Cavenderia fasciculata (cellular slime mold): DFA_02468
Help
Entry
DFA_02468 CDS
T02668
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
dfa
Cavenderia fasciculata (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_2
hEGF
EGF_Tenascin
EGF
DUF3844
I-EGF_1
EB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14871257
NCBI-ProteinID:
XP_004366853
UniProt:
F4PZJ1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2003 aa
AA seq
DB search
MECIKVLQDPGDSSIFRVFLTSIKWLNNQFGLGIDVSQTSTICSSTTGINCQVADDDNAY
HVVSIYIGQQTVFVNSGEQVDTTLKSLNLPFVQSITATFSGLVQNFSINTLDMISNMPRL
EFLTLSNDKTIDIVPTNFPNNLPSLKTITFYLLSNLTSIPNFFNNSISLNSITMYQNNIE
WVGIDKSIRLPNIASISIQVKNSKNMTLIIDPISFPSLKLFEMTSNDFIGTSNIRIIIKV
ALENIGAYAFSGTGSINPTISYPLSLRGLSVGGKGMDFQPNDLTLYKNLETLQIYQTNLT
SMPISSFGKITSFRLSDSKLQQFPNIPFPNGMNDVNYQNNQMSGTIPSGLLINNQLGLSL
SLIGNQNIVGSAPNDTCFLNSFSIDNTGIDSLPDCWWCFYEQVINTKLSTQLTKPIGFEC
LAIKIDQLNLNSIGGVFTISGSNIGWNINSGGRRLIEPNRKIEFQMDLSLGTKQQRLINL
INPPPTSAYSFNFIVTEVGFNVESVKIINQNLAILELNCTFEMINPDFLPTVIYTSQDHV
PCDIINYNNSTKSLNCLLRTLPIIGQQQIIFKNQFFNQSFMFIYNRDPIITSLLMEPNYY
PPTFLNLYGYFGNTTGASVILQLREFTFCNITIASKEYIKCRFYTLPEPGPQTLYFASNQ
GYFKSDSILSIPFPLPTFTDCMNRTNNCNGHGVCINGICQCDVGYFDDCKLKENDGFNGQ
FQSNNTDPTSNLKYGDYLFSFSIIGIQEMDLDNNITRELVAKTWDVEDNSSGDLTMIQYK
LTNHLHNITNGSTPFTKDADYSNLNLTTTIEFSNQSRTIEFGGDEIVLASGAIKIGVNVT
NWPYMSVMTRLRLVFSTTINNQQMIVGCDNSSYSIESLQNFADRDSIQYLRVLKDNVQFF
GRFLDYSLSDGRKTYSKTEVLNITRINDEESNVIIGINIGQCKICLMDPDFSALLIDHKS
FGQCNDESKNDNWKLIVGVVVGTVGGTCLIIISILFIKSNKYYFIHRAKRRLSISLKKKR
NRKRKRKRKRKRITAIALPGVIKSIQWVIQQYQSTIGLDQTSICSSGQVKCTNYQDVDIY
IQSVYVNSGAPPNIDTFEFPNLLTFTLSTSGAPFYSNSFDILSKMKGLPLVESIKLIGDN
TIKSIPIDFTAGKPLLRKLWISSVNLVSAGNIFSHNLLNEINFSITSLNSVRFNTTVYMP
DLKTLILDIKCDYASNWEISSSSFPTLYSLIISASSTCNQPIIVNVTAPLRLIECSNQPV
GSPTGYIKMIIQHPLNVTSLGVGGYYSTLPDLTIFPNINSFYMSNSQISDISSIKYPLGL
MQFQLSYSKIMTIPNVPLPKTLTSFDMSSNLLTSTVPAILMDNNPSTYITFGNNLGLTGS
IPESFCSARFLSIPQTGITTVPNCFWCYTGNLLSDLTKPNNIDCQPIIDNFNLISLIGGY
EVRGQLLGWGKDIPNMILAIQPNKILRFTMDLANGMNQNITIKFSPTSPSFVFFVQESYF
IVQDIKNIQQTVNYLSLNITFATVNPELMPRISVGGSVCELIKFYPVEKVIQCAATFSSY
NNNNTIYFTNDYYNFTTTYNKATYVETISLEPLIYPPKYLILNGYFGTGLSLGYISIRNG
TLPSFGCTILNGTLYYIKCEFPNQPPSGQTVLNVDVPNGLYQTSISIPFAQPTNDDCMNR
TNNCNNHGTCVNGQCVCDPGYFDNCKLKTDPNIEIEPNNQEPSFSFKDYSFSFKMIAIQE
LDIENNVVRNLNTTKWNVSESQKIDYSSINYFLTNHLNNSQEGFIPQLINTNVTSIFEIS
NQSRTIKFGGQSIQLASGSIKISVNVTNWPFTSVLTRLRVVFSTIVNNQQAIVGCDDSVN
QIESFQQFTDSDSIQYLRVVKNNTQFFGRFLDYSVADGRNTYSKAEVLNITKIDNQESQA
ILGINIGQCRTCLLDPDFSALLIDRQSYGQDCTSNSPDNNWKIIVGVVVGAVGAAILIAV
AIFIKQNRYFFLRRNNETKIEMN
NT seq
6012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatgtataaaagtcttacaggatcctggtgattcgagcatttttcgagtttttttg
acaagtataaaatggttaaataatcaatttggtttaggaattgatgtttcacaaacatct
actatttgcagtagtacaactggtattaattgtcaagttgcagatgatgataatgcttat
catgtagtttcaatatatattggacaacagacagtatttgtaaatagtggtgaacaagta
gatacaacattgaaatcactcaatctaccatttgtacaaagtatcacagccactttttca
ggtcttgttcaaaactttagtatcaatacacttgatatgatatctaatatgccaagacta
gaatttctaacattatccaatgacaagactattgatatagtaccaaccaatttcccaaat
aatctaccatctttaaaaacaataacattttatttattatcaaatctaacatcaatacca
aactttttcaacaattcaatttcattaaattcaattacaatgtatcaaaataatattgaa
tgggttggtattgataaaagtatacgtctaccaaatatagcttccatttcaattcaagta
aaaaattcaaaaaatatgactttaatcattgatccaatttcctttccttctcttaaatta
tttgaaatgacatcaaatgattttattggaacaagtaatattagaataattataaaagta
gcattggagaatattggagcttatgcattttctggtacaggttcaattaatccaaccatt
tcttatcctttatcgctaagagggttgtcggttggtggtaaagggatggattttcaacca
aatgatttgacactttataaaaatctggaaactttacaaatctatcaaaccaatcttact
agtatgccaatttcaagttttggtaaaatcactagttttagattatcagattcaaaatta
caacaatttccaaatattccattcccaaatggtatgaatgatgtcaattatcaaaataat
caaatgtctggtacaatcccatcaggattattaattaataatcaattgggtttatcactt
tctttaattggtaatcaaaatattgttggatcagcaccaaatgatacatgttttttaaat
agttttagtattgataatactggaattgattcattaccagattgttggtggtgtttttat
gaacaagttatcaataccaaattatctacacaattgaccaaaccaattggatttgaatgt
ttggcgataaagattgatcaattaaatttaaatagtattggtggtgtatttaccatttca
ggttcaaacattggatggaatataaattctggtggaagacgattaattgaaccaaatcga
aaaattgaatttcaaatggatctctcccttggaacaaaacaacaaagattaatcaatcta
atcaatccaccaccaacatctgcttattcatttaattttatagtgacagaagttggattc
aatgttgaatctgtaaaaattattaatcaaaatttggcaattttagaattaaattgtaca
tttgaaatgataaatccagattttttaccaaccgtcatttatacatctcaagatcatgta
ccttgtgatattataaattacaacaattcaacaaaaagtttaaattgtcttttacgtact
ctaccaataatcggacaacaacaaattatttttaaaaatcaattttttaatcaatctttt
atgtttatttataatagagatccaattataacatcattattaatggaaccaaattattat
ccaccaacttttttaaatttatatggttattttggaaatacaactggtgcaagtgttata
ttacaattgagggaatttacattttgtaatattaccattgcaagtaaagaatatattaaa
tgtagattctatacattaccagaacctggtccacaaaccctctattttgcctccaatcaa
ggatatttcaaatcagattcaatcttgtctattccatttcctctaccaacctttacagat
tgtatgaatcgtacaaataattgtaatggtcatggtgtttgtataaatggaatatgtcag
tgtgacgttggttattttgatgattgcaaattaaaggaaaatgatggtttcaatggacaa
tttcaatcaaataatacagatccaacaagtaatttaaaatatggagattatttattttca
ttttcaattattggtattcaagaaatggatttggataataatattacaagagaattggtt
gcaaaaacgtgggatgtagaggacaatagtagtggtgacctaacaatgattcaatataaa
ttgacaaatcatttacacaatattacaaatggttcgacaccatttacaaaagatgcagat
tattcaaatctaaatctaacaaccaccatagaattttcaaatcaatcaagaaccattgaa
tttggtggagatgaaatagttttggcaagtggtgccattaaaattggtgtaaatgttacc
aattggccttacatgtctgtcatgacaagactgagattagtcttttcaacaaccatcaat
aatcaacaaatgattgttggttgtgataattcaagttattcaatagaatctttacaaaac
tttgcagatcgtgattcaattcaatatcttcgagttttaaaagacaatgttcaattcttt
ggtagattcttggattatagtttatcagatggtagaaaaacctatagtaaaactgaagtt
ttaaatatcaccagaatcaatgatgaagaatcaaatgtgattattggtattaatattgga
caatgtaagatttgtttaatggatccagattttagtgcacttttaattgatcataaaagt
tttggtcaatgcaacgatgaatcaaaaaatgataattggaaattaattgttggtgttgta
gttggtactgttggtggtacttgtctaatcatcatatcaatattatttattaaatcaaac
aaatattattttattcatcgtgctaaacgtagattatcaatttcattgaaaaaaaaaaga
aatagaaaaagaaaaagaaaaagaaagagaaaaagaataactgcaattgcattaccaggt
gtaataaaaagtattcaatgggttatacaacaataccaatcaacgataggacttgatcaa
acatctatttgtagtagtggtcaagttaaatgtacaaattatcaagatgttgatatatat
attcaatcagtttatgtaaattcaggagcaccaccaaacattgatacatttgaatttcca
aatctattaacttttacactttcaacatctggtgcacctttttattccaattcatttgat
atcttgtcaaagatgaaaggattaccattggtagaatcaatcaagcttattggtgataat
acgataaaatcgattccaattgattttacagctgggaaacctctacttagaaaactttgg
ataagttcagtcaatttagtttcagcaggaaatatttttagtcacaacctactaaatgaa
atcaacttttcaatcactagtcttaacagtgtaaggttcaacactacagtatacatgcca
gatcttaaaactctaattctagacattaaatgcgactatgcttccaattgggaaatttca
tcttcttcttttccaactttatattcattaataataagtgctagttcaacatgtaatcaa
ccaatcattgtaaatgtgacagcaccattacgattaattgagtgttcaaatcaacctgtt
ggttctccaacaggttatattaaaatgatcattcaacaccctctcaatgttacatctctt
ggcgttggaggttattattctacattgcctgatctaaccatttttccaaacataaattct
ttttatatgtcaaatagtcaaatatcagatatctcatcaatcaaatatcccttaggtcta
atgcaatttcaactttcatactctaaaattatgacaataccaaatgtaccactaccaaaa
acattaacatcatttgatatgagttcaaaccttcttacatcaactgttcctgccatcttg
atggacaataacccatcaacttatattacatttggaaacaacttaggccttactggatcc
attccagaatcattttgttcagctcggtttttatccatcccacaaactggtataacaact
gttccaaattgtttttggtgttatactggaaatcttttatcagatttaacaaaaccaaat
aatattgattgtcaaccaataattgataatttcaatttaatatcattaattggtggatat
gaagtcagaggtcaactactaggatggggaaaagatattcccaatatgatattagcaatc
caaccaaataagattttaagattcacaatggatcttgcaaatggaatgaatcaaaatatt
acaatcaaattttcaccaacttctccaagttttgtatttttcgttcaagaatcctatttt
atagttcaagatattaaaaatattcaacaaactgttaattatctaagtctcaatattaca
tttgctacggtaaacccagaattgatgccaagaatatcagttggtggttcagtttgtgaa
ttgattaaattctatccagtagaaaaagtcattcaatgtgctgctactttttcatcctat
aataataataataccatttattttacaaatgattattataattttactactacttataac
aaagcaacctatgttgaaacaatttcacttgaacctttaatatatccaccaaaatattta
attttaaatggttattttggtactggattatcacttggatacatttcaattagaaatgga
acattgccaagttttggttgtaccattttaaatggtacattgtattatataaaatgtgaa
tttccaaatcaaccaccatcaggtcaaaccgtattaaatgtagatgtaccaaatggtctt
tatcaaacatccatttcaattccatttgcacaaccaacaaatgatgattgtatgaatcgt
acaaataattgtaataatcatggtacttgcgtaaatggtcaatgtgtttgtgatcctggt
tattttgataattgtaaattaaaaactgatccaaatatagaaattgaaccaaataatcaa
gaaccatcattttcatttaaagattattcattttcatttaaaatgatagcaattcaagaa
ttggatattgaaaataatgttgttagaaatttgaatacaaccaaatggaatgttagtgaa
agtcaaaagattgattattcatcgatcaattactttttgaccaatcatttaaataatagt
caagaaggatttataccacaattgatcaataccaatgtaacttcgatttttgaaatttca
aatcaatctagaaccataaagtttggtggacaatccattcaattggcaagtggatcaatc
aaaattagtgtaaatgttaccaattggccttttacatctgtactgactaggttgcgtgta
gtattctctaccattgttaataatcaacaagctattgttggttgtgatgattctgtcaat
caaattgaatcgtttcaacaatttacagattcagattccattcaatacttaagagttgta
aaaaataatactcaattctttggtcgattcttggattatagtgtagcagatggtagaaat
acttatagcaaggctgaagttttaaatatcaccaaaatcgataaccaagaatcacaagct
attcttggtattaatattggtcaatgtcgtacttgtcttttagatccagatttttctgct
ttactaattgaccgtcaaagctatggtcaagattgtacatccaacagtccagataataat
tggaagattattgttggtgttgtagttggtgctgttggtgctgccattttaattgctgtt
gccatttttataaaacaaaatcgttatttcttcctaagaagaaataatgaaactaaaatt
gaaatgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
