Cavenderia fasciculata (cellular slime mold): DFA_05713
Help
Entry
DFA_05713 CDS
T02668
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19026
spatacsin
Organism
dfa
Cavenderia fasciculata (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dfa03400
]
DFA_05713
DNA repair and recombination proteins [BR:
dfa03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
DFA_05713
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Spatacsin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14875656
NCBI-ProteinID:
XP_004361431
UniProt:
F4PM80
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2847 aa
AA seq
DB search
MINNNLFDVSRFVIDCWIIDSQTMNPLISSNSPISTLISASSQLESLPLLIRRLPIALLS
NLQAAAISDNVVTTLFACIKQLELDDEKKNKLAITYVPTGTSLFSGKDYDYHSSNDSNGL
ESTIDIIKSATTSSSSSSLSSSTSSLLSSTSYQELELPKQISSLVDIDRSSLQWIRVQPS
DSVCSTVSLYSTENELLHSLPALLAFTNHSNNLNIVTIFKKSTTTSTSPTSSLNQQQENI
KKLGSPLCIIYNNQLQQHQQSIVGKEERIVNQINNNNQLIINSISFDINQLLSIFKIDTN
ESKNIEIIENDKKIILLIEDSIVGVIGVKQLDCNSIVLYAERKFTISKYQKLVPEQRLIK
MVDKWIFTLDKENSIISIFSVSGRQRALINLKDYLIQNNNNIDLNDIKFNDFSISSDKST
LVIKDENDRIYMIMLDYYFQTTSQPIFSSSHMVEFKDKSTTNQEEEEQEEEEEEEEEEKD
QEESSESLSDSEDSIISSDLDDSSDDDLFLMHWFETKGSGRLLKDTQKEFDSVISWLPNR
SINYPTNGFKVNKNQTKTMSRENSFNSMIRSSSFADLLQQQQQQQFNNEDGQLQQQQQQL
NQSQSIQSSTSLFNYKSNREDQLKLWGTTIDYQIEKRLDILSSNFLITPRVIIYQRSLKE
KSEIYLFDRNDPVKKQFYHSIPEKITRVFYGKDQNLFYLCSSGLNILLVDQNQQQLLNNL
IMFEGSNSANHLCDLNGWNKRDLKIHALHLGLKYRQLEVVEPALKSLDHDQQLAGSRLLV
HTILENTAVSSNANVHNESFTTELLHIGMNFIGLIIKDRASKLDDQKNQGGISTFNWTET
LTTPLLPATAVNASSTPNTNILLSILSPSQQPTLLALQDENSKNSPIHDLLHFTTILEAF
RMFQWQQQVDKSQDNLYQQQYQQQQQQQTVQLYDSVNDQITDLEIGNLFFKDVKDRWSKM
EELQIIKESLNNNTITTALSFINWKREKNKQQEITNNQQDDEDDDIISLKGKMFTLEDFK
RIAVCFIYQTISQEEMDMTIKLLNNLGLSVIENLKQITLTTSRRNIRKLGLDTLGQSGGN
RFYDRDLIEFSNLLERLYPNPSYFREYSKLSFKWRPMMETRQPLLFNQLLNYQNNNNILI
EEERLKSTCQEVDDLLAKTQDLYGFQILNHNINNSNNATLNIYNSGLLGSMPTVGNNNNL
LNNINNSNNNDRIIINPPNIQQQMVNDHHSMSYDGYSHFTLEWLKKWSNITRERILLEKN
HQLNERDVVAQFLYFASHVKIEPLLQLIDHLEGDQLQQIIKVLKQMIKLLPNFLREIILS
RFLIRHHIVLVECESSGLFYLESKHQDKENNLRILYRLATTNQLFNRDLRGDIMVKFHPF
FIQFCIENNLTLLLSSYLEFYDLEKNQKNRSEQDRLLKLPLPIQLLFLLRSHRIEDLVES
NLINNSMVLGKNLGLVRDLDQFTLMINHSIDQNRPLLALSSILYSPIQFKNLNHLNQRLF
NQLEIDYPFLKTSLSPKNPNNNNNMNRRDIISNQNDISLFELINNNSLFNIQNLLNNSKL
ELLSNQSFREGYIDKIDIFYYLDHGRPFTAFKVFNQQKQKQKDLGEYSNILIGWLIRQFI
ISQKLQNQKTIVASLEFLDLLGLSRFSTILRCDLNILQQLQSSNELIELFLSIYQYPSSM
INNNFNSIAIQKIIQLFFETLSMDEPLIVGETLQWQLLSKFCDAHGVEKQTKHLEYLAFK
NNWIRFIFEIQSQSFELQQVEKIIQLFGNDDIRNHLIIIFQQIQKTRDNNELKSQDDSIF
NYLIESIDSNSGKEYLLNQSINDNRPLLSILANSIDSNENISTIQCFIIWLNREINNINN
NNNNNDYSIENIIILQGFKIFYPNCILFNFLTFILQFQQYRFEESEQSLLLFIRDLENDQ
IQSNFPIEKSLVKKQSIHICEKILDVLSIYEREHFLEILSRSNLDENFSTLFSTFSLLKR
NQQQQSFEFNVNPKLIVEQLLTKSMFEEARQYSMENHLDKDVVTIAEVESLVNHYKQGCL
WEIEQERINLWKKCQHYFTLYQTEPQVAGNFYYSHAIKLFNSNEKVYLLSLTIEWFEKMN
IQNDQEFKLLLEDLKKQILLISVGLSLENDKKQNSSNNNNNNGNLLYSNSNSNSNSVSPL
SSPFKPPNGTSTLNYSTNNYFRSPSSSLSSSPTESFNFNNFSSPFKPRNINNINNNNNNN
REESIIENNYLSSHPLNNLKEEKDNNFSNPKGLDNVLAKLLNNGNYSQAMEISKQFNFKS
IDYEIIFFMLSVASKKIAPLPTFIPSNILTIVQQNFNGIKWLNELQQQQQQQQLSMSQNL
SDNSLILNLLDILCSCCQTTTSAAKTIITKFNVCQTLFMDFNDPQLDNHYDILNLLLLSG
GKDSFRLVKQFIILNHLNFSIVNQQLVDLFLKSLNQNNNQSNWSLSSSSNSNSFDSKIDI
NWTSEEFHEYIRLGKDPFTFGMKLLESLDIDVEKYQSTNSPIISGENSSSSSSSSDAISV
EIFIRAHFCFVIGCSVDGTIMVLNIVKSRIQYYASKGEYKLLVRLVTGMQSYNELQGILD
ILLQHDQFELLLRKKIHQHEDHNGLKLALHSYLLKKQPLYQEKLEMLFLRFKMYREIAAS
HEHKAKQLLESLNIPPSKELSKPSSPIAQQYIKDLLNIMREFMDASDNYAKERSNKTSQV
CVSMGILVAAQIKNLDIRILNLKQSDARLLMQSRGNFRDGLIIANAYNLNNYTEWLNVIF
NQFLVLANFNYLSDYLNNFSSNINLYHDLIKKYKSNSPENQILIKSVKVLNVKHLLNHFV
LDRTMRYELAMICQFDDIVQSNKSLVK
NT seq
8544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaataataatcttttcgatgtaagtagatttgttattgattgttggattattgat
tctcaaacaatgaatccattaatcagttccaattcacccatctctactttgatatcggca
tcttcacagttggagagtctacctctactcattcgtagactaccaattgctttgttatca
aatttacaagcagctgccatatctgataatgttgtcactactctatttgcttgcatcaaa
caacttgaacttgatgatgaaaagaagaacaagttggccattacatatgtacctacaggc
actagtttatttagtggtaaagattatgactatcatagtagtaatgatagtaatggttta
gaatcaaccattgatataattaaatcagctaccacatcatcctcttcttcttccctatca
tcatccacttcatcccttttatcgtcgacgtcatatcaagaattagaattaccaaaacaa
atatcaagtctagtagatattgacagatcatcattacaatggattagagttcaaccatct
gatagtgtttgttcaaccgtttcattgtattcaaccgagaatgaattattacattcccta
cctgcactattggcttttaccaatcatagtaataatctaaacattgtaaccatatttaaa
aagtcgacaacaacctctacatccccaacttcatcattaaaccaacaacaagaaaatata
aagaaattgggatcacctttatgtattatatataataatcaattacaacaacatcaacaa
tcaattgttggaaaagaagaaagaattgttaatcaaattaataataataatcaattgatt
attaattcaatatcatttgatattaatcaattattatctatttttaaaattgatacaaat
gaatcaaaaaacattgaaattatagaaaatgataaaaagattatacttttaatagaggat
tcaattgttggagtgattggagttaaacaattagattgtaattccattgtattatatgcc
gaaagaaagtttaccatttcaaaataccaaaaactagtacctgaacaaagattaattaaa
atggttgataaatggatattcacacttgacaaggaaaattcaatcatttctatttttagt
gtatctggtaggcaaagagctttaatcaatttaaaagattatttaattcaaaataataat
aatattgatttaaatgatattaaatttaatgatttttcaatatcaagtgataaatcaaca
cttgttattaaagatgaaaatgatagaatttatatgatcatgttggattattatttccaa
actacaagtcaacctatattctcttcaagtcatatggtggaatttaaagataaatcaaca
acaaaccaagaagaagaggaacaagaagaagaagaggaggaagaagaagaggaaaaagac
caagaagaatcatctgaatctttatcagattctgaagattctattatttcatcagatttg
gatgattcatcagatgatgatttatttttaatgcattggtttgaaaccaaaggtagtgga
cgtttactaaaagatactcaaaaggaatttgatagtgttatatcatggttaccaaatcgt
tcaatcaactatccaaccaatggttttaaagtaaacaagaaccaaactaaaacaatgtct
agagaaaactcttttaattcaatgattagatcttcatcttttgctgatcttttacaacaa
caacagcaacaacaatttaataatgaagatggtcaacttcaacaacaacaacaacaatta
aatcaatcacaatcaattcaatcttctacttctttatttaactataaatcaaatagagaa
gatcaattaaaactttggggtacaacgatagattatcaaattgaaaagagattggatatt
ttatcaagtaactttttgattacaccacgtgtaattatttatcaaagaagtttaaaggaa
aagagtgaaatttatcttttcgatagaaatgatccagtaaagaaacaattttaccattcc
atcccagaaaagattacacgtgtattttatggaaaagatcaaaatttattctatctctgc
tcgtctggattgaatatacttttggttgatcaaaatcaacaacaacttttaaacaatctc
atcatgtttgaaggaagtaatagtgccaatcatttgtgtgatttgaatggatggaacaag
agagatttaaagattcatgcacttcacctcggtctaaagtatcgtcaattggaagtggta
gaaccagcactcaaatcattggaccacgatcaacaattggcaggatctcgattattggta
catactatattggaaaacactgcagtatcttccaatgccaacgttcacaatgaatctttt
acaaccgaactacttcacattggtatgaattttattggtttaattataaaggatcgtgcc
tctaaattggatgatcaaaagaatcaaggaggtatttcaacttttaattggactgaaaca
ttgactacaccacttttaccagcaactgcagttaatgcttcatctacaccaaataccaac
attcttctttccatcttgtcaccttcacaacaacctactttacttgctttgcaagatgaa
aattcaaaaaattctcctattcacgatctcttacattttacaactatattggaagcattt
agaatgtttcaatggcaacaacaagttgataaatctcaagataatctttatcaacaacaa
tatcaacaacaacaacaacaacaaacagtacaactttatgattcagttaatgatcaaatt
acagatttggaaattggtaatttatttttcaaagatgttaaagatcgttggtcaaagatg
gaagaacttcaaattatcaaggaatctttaaataataatacaattacaactgctctatct
tttattaattggaaacgtgaaaaaaacaaacaacaagaaataacaaataatcaacaagat
gatgaagatgatgatattatatcattaaagggaaagatgtttacattggaagattttaaa
agaatagcagtttgttttatttatcaaactattagtcaagaagaaatggatatgactata
aaattgttaaataaccttggattatcggtgattgaaaatttaaaacaaattactttgacc
acctcgagaagaaatattcgtaaacttggtttggatacacttggacagagcggtggtaat
cgattctatgatagagatttgattgaattttcaaatcttttagaaagattatatccaaat
ccatcctattttagagaatattcaaaattatcatttaaatggagaccaatgatggaaact
cgtcaaccattattatttaatcaattgttaaattatcaaaataataataatattttgatt
gaagaggaaagattaaaatcaacatgtcaagaagttgatgatcttttagccaagactcaa
gatttgtatggatttcaaattctaaatcataatataaataatagtaataatgcaacattg
aatatttataattctggtctattgggatcgatgccaaccgttggaaataataataatcta
ttaaataatattaataatagtaataataatgatcgtattattattaatccaccaaatatt
caacaacaaatggtaaatgatcatcattcaatgtcatatgatggatatagtcattttaca
