KEGG   Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124489910
Entry
124489910         CDS       T08043                                 
Name
(RefSeq) protein RRP5 homolog
  KO
K14792  rRNA biogenesis protein RRP5
Organism
dfr  Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:dfr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:dfr03009]
    124489910
Ribosome biogenesis [BR:dfr03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   Other 90S particles
    124489910
SSDB
Motif
Pfam: S1_RRP5 S1 HAT_Syf1_CNRKL1_N HAT_PRP39_N OB_RRP5_4th HAT_PRP39_C OB_RRP5 TPR_CcmH_CycH
Other DBs
NCBI-GeneID: 124489910
NCBI-ProteinID: XP_046908271
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1472 aa
MALKDESFPRSKPSKHPTSILPSYRPSIAEDEQLFKSRKRKPTESKSAKPKKRSKKTSKD
HNNMQEQNQESNLKKTVIENLTVNRLIENMVVLGCIEEITDFELKFSITGGINVTVPITN
ISTPYSQLVENFANDQNEHGVEIAKLASLFNMGEYFAIRILSKRICDKFGHSEVIGSINP
KDVYHNFSFKTFQRLPSGYNLIAAVLSKEDHGYLMDIGVEDMKAFLPNEDIEQNNNVDLH
IGQLIQCSVANVNERSLTLTVDDKMAKKFSIEDDHQPGILFYTPGIKTNATITGTFNHGL
ELGLPGGYKGFVPRFHVSDDLSVMPKQFQISNTVHGHVMYVHPHTKQVCISLKSKIKSKK
IKSLIESIRIGLIIDNAIVCSRTQYGGLTFRLPGNNYAIALKKNLFEAKEFDEDNYDRLY
RPGSSHRVRVKKFHLIDNLIEISLRKSFIDRKDLTIDDIDIGTIVEGVVKKYRPDGVYVK
IGFGINGFIPNIHLTDTPTLNWEKTRSQFFPLKKRVQCKVLKLDFSSRIPKIALTAKKTL
LKMNDEEMFKDLSKINARMSSTGVVCLTTDKGILLEFFNHVRGFIPLKFLATYKIEYPDK
VFRLGQLIKCTVVTVDHHAQHMVCSLIDLDETKKLKMNLQIKTKNDTYNSKLKVGQILKR
MRIISKTPMKGYDLTDDAQEKIQVFLPLAHLSDDTYISRIMFGTYKVGDIIDELMVFSKD
SANVVCVTMKPIFLQKIYPLIMNEHDVQLNSPFPAIVRNVTPTGVFFETTNAQYGVVRRK
FLQDGFIDEPQKLGLCRGQTIFVKAIDVSSYEFSGSNDENYLKRFKFSMKLSDVWNRENS
NESIEMLKSYLNQLQCIRQSSMENKDEDEKIRLLTSYSIGEVITFVITEINDDHIKMDCS
RSGCKNEPTVSGIAMKYETFPDLTISQMGMAIVCDIDFDRKNLILFIQSKPSKLIRLVKN
FQRTNLTKIKSNQLIKGTVIHVNPKYILTILGGHLPGLIAYVPSRKHYNDLRHVEKLFTI
NQSYQFMIENFDNNEDHHIAKVFVILYDNQMKKSIESKKIHSKKPIAHQPPIIEFKNEVI
TVNVETEQKSKNNHEKQIEKSNLTSTIDRFDWNVLDLSKLTNKRKFEELQTKSDEDSGFN
IDSDSDESDAAYDGLNNKKHRNREERGQEARKREMMLREKEQKLTDIDRKPQDEQDFEMA
IVAKPNSSYIWIEYMAFMVECKQIDKAREIGERALKKISFREEKEKLNIWTSLLNLENQY
GDENSMKELIEKAVKFNDAKTIYSRVAIIYDESERKDDAEQIYQFMIRKFHTNLTVWISF
LLFYMKNGQIENGRKLFVKALAAINKQQHIDLISKFGQFEFCYGDCENGKTLFEKLLALY
WGRLDKWSIYIDMLIKYTLNDNDNHDDSIEFIRNIFERLLTFKFSPHKMRFIFKKYYDFE
MKYSSSSDNGELLERLKQKAAEYVEHGTFFSN
NT seq 4419 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcactcaaagatgaaagctttccacgatcaaaaccatcgaaacatccgacttcgatc
ttaccatcatatcgaccatcgattgctgaagatgaacaattattcaaaagcagaaaaagg
aaaccaacagaatcaaagtccgcaaaaccaaagaagcgatctaaaaaaacttcaaaagat
cataataatatgcaagaacaaaatcaagaatcaaatcttaaaaagacagtcatcgaaaat
ttaaccgtgaatcgtttgattgaaaatatggtcgtacttggttgcatcgaagagataacc
gattttgaattgaaattttccatcactggtggaatcaatgtaaccgttccgataacgaat
atttcgacaccatatagtcaattggttgaaaattttgccaatgaccaaaatgaacatggt
gtggagattgcaaaattagcttcattattcaatatgggcgaatattttgccattcggatt
ctgtccaaacgaatctgtgataaatttggccattccgaagttatcggttcaatcaatcct
aaagatgtttatcataatttttcgttcaaaacatttcaaagattaccatctggttataat
ctaattgcggcagtgttaagcaaagaagatcatggctatctaatggatattggtgttgaa
gacatgaaagcatttttacccaatgaagatattgaacagaataataacgtagaccttcat
attggtcaattaattcaatgttcagtagcaaacgttaatgaacgaagtctaacattgaca
gttgatgataaaatggcaaaaaaattttctattgaagatgatcatcagcctggtattctt
ttctatacaccgggaatcaaaacaaatgccacaatcaccggaacttttaatcatggtctt
gaattaggattacctggtggttacaaaggttttgtaccacgattccatgttagtgatgat
ctttccgtaatgcctaaacaatttcaaatcagtaataccgttcatgggcatgttatgtac
gtacatccacatacaaaacaagtgtgcatatcacttaaatcaaaaataaaatcaaaaaaa
ataaaaagccttatcgaatcgatacgtatcggattgatcatcgataatgccattgtttgt
tctcgtacacaatatggtggactaacatttcgattaccgggtaataattatgcaattgca
ttgaaaaaaaatcttttcgaagcgaaagaatttgatgaagataattatgatcgtttatat
cggccaggatcatcacatcgtgtacgagtgaaaaaatttcatcttatcgataatcttatt
gaaatatcattacgaaaatcatttatcgatcgtaaagatttaaccatcgatgatatagat
attggtaccattgtcgaaggtgtagtaaaaaaatatcgaccagatggtgtatatgtaaaa
ataggtttcggtatcaatggtttcataccgaatattcatctaacagatacacctacattg
aattgggaaaaaacccgttcacaattttttccattaaaaaaacgtgttcaatgtaaagtg
ctgaaattggatttttcttcaagaataccgaaaatagcattaacagcgaagaaaacttta
ttgaaaatgaatgatgaagaaatgttcaaagatttgagtaaaataaatgcacgaatgtca
tcaacaggtgtggtttgtctcaccaccgataaaggaatattgttagaattttttaatcat
gttcgtggttttataccgttaaaatttctcgcaacctataaaattgaatatccggataaa
gtatttcgtctgggacaattgataaaatgtacggtcgttaccgttgatcatcatgcacaa
catatggtctgttcattgatcgatttggatgaaacgaaaaaattgaaaatgaatctacag
attaaaacgaaaaatgatacatataattcaaaacttaaagtcggacaaatcctaaaacga
atgcgaataatttctaaaacaccaatgaaaggttatgatcttacggatgatgcacaggaa
aagatacaagtatttctaccacttgctcatttatcggatgatacatacattagtcgtata
atgtttggtacatataaagttggtgatattatcgatgaattaatggtattctcgaaagat
tcagctaatgtggtatgcgttacgatgaaaccgatttttctgcaaaaaatctatccatta
ataatgaatgaacatgatgttcaattgaattcaccatttccggctattgtacgtaatgta
acaccaaccggtgtattctttgaaacaactaatgctcaatatggtgtggttagacgaaaa
tttcttcaagatggttttattgatgaaccacaaaaacttggtctttgtcgtggccaaaca
atatttgtcaaagcaatcgatgtatcatcatatgaattttctggatctaatgatgaaaat
tatttaaaaagatttaaattttcaatgaaactttccgacgtttggaatagagagaattcg
aatgaaagtattgaaatgttaaaatcttatctaaatcaattgcaatgtattcgtcaatca
tcgatggaaaataaggatgaagatgaaaagattcgtttgttgacatcatattcgattggt
gaagttattacgtttgtcatcacagaaattaatgatgatcacattaaaatggattgtagc
cgaagtggttgtaaaaatgaaccaactgtatctggtatagcgatgaaatatgaaacattt
cccgatttaaccatttcacagatgggaatggccattgtttgtgatattgattttgatcga
aaaaatctcattctatttatacaatccaaacctagcaaattgattcgtctggtgaaaaat
tttcagcgtacaaatttgacaaaaattaaatcaaatcaattgataaaaggaacggttatt
catgtgaatccgaaatatattctaaccattttgggtggtcatttacccggattaattgcc
tatgtaccttcaagaaaacattataatgacctaagacatgtggagaaattatttaccatt
aatcaaagttatcaatttatgattgaaaattttgataataatgaagatcatcatattgct
aaagtgtttgttatactttatgataatcaaatgaaaaaatctatcgaatctaaaaaaatt
cattcgaagaaacctatcgctcatcagccaccaatcatcgaatttaaaaatgaagtcatc
actgtaaatgtggaaactgaacaaaaatcgaaaaacaatcatgaaaaacaaattgaaaaa
tcgaacttgacatctacaatcgatcgattcgattggaatgtattggatctatcgaaattg
actaataaacgaaaatttgaagaattacaaacaaaatccgatgaggattctggtttcaat
attgatagtgattccgatgaatccgatgctgcttatgatggattgaataataaaaaacat
cgaaaccgtgaggaacgaggtcaagaggcaagaaaacgtgaaatgatgttacgtgaaaag
gaacaaaaattaaccgatatagatcgaaaaccacaagatgaacaggattttgaaatggcc
atcgttgccaaaccgaatagttcatacatatggattgaatatatggcattcatggtcgaa
tgtaaacagattgataaagcacgtgaaattggtgaacgtgcattgaaaaagatttcattc
agagaggagaaagaaaagctaaacatatggacaagtttactgaatttagaaaatcaatat
ggtgatgaaaattccatgaaagaattgattgaaaaagctgtaaaatttaatgatgctaaa
accatttatagccgtgtggcaatcatttatgatgaaagtgaacgtaaagatgatgctgaa
caaatttatcaatttatgataagaaaatttcataccaatcttactgtatggatttcattt
ctattattttatatgaaaaatggacaaattgaaaatggcagaaaattatttgttaaagca
ttggccgcaatcaataaacaacaacatattgatctaatttcaaaatttggtcaatttgaa
ttctgttatggtgattgtgaaaatggtaaaacattatttgaaaaattattggcactttat
tggggacggttggataaatggtcaatctatatcgatatgcttattaaatatacattgaat
gataatgataaccacgatgattcgattgaatttatacgtaatatttttgaacgtttatta
acatttaaattttcaccgcataaaatgcgttttatatttaaaaaatattatgattttgaa
atgaaatattcatcatcatcggataatggtgaactattggaacgtttaaaacagaaagca
gccgaatatgttgaacatgggacatttttttcaaattga

DBGET integrated database retrieval system