Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124493804
Help
Entry
124493804 CDS
T08043
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog isoform X1
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
dfr03009
]
124493804
Ribosome biogenesis [BR:
dfr03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
124493804
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124493804
NCBI-ProteinID:
XP_046912861
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2463 aa
AA seq
DB search
MEMLCEKFYLQNNTCLPLDDLLNFTSKIISSPIYDIILFKYLHQLFYKVLLSNSIDDKIC
VIEFISFVILKKKPRPILGNELEKIQKYSLDFGENNQMVIENLCQMIKCNKSDNLQIVYS
CLTILSSIVKFNSICDDDFIHENIVNIIESPLSRSFQFEDSNIYAELLYETIIFAILNSH
QNSPITRFNLKMFTTFLSANPNCTRVLQALDLFVSYNKSTTSKDFRQELNAEFSNLYPLL
EHNLSSPRRLNRLVCLHLLTLFDCLSVPITEENPKAISVFQICLNAEFVPVDLENYRERL
RLIWKLDSTYISLYLPQPLDDIKFDMAPVCFLFGTLYENLSVLWKPIVEVIETYAKQNSD
KPNRFLEVLFNHFRQILVLIKASRLKSDCLWSSRTKIAIEFIEKSNIFALDHLNHRLWLL
KCFERFPNLIERKNAEFVDLFFRFLSEEFDDHYICRTNSRENISSNTSSDMSGENKSLRK
MENSKMTWKTFFAFLDVFEKFKNPKAIHKEPQLNQIYLDLLSSPNSQCQKHAFNCLLTYN
QSHLTKYRENFLQLIDDKSFVSEINSFMFRENVDDNVIVVEDRPKVVPVFLRILIGKMIA
SAGTKTHGKSKVDFVRSLIMKILSNFNADQQIMFMDFVYASINPLLQTDYCDLLEKINKE
FVNVESFIPFKHFQSFITTLEFLMKHFGNRSTMVMQYMFKILLICSSICSQLLSIQNRSK
IKEYIVDQLKIFRTNCFKVAEYFFNNFLTYPFEPIEIDLLFESLIRPLVGNISTESQNYP
SPLLRLFNVWSENPRYFILLIKHFDSEKDSTPLVSIIQLFKNPKLSQMTIGFIVKLIENL
LIADEPITRLNINNFDHLIPSGEQSINFGSLILIPHIKDIIERIKLNYHSKSNPKFSLQE
INILARLSLHVTDAMDSHTIMMLLIRSISRKKRPEEDKEIFILKILSHLSQNLSDESFEI
ILNSSYDLFTLVQKPMPRKELTSNYLLNLSKNNESFIPFAQMISDLNSFNPKYPEEPDYD
CRISAFNKINNYIDSICENPTRLSSTQLKFIDLLLLNCAFFLNTFDDLSIRESSSAVIMK
ITLLFRIHPLTDLYNKYVIDMILLKIIPDGIRNPKESASIEFIGILVDIIRTPSSSSSSS
LLNNIYIDQLLSLCNNDDEELDFWQNIRHIQLHRRARALNRLLQNKSLLESLSSCVYSNF
LIPIVENQIIYSSSSSGGGQQTNVGLFNTSVESLATFLQYCSWSKYDAILSRHVNNLLSP
LPPPPPPSTTTSAAAATLANKKNVVDPKISIKIISALLEKFSFLKPEHVSHIEKSLMSND
FERITLEYNHQNDYRRGKSFRKSLSTKKKMSNHNNNKKNDNKERIKLNSSKKCGNGKDQN
GDDDDDMKNESFDAIITTPNNVDHGDDKMMTGSENFSNDKCNNIVDDDNDDHDDHNDDKN
GDNIIANNKNDIDILYYKKIYDSLCRKLLPMLHRCLHQQSRMENVHDVNKFVDDDDDDDH
IQTIPLSLAIVKLLKHVQLDQRVFLANLNSIILRLCQFLQSKAHSIRELARKTLAQILDV
IGPKYFANIFNEMKILLSRGYQRHVFIYTVHVLLQRIITKLNGGDLDSCMVDLIHACHEE
LFGSLSEEKEISQIVTKTKEAKKIKAYDIYEIIARSTSESSLRSLIEPLKTLLFDTNDHR
KMQKIEKAFHRIGCGLVHNEHVSIEMLLKFLNEIFISSSFINFQSEMNDNNNDDDGMINS
SKKQRLMVDSCFIIPEKSLRRVNQLSKINSHSHWHVVLNFALECYLYILKHNKSIKSFGY
HDILNETLGHLEMFLRKSNDLKVISSTLNCLLLMLTKFTDIVSFDQHAESIISQLFLLLQ
KYSGLVNDDNQQMTTLCFKTITHFVNIRSDCKLSDQQLAILLAYADYDIENNGQNISIYI
LLKSIIVRKFISKEVHQLMERLMVMAIITDIDNVRDHAIELYVKYLTDYPIDRNRLKGKL
INLAKQLEVDHVSGRKAAIIMLKNVIQNLSCDILNMVRDQLFFILALRLINEDFIECLKL
VHETMGKLLMKIDEENVDKFFEQFVLSWLRSDSLAKQTLGSKMLTLYLEKEKCDFEKRLS
SCLYLIAEQLEPDHYESLKSGEKTTDNNDLAKDEDNLLFQHFNFIFKLLKIETAKNLIMK
NKFQNHMNKILTNIVSTYLLHPHVWIRGICVQIFGQIFAWFDPESFAPQSGVSMNILTFF
LFTNPEDKMINLARKFSLIFRDIYACQFLAEQLIKNLIYIARVFIIMDYSGHGHTLNNKQ
NGDDHYGDDIVVVVEQIENNDENRKKLEWLVKKLLFETKFEIKYRPNECRKRILFIKWLA
AVSLKLGHEHLKEYLPIFLPPLCRETISSSSTLVYNNNRSSIGNEYSSMTGAGDDGGGGG
IDELKNLTKQVLQMFRNMVGNELFIDQYNQCRNQISHRRLERRKQRAIQVIIFVEKAGIV
SIN
NT seq
7392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatgttatgtgaaaaattttacctgcaaaacaacacttgtttaccacttgatgat
ttgttgaattttacatcgaaaattatcagtagcccaatttatgatatcatcttgtttaaa
tatcttcatcaattattctataaagttctactatcaaatagtatcgacgataaaatttgt
gtaattgaattcatttcttttgtcatattgaagaaaaaaccaagaccaatattgggaaat
gaattggaaaagatccagaaatattctttggattttggtgaaaataatcaaatggtcatt
gaaaatttatgtcaaatgataaaatgcaacaaaagcgataatcttcaaatagtgtattct
tgtctaacaattttgtccagtatcgttaaattcaattccatctgtgatgatgattttatc
catgaaaatattgtcaatatcattgaatcaccattgtcacgatcgtttcaatttgaagat
tcgaatatttatgctgaattattgtatgaaacaataatttttgccattctaaattcacat
caaaattcaccaattacaagatttaatttaaaaatgttcactacgtttctaagtgcaaat
cccaattgtacacgagtcttacaagcattggatttattcgttagttacaataaatctacc
acatcaaaagatttccgccaagaattgaatgctgaattttcgaatctttatccattactt
gaacataatctttcgtcgccacgccgattgaatcgtctggtttgtctccatctgttgaca
ttgtttgattgtttatctgtgcccatcactgaagaaaatcctaaagctatttctgtgttt
caaatatgtttgaatgcagaatttgtaccagttgatctggaaaactatcgagaacgtttg
cgattaatttggaaattggattcaacttatatatcgctgtatctaccgcaaccattggac
gatattaaattcgatatggcacctgtttgttttctttttggaactttgtatgaaaattta
agtgtattatggaaaccaatcgtagaagttatcgaaacttatgccaaacaaaattcggat
aaaccgaatagatttctagaagttttgtttaatcattttcgacaaattttagtacttatc
aaagcatctcgattgaaatcggattgtttatggagttcaagaacgaaaattgcaattgaa
tttatcgaaaaatcaaacatttttgccctggatcatttgaatcatcgattgtggttgctg
aagtgttttgaacgattcccaaatcttatcgaacgaaagaatgccgaatttgttgatctt
tttttccgatttttatccgaagaatttgatgatcattatatttgtcgtactaatagccgt
gaaaatatttcttccaacacttcatctgacatgagtggcgaaaacaaatcgttgagaaaa
atggaaaattccaaaatgacttggaagacattttttgcttttctggatgtgtttgaaaaa
ttcaaaaatccaaaagccatacataaagaacctcaattgaatcaaatttatctagatctt
ttgtcatcaccaaattcacaatgtcaaaaacatgcattcaattgtctactaacatataac
caatcacatttgaccaaatatcgtgaaaattttttacaattaatcgatgataaatccttt
gtttcggagataaattcattcatgtttcgtgaaaatgttgatgataatgttattgttgtt
gaagatcggccaaaagttgtaccagtgtttctacgaatccttatcggtaaaatgattgct
tcggccggcactaaaacacatggtaaaagcaaagtcgattttgttcgttcattgatcatg
aagattttatcgaattttaacgctgaccaacagataatgtttatggattttgtttatgca
tcaataaatccattattgcaaactgattattgtgatttattggaaaaaatcaacaaagaa
tttgtcaacgttgaatcattcattccattcaaacattttcaatcatttataacgactttg
gaatttttgatgaaacattttggcaatcgatctaccatggtcatgcaatacatgtttaaa
attttattgatttgttcatcaatttgttcacaacttttatctattcaaaatcgttcaaaa
atcaaagaatatattgtcgatcaattgaaaatattccgtactaattgtttcaaagtggct
gaatattttttcaacaattttctaacttatccatttgaaccgattgaaattgatttacta
ttcgaatcattgattcgaccacttgttggaaatatttctaccgaaagtcaaaattatccc
tcaccattgttacgattgttcaatgtttggagtgaaaatccacgttattttattttatta
atcaaacattttgattcagaaaaagattcaacaccactcgtgtcaattatacaattattc
aagaatccaaaactatcacaaatgaccattggatttattgtgaaattgattgaaaatcta
ttgattgctgatgaaccaatcacacgattaaatattaacaattttgaccacctgattcca
agtggtgaacaatctatcaattttggttccttgatattgataccacacatcaaagatatt
atcgaacggataaaattaaattatcattcgaaaagtaatccaaaattttcattacaagaa
atcaatatattggcacgtcttagtcttcatgtgaccgatgctatggattcacatacaatc
atgatgttattgattcgatcaatatctcgtaaaaaacgacctgaagaagataaggagatt
ttcattcttaaaatattatctcatctatcacagaatttatctgacgaaagttttgaaatt
attctcaattcatcttatgatcttttcactttggtacagaaaccgatgccaagaaaagaa
ttgaccagcaactatctattgaatttgagcaaaaataatgaatccttcataccatttgct
caaatgattagtgatctgaattctttcaatccaaaatatcctgaagaaccagattatgat
tgtagaatttctgcattcaataaaattaacaattatatagatagtatatgcgaaaatcca
accagattatcatcaacacagcttaaatttattgatttattactactgaattgtgcattc
tttctcaatacattcgatgatctgagcatacgagaatcatcatctgcagtcataatgaaa
attacattattattcagaattcatcctttaaccgatttatacaataaatatgtcatcgat
atgatattattgaaaatcattccggatggaattcgaaatccaaaagaatcagcttcaatt
gaatttataggcatattggtggacattattcgtacaccttcttcatcatcatcatcatct
ttgttgaataacatttatattgatcaattactatcattatgtaataatgatgatgaagaa
ctagatttttggcaaaacattcgccacattcaattacatcgtcgtgcccgtgcattgaat
cgtttgttacagaataaatcattacttgaatcgctttctagctgtgtttattcgaatttt
ttaataccaattgttgagaatcaaatcatctattcatcatcttcttctggtggtggccaa
caaacaaatgttggattatttaacacttctgttgaatcattggcaacatttttacaatat
tgttcatggtccaaatatgatgccatattatctcgacatgtgaataatttattatcacca
ttaccaccaccaccaccaccgtcaacgacaacatcagcagcagcagcaacattggcaaac
aaaaagaatgtcgttgatccaaaaatttcaatcaaaattatatcagctttattggaaaaa
ttttcatttctaaaaccagaacatgtttcacatattgaaaaatcattaatgtcaaatgat
tttgaacgtattacattggaatataatcatcaaaatgattatcgtcgtggtaaatcattt
cgaaaatcattatctacgaagaaaaaaatgtcgaatcataataataataaaaaaaatgac
aataaagaacgaataaagttaaactcttcgaaaaaatgtggcaacggcaaagatcaaaac
ggcgacgacgacgacgacatgaaaaatgaatcatttgatgcaattattaccactcccaat
aatgttgatcatggtgatgataagatgatgacgggttcggaaaatttttcaaacgataaa
tgcaacaacattgtcgatgatgataatgatgatcatgatgatcataatgatgacaagaat
ggcgataacattattgctaacaacaaaaacgacatcgatattctttattacaagaaaatt
tatgattctctttgtagaaaattattaccaatgttgcacagatgtttacatcaacaatca
cgtatggaaaatgttcatgatgtgaacaaatttgttgatgatgatgatgatgatgatcat
atacaaactataccactatcattggcgattgttaaactattaaaacatgtacaactggat
caacgtgtttttctagccaatttgaatagtatcatattacgattatgtcaatttttgcaa
tcaaaagcacatagtatacgtgaattggcacgtaaaacattggcacagattcttgatgta
attggaccgaaatattttgccaatatttttaatgaaatgaaaattttactatccagaggt
tatcaacgacatgttttcatatatacagtgcatgtacttttacagcgaatcataacgaaa
ttgaatggtggtgatttagacagttgtatggtggatttaattcatgcatgtcatgaagaa
ttgtttggatcattatcagaagaaaaagaaatctcacaaattgtaacgaaaaccaaagag
gctaaaaaaattaaagcatatgatatatatgaaattatagcaagatctacatcagaatca
tcattacgatcattgattgaaccattgaaaacattgttgtttgatacaaatgatcataga
aagatgcaaaaaattgaaaaagcatttcatcgtattggatgtggattagttcataatgaa
catgtgtctattgaaatgttgttaaaatttttgaatgaaatttttatttcatcttcattt
atcaattttcaatcggaaatgaatgataacaacaatgatgatgatggcatgatcaatagt
agcaaaaaacaacgattaatggtcgatagttgctttataataccggaaaaatcattacgt
cgtgtaaatcaattatcgaaaataaattcccattctcattggcatgtggtattgaatttt
gctcttgaatgttatctatacatactcaaacataataaatcaatcaaatcatttggttat
catgacattttgaatgaaacattgggacatttagaaatgtttttacgaaaatcaaatgat
ttaaaagtcatatcatcaacattgaattgtttattgttaatgttgacaaaattcaccgac
attgtttcatttgatcaacatgctgaatcgataatatcacaattgtttttattattacaa
aaatattctggacttgttaacgatgataatcaacaaatgacaacattgtgtttcaaaaca
attacacattttgtcaatattcgttctgattgtaaactttctgatcaacagttggccatt
ttattagcatatgctgattatgatattgaaaacaatggtcaaaatatttccatttatatt
ctacttaaatcgattattgtaagaaaatttatttcaaaagaagtacatcaactaatggaa
cgattgatggtgatggcgatcatcaccgatattgataatgttcgtgatcatgccattgaa
ttgtatgtcaaatatttgactgattatcctatcgatcgtaatcgtttgaaaggaaaacta
atcaatttggccaaacaattggaagtggatcatgtttctggacgtaaagcggccattatt
atgttgaaaaatgtgatacaaaatttatcctgtgatattttaaacatggtacgtgatcaa
ttatttttcatactagcattacgattgatcaatgaagatttcattgaatgtttgaaactt
gttcatgaaacaatgggaaaattattaatgaaaattgatgaagaaaatgttgataaattt
tttgaacaatttgtcttatcttggctacgatctgattcattagcaaaacaaacacttggt
tcaaaaatgttaacattatatttggaaaaggaaaaatgtgattttgaaaaacgactgtcc
agttgtttgtatttgattgccgaacagcttgaaccggaccactatgaatcgttgaaatct
ggtgaaaaaactaccgacaataatgatttggcaaaagatgaagataatcttttatttcaa
cattttaatttcatctttaaattattgaaaatagagacggcaaaaaatttaatcatgaaa
aataaatttcaaaatcatatgaacaaaatattgacaaatattgtttccacatatcttctt
catccacatgtttggatacgtggtatttgtgtacaaatttttggccaaatatttgcctgg
tttgatccagaatcatttgcaccacaatcaggtgtcagtatgaatattttgacatttttt
ctattcacaaaccctgaggacaaaatgatcaatttagctagaaaattttcgcttatattt
cgtgatatttatgcctgtcaatttttggccgaacaattgattaaaaatctaatctacatt
gctcgtgtgttcatcataatggactatagtggtcatggtcatacactgaataataaacaa
aatggtgacgaccactatggcgacgatattgttgttgttgttgaacaaatagaaaataat
gatgaaaatagaaagaaacttgaatggctggtgaaaaaattacttttcgagaccaaattc
gaaatcaaatatagaccaaatgaatgtagaaaacgaattttattcatcaaatggttggca
gcggtttctttgaaacttggtcacgaacatttaaaagaatatttgccaatatttcttcca
ccattatgccgtgaaacaatttcatcgtcatcaacattggtttataacaataatcgatca
tccataggcaatgaatattcatcaatgactggtgctggtgatgatggtggtggtggtggt
attgatgaattaaagaatctaactaaacaagtattacaaatgtttcgtaacatggttggt
aatgaattatttattgatcaatataatcaatgtagaaatcaaatttctcatcgacgatta
gaacgacgaaaacagagagctatacaggtgattatttttgtcgaaaaagccggaattgtt
tccataaattga
DBGET
integrated database retrieval system