Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0295483
Help
Entry
DDB_G0295483 CDS
T00245
Name
(RefSeq) RUN domain-containing protein
KO
K19330
run domain Beclin-1 interacting and cysteine-rich containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
DDB_G0295483
Membrane trafficking [BR:
ddi04131
]
Autophagy
Other autophagy associated proteins
Others
DDB_G0295483
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RH_dom
RUN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628288
NCBI-ProteinID:
XP_001733052
dictyBase:
DDB_G0295483
UniProt:
B0G190
LinkDB
All DBs
Position
6:<636558..>641010
Genome browser
AA seq
1398 aa
AA seq
DB search
MFNNSQNPEFNILSDLNGYIQQLLDITRQDGGSNNDNNTIVQDRNPSLLKICFCVEKILN
SGLKDVNFLSATVMWDFLQNLPQCLPDTGRIIEMSKDCSKTSVGRGRVLIRLALNEGRLE
EYISALCYCEDVLKSYYKENAVLRNQEFLGLFQGLISMLSHIQFSLVVKDKDLDKPNYWE
DIALTLLTNVDRTITRVVHHTIIEQVPVLVQAPPSTQSNEQQTATTTTTTTTTTTTTTTV
SPELNIPIIVQSEEQQPKPIEIVQPQIEVTTTTTTTTNEKQTEEEEKQKEKEEKEEDEVQ
KKTELIPTTTPTPTTIITTTPKQFTPNTTTPPLTPKLKLLKEQEFNNIMTSSTSSISLEE
LENVLTEITTENSNNNNNNNNSNNNGGGDDDTESITNTNIPPLPEYEQIKITEEDFKRWD
SLIDQLTKSKKKVILDFGAKGSSMTSTDKCLQSLWYSIDLILTNEIRLSDSVQSLWDCLS
LISLTDYENSINNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNIKLQDYNGDYNLNE
IIKSIESIYLNNFKRIRAFYYYGFSNNSVSNINNNNNGQSLKSNFVDFLTRFFNIYDFQK
YSSLIRLYKKNSFVMQKDYMLKFFDILADINNTVTFKLKWDKDVHTLIEIQQQQQQQQQP
IQQQQQQQPPQKKMVTKIIKKKVIVKKTITVPKKLDSTTTTSSGTSSINSEQQQDEEELE
DEKKQLNDGSSSGGGDNFENGGDLEKEKEKDDDTDISKIESILNDDNDNDTTLNEIQQQQ
QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQREFEQPIRTDSPPLQQPQPQRILNLTSSIDSVNSIID
EQPISARDEENNNSNNNNVNNNNLVIKSTITTTTTDNINEKEIKENLVGEEFEEEKKEFS
EENNTTTIRKNNSIGNISNDGSEKSKDEEEIQKLEILMHSRLVPERKSTLSEVMKKEKEK
EKFISTVVAGTLSKSNSQIALNESFDNNDIIDNSNNNNNNNNNNNNNNENNNNNNSNNTV
LNKNNSNGSINSSNNDNPDDVNSEHFQNLLSSLKSSQEPIEFRYQSNPTYSSYTDSYTTN
DTFSSSFTHNIGSLPSLSDKLKSSSSIEYQMIQDYFDDDDQVAANGNGNKKNKNPLMGDD
GQLFNNTLYRTSTIKAQYQNQRVCPDCHIQLDRLGFFKMKICYYTGKYYCHNCHSGQKSL
IPARILWHWDFKLFPVCDSAKSYITRNFSHPFDIFQFNPESISLSSRLAKILSFRTKLHF
IGEYIESCRSRVTLDSSLPHVNDYLISGNVNLYSLMDLDKINSGNSLELIIQEVMEKYIN
HVTNDCITCKGKGFICEFCDNDELIFSWMSLDTQNYSKCDKCFTLSHKKCYSKDSCPKCI
RISRVKSHRNTTVHLQLK
NT seq
4197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaataatagtcaaaaccccgagtttaacattctatcagatttgaatggttatatt
caacaactattagatatcacacgtcaagatggtggtagtaataatgataacaatacaata
gttcaagatagaaatccatcacttttaaaaatttgtttttgtgttgaaaaaatattaaac
agtggattgaaagatgttaactttttatcagcaacagtgatgtgggattttttacaaaat
ttaccacaatgtttaccagatactggtagaattattgaaatgtcaaaagattgttcaaag
acatcagttggtaggggtagagttttaattagattagcattgaatgaaggtcgtttagaa
gagtatatctctgcattatgttattgtgaagatgtattgaaatcatattataaagagaat
gcagttttaagaaatcaagaatttctaggactatttcaaggtttaatttcaatgttatct
catattcaatttagtttagtcgttaaagataaagatttagataaaccaaattattgggaa
gatatagctttaactttattaacaaatgttgatagaactataacaagagttgttcatcat
acaattattgaacaagtaccagtattagttcaagcaccaccatcaacacaatcaaatgaa
caacaaacagcaactactactactactactactactactactactactactactacagta
tcaccagaattaaatataccaataattgttcaaagcgaagaacaacaaccaaaaccaata
gaaatagtacaaccacaaatagaagtaacaacaacaacaacaacaacaacaaatgaaaaa
caaacagaagaggaagaaaaacaaaaagaaaaagaagaaaaagaagaagatgaagtacaa
aaaaaaacagagttaataccaacaacaacaccaacaccaacaacaataataacaacaaca
ccaaaacaatttacaccaaatacaacaacaccaccattaacaccaaagttaaaattatta
aaagaacaagaatttaataatattatgacatcatctacatcatcaattagtttggaggaa
ttagagaatgttttaactgaaattacaacagagaattcaaataataataataataataat
aatagtaataataatggtggtggtgatgatgatactgaatcaataacaaatactaatata
ccaccattaccagaatatgaacaaattaaaattacagaagaagatttcaagagatgggat
tcattaattgatcaattaacaaagtcaaagaaaaaggtgattttagattttggtgctaaa
gggtcatcaatgacaagtactgataaatgtttacaatcattatggtattcaattgattta
attctaacaaatgaaattagattatcagattctgttcaatcattatgggattgtttatca
ttaatttcattaactgattatgaaaatagtattaataatagtaataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataatattaaattacaagattataatggtgattataatttaaatgag
attataaaatcaattgaatcaatttatttaaataattttaaaaggattagagcattctat
tattatggatttagtaataatagtgtttctaatattaataataataataatggtcaatca
ttaaaatcaaattttgtagatttcttaacaagatttttcaatatttatgattttcaaaaa
tattcatcattaattaggctttataaaaagaattcttttgtaatgcaaaaagattatatg
ttaaaattctttgatattttagctgatattaataatactgtaacttttaaattaaaatgg
gataaggatgttcatactttaattgaaattcaacaacaacaacaacaacaacaacaacca
attcaacaacaacaacaacaacaaccaccacaaaagaaaatggtaactaaaattattaaa
aagaaagtaatcgtaaagaaaaccattactgtaccaaagaaattggattcaacaacaaca
acatcgtcaggaacttcttcaataaattctgaacaacaacaagatgaagaagaattagaa
gatgaaaagaaacaattaaatgatggcagtagtagtggtggtggtgataattttgaaaat
ggtggtgatcttgaaaaagaaaaagaaaaagatgatgatacagatatttcaaaaattgaa
tcaattttaaatgatgataatgataatgatactactttaaatgaaattcaacaacaacaa
caacaacagcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaaagagaatttgaacaaccaattagaacagattcaccacctttacaacaacca
caaccacaaagaatattaaacttaacatcaagtattgatagtgtaaatagtataatcgat
gaacaaccaatatcagctagagatgaagaaaataataatagtaataacaataatgttaat
aataataaccttgtaataaaatcaacaataacaacaacaacaacagataatataaatgaa
aaagaaattaaagaaaatttagtgggtgaagaattcgaagaagagaaaaaagaatttagt
gaagaaaataatactactactattagaaagaataatagtattggtaatattagtaatgat
ggtagtgagaaatcaaaagatgaagaggaaattcaaaaattagagattttaatgcattct
agattagtaccagaaagaaaatcaactttatcagaggtaatgaaaaaagaaaaagaaaaa
gagaaattcatttcaaccgttgttgctggtactttatcgaaatcaaattctcaaattgca
ttaaatgaaagttttgataataatgatattattgataatagtaataataataataataat
aataataataataataataataatgaaaataataataataataatagtaataatacagtt
ttaaataaaaataatagtaatggtagtattaatagtagtaataatgataatccagatgat
gtaaattcagaacattttcaaaatttattatcaagtttaaaatcatcacaagaaccaatt
gaatttagatatcaatcaaatccaacctattcatcatatactgatagttatacaaccaat
gatacattttcatcatcttttactcataatattggtagtttaccatcattatcagataaa
ttaaaatcatcctcttcaatagaatatcaaatgattcaagattatttcgatgatgatgat
caagttgctgctaacggtaatggtaataaaaagaataaaaacccattaatgggtgatgat
ggtcaattatttaataatacactttatagaacatcaactattaaagcacaatatcaaaat
caaagagtttgtccagattgtcatattcaattggacagattgggattctttaagatgaaa
atttgttattacactggtaaatattattgccataattgtcattctggtcaaaaatcatta
atacccgcaagaatactttggcattgggatttcaaattattcccagtttgtgattccgcc
aaatcctatatcactcgtaacttttctcatccatttgatattttccaatttaatcctgaa
tcaatttcattatcatcacgtttagctaaaattttatcctttagaactaaacttcatttc
attggtgaatatatagaaagttgtagaagtagagtaaccttggattcttctttacctcat
gttaatgattatcttatctctggtaatgttaatctttactctctaatggatttagataaa
attaatagtggtaattctttagaattaataattcaagaggtaatggaaaaatatattaat
catgttacaaatgattgtattacttgtaaaggtaaaggatttatttgtgaattttgtgat
aatgatgaattaatattttcttggatgagtttagatacacaaaattattcaaaatgtgat
aaatgtttcactctttcacacaagaaatgttattcaaaagattcatgcccaaaatgtatt
cgtatttctagagtaaaaagtcatagaaatacaactgtgcatcttcaattaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system