Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124497123
Help
Entry
124497123 CDS
T08043
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: trafficking protein particle complex subunit 11-like
KO
K20308
trafficking protein particle complex subunit 11
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dfr04131
]
124497123
Membrane trafficking [BR:
dfr04131
]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
124497123
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Foie-gras_1
Gryzun-like
tRNA_lig_kinase
TPR_1
TPR_2
PelD_GGDEF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124497123
NCBI-ProteinID:
XP_046916687
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1217 aa
AA seq
DB search
MMNNIPAEISVNPVPYISLLGLDAANNPIHSIIWNSFAINRSTDRPVLYYKLLPIDYRFP
SSKNRRSYDRYIPAGIIKTKWLNKHLFEIPSVVVVFVSLQNWQQLDRHRLIDEINSLKMA
LINRQIKIVVILLQSEPISSITYNHQDNHQDVNQINKDQATRLCEECDINPKSLFIIPVQ
DEQSIPGYVHRIESTLNELVKAHFSSKVKQIKSYRDQLNKITQNYLFVRHEFKLGFYHEI
RQIYNQALVHYKNAYASLMELRQSSINLIEIKNVATVLNYKIIRLSFYLNIPLDAISYFR
KHIDIFHNRFADDERIEFEHYAWLANQFYLFAELFDMSISMLHLSPSSSQNPGVYYFESA
MYTIKRRESSQRSSSSSLSSLNHEEIAHVERALQNGSEFIGQLSWYRPGELNDDSYVKIF
HHIERTTDLAPFLIKLLVNVLNQIKKFKKPRFMRFVMYLIGREYFLQGNYNDALNYFGNI
LGYYREERWKPIHRRLAQLALQSAYLCMDYISVIKCSFEYISNDTIDPQRKISLLKSLLQ
FLQLEFQSFITDDTDVEMKINSKTLSEAEMEWPRKLMEIEQNGLPSNIGGEILINADHEL
NFMKCKVTFDRRQYTIEDDIRIKVAIFNQLIEQLDPIDIQIRFEIPEFDKQCQLLSPQDE
QQQSILYSNSLNLFEFRLRLRPSNDRQYCRIKISEIAVILKSKISVRFQWLYTSTMLTMA
TTTTTTPTITLPISSISDDSIKFNKIDNRIDADLLDLESRLQLIGIEMKQRLFRNENASI
RIRLRSKERHVIGNLKLLPKIMIQQQQQQQQQQVAIAATEINIDNTATVMNIIQDTNCQW
SIRLVNQTDAFETIPSDSAGILITDQLEPSHDDDGDDDFIIDLILCSRDLGLKILSFEFS
YDLMMKTDDDDDVQSIPITKNFQTSINVVEPFQFLAKVANFANPDTSNIRLDEPFRLNCH
LRLPTNGDEEDDYSSSSNNNNQKDDDSSIIEIDSISSNFDENIKIISQKMTKLPALLSKD
STTPIDSYLMNCIKSEQNXQPLGSWSIRWHRKSETTTAIHAPILSETTFPLPAITMIPAI
IYVELFVPDKLYARNPFMAKYKITSRLDVDVSLEIQIGQAEYFMIAGNRQVKIILPSRSI
IEQVFIFFPLTCGQLVLPKLDIMVHPMATMNSLSLTSSSSQIGSKQTITHPIKIDYIGQM
ILPTVFVLPKLRTNINL
NT seq
3654 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaataatattccagcagaaatatctgtaaatccggtgccttatatatcattgctt
ggattagatgccgcaaataatccaatacattctataatatggaatagttttgcaataaat
cggtcaaccgatcgaccagttttatattataaattattacccattgattatcgatttcca
tcatctaaaaatcgacgatcatatgatcgttatataccggccggtataatcaaaactaaa
tggctaaataaacatctgtttgaaataccatcagtggtcgtggtgtttgtttcattgcaa
aattggcaacaattagatcgtcatcgattaattgatgaaattaattcattgaaaatggca
ctaataaatcgtcagataaaaatcgtcgtaattctattacaaagtgaaccaatatcatcc
attacatataatcatcaagataatcatcaagatgttaatcaaattaacaaagatcaagct
acacgtttatgtgaagaatgtgatattaatccaaaatcattattcatcataccagtacag
gatgaacaatccattccaggttatgtacatcgtattgaatcaacattgaatgaattggtt
aaagcacatttttcatcgaaagtaaaacaaattaaatcctatcgtgatcaactaaataaa
attacacaaaattatctattcgtacgtcatgaatttaaacttggtttctatcatgaaatt
cgtcaaatttataatcaagcattggttcattataaaaatgcttatgcatcattgatggaa
ctacgacaatcatcaattaatctgattgaaattaaaaatgttgctaccgttttaaattat
aaaatcatacgtttatcattctatttaaacattccgttggatgcaatttcatattttcgt
aaacatatcgatatatttcacaatcgttttgccgatgatgaacgtattgaatttgaacat
tatgcatggcttgccaatcaattttatttgtttgccgaattattcgatatgtcaatatcg
atgttacatctttcaccgtcgtcatcacagaatcctggtgtttattattttgaatccgct
atgtatacgataaaacgtcgtgaatcaagtcaacgatcatcatcatcatcattatcgtcg
ttgaatcatgaagaaattgcccatgttgaacgtgcactacagaatggatcagaattcatt
ggacagcttagttggtatcgacctggtgaattgaatgatgatagctatgtgaaaatattt
catcatattgaacgtacaaccgatctggcaccatttcttataaaacttttggttaatgta
ttgaatcagatcaaaaaattcaagaaaccacgttttatgcgttttgttatgtacctgatt
ggtcgtgaatatttcttgcaaggtaattacaatgatgccttaaattattttggcaatatc
ctcggttattatcgtgaagaacgatggaaaccaattcatcgacgtcttgctcaacttgcg
ttgcaatctgcatatctttgtatggattatattagtgttataaaatgttcattcgaatat
atatcaaatgatacgattgatccacagagaaaaatttcactactaaaatcattgctccaa
tttttacaattagaatttcaatcattcatcactgatgatacagatgtggaaatgaaaata
aattcgaaaactttatcagaagctgaaatggaatggccaagaaaattgatggaaatcgaa
caaaatggtctaccttcgaatattggtggtgaaatactaatcaatgctgatcatgaattg
aattttatgaaatgcaaagttacatttgatcgtcgacaatatacaattgaagatgatatt
cgtattaaggtggcaattttcaatcaactcatcgaacaacttgatccaatagacatacaa
attagatttgaaatacctgaatttgataaacaatgtcaattattatcaccgcaagatgaa
caacaacaatctatactttattcaaattcattaaatttatttgaatttcgtctacgatta
cgaccatccaatgatcgtcaatattgtcgaattaaaatcagtgaaatagcagtgatattg
aaatcgaaaatttccgttcgttttcaatggctttatacatccacaatgttgacgatggca
acaacaacaacaacaacaccaacaattactttaccaatttcatcgatatccgatgattca
atcaaatttaataaaattgataatagaatcgatgctgatttgttggacttggaatcacgg
ttacaattgattggcatcgaaatgaaacaacgtttatttcgtaatgaaaatgcatccata
cggattcgattacgatcaaaagaacgtcatgttattggtaatttaaaattattgccgaaa
attatgatccagcagcagcagcaacaacaacaacaacaagtggctatagctgcaaccgag
ataaacattgataatactgctaccgttatgaatattatccaggataccaattgtcaatgg
tcaattcgtcttgttaatcaaactgatgcttttgaaaccattccatccgattcagcgggc
attttaatcactgatcaacttgaacctagccacgatgatgatggtgatgatgatttcatc
attgatcttatactctgctcacgtgatcttggattgaaaatattatcattcgaatttagt
tatgatttaatgatgaaaacagatgatgatgatgatgttcaatcgattccgataacaaaa
aattttcaaacatcaatcaatgttgtcgaaccatttcaatttttagccaaagtggctaat
tttgctaatccagatacatcaaacatacgattagatgaaccatttagattgaattgtcat
ttacgattaccaacgaatggtgatgaagaagatgattacagcagcagcagcaacaacaat
aatcaaaaagatgatgattcatcaataattgaaattgattcgattagttcgaattttgat
gaaaatatcaaaattatttcacaaaaaatgaccaaattaccagcattgttatcgaaagat
tcaactacgcctattgattcatatctaatgaattgtattaaatctgaacaaaacncacaa
ccattaggatcatggtcaatacgatggcatcgaaaatcggaaaccaccaccgctattcat
gctccaatactatcggaaaccacgtttccattaccagcaattacaatgataccggcaatt
atttatgtggagctattcgttccggataaattatatgcacgtaatccatttatggctaaa
tataaaattaccagtcgtttagatgtggatgttagtcttgaaatacagattggacaagcc
gaatattttatgattgctggaaatcgacaagtaaaaattattcttccatcacgttcgatt
attgaacaagtgtttatattttttcctcttacctgtggtcaacttgttttgcctaaactt
gatataatggtacatccaatggctacaatgaattcattatcattaacatccagtagtagc
caaattggatcaaaacaaaccataacacatccaattaaaattgattatattggtcaaatg
attttaccgacagtatttgttctgccaaaacttcgtaccaatattaatttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system