ttggaatggttaaagaaatggtcaaatattacaagagaaagaattttattggaaaagaat
catcagttgaatgaaagagacgttgtagctcaattcctctactttgcaagtcacgtcaag
attgaaccattattacaacttattgatcatcttgaaggtgatcaattacaacaaatcatc
aaagtattgaaacaaatgattaaattgttaccaaactttttaagagaaatcattttatca
agattcctcattagacatcacattgttttggtagaatgtgaatctagtggactcttttat
ctagaatcaaaacatcaagacaaggaaaataatttacgtatcctttatcgtttggcaact
acaaatcaattatttaatcgcgacctaagaggtgatataatggttaaatttcatccattt
tttattcaattttgtattgaaaataatctgactctattattatcaagttatttggaattt
tatgatttggaaaaaaatcaaaaaaatagatcagaacaagatcgattattaaaattgcca
ttaccaattcaattacttttcctacttcgaagtcatcgtatcgaagatttggtagaatca
aatttaatcaacaattcaatggtacttggtaaaaatcttggtttggttagagatttggat
caatttacattgatgattaatcattcaattgatcaaaatcgtccattattggctttatca
tcaattctttattccccaattcaatttaaaaatctaaatcacctaaatcaaagattattt
aatcaattggaaattgattatccttttttaaaaacttcattatcacctaaaaatcccaat
aataataataatatgaatagaagagatataatatcaaatcaaaatgatatttcattattt
gaattgataaataacaattcattatttaatattcagaatctattgaataatagtaaattg
gaattattatcaaatcaatcatttagagaaggttatattgacaagattgatatattttat
tatcttgatcatggtagaccttttactgcttttaaagttttcaatcaacaaaagcaaaaa
caaaaagatcttggagaatattcaaatattctaattggttggttaattagacaatttatc
atttctcaaaaattacaaaatcaaaaaacaattgtcgcaagtttggaatttttggattta
ttgggtttatcaagattctctaccattttacgttgtgacttaaatatccttcaacaactc
caatcatcaaatgaattgattgaattatttttatcaatttatcaatatccaagttcaatg
atcaacaacaattttaattcaattgcgattcaaaaaataattcaattgttttttgaaact
ttatcaatggatgaaccattgatagttggtgaaacattacaatggcaattgttgtccaag
ttttgtgatgctcatggtgtagaaaaacaaacgaaacatttggaatatttggcttttaaa
aataattggattcgttttatttttgaaattcaatctcaatcatttgaattacaacaagtc
gagaaaatcattcaattatttggcaatgatgatattagaaatcatttaattattattttc
caacaaattcaaaaaactagagacaataatgaattgaaaagtcaagatgattctatattt
aattatttaatagaatctatcgatagtaatagtggtaaagaatatttattaaatcaatca
attaatgataatagacctttattatcaattttggcaaattctattgatagtaatgaaaat
atttcaactattcaatgttttatcatttggttaaacagagaaattaataatattaataac
aataataataataatgattattcaattgaaaacattataattttacaaggatttaaaata
ttttatccaaattgtatattatttaatttcttgacatttatattacaatttcaacaatat
agatttgaagaatcagagcaaagtctattattatttattcgagatttggaaaatgatcaa
attcaatccaattttccaatagaaaagtctttggttaaaaaacaatcaattcatatttgt
gaaaaaatcctagatgtactatcaatttatgaaagagaacattttttggaaatactatca
agatcaaatctggatgaaaacttttcaacattattttcaaccttttcattattgaaacgt
aatcaacaacaacaatcatttgaatttaatgtaaatccaaaattaattgttgaacaatta
ttgaccaaatcaatgtttgaagaagcaagacaatatagtatggaaaatcatttggacaag
gatgtggttaccattgcagaagtggaatctttggtcaatcattacaaacaaggttgttta
tgggagattgaacaagaacgtattaatctttggaaaaaatgtcaacattattttacattg
tatcaaactgaaccacaagttgcaggaaacttttattatagtcatgctattaaacttttc
aattcaaatgaaaaggtttatctgttatctctgactatagaatggtttgaaaaaatgaat
attcaaaatgatcaagaatttaaattattattggaagatttgaaaaaacaaatcttatta
atttctgttggtctatctttggaaaatgataaaaaacagaacagtagtaataataataat
aataatggtaatttattatattcaaattcaaattcaaattcaaattcagtttcaccactt
tcttcaccatttaaaccaccaaatggaacaagtacattaaactatagtacaaataattat
ttccgttctccatcttcttctctttcttcttctccaactgaatcttttaattttaataat
ttttcttctccttttaaaccaagaaatataaataatattaataataataataataataat
agagaagaatcaattatagaaaataattatttatcatcacatccattaaataatttaaaa
gaagaaaaggataataatttttcaaatccaaaaggattagataatgtattggcaaaatta
ttaaataatggaaattactcgcaagcaatggaaatatcaaaacaatttaattttaaatct
atagattatgaaattatatttttcatgttgtctgtagccagtaaaaaaattgcaccttta
ccaacttttataccatcaaatattttaaccattgtacaacaaaattttaatggtattaaa
tggttaaatgaacttcaacaacaacaacaacaacaacaactgtcaatgtcccaaaacctt
tcagataatagtttaattttaaatcttttggatatattatgtagttgttgtcaaactaca
acttcggcagcaaaaacgattataacaaaattcaatgtttgtcaaacattgtttatggat
tttaatgatcctcaattggataatcattatgatattttaaatttattattactttcaggt
ggtaaagatagttttagattggtaaaacaatttatcattttaaatcatttaaatttttca
atagtcaatcaacaattggtagatttatttttaaaatctcttaatcaaaataacaatcaa
agtaattggtcattatcttcttcatccaactccaactcttttgattcaaagattgatata
aattggacatctgaagaatttcatgaatatattagattaggtaaagatccttttaccttt
ggtatgaaattattggaatctttagatatcgatgttgaaaagtatcaatcaaccaattca
ccaatcatttctggtgaaaattcctcttcctcttcatcctcttcagatgcaatttcagta
gaaatatttattagagctcatttttgttttgtaattggatgtagtgtagatggaacgata
atggtattaaatattgtaaagagtcgtatacaatattatgctagcaagggagaatataaa
ttattggttcgtttggttactggtatgcaatcttataatgaattgcaaggtattttggat
atcctattacaacatgatcaatttgaattgttgttgcgtaaaaagattcatcaacatgaa
gatcataatggacttaaattggcattacatagttatttactcaaaaaacaaccactctat
caagagaaattggaaatgctctttttacgttttaaaatgtatcgtgaaattgcagcctct
catgaacacaaggcaaaacaattattggaaagtctcaatattcctcctagtaaggaactg
tcaaaaccatcatctcctattgctcaacaatatattaaagatcttttaaatataatgaga
gaatttatggatgcttcagacaattatgcaaaagaacgtagtaacaagacatcacaggta
tgcgtgtcgatgggtattttggttgctgctcaaattaaaaatttggatattcgtatactc
aatttaaaacaatcagatgctcgtctattaatgcaatctcgtggaaactttagagatggc
ctaatcattgcaaatgcctataatttaaataattatacagaatggttaaatgttattttt
aatcaatttttggttctcgcaaattttaattatctttcagattatttaaataatttctca
agtaacattaatttatatcatgatttaattaaaaagtataaatcaaattcaccagaaaat
caaatattgataaaatctgtaaaagttttaaatgttaaacatttattaaatcattttgtt
ttggatcgtactatgcgttatgaattggctatgatttgtcaatttgatgatatcgttcag
tcaaataaatctctagttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
