Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293772
Help
Entry
DDB_G0293772 CDS
T00245
Symbol
vps52A
Name
(RefSeq) Vps52 / Sac2 family protein
KO
K20298
vacuolar protein sorting-associated protein 52
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0293772 (vps52A)
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
DDB_G0293772 (vps52A)
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
GARP complex
DDB_G0293772 (vps52A)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps52_C
Vps52_CC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629410
NCBI-ProteinID:
XP_628979
dictyBase:
DDB_G0293772
UniProt:
Q54BB5
LinkDB
All DBs
Position
6:3307775..3310766
Genome browser
AA seq
838 aa
AA seq
DB search
MDNNNNNINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNYSNEIDEFGEQIQTPPNVHTKQ
EILEKMVEDLDQYMVDENFDNGDEEYDEYNNKIDLPHKNNARDFTTPQYIIDDDLDFKHY
SHIKKPDGSNYNNIEEILNYLINEKKVLEISNKTIDNNNNNNNNNNEYHRPRINQSEFGQ
HLENELKSLPSAVINTYFEQSSGLVELHKYIKESRDTLNGFSKSFDSIILELSNLIKDMP
DNHVASLQISKSLENRILARAELYDLNEEYIKCIKELEDRIKSLDPWMMKKEAKFIEDIA
YEIDLLKKKASKSVRDYLLKLIIGLRKPRTNIQILQQSKLFKYSPLNEFIYHNSPSSAIE
VKNSYIETLSRTFTMYFKNYLTNLTKVFNQIALKSDVIGYIEQVKGYFGTVNKGFELNKA
SAFNLYISGLPIDIWTSIRSETIEQIPERFSRADILTRCLDAPLIIPHAAIKNGKKYPFE
QIFRSMNILLLDTICSEYLFDRQWFAKPLLANSPDALIPSIFNNIFQLYYDNIFSFVGGT
YDCLSLLLCLQINSILVQLLIDRKLWDRISCLKTYFQKLDVIIWDRFSEVFKRNIDSLNL
AIKMDTPPTDFRPHIYTRRFSEFYSSIAEILSHNEEPRVLAWVAVLRSSMERLLLHFSNS
FTDIKSKSIFLITNYDVVITVFSENNINQNEEGYLKFLNLLHEQIDIFVELLLFSYYKSL
ITFIKDTEFSCSNVSNYQIDKNQLSMLIGEFSQKWKDILSKIQTEIMTNFSNFNLGSSIT
KKIITQYLLYYKRFEEIYKKFIKQSSTTDGNNNQLRLAFIPVSTITYEISKSYSSFNP
NT seq
2517 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataataacaataataatattaataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataattatagc
aatgaaattgatgaatttggagaacaaattcagacaccaccaaatgttcacacaaaacaa
gagattttagaaaagatggttgaagatttagaccaatatatggttgatgaaaactttgat
aatggagatgaagaatatgatgaatataataataaaatcgatttacctcataaaaataat
gcaagagattttacaactccacaatatattattgatgatgatttagattttaaacattat
tcacatattaaaaagccagatggttcaaattataataatattgaagaaattttaaattat
ttaataaatgaaaaaaaagtattagaaattagcaataaaactattgataacaataataat
aataataataataataatgaatatcatagaccaagaattaatcaatcagaatttggtcaa
catttagagaatgaattaaaatcattaccttcagcagtaataaatacatattttgaacaa
tcaagtggattagttgaattacataaatatattaaagagagtagagatacattaaatgga
ttttcaaaatcatttgattcaattatattagagttatcaaatttaattaaagatatgcca
gataatcatgttgcatcacttcaaatttcaaaatcactagagaatagaattttagctaga
gctgaactttatgatttaaatgaagaatatataaaatgtataaaagaattggaggataga
attaaaagtttagatccatggatgatgaaaaaagaagcaaaatttatagaggatatagca
tatgaaattgatttattaaaaaagaaagcaagtaaatcagttagagattatctattaaaa
cttataattggtttaagaaaaccaagaaccaatattcaaatcttacaacaatctaaatta
tttaaatattcaccattgaatgaatttatttatcataattcaccttcttctgcaattgaa
gttaaaaattcttatattgaaactttatcaagaacttttacaatgtattttaaaaattat
ttaacaaatttaacaaaagtttttaatcaaattgcattaaaatcagatgtaattggatat
attgaacaagttaaaggatattttggtacagttaataaaggatttgaattaaataaagca
tcagcatttaatttatatatttcaggattaccaattgatatttggactagtattagaagt
gaaactattgaacaaattccagaaagatttagtagagctgatatattgacaagatgttta
gatgcaccattgattataccacatgcagcaattaagaatggtaaaaagtatccatttgaa
caaatttttagatcaatgaatattttattgttggatactatttgttcagaatatttattc
gatagacaatggtttgcaaaaccattattggcaaattcaccagatgcattaataccctcg
attttcaataatatctttcaactttactatgacaatatcttttcattcgttggtggtacc
tatgattgtttatcattgttgttatgtttacaaatcaatagcatcttggttcaattgtta
attgataggaaattatgggatcgtatatcatgtttaaaaacttattttcaaaaattggat
gttataatttgggatagatttagtgaagtctttaaaaggaatatcgatagtttaaacttg
gcaattaaaatggatacacctccaaccgattttagacctcatatttatactcgtagattt
tcagaattttattcaagtattgcagaaatcttatcacataatgaagaaccaagagtttta
gcttgggtagctgtattacgttcgtcaatggaaagattattattacatttttcaaattct
tttactgatataaaatcaaaatcaatatttttaattacaaattatgatgttgtaattact
gttttttctgaaaataatataaatcaaaatgaagaaggttatttaaaatttttaaattta
ttacatgaacaaattgatatatttgtagaattattattatttagttattataaaagttta
attacttttataaaggatacagaatttagttgttcaaatgtttcaaattatcaaatagat
aagaatcaattatcaatgttaattggtgaattctcacaaaaatggaaagatatattatca
aaaattcaaacagaaattatgacaaatttttcaaactttaatttaggttcaagtattaca
aagaaaattatcactcaatatttattatactataaaagatttgaagaaatttataaaaaa
ttcattaaacaatcatcaaccactgatggaaataataatcaattaagattagcttttata
ccagtttcaactattacttatgaaatttcaaaaagttatagttcttttaatccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
