Cavenderia fasciculata (cellular slime mold): DFA_00024
Help
Entry
DFA_00024 CDS
T02668
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
dfa
Cavenderia fasciculata (cellular slime mold)
Pathway
dfa02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfa00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DFA_00024
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dfa02000
]
DFA_00024
Transporters [BR:
dfa02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DFA_00024
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
R1_ABCA1
GATase_6
GATase_7
Pribosyltran
AAA_29
GATase_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14871540
NCBI-ProteinID:
XP_004357741
UniProt:
F4PXD7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2182 aa
AA seq
DB search
MKDKEDIELDINGNIITASEHQQIEDDEPKEKCGVFGIYAPELDVSRIAFFALVALQHRG
QESCGIATYDQHHAVHVETGMGLVNQVFTETNLKPLRGNMGIGHTRYSTAGKSTINNAQP
VIVQTLHGQVGIVQNGNLTTAHSLRSELLQQGIGFFKETDVEIITQLLAANPPAIIPTSP
LLGSANGNGVHSSGSSTPSTTTKSQPNWEQRIANFMSKAEGAYSLCLMTPTALYGVRDYL
GLRPLCIGALDVPSTSDPTKTITRYVIASESCAINTIGGRYIREVRPGEIVRIDDNGLDS
FIGRTPADKPALCVFEYVYFSRPDSLLEDQLIHSVRQRMGEQLARESPPPPASQANKDLE
TIVIGVPDSSLPAAIGYAKQSGLAYTEGLTKNRYIHRTFIQPSDHLRQQGIKLKFNPLSE
NIKGRRVVLVDDSIVRGNTIKNAGAVEIHVRISSPPVMHPCYMGIDMATHDQLVGYQKTT
KQVCDYIGAESLEYLSYPGMMKSVNIGLLDKQQQQQQQQNGKLLCDNEKELEDGSRHCSA
CFSGVYPLAKSKCGIVCDIIFPIIVVSLLLALISLLSIIEFDYDQYEILTLENYVYDINR
TRVLYGPSPLTPTSQKILDSLKNDIINGSNGLLPMQYVDQLFVAFKTESEMESYYANFSE
SAPYGLWFNNDQLSSTTPFSYSIRYDQDRLPANDGHLKEDFSTSAVFAERGICSLQLSLD
QAIIRELGGRTSQSISVYHRLFPNPHDQAYQKVRLGRDLIHKSAGGIFITAALLIYAYRL
ITDLVVEKETKIKEGMTMMGMSSAAYYLSWNITSIYIGLPVTVVLWLIFKISNIIHFGNW
GLVLLLFVFYFFTLLLIGNLLSLFFDRSKFAGIISYGFVVGLSVAGYYVAKAEMTQKAKL
ALSLISPFGFQCAIFSMAQKDLDGIDPNPDYFPQLGHIVGMLFIDILLYVLILWYLDKVV
PSEYGVKEPFYFFLMPSYWRKGGKRFDDPESNALNNYADQDVELIPVDLRNKVTVSIRGL
KKDFNTGNGLRTAVDGLNLEMYQDQIHAFLGHNGAGKSTTIGMLTGLIKPTSGDALIQGN
SISREMNRVRNVIGVCPQQDIIWKELTVFEHLSIYAALKGVPANLIDKQAEEMAREIGLA
DKIHAPSGTMSGGQKRKLCLGIAFIGRSEVIFLDEVTSGMDPLSRRGVWDFLLRHKKTRT
IVLTTHFMDEADFLGDRIAIISHGKLRCDGSPLYLKKKFGIGYLLTMSKIEGQCRSQDVI
NFVQSYIPEAAVLSDVGTELSIRLPTSSSNQFVPLFIQLDQQKGYLGVGHYGISITTMEE
VFLRIGQESDGGARQFNLTSNNNNNNNKAINTNAVARTAKQQLYGLLIKRIRTSIKDARG
FFLSILLPAVVIFASIIIYKSVSGGESNSTLHSLPLSMSIYPPSQDFFIPYQTADNQSAT
TSFLGTSPFISQLTGPITSDFEDYLRDNFTRDPGALHFSTLLSASASSTLNYTALYNINY
KQTLPALINMVSDSLLRSSPNANGAGIAATYKPFKHVLTLFEKQSDQVQTQTIVFFSLLF
LAGYALMGASFAGNVCQERAYNIKRLLYISGCKKHVYWLSNLLWDYFFAAILVMVVTITM
VCIDERFRDQWAIVLIAQVLYCIGIIPLSYLFSYNFKTHGKATGAIFGLLYTIGIVFFIT
SMNVRVQAASRQSTNLQNIGDILDYIFYAISPLYCLANTMLFLAKFPGTARVGQFEVDDF
WSLHACGLPLIYLAVHVIVWLVWLFVLDMMPEIKGRLRNPRNVRAPTPEHDEDSDVANER
LRIRSLENGGGGGSAGPEDLVVVRGLHKLFKASGKNKDKIAVHNSTFGIPRGQTFGLLGL
NGAGKTTTLSMLSGDIYPTSGSASISGHDLITERSGALQSIGSCPQFDALIPLLTAREQL
TLYARIKGIPEHQIQETVEAFISMMDVSGIANSNVGGYSGGNKRKISLSIAMLGNPSVVF
LDEASTGCDPQVRRFMWNVITELGKNKVIIITTHSMEECEALCQRVSIMKDGKLTCLGSI
QHIKSKFGSGYSIDIKFKKEYVDTGVDIVLRSFPGSSLLDRHDLVANFELPNPPQRPVKL
CTIFQILQSQLHYLMDDYSVSQSTLDSIFIKLTASTHADRLATLSEHQYEYYDQSSSDTE
SVSKMMLIDKYINNNNNHTILN
NT seq
6549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagataaagaggatattgaattagatattaatggtaatatcattacagcatcggaa
caccaacaaatagaagatgacgaaccaaaagaaaaatgcggagttttcggtatatacgct
ccagagttggacgtaagccgtattgccttttttgcattggttgcactccaacatcgtgga
caagaaagttgtggtattgcaacatacgatcaacaccatgctgtacacgtagagactggt
atgggtcttgtcaatcaagtattcacagagactaatctaaaacctctacgtggtaacatg
ggaatcggtcatactcgttattcaaccgctggaaagagtacaatcaacaatgcacaacca
gttatcgtgcagactttacatggacaagtaggaattgtccaaaatggtaacctcaccact
gcacactcgttgagaagtgaattgcttcaacaaggtatcggtttctttaaagagacagac
gtagaaattatcactcaattgttggctgctaatccacctgcaatcattccaacatctcca
ttacttggtagtgccaatggtaatggtgttcattcatctggttcttcaactccatcaaca
acaacaaaatcacaaccaaattgggaacaacgtattgccaatttcatgtcaaaggctgag
ggtgcctattcactctgtttaatgacaccaactgcattgtatggtgtcagagattatttg
ggtcttcgtccactatgtatcggtgctcttgacgttccatctacatcggatccaacaaag
acaatcactcgttatgtcattgcttcggagagttgtgctatcaataccatcggtggtaga
tatattagagaagttagaccaggtgagattgtacgtatcgatgacaatggtttagactct
tttattggtagaacccctgccgataaaccagctctatgtgtctttgaatacgtatacttt
tcgcgtccagattcattgctcgaggatcaactcatccacagtgtacgtcagagaatgggt
gaacaattagctcgcgagtcaccaccacccccagcatcacaggccaacaaagatctagag
accattgttatcggtgttccagactcatcacttccagcagccattggttatgccaaacaa
tctggattggcatacacagaaggattgacaaagaatcgttatattcatcgtacatttatt
caaccatcggatcatcttcgtcaacaaggtatcaaattaaaatttaatccattgtctgaa
aatattaaaggtcgtagagttgttttagttgatgattctatagttagaggtaatactata
aaaaatgcaggagcagtagagattcatgttagaatttcatcaccaccagttatgcatcca
tgttatatgggtatagatatggcaacacatgaccaattagttggctatcaaaagacaacc
aaacaagtttgtgattatataggtgcagagagtttagagtatctaagttatccaggaatg
atgaaatctgtcaatatcggtttactcgataaacaacaacaacaacaacaacaacaaaat
ggtaaactgttgtgtgacaatgaaaaggaattagaggatggcagtagacattgttctgca
tgtttctctggtgtttatcctttggcgaaatcaaaatgtggaatagtatgtgatatcata
tttccaatcatcgttgtttctttattattggctttgatttcattattgtcaattatcgaa
tttgattatgatcaatatgagatattgacattagagaattatgtctatgatatcaataga
acaagagtattgtatggtccatctccattgactccaacatcacaaaagatattggattca
ttaaagaatgatatcatcaatggaagcaatggactattgccaatgcaatatgtcgatcaa
ttgtttgttgccttcaagacagaatccgaaatggagtcatactatgccaatttctcagag
tctgctccttatggtctatggttcaataatgaccagctctcatctactaccccattttca
tacagcattcgttatgatcaagatcgtttacctgccaacgatggtcatctaaaggaagac
ttttcaacatctgctgtgtttgcagaaagaggtatctgctctttgcaattatcactcgat
caagcaatcattagagagttgggaggtagaaccagtcaatccatcagtgtttatcatcga
ttgttccccaatcctcacgatcaagcctatcaaaaggttagattgggaagagatctcatt
cacaaatcggcaggtggtatctttattaccgctgctctactcatctatgcctatcgttta
attactgatttggttgtggaaaaggaaacaaaaatcaaagaaggtatgacaatgatggga
atgagttctgctgcctactatctcagttggaatattacatcaatctatattggtctacca
gtcacagttgtactttggttaatattcaaaatttcaaatatcattcattttggtaattgg
ggtttggttttattactatttgttttctatttctttactttattgttaattggtaatctt
ttaagtttattctttgatagatcaaagtttgcaggtattatatcatatggttttgtagtt
ggtctatctgtagctggttattatgttgccaaagcagagatgactcaaaaggcaaaactt
gcattatctcttatctctccatttggatttcaatgtgctatcttttcaatggctcaaaaa
gatttagatggtatcgatcctaatcctgattatttccctcaacttggtcatattgttgga
atgttatttattgatatattattatatgtattgattttatggtatttggacaaggtagta
ccatcggaatatggagtaaaagaacctttttatttctttttaatgccatcctattggaga
aagggtggaaaaagatttgatgatccagaatcaaacgctttgaataactatgccgaccaa
gatgttgaacttattccagttgaccttcgtaacaaggtgacagtctctattcgtggtctc
aaaaaggatttcaatactggtaatggtcttagaaccgctgtcgatggtcttaatcttgaa
atgtatcaagatcaaattcatgcatttttaggtcacaatggtgcaggaaagtctactaca
attggaatgttaacaggattaattaaaccaactagtggtgatgcattgattcaaggtaat
tctatttcacgtgaaatgaatagagttagaaatgtgattggagtttgtccacaacaagat
attatttggaaagagttgacagtctttgaacatctttctatttatgctgctctaaagggt
gtacctgctaatttgattgacaaacaagcagaagaaatggcaagagaaattggtttggcc
gataaaatacatgctccttctggaacaatgtctggtggtcaaaagagaaaattatgtctt
ggtattgcttttatcggtcgatctgaagttatcttccttgatgaagttacatctggtatg
gatccattatcaagacgtggagtatgggactttttacttcgtcacaaaaaaacaagaacc
attgttctaacaacacattttatggatgaagctgatttccttggtgatcgtattgctatc
atttctcatggaaagcttagatgtgatggttcaccactctacttgaagaagaaatttggt
attggttatctcttgacaatgtcaaagattgaaggtcaatgtagatcacaagatgtcatc
aactttgttcaatcttacataccagaggctgcagtactctctgatgtcggtacagaatta
agtatccgtcttcccacctcttcgtcgaatcaatttgttccactctttattcaactcgat
caacaaaaaggatatctcggtgttgggcattacggtatctctattacaacaatggaagag
gtattcttgagaataggtcaagagtctgatggtggagcacgtcaatttaatttgacatca
aacaacaataacaataataacaaagcaatcaacaccaatgcagtggctagaactgccaaa
caacaactctatggtcttctcatcaaacgtatccgtacttcgatcaaagatgcacgtggt
ttctttttatcgatactcttgccagccgtcgttatctttgcatcgattattatttataaa
agtgtttctggtggagagtccaacagtacattgcattcattgcctctctcaatgtccatc
tacccaccatcacaagacttttttataccctatcaaacggcagacaatcaatctgcaacc
acctcattccttggtacgtctccattcatctctcaattgaccggaccaattaccagtgac
tttgaagattatctcagagataattttactagagatccaggtgctctccacttttctact
ttgttgtctgccagtgcctcttcaacactaaactacactgcactatacaacattaattac
aaacaaacacttccagcgctcatcaatatggtatcagattcactacttagatcatcaccc
aatgccaatggagctggtattgcggccacttacaaaccatttaaacatgttttaacattg
tttgaaaagcaaagtgaccaagttcaaactcaaaccattgtattcttttcattactgttt
ttggctggctatgcattgatgggcgcatcatttgcaggaaatgtttgtcaagaacgtgct
tacaatataaaacgtctattgtacatatctggttgcaagaaacatgtctattggttgagt
aatctgctgtgggattacttttttgcagccatccttgttatggttgtcacaatcactatg
gtttgcatcgatgaaagatttagagatcaatgggcaattgtattgattgctcaagtattg
tattgtattggtatcatcccattatcctaccttttctcttacaatttcaaaacacatgga
aaagcaaccggtgccatctttggtctactctacactatcggtatcgttttctttatcacc
tctatgaatgtacgagtacaagctgcctctcgtcaatcaactaatcttcaaaacattgga
gatatattagattacatattctatgccatctctcctctgtattgtctcgccaatacaatg
ttattcttggcaaaattcccaggaactgcaagagtcggacaatttgaagttgatgacttt
tggtcgctacatgcttgtggactacctcttatttacttggctgttcatgttattgtttgg
cttgtttggttgtttgtattggatatgatgccagagatcaaaggtcgtcttcgtaatcct
cgtaacgtacgtgctcccactccagaacacgatgaagatagtgatgttgccaatgaaaga
ctacgtattcgttctttggaaaatggtggtggtggtggatcggcaggcccagaagacttg
gtcgtggtacgtggtctacataaactattcaaagcaagtggaaagaacaaagacaagatt
gcagttcacaacagtacatttggtattcctcgtggtcaaacatttggtctcctaggtctc
aatggtgccggtaaaacgactaccttgtcaatgttatctggtgatatctatccaacctct
ggctctgcatccattagtggtcatgatttgatcactgaaagatcaggtgcactccaatcg
attggtagttgtccacaatttgatgcactcattccactattgacagcaagggagcaactc
acactctatgctcgtatcaagggtataccagaacaccaaatacaagagacagtagaagca
ttcatatcaatgatggatgtcagcggtattgccaacagtaacgtcggtggttacagtggt
ggtaacaagagaaagatttcactctctattgctatgcttggtaatccttctgttgttttc
cttgatgaagcaagtactggatgtgatccacaagtaagacgtttcatgtggaatgtaatt
acagaacttggcaagaacaaggttatcattattacaacacattcaatggaagaatgtgaa
gcactatgtcaacgtgtttcaatcatgaaggatggtaaactaacatgtctaggatctatt
caacacatcaagagcaagtttggttctggttattcaattgatatcaaatttaaaaaggaa
tatgtagacactggtgttgatattgtactaagatcattcccaggatcatcactcctagat
cgtcacgatctcgttgccaattttgaacttccaaatcctccacaacgtccagttaaatta
tgtaccatcttccaaatacttcaatcacaacttcattacttgatggatgattattctgtc
tcacaatctacattggacagtatattcatcaaactcacagcctctacacacgccgataga
ttagcaacactatctgaacaccaatacgaatattatgatcaatcatcatctgatacagag
agtgtttcaaaaatgatgttgattgataaatatataaataataataataatcatacaatt
ttaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
