Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124499574
Help
Entry
124499574 CDS
T08043
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: HEAT repeat-containing protein 5B-like
KO
K24814
HEAT repeat-containing protein 5
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
dfr04131
]
124499574
Membrane trafficking [BR:
dfr04131
]
Endosome - Golgi transport
Others
Aftiphilin/p200/gamma-synergin complex
124499574
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laa1_Sip1_HTR5
HEAT
Vac14_Fab1_bd
Cnd1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124499574
NCBI-ProteinID:
XP_046919457
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2085 aa
AA seq
DB search
MASQSDYLLNETEFHKLNGEKKIIYVYDWLRHLSKLLHKAEKDDIKDIQKTLVDQLIKQL
FSQNGNPSRRLIAKCLAMIFTVGDTFLLFDTVNKFIETLKNKDDSAVISNSKLSSIICIG
IMYENLGRLMGRTYEETVQSLLKLLKNVDSQTRFEIYSTLRMIISGLGSAGNSIHRDVYK
SLKHGMLDRSMSVRANAASCLQKLIEVASFLYTTEIENVFSLCFRALDGSNYEVRLAIAQ
TLGTVVAITQTPSIRQSLQSLQISANSTKVKIFTLEEVLNLLASGFLRGGIGFLKAGEMI
KGSSTANREIRIGVIHSYVDFGNRMGYEWIERNSPVLLNHFFEILSNSKAVSTHLDAIHS
RRCITFILKMIISTYITEKGQFMAIKELVKIMSQYSRVGHVMSTNPKSQDSANAEIEKNS
VIRNSIDLQTAQHILVVCLLEIGTLINQLGASCLAILNDTHLSLIDNVCFVINHPAHIVR
LSAAWCLRCICLAVNSQLTPLMERSLERLETLRTSPESINGHSYVLSALFGTVRYTPLGI
PQNKTKLVFNIAEDLLRTASQNSRLSMPRTQAGWQLMGAVLSLGPGQIKNLLPRLLLLWK
NSFPRNTKELDSEKARGDAFTWQITLENRAGALAAMSSFLTYCSKLVTDEIRRRLFTPVE
SAIAMLVSLNSHFKTLGPAIKGSYTMVRLRLYQVLLCLPPQLYENCFANLLRLLVSDLTL
TENVVNTSSSLIRHLIQTNADIILGSWIQDTEHSLVEDQMEPNRKLEKDSIQNHLSSGVG
SIEYDPTILYKSANDPLLVPASPPLAVAVINKSAQVFALVFPYVAQKHRVQMLNHFQECL
KHAKSSRQEAIQINILTAMLGALRTLVENKINLGIDEVRKLVVAQLFNVLDHQNILIRYA
AAESLGRCVQTINDAKFLSTITQQCFEKLRTARDALTRTGYSLAIGCIHHYVVGMGSVPQ
LKNNISLLLALAEDHSSPSVQLWALHALTLIVESGGPMFRPYVEPTLSQCLKILMALSPS
LIDIHQSIAKCLSAIITTIGPEFQTSSTHSINEIRLMIMIACSILQEHGDFLIKSETIAC
LQQLHMFDRNCYELNELIFILCDGFISSRYLLRKASICCFQQIAQKDSKALIEYGSEWVA
QNKSQQKIGIISNFNLRANHQFPGILVALLDYETNSSNMNNIKKILNCLVQHVDEKNLNL
WITLCKEVLSASDAGSSTIDSNENDHDADDGDFEESGFKSNHNDSLNVKLTYRWQTRVFI
MNILYKIISTCSQSLNDAAIHFDLNMAREKRLKHQDQDFLCLHLPDLVRMSFIGATSDCD
QLRMEGLKTLELVIDKFAHVPEPEFENHVILEQYQAQVGAALRPAFAVDTPSHVTAMACQ
VCSAWIGSGVARDLNDLRRVHQLLVSSLEKLHKHSNSKIYNESASTMEKLAILKAWAEVY
VVAMLRNKQQQQEEMKSPSVTINSESLLDLVQPQLLTLSKYWIFALKDHALLTLPDEYYS
QIPPDGSTFFNLETIDIVRPMYRASWPSILNAAALWLCCSDKGFEQLENDTSLNLTRFEQ
FYLLFGVCIESLSNPKSTEQVAYVSTYLDSLKELITHNEVTESILSKDTQLILELSQVLH
RLLLTHEVSGCQLVITEIIKSLIDIQIRMKRDGNESNKSLSSVTGIEAHKSIVYSILEIC
LAILVRQLPQLCPQLAKTPEFCFVRSQKSTNYFQLFNNDNARIIANVLQILSDLCNVCQP
VDTVAILPTILYLIIGVFCELSVVCQTVYDEKLYEKQPIITFLKCIKNLCTSPMLMAHND
NDEIRLKWIQLLQTAIARILDLSKTSGGNDDQKQDFISTLLAIGVFIIHSPEEVLSHPQI
QYPIINLMTRALKSENELVQLKCIETLKSVFTMQNNNQSNFYIHNLAAELIDVYYSLTAS
FRMNQSLSTNRITSMINILACLEILVSKANDEKRINMLYIYIPALISLLNVDPPSSSTEL
QTNPRLLSQSHAQKIMIHEHSLKXLTEIGPKYPHEFKQIMNSNTTYSDCLKKAIHHQGRK
TTTTTTNLHDTMDNDSKMNSSLSQQQRNSNENQTIKLKVDFSNYK
NT seq
6258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctctcaaagtgattatctgctcaacgaaaccgaattccataaattgaatggtgaa
aagaaaattatttatgtctatgattggttgcgacatttgtcgaaacttttacataaagcc
gaaaaggatgatattaaagatattcaaaagactttagtcgatcaactgataaaacaattg
tttagtcaaaatggcaatccatctcgacgattgattgcaaaatgtttggcaatgatattc
actgttggtgatacttttttactgtttgatacggtcaataaattcatcgagactctaaaa
aataaagatgattctgcagtaatttccaattcaaaattatcttcaataatttgcataggt
attatgtacgaaaatcttggacgattgatgggtcgaacatacgaagaaacagttcaatcg
cttttgaaactactgaaaaatgttgattctcaaacaagattcgaaatatattccacacta
cggatgatcatttctggattaggttcagctggaaattcgatacatcgtgatgtctataaa
agcctgaaacatggaatgttggatagatccatgtcagttcgagctaatgcagctagttgc
ctgcagaaactgatcgaagtagcatcatttttgtatacaaccgaaattgaaaatgttttc
tcgctttgttttcgtgcattggatggatccaattatgaggttcgtttggctatagctcaa
actcttggaacggttgtagcgatcacacaaacgccttcgattagacaaagtctacaatca
cttcaaatatcggctaattcgacaaaggtgaagatttttacccttgaagaagtactaaat
ctcctggcttcgggatttttacgaggtggaattggattcttaaaagctggcgaaatgatt
aaaggtagttcgacggccaatcgtgaaatcagaatcggtgtcattcattcctatgtagat
ttcggtaatcgtatgggctatgaatggatcgaacgaaatagtccggttttattgaatcat
ttcttcgaaatcctaagcaattcaaaagccgtctccacacatttagatgctatccacagt
cgcagatgtataacattcattttgaaaatgatcatcagtacatacattacggaaaagggg
caatttatggcaatcaaagaactggtgaaaataatgtcacaatattcacgtgttggacat
gtgatgagtacgaatccaaaatctcaagattcagcaaatgctgaaatagaaaaaaattct
gttatacgaaattcaattgatttacaaaccgctcaacatattctggtcgtttgtctgttg
gaaattggtacattaatcaatcaattaggtgcttcatgtttggcaatattgaatgataca
catttaagtttgatcgataatgtctgttttgtaatcaatcatccagcgcatattgtacga
ttatcagcagcatggtgtctacgatgtatatgtttagccgtaaatagtcaactgacacca
ttgatggaacgttctctagaaaggctagaaacattacgtacaagtcccgaatcaataaat
ggtcattcatatgttttatccgcattgtttggaacagttcgttatacgccgttaggcatt
ccacaaaacaaaacgaaattagtattcaacattgctgaagatttattgcgaacagcatca
caaaatagtcgtctttcaatgccaagaacacaagctggttggcaactaatgggcgctgta
