Dolichospermum flos-aquae: HGD76_22555
Help
Entry
HGD76_22555 CDS
T06652
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
dfs
Dolichospermum flos-aquae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dfs02000
]
HGD76_22555
Transporters [BR:
dfs02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HGD76_22555
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJB46549
UniProt:
A0A6H2C6I0
LinkDB
All DBs
Position
4712527..4714617
Genome browser
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MSTNLVAKLGIQIVASSVTMTLGILCENYKVIAAEIPQHEEPVTEKITQNTPADTEEKEA
DIEINVIEKLLNEPVFSPFRQEGTVKDSTRPIYVITGEEMAAQGARTIREALKFLPGILG
DGTVGTEVNALSGQLIRGSNTSQVLILLDGRPINNAGSGGFDLSEFTTNNIQRIEVLPGG
GSTLYGSDAIGGVINIITRRPTEKITTEAKVNIGAYGLNQQSIQNSGKKGDISWVVGYNR
TQAENNYPFSIPEANFSGTRRNNDALYNNFNVKLEADLGKRNTLSFSTLYLNKEQGTPGG
VPIPFPVNGQGFFNSLTDRNRKYTDQVLTDLTWNSKLGGGNNSLLTARVYGDFLNTRFDP
SGSSRFETNQTSYGIQTTHSWNFAKNQSLVYGFDYRTVNVRNTSFSYSTNRETLNYDNDI
NQGALFAKYEVALIPSLTVNLGLRQDFSTLVNGSVTSPSVGTKFAVSDSTTLRANYIKNF
RVPTIANLFNVNPSNIGNPELKPERGDSFDIGIDQKLGDIGLLRLTFFKNSVSDTIAFKR
LTPPVNGNTGTWENIGLVETTGIEATLNLQLAKNIYTFVNYTANDPRILKSSNAAEIDKE
LRFAGADKLNLGVSYENPQGLYLGLLMNSLNGYPTNNTNTEFLSGYTTFDFKLRVPLSDK
LVVTGSLENLFNQRYQLFPGFPDGGRGFQIGLSATF
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctactaatttagttgcgaaactgggaattcaaattgttgcatctagtgtaactatg
accttgggcatattgtgtgagaattacaaagttatagcagcagaaattccccaacacgaa
gaaccagtcacagagaaaattactcaaaatacaccagcagatactgaagaaaaagaagct
gatattgaaataaatgtcattgaaaaattattaaatgaacctgttttttcaccctttcgt
caggaaggaacagtcaaagattctactcggccaatttatgtaattacgggtgaagaaatg
gcagcgcaaggtgcgagaaccatcagagaagcacttaaatttctgcctggtatattaggt
gatggtacagtaggaacagaagttaatgctttaagtggtcaattaattcgtggttctaat
actagtcaagtattaatattacttgatggtagaccaattaataatgccggaagtggtggt
ttcgatctttcggaatttacaactaacaatattcaaagaattgaagtattaccaggagga
ggttcaactctttacggttctgatgcaattgggggagtaattaatattatcacccgtcgt
cctacagagaaaattaccacagaggcaaaagtcaatattggtgcttatggactcaatcaa
cagagtattcaaaatagcggtaaaaaaggtgatatttcttgggttgtaggttataaccgt
acccaagcagaaaataattatcctttttctattcctgaagctaatttttcaggaacaagg
aggaataatgatgcactttataacaatttcaatgtcaaattagaagcagatttaggaaaa
cgaaatactctcagtttctcgactttatacttaaataaagaacaaggaacaccgggagga
gtgccaattccttttcctgtcaatggacaagggttttttaattcgcttacagatagaaat
cgcaaatatacagatcaagttttgactgatttaacctggaattcaaaattaggaggtggg
aataattctttattaacagctagagtttatggtgattttttgaatactcgttttgatcct
agtggttcaagtcgctttgaaaccaaccaaacttcctacggaattcaaaccacacacagt
tggaattttgctaaaaatcaaagtttagtttatggctttgattatcgcactgtcaatgtt
cggaatacttcttttagctattctactaatagagaaacattgaactatgataatgatatt
aatcaaggagcattatttgccaaatatgaagtagcattaatccctagtttgaccgttaat
ttaggtttgcgtcaagactttagcaccttggtaaatggttcagtcacatctccttctgtg
gggacaaaatttgctgtttctgactcaacaactttaagagcaaattacatcaaaaatttc
cgagttcctactattgctaatttatttaatgtcaatcctagcaatattggcaacccagaa
cttaaaccagaaagaggtgatagttttgatattggcattgaccaaaaacttggtgatatt
ggtttactaagattaacctttttcaaaaatagcgtatctgatacaattgcctttaagaga
ctgacaccaccagtaaatggtaatacaggaacttgggaaaatatcggactggtggaaact
acgggaattgaggcgactttgaatttgcaacttgccaaaaatatttatacttttgttaat
tacacggcaaatgatccgcgtattttgaaaagttctaatgcggcggaaattgacaaagaa
ctgcgctttgctggtgcagataaattaaatttgggagtttcttatgaaaatcctcaaggt
ttgtatttgggtttattaatgaattccttaaatggatatcctactaataatacaaataca
gaatttttatctggttatacgacttