgttgcaattgctcgtgctattattcgtaatccaaaggttttatta
ttagatgaggctacatctgctttagatactgtctctgaaaaagtagtacaagttgcactc
gataatgtctctaaaggtcgtacttcaattgtaattgctcatcgtttatcaactgttatt
gatgctgatttaattgtagtcgtaaaagaaggtaaagtagttgaattaggtactcatgaa
actttattagctgaaaatggtttctatgctgaattagtttcaagacaaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
