Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124490691
Help
Entry
124490691 CDS
T08043
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: laminin subunit beta-1-like
KO
K06243
laminin, beta 2
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Pathway
dfr04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
124490691
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_N
LAMININ_IV_B
F5_F8_type_C
Flagellin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124490691
NCBI-ProteinID:
XP_046909188
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1986 aa
AA seq
DB search
MSTINNQLKMSSQTTTTTPSTSCSWSSLIHSFGTKFIHLFIVFLFLFLSLTLCQRYPDHH
HQREYDEYDRNARQQRVGYNSKPYSHDVSYFKLNETSITSTSNDHHDSQQKQRPVPINPV
NGRSSSYEWSRNSGYPQSSLNHRNYYESHHKSRVTDDNRNQQIVSNRPSVIGDGGKHMPG
PFIWYNDTFHWAENRSRGYDPDLDGPTLAPPTIEHTYDEEDWDGTDLKSRHKFDDRHPMA
IYPSGRCDDFQACYPATGNLLIGREDRLKASSTCGLRQQVRYCVVSHLKEKKKCFYCDSR
DRFKGTARYHGIENVVSRVGQKRRQFWWQAENGVENVYVQFDLEAEFHFTHLVMTFKTFR
PAAMLIERSHDFGRTWKVYQYFAYDCGASFPGIPLGPRNRITDLVCDSRYSNVEPSTEGE
VIFRVLPPNIHIDDPYSKEVQDMLKITNLRINFTQLHTLGDNLFDPRIEVKEKYYYAIYD
MVVRGSCSCYGHASRCIPSNHETIPDMVYGRCECTHHTKGLNCELCEDLYNDLEWKPAIG
RQTNACKKCECNNHASRCHFDMAVYQASNNISGGVCEDCQHNTMGVHCERCRPSFFRDPN
RRLDDPYVCQQCDCDPRGSKEEGNCDPYTDPALGLESGRCSCKKNVEGRRCDHCKPGFWN
LHEINPDGCEPCSCNQMGTVGNHGCNINTGECVCKRNVVGRDCNQCAPNYYGLGVDEEGC
KFCDCDPGGSYSPDCDQETGRCNCRPHVTGRRCDQPEPGYFVPSPDYLTFEAEDAKTIQG
SPIITPRNYDERMHWTGEGFNRLPPYSGIEFTIDNVPISKYYDVVVRYEPETSGRFNNAQ
LMIKRPYGTDVYGPCGNYSTTNDIRTINLSSNERTAIADSICLEKGQRYQMELNANEFER
PSYGNEQSPSILIDSIILIPKANDIPFLSGGTPENQRRQYEYEHRCLMPYYNLNRAPEVD
EHCRKTLMSAGFYTFDGAQPCSCNPTGSYSADCQQLGGLCQCKQYVSPRTCDRCHVGYYG
FGPDGCKACDCHRIGALDNECDPITGQCNCRPETYGRQCDECQPGYWNYPNCQRCDCNGM
SDMCDSKTGSCIDCRDNTAGAHCEECVAGYYGDPLGRMTGMVVPCRPCPCPGVEDSGMSH
AHTCQLDPRTQNVICHCHPGYAGERCDRCDENYFGDPNLPGGQCVACNCSGNTDISQPGN
CDPKTGECLRCLYNTGGPNCQVCKPGYYGNALDHSCAECVCHHLGTDPRSAFCNQTTGQC
SCLPNVEGISCNRCADNHWNLASQQGCEPCDCDPQGALSMKCNEIDGQCHCKTTFGGRAC
NECLPNHYGNPRLQCKLCECNSAGSSSMQCHKVTGDCVCIDGISGAKCDRCARGFTGMVP
YCEACGECFESWDNITNILKTETFHLLDKARQIKQTGTTGAYTKQFTQIELNLDEINKIL
EGQNINKFDLERVQHMIEEAKSNLANLQEALNNHERQLEDTKTNIINVNFKLNALANKSM
ELELEANQLKNETFALQEANVEGAYNMTKDAQRRSRASRNMVEESSNILTDSQTIRRNTE
QLIDQPKGQHNLTYHENDRILRNIQQEISEMENGLPNINNLVCDGFSTIDQCDNLCGGAG
CGRCGGISCTHGATTKASTAVELAKKAEKDLQEKDRHVKDELRRIKEAREKSDEALEEAK
AAFERIMLAKNTSTNTAVEVNNLLDQIHNFLSDDVAQAKDVREIAEKCRQNTISLDENEI
ALLALEINKTIAGLKDIDRILIETRDSLEKAEHLKIKADQVKKKANDILSVAESVKQELN
KALEAQRKAKNSIDMANKSIIGIEQDLKEVTGKAEEAKDKTEEAKGKIGSLNDRLNNLTK
KFTGNKFNIENAEKEAMAASSSAEDANKYVDDLERKYRLAAQKLDQKSKVSDDLKKRAKA
LKDNASTLLNNVSVKLKSIEDFENDIANNDQKLDDLRRKIEELDNEMKNHLENIERQSKF
YRDCQA
NT seq
5961 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaactattaataatcaattaaaaatgtcatcacagacaacaacaactactccaagt
actagttgtagttggtcatcattgatccattcatttggaaccaaatttattcatctattt
attgtgttcttgtttctattcttgtcattaacattatgccaaaggtatcctgaccatcat
caccaaagagaatatgatgaatatgatcgtaatgctagacagcaacgtgtcggctataat
agtaaaccatattcacatgatgtttcatattttaaattgaatgaaacatccatcaccagt
accagtaatgatcatcatgattcacaacaaaaacaacgaccagtgcccataaatcctgtc
aatggtcgttcatcatcatatgaatggtcacgtaatagtggttatccacaatcatcatta
aatcatcgaaattattatgaatcacatcataaaagtcgtgttaccgatgataatcgtaat
caacagattgtatctaatcgaccatcggttattggtgatggtggtaaacatatgcccggt
ccatttatatggtataatgatacatttcattgggctgaaaatcgttctcgtggttatgat
ccagatctggatggtccaacactggcaccacccacaattgaacatacatatgatgaagaa
gattgggatggaaccgacctcaaaagtcgacataaattcgatgatcgtcatccgatggct
atttatccatctggtcgttgcgatgattttcaagcttgttatccggcaaccggtaaccta
ttgattggtcgtgaagatcgattaaaagcatcatcaacatgtggcctacggcaacaggtc
cgttactgtgtcgttagtcatttgaaagagaagaaaaaatgtttctattgtgattcgaga
gatcgattcaaaggaacggcaagatatcatggaattgaaaatgttgtatcacgtgttgga
caaaaacggcgacaattctggtggcaagcagagaatggtgtggaaaatgtttacgtacaa
ttcgatttggaagcagaatttcatttcacacatttagtaatgacatttaaaacatttcgt
ccagctgcaatgcttatcgaacgttcacatgattttggccgcacatggaaagtatatcaa
tattttgcctatgattgtggtgcatcatttcctggcataccattgggtcctcgtaatcgt
attaccgatttggtttgtgattcacgatattcaaatgtcgagccatccactgaaggtgaa
gtgatttttcgtgtgctgccaccgaacattcatatcgatgatccatattcaaaagaggtt
caagatatgcttaagattactaacctacgaattaatttcacacaattacatacattgggt
gataatctatttgatccacgtattgaagtgaaagaaaaatattattatgctatctatgat
atggttgtacgtggttcttgttcctgttatggtcatgctagccgttgtataccaagtaat
catgaaaccataccagatatggtttatgggcgttgtgaatgtactcatcatacaaaagga
ttgaattgtgaactttgtgaagatctttataatgatcttgaatggaaaccggctatcgga
cgtcaaacaaatgcctgtaaaaaatgtgaatgtaataatcatgcaagtcgatgtcatttc
gatatggctgtatatcaggccagtaataatattagtggcggtgtttgtgaagattgtcag
cataatacaatgggcgttcattgtgaaagatgtaggccttcgttttttcgagatccaaat
cgtcgtctcgatgatccttatgtttgtcaacaatgtgattgtgatccacgtggttcaaaa
gaagaaggaaattgtgacccatatacagatccagctttaggtctagaatctggtcgttgc
agctgtaaaaaaaatgttgaaggtcgtcgttgtgatcattgtaaaccgggtttctggaat
ctacatgaaattaatccagatggctgcgaaccttgttcatgcaaccagatgggtaccgtc
ggtaatcatggttgtaatatcaacacaggtgaatgcgtctgtaaacgcaatgttgttggg
cgtgattgtaatcaatgtgcgcctaattattatggtttgggtgtggatgaagaaggttgt
aaattctgtgattgtgatccaggtggatcatattcaccggattgcgatcaggaaactggc
cgctgtaattgtcgtccacatgtaaccggtagacgctgtgatcaacctgaacctggttat
tttgttccatcacctgattatcttacatttgaagctgaagatgctaaaacaatacaagga
tcaccgataataacaccacgaaattatgatgaacgtatgcattggactggcgaaggattt
aatcgattaccaccatattcaggaattgaattcacaatcgataatgtacctatttcgaaa
tattatgatgtagttgttcgttatgaaccagaaacatcgggtcgtttcaataatgctcaa
cttatgatcaaacggccatatggtacagatgtatatgggccatgtggaaattattccaca
acaaatgatattcgtaccataaatttatcgtcaaatgaacgtacagcaattgccgattct
atttgtctggaaaaaggtcaacgttatcagatggaattgaatgcaaatgaatttgaacga
ccatcatatggtaatgaacaaagtccttccattctaattgattcgattatattgattccg
aaagcaaacgatataccatttttaagtggtggtacgccagaaaatcaacgaagacaatat
gaatatgaacatcgttgtctaatgccctattataatttgaatcgtgcaccagaagttgat
gaacattgtcgtaaaacattgatgagtgctggattctatacgttcgatggagcacaacca
tgtagttgtaatccaaccggatcatatagtgctgattgtcaacaattgggtggtctttgt
caatgcaaacaatatgtatcaccacgtacctgtgatcgttgtcatgttggttattatggt
tttggtcccgatggctgtaaagcttgtgattgtcatcgtattggtgcattagataatgaa
tgtgacccaattactggacaatgcaattgtcgaccggaaacatatggtcggcaatgtgat
gaatgtcagccaggctattggaattatccgaattgtcaacgttgtgattgtaatggaatg
tctgatatgtgtgattcgaaaacaggaagctgtattgattgtcgagataatacagccggt
gctcattgtgaagaatgtgttgccggttattatggggatcctttaggtcgaatgaccgga
atggtcgttccttgtcgcccttgtccttgtccaggtgttgaagattccggaatgtcacat
gcacatacctgtcaattagatccacgtacacagaatgttatttgccattgtcatccgggt
tatgctggggaacgttgtgatcgctgtgatgaaaattattttggggatcccaatttacct
ggtggtcaatgtgtcgcctgtaattgcagcggtaatactgatatcagtcaacctggaaat
tgtgatccaaaaacaggtgaatgtcttcgttgtttgtacaatacgggtggaccaaattgt
caagtatgtaagccaggctattatggtaatgcacttgaccattcttgtgccgaatgtgtt
tgtcatcatttgggaacggatccacgatctgcattttgtaaccaaactactggacaatgt
tcatgtctgcccaatgttgaaggaatttcctgtaatcgttgtgccgataatcattggaat
ttagcctcacaacaaggctgtgaaccatgtgactgtgatccacaaggtgctttatcaatg
aaatgtaatgaaatcgatggacaatgtcattgtaaaacaacatttggtgggcgtgcttgt
aatgaatgtcttcctaatcattatggaaatccaagacttcaatgtaaactttgtgaatgt
aattctgccggatcaagtagtatgcaatgtcataaagttacaggcgattgtgtttgtatt
gatggtatatccggtgcaaaatgtgatcgatgtgcacgcggttttaccggtatggtacca
tattgtgaagcatgtggtgaatgttttgaaagctgggataacataacgaacatattgaaa
acggaaacattccatttgttggataaagcacgtcaaattaaacagactggtactaccgga
gcatatacaaaacaattcacacagattgaattgaatttagatgagataaacaaaattctt
gaaggacaaaatatcaataaattcgatttggaacgtgtacagcatatgattgaagaagct
aaatccaatctagcaaatctacaggaagcattaaataatcatgaacgacaacttgaagat
acaaaaacgaatataatcaatgtaaatttcaaattaaatgcattggcaaataaatccatg
gaattggaattggaagcaaatcaattgaagaatgaaacatttgctctacaagaagcaaat
gttgaaggtgcatataatatgacaaaagatgcacaacgtcgtagtcgtgcatcaagaaat
atggttgaagaatcaagtaatatattaaccgattcacaaacaattcgtcgtaatactgaa
caattaattgatcaaccaaaaggacaacataatctaacctatcatgagaatgatcgaatt
cttcgtaatattcaacaggaaatatcagaaatggaaaatggcctaccaaatattaataat
cttgtttgtgatggattctctaccattgatcaatgtgacaatctttgtggtggtgctggt
tgtggtcgttgtggtggtataagttgtacacatggtgcaacaacaaaagcatcaacagct
gttgaattagcgaaaaaagcggaaaaagatttacaggaaaaagatcgtcacgtcaaagat
gaactccgtcgtattaaagaagcacgtgaaaaatccgatgaagcattggaagaggcaaaa
gctgcattcgaacgaataatgttggctaaaaatacatcaacaaatacggctgtcgaagtg
aacaatctgttggatcagattcataatttccttagcgatgatgttgcacaggctaaagat
gtacgagaaattgccgaaaaatgtcgacaaaatacaatatcattggatgagaatgaaatt
gctttacttgcattagagattaataaaactattgccggattaaaagatattgatcgtata
ttgatagaaacacgtgattcgttggaaaaagctgaacatctcaaaatcaaagccgatcag
gtcaagaaaaaagccaacgacattctatccgttgctgaatcagtgaaacaagaattgaat
aaagcgttggaagcacaacgaaaagcaaaaaattcaattgatatggcaaataaatcgatt
atcggtatcgaacaggatctaaaagaggtaacaggtaaagctgaagaagccaaagataaa
acagaagaagcgaaaggcaaaattggttccctaaatgatcgattgaataatttgacgaaa
aaatttactggaaataaattcaatattgaaaatgctgaaaaagaagcaatggctgcttca
agcagtgctgaagatgctaacaaatatgtcgatgatctggaacgtaaatatcgattagca
gcacagaaattggatcaaaaatctaaagttagtgatgatctaaagaaacgtgctaaagct
ttaaaagataatgcatcaacattgttgaataatgtatcagtgaaattaaaatcaatcgaa
gatttcgaaaacgatatcgctaataatgatcaaaaattggatgatctacgtcgtaagatt
gaagaattggataatgaaatgaaaaatcatctagaaaatattgaacgacaatcgaaattt
tatcgtgattgtcaagcttag
DBGET
integrated database retrieval system