Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124497637
Help
Entry
124497637 CDS
T08043
Name
(RefSeq) glutamate receptor ionotropic, kainate 2-like isoform X1
KO
K05313
glutamate receptor, ionotropic, invertebrate
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
dfr04040
]
124497637
Ion channels [BR:
dfr04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
124497637
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lig_chan
Lig_chan-Glu_bd
ANF_receptor
SBP_bac_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124497637
NCBI-ProteinID:
XP_046917262
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1064 aa
AA seq
DB search
MIKIGGIFSPDQFEQATVFRYAIDRLNNDNNMAIAIGSSGSNGNNNARILPKTKLHANIV
QINLDDSFHGHKQVCSLLENGSIALFGPLNGKLYRHVQSILDSLEIPHLECHWNTMKQSN
NQLSVNIYPKHDYLSMAFIDIVKSWKWKTFVIVYEANEGLMRIQEFLKEAEKNEWNIRLY
QIQDRMYRDIFWEIKQNNINNLLLDLDRDNIFLALKHVMSIHSFFFCLKNFHDDFSFILF
LHKTQAQQVGMMTENQNYLITSLDLHTINLENFQYAKTKITALSLIDFSSKELHDVINHL
RFSYRFRSLPQPSSSLSSILSKSTTTSTFPDPPIRLANTILTESALLYDSVRLFATALKD
LDQSQSISMPTTSCTNMNPWLYGTSLMNYMRPISFQGITGLVGFDQQGKRSHFRLHLMTI
TRQGLQTVGSWDRNELAYKRLKIKPEWQSTFQIGTLENKTLRVTTILNDPYCMYTESSET
KIGNERFEGYIIDLVEELSKLLGFKYIFKLVDDGVYGTNENGEWNGLIGEVIKKKADIAV
VDLTITSKRAEAVDFTLPFMNTGISILFKKPTTKVTTLFSFLSPLSSTVWCYVLAAYVGV
STVLFFVGRMSPYEWENPNPCRENDGVLENNFSQLNSFFFTIGSLMQQGSDLAPKAMSTR
TIAGLWYFFTLIMISSYTANLAAFLTVEKVIYPIKDAEDLSKQTTIEYGCLNSGSTKAFF
RESNLSTFKRMYEFMKSRPHVFMAKNEDGRKRVERGNYAYLMESASIEYIIERNCNLTQI
GGLLDTKGYGIATRKRSKYRNLLSEAILKLQESGRLLELKEKWWKQKKGGGQCIDDAKKS
SSSVTALKMDNVGGVFVVLIGGLALAFCLALCEFWFHAKTPHKACDVVCEELSKDLKFAM
MCQSKTKPNRDPSPRSRSLSSSTESYNTVLSPNNNGIIGATAIINNLHTKNQQISSLLLT
QTPTLGQMHHSISQYSNCQILTTGPSTNQPSQLLPLFQQQQQHQQQQQQQQSSSSTTELQ
SPTSITHLRTPSITNNNGTTLAEQIELEMEHQQQQQQRRGQLIL
NT seq
3195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaattggcggaatattctcaccggatcaatttgaacaggcgactgtatttcgt
tatgcaatcgataggctcaataatgataataatatggccattgccattgggagcagcggc
agcaatggaaacaacaatgcaagaatattgcccaaaacaaaactacatgcaaatattgta
caaatcaatttggatgatagttttcatggccataaacaagtatgttcattattggaaaat
ggttccattgcattatttgggccattaaatggtaaattatatcgtcatgtacaatcaata
ttggattcattagaaataccacatcttgaatgtcattggaatacaatgaaacaatcaaat
aatcaattatcggtgaatatttatccaaaacatgattatttaagtatggcattcatagat
attgttaaatcatggaaatggaaaacattcgttattgtttatgaagccaatgaaggttta
atgcgtatacaagaatttcttaaagaagcagaaaaaaatgaatggaatatacgtttatat
caaatacaggatcgtatgtatcgtgatatattctgggaaatcaaacagaataatattaat
aatctattgctcgatttggatcgtgataatatatttttggcgctcaaacatgtaatgtcc
attcattcattttttttttgtctaaaaaattttcatgatgatttttcattcattttattt
ttacacaaaacacaggcacaacaagttggaatgatgactgaaaatcaaaattatcttatt
acatcattggatcttcatacaataaatttggaaaattttcaatatgctaaaacaaaaatt
actgctctcagtttaatagatttttcatctaaagagcttcatgatgtgattaatcattta
cgttttagttatcgttttcgttcattaccacagccgtcatcatcattatcatcaatttta
tcaaaatctacaacaacatctacatttccagatccacccataagacttgccaatacaatt
ttgacagaatcagcattgttatatgattcagtacgtttatttgcaacagcattaaaagat
ttggatcaaagtcaatcaatatcgatgccaaccacatcatgtacaaatatgaatccatgg
ttatatggtacatcattaatgaattatatgagacctatttcatttcaaggaatcaccggt
ctagttggttttgatcaacaaggaaaacgtagccattttcgtttacatttaatgacaatc
acaagacaaggacttcaaactgttggttcctgggatcgtaatgaattggcatataaacga
ttgaaaattaaaccagaatggcaatcaacatttcagattggaacattggaaaataaaaca
ttacgtgtaacgaccatattgaatgatccatattgtatgtatacagaatcatcggaaaca
aaaatcggtaatgaacgttttgagggttatattattgatctggttgaagaattatcaaaa
ctacttggttttaaatatatatttaaactcgttgatgatggtgtttatggtacaaatgaa
aatggtgaatggaatggtcttattggtgaagtaatcaagaaaaaagctgatattgctgtc
gttgatctgacaattacatcgaaacgtgccgaagctgttgattttactttgccttttatg
aatacaggaatcagtattctgtttaaaaaaccaaccaccaaagtgaccacattattttca
tttttatcaccattatccagtactgtttggtgttatgtattggccgcttatgttggtgtg
tccactgtattgttttttgttggccgtatgtcaccatatgaatgggagaatccaaatcca
tgtagagagaatgatggtgtacttgaaaataatttttcacagctcaatagttttttcttt
acaattggttcattaatgcaacaaggatcagatttagcgcccaaagcaatgtccactcgt
acaattgctggtctttggtatttttttacattaatcatgatatcatcatatacagctaat
ttagctgcatttttgacagtggaaaaagttatctatccaataaaagatgctgaagattta
tccaaacaaacaacaattgaatatggctgtctgaatagtggttcaacaaaagcatttttt
cgtgaatcaaatctatcaacatttaaacggatgtatgaatttatgaaatcacgtccacat
gtatttatggctaaaaatgaagatggtcgtaaacgtgttgaaagaggcaattatgcttat
ctaatggaatcggctagtattgaatatattatcgaaagaaattgtaatctaacacagatt
ggtggcttattagatacaaaaggttatggtattgcaacaagaaaacgatcaaaatatcgt
aacctattatcggaagcgatactaaaattacaagaatctggtcgtttattagaattgaaa
gaaaaatggtggaaacagaaaaaaggcggtggacaatgtattgatgatgcaaaaaaatca
tcatcatctgtaacggcattaaaaatggacaatgtgggtggtgtattcgttgtattgatt
ggtggccttgcattagcattctgtttggctttatgtgaattttggtttcatgcaaaaact
ccacataaagcttgtgatgttgtttgtgaagaattgtcaaaagatttaaaatttgcaatg
atgtgtcaaagtaaaacgaaaccaaatcgtgatccatcaccaagatcaagatcattatca
tcatctactgaatcatataatacagtattgtcaccgaataataatggtattattggtgct
actgccattatcaataatttgcatacaaaaaatcaacaaatatcatcattattgttaact
caaacaccaacattaggccaaatgcatcattcaatttcacagtattctaattgtcagatt
cttacaacaggaccatcaacaaatcaaccatcacaattactgccattatttcaacaacaa
cagcaacatcaacaacaacaacaacaacaacaatcatcatcatcaacaacagaattacaa
tcaccaacatctataactcatttacgaacaccatccataacaaataacaatggaacaaca
ttagctgaacaaatcgagcttgaaatggaacatcagcagcaacaacaacaaagacgaggg
cagctaattctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
