Dolichospermum flos-aquae: HGD76_21795
Help
Entry
HGD76_21795 CDS
T06652
Name
(GenBank) AAA family ATPase
Organism
dfs
Dolichospermum flos-aquae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_30
AAA_19
Viral_helicase1
AAA_16
AAA_25
nSTAND3
nSTAND_NTPase5
DEAD
UvrD_C_2
AAA
PhoH
ResIII
AAA_5
NTPase_1
RuvB_N
Sigma54_activat
FTHFS
AAA_7
TsaE
cobW
NACHT
AAA_22
Pox_A_type_inc
AAA_33
ATPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJB46422
UniProt:
A0A6H2C3L2
LinkDB
All DBs
Position
complement(4556967..4561271)
Genome browser
AA seq
1434 aa
AA seq
DB search
MNNKTKIEDCGYTFIGSAVDNLVRHLEGQSSLQLYPEFRERRERANELLFDLVGKQPGLF
YIRRQGTAKEPGEEIWELTIATDQENFQLPKKLKKLGKTLAFKAAIRQDGHGGFKILSAY
LLHELRGNIDGYALPYWLRLSPNHQHPLDIPKPLLAKIKNMPICGNHVPTEDQLKAWKAF
LKVEERIAKSRQFCVSFRISHHGSNSRQIALEVKVNSATLNGSEENILGVENFWERVRKA
KNQEVNFLDSVPTDRNRRHSRQLGTIEKIDQKHNFIHVRLEREIIEYIAKGNYQLPKNGY
LFFDAAGDIKQIERKEKALEQLKQGRTQNPYLGNFLFDASQARPIIKRIKLNSKDLLLSS
ANAGQKAAVEKVLSAEDLVLIQGPPGTGKTTVIAEICYQVALRGGRTLITSQANLAVDNA
LSRLVHNPVIRAIRKGRAEKVGEEGQPFLEDQVIGTWLQNTATDCENNLSQRHENIRIIN
QLLPLLPRFTDYFLAEQEVNQQQNELKNEKDNLETSYQNQEIEYNQTLVTKKEIELLITG
LENILKNATNIDWESSEINSFLPQIKPYTENNQEVQNFRENVRQAIKCIEELGFTRPGFG
AFGLAVWLQKNITTHISAFKPGLKDANDVGLAISEVAKLVYIFQQHSVSLEKLETDHQNC
HNQNDLRTTIQIWENRKREIDYIIEAIVEWKSTAYNNLYQALKECQESDFELTESMVGLP
LGLLMFAKTLKLTIVPKNYQISLPDWGVLTKAISYEIAGNFTDKKGKKHDFSYFLQESFS
QIPIVLSKIDQIQWQTTYQKFQNYQLLNPKQRKLLVENTQVFLIRLEKTYGKSFEWNNIE
ATLTRITQELLDIILVHARQCVLRVKTEAEQQLEILQQQFQELPENEISSAQISEAKSQV
KKTKEAANLKLAEVINNLQALHKQQNIPLPLRILAEKYLTRQANIWEKSQEFSQQVKFWE
NRINEMETLILSLAPFTVLETIKDSLNQEFTNFQAEADIYQQELAELQIKISDLEQKLQL
QLSASLISERHWWQSIWQTIPDKLKPELSNNDLLDLGSLCNIQNKFKSWKRQLKSEENYL
HKYQNFVQDWVAKLRQPSEQDSKDLRGIYLDNANVVGITCVQAANYNFSEEFQSFDVVII
DEVSKCTPPELLIPALKGKKLVMVGDHRQLPPMLDTSTVEEVAKTMGNTREELQFLEESL
FKSQFETADKSIKKMLNTQYRMHPMIMGAINQFYHGKLECGILEPDTKRAHNLAGEIMES
YHHLCWVKMPKENEFQEERNGTSFLNIKEVDVIESICHQFEQVWVHKVANGEPKKEIAVI
TFYGAQLRKIDERLQSELFPSLQIRTGTVDRFQGMERPVVIVSMVRNNQQGDVGFANKPE
RVNVAFSRAQELLVIVGCHDLFTTKPGTVGNMYSEVAKTVNSHGGFIDVSCFCN
NT seq
4305 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataaaacaaagatagaagattgtggttatacgtttataggttcagccgttgat
aatttagttcgccatcttgaaggtcaatcatctctacaattatatcctgaatttagagaa
cgacgagagcgtgccaatgaattattatttgatttagttggtaaacaacctggcttgttt
tatattcgtcgtcaaggaactgcaaaagaaccaggagaagagatttgggaactaactata
gccacagatcaagaaaactttcaactaccaaaaaaactgaaaaagctaggaaaaacttta
gcatttaaagctgctattcgtcaagatggacatggcggatttaaaattttatcagcttat
ttattacatgaattgcggggaaatattgacggctatgctttaccctattggttgcgacta
agtcccaatcatcaacatcctttggatattcccaaaccattattggcaaaaattaaaaat
atgccaatttgcggaaatcatgtccccacagaagatcaacttaaagcctggaaagcattt
ttaaaagttgaagaacgcattgctaaatcccggcaattttgtgtatctttccgaatttct
catcatggctcaaattctcgacaaatcgctttagaagttaaagttaattcagctaccctt
aacggttctgaagagaatattttaggtgtagaaaacttttgggaacgggtaagaaaagcc
aaaaatcaagaagttaactttttagattccgtacccacagacagaaatcgtcgtcacagt
cgtcaattaggaactattgaaaaaattgatcaaaaacataattttattcatgttcgatta
gaacgagaaatcatcgaatatatagccaaaggtaattatcaacttcccaagaatggttac
ttattttttgatgctgctggagacatcaaacaaattgaacggaaagaaaaagccttagaa
caattaaaacaaggacgcactcaaaacccctatttaggtaactttctctttgacgcttcc
caagccagaccgattatcaaaaggattaaacttaactcaaaagacttattattatcttct
gcaaatgctggacaaaaagccgcagttgaaaaagtcctgtccgcagaagatttagtgctg