ttatcattaggtccgggtcagattaaaaatcttcttccccgtttattattactgtggaag
aattcatttccacgtaatacaaaagaattggattcagaaaaagcacgtggtgatgctttc
acttggcagataacattggaaaatcgtgccggtgcattggctgcaatgtccagtttttta
acttattgttcaaaattagtaaccgatgaaatacgtcgacgattattcacaccagttgaa
tcagctattgcaatgcttgtatcattgaatagtcactttaaaacattaggaccggcaatc
aaaggcagctatacaatggttcgattgcggttatatcaagtcctgttgtgtttaccacca
caactttatgaaaattgttttgcaaatcttcttcgtttattggtttccgatttaacttta
acagagaatgttgtcaacacatcaagttcattgattcgtcatctaattcaaaccaatgct
gatattatacttggttcatggattcaagatactgaacatagtttggtagaagatcagatg
gaaccgaataggaaattggaaaaggattctattcaaaatcatttatcatcgggtgtcggt
tcaattgaatatgatccaaccatattgtataaatcggccaatgatccattattggtacca
gcatcaccaccattggccgttgctgttatcaataaatcggcacaagtctttgccttggtt
tttccttatgtggcacaaaaacatcgtgttcaaatgttgaatcattttcaagaatgtttg
aaacatgctaaatcctcacgacaagaagccattcaaatcaacatattaacggctatgctt
ggcgctttaagaacattggtggagaataaaatcaatctaggaatcgatgaagttcgtaaa
ctagtcgttgcacaactatttaatgtattggatcatcagaacatattgattcgttatgca
gcagccgaaagtcttggacgttgtgtacaaacgattaatgatgcaaaatttttatcaact
attactcaacaatgtttcgaaaaattacgtaccgcacgtgatgcattgactagaacgggt
tattcattagctattggttgtatacatcattatgtcgtaggaatgggttcggttccacaa
ctcaagaataacattagtcttttgttggcattggccgaagatcattcatcaccatcggtc
cagttatgggcattacatgcactgacattgattgttgaatctggtggaccaatgtttcga
ccatatgttgaaccaacgttatcgcaatgtttaaaaattttgatggcattatcgccatca
ttgattgatatacatcaaagtattgccaaatgtctttcagctattattacaacgattgga
ccggaatttcaaacatcatccacacattcaattaatgaaattcgattgatgataatgatt
gcatgttccatactacaagaacatggtgatttcctcatcaaaagtgaaactatcgcttgt
cttcaacagcttcatatgtttgatcgaaattgttatgaattgaatgaattgatattcatt
ctatgtgatggatttattagttcacggtatctacttcgtaaagcatctatttgttgtttt
caacagattgcacagaaagattccaaagcattgattgaatatggatcagaatgggtcgct
caaaataaatcccaacaaaagattggaatcatatcaaattttaatcttcgagctaatcat
caatttccaggcattctagtcgcattgcttgattatgaaacaaattcatcaaatatgaat
aacattaagaaaatattgaattgtcttgtacaacatgtggatgaaaaaaatctcaatcta
tggattacattgtgtaaagaagttttaagtgcatcagatgctggctcatccaccattgat
tcgaatgaaaatgaccatgatgctgatgatggtgattttgaagaaagtggttttaaatct
aaccataatgattcattgaatgttaaactaacatatcgttggcaaactcgagtttttatc
atgaatattttgtacaagattatttccacatgtagtcaatcgctgaatgatgctgcgatt
cattttgatttgaatatggcaagagaaaaacgtctcaaacatcaggatcaagattttctt
tgtttacatttaccggatttagttcgaatgtcattcattggtgctacatctgattgtgat
caattacgtatggaaggtttgaaaacacttgaattagttatcgataaattcgctcatgtt
ccagaaccggaatttgaaaatcatgtaattttggagcaatatcaagcacaggttggtgct
gcattacgtccagcattcgctgtggatacaccatcacatgtgacagctatggcatgtcaa
gtttgtagtgcttggatcggtagcggtgttgctcgtgatctgaatgatttacgtcgtgta
catcaacttctggtttcatcattggaaaaattgcataaacattccaattcaaaaatctac
aatgaaagtgcatcaacaatggaaaaattggccatattaaaagcatgggctgaagtttat
gttgtagccatgttacgaaacaaacaacaacaacaagaagaaatgaaatcaccatctgta
acgattaatagtgaaagtttattagatcttgtacagccacaattattaacattatcgaaa
tattggattttcgcgctgaaagatcacgcattgcttacattaccggatgaatattatagt
caaataccgccagatggaagtacatttttcaatcttgaaacaatcgatattgtacggcca
atgtatcgtgcatcatggccatcaattttaaatgctgctgcattatggctttgttgttcg
gataaaggctttgaacaacttgaaaatgacacttcattgaatttgactagattcgaacag
ttctatctattattcggtgtttgtattgaatcattaagtaatcctaaatccacggaacaa
gttgcttatgtttcaacatatcttgattcattgaaagaattgattacacataatgaagtc
acagaatcaatattatcgaaagatacgcaattaatattggaattatcgcaagtattacat
cgtcttttattgacgcacgaggtttctggttgtcaattggtaattacagaaattatcaaa
tcattgatcgatatacaaattcgaatgaaacgtgatggaaatgaatcgaataaatcctta
tcatccgtaaccggtattgaagcacataaatcaattgtttattcaatattggaaatatgt
ttagccattctagtacgacaattgccacaactttgtccccagttggctaaaacgccggaa
ttttgttttgttcgtagtcaaaaatcaacaaattattttcaattattcaacaatgacaat
gctagaattatagcgaatgtattgcaaattctaagcgatttatgtaatgtttgccaacca
gtcgatactgttgcaatattaccaacgattctttatctaatcattggtgtattctgtgaa
ttatcggtcgtatgtcaaactgtttatgatgaaaaattgtatgaaaaacaaccgataatt
acttttctcaaatgtattaagaatttatgcacatcaccaatgttgatggctcataatgat
aatgatgagattcgtttgaagtggattcaattattacaaactgctattgcacgtattttg
gatctttctaaaacaagtggtggtaatgatgatcagaaacaggatttcatatccacatta
ttagcaattggtgtattcattatacattcaccggaagaggtgctgtctcatccacagata
caatatccaattataaatttaatgacaagagcattgaaatcagaaaatgaattggtacaa
ttgaaatgtattgaaacattgaaatcagtgtttacaatgcaaaacaataatcaatccaat
ttctacattcataatttggccgccgaattaattgatgtttactattcattaacggcatca
tttcgaatgaatcaatcactttcaactaatcgtattacatcaatgattaatattctagcc
tgtttagaaattctcgtaagcaaagccaatgatgaaaaaagaatcaatatgctatacatt
tatattccagcattgatttcattattgaatgttgatccaccatcatcatcaacggaactt
caaacaaatccaagacttttaagtcaatcacacgcacagaagattatgatacatgaacat
tcattaaaanaattgacagaaattggaccgaaatatccacatgaatttaaacaaattatg
aacagtaatacaacatatagtgattgtctgaaaaaagctattcatcatcaaggaagaaag
actaccaccaccaccacgaatcttcatgatacaatggacaatgattcaaaaatgaattca
tctttatcacaacaacagagaaattccaatgaaaatcaaaccattaaacttaaagttgat
tttagtaattataaatga
DBGET
integrated database retrieval system