attcaaggaccaccaggtacaggaaaaactaccgtaattgcggaaatttgctatcaagta
gctttgcgcgggggacgcacattaattacctcacaagctaatttagccgttgataacgcc
ctcagtcgcttagttcacaatcccgttattcgtgctattagaaagggacgagccgaaaaa
gttggggaagaaggacagccatttttagaagatcaagtaattggtacatggctacaaaat
accgctactgactgtgaaaataatctcagtcaacgtcacgaaaatattagaattatcaat
caattattaccattattaccacgatttacagactattttctggcagaacaagaagtaaat
cagcaacagaatgaactcaaaaatgaaaaagataatttagaaacaagttatcaaaatcaa
gaaattgaatataatcaaactttggtaactaaaaaagaaattgaattattaattactggg
ttagaaaatattctcaaaaatgccacaaatatagattgggaatcttcagaaatcaacagt
tttttaccacaaattaaaccttatacagaaaataatcaagaagtacagaattttcgagaa
aatgtgcgtcaagctattaaatgtattgaagaacttggttttactcgtccgggatttggt
gcatttgggttagcagtttggttgcagaagaatatcacaactcatatttctgcatttaaa
ccgggattaaaagatgctaatgatgtcggtttagctatttcggaagtagcaaaattagtt
tatattttccagcagcattctgtatctttggagaaattagaaacagatcatcaaaattgt
cataaccaaaacgatttacggacaacaattcaaatttgggaaaatcgcaaacgggaaatt
gattatattattgaagccattgttgaatggaaatctacagcttacaataacttatatcaa
gcattgaaagaatgtcaagaatctgattttgaattaacagaaagtatggtaggtttacca
ttaggtttattgatgtttgccaaaacattaaaattaactattgttcctaaaaattatcaa
atcagtttaccagattggggagtattaacaaaagccatatcttatgaaatagcgggtaac
tttaccgataaaaaaggtaaaaaacatgattttagttattttttacaagaaagttttagt
caaattcctatagttttatcaaaaattgatcaaattcaatggcaaacaacctatcaaaaa
ttccaaaattatcaactcctcaatcctaaacagcgaaaattgctagttgaaaacactcaa
gtctttttaattagattggaaaaaacctatggtaagtcctttgaatggaataacattgaa
gctactcttacccgcattacccaagaattactagatattatcttagttcatgcgcgtcaa
tgtgttttaagagttaaaactgaagctgaacaacaattagaaattttacaacagcaattc
caggaacttccagaaaatgaaatttcatcagcacaaatatctgaagctaaatctcaggta
aagaaaactaaagaagctgctaatttaaaacttgcagaagttatcaataacttacaagca
cttcataaacagcaaaatatccccctaccactacggattttagcagaaaaatatctgact
agacaagcaaatatttgggaaaaatcccaggaattttcccaacaagtcaagttttgggaa
aatcgtattaatgaaatggaaactctgattttatcattagcaccttttactgttttagaa
acaattaaagactctttaaatcaagagttcacaaattttcaagcagaagctgatatttat
caacaagaacttgcagaattacaaataaaaatatctgacttagaacagaaattacaatta
cagttatcagctagtttaattagcgaacggcattggtggcagtcaatttggcaaacaatc
ccagataaattaaaaccagaattatctaataatgatttattagatttaggatctttatgc
aatattcaaaataaatttaagtcatggaaacgacagctaaaaagtgaagaaaattatttg
cacaaatatcaaaattttgtgcaagattgggttgcaaaacttcgtcaaccctcagaacaa
gatagtaaagacctcagagggatttatttagataatgctaacgttgttggtattacttgt
gttcaagctgcaaattataatttctcagaagaattccaatcttttgatgttgtgattatt
gatgaagttagtaaatgcactcctccagagttactaattccggctttaaaaggtaaaaaa
ttagtcatggtaggagatcatcgacaattaccacctatgcttgatactagcaccgtggaa
gaagttgcgaaaacaatggggaatacgagggaagaattacaatttttagaagaatcatta
tttaaaagtcagtttgaaaccgctgataaaagcattaaaaaaatgctaaatactcaatat
cgaatgcacccgatgattatgggcgcaattaatcaattttatcatggtaaattggaatgt
gggattttagaacctgacacaaaacgcgctcataatttagcaggagaaatcatggaatct
taccatcatctctgctgggtaaaaatgcccaaagaaaatgaatttcaagaagaacgcaat
ggaacttcatttttgaatattaaagaagttgatgtgattgaaagtatctgtcaccaattt
gagcaggtttgggtgcataaagtagcaaatggagaaccaaaaaaagaaatagctgtaatt
acattttatggcgctcaattaagaaaaattgatgaacgcttacaatctgaacttttccct
tctttgcaaattagaacaggtacagtggatagatttcaaggtatggaaagaccagtggta
attgtgagtatggtaaggaacaatcagcaaggagatgtgggatttgccaataaaccagaa
cgggtgaatgtggctttttcccgcgcacaagaattattagtaattgttggttgtcatgat
ttatttacaactaaacccggtacagtaggtaatatgtattctgaagttgccaaaactgtt
aattctcatggaggttttattgatgtttcctgtttctgtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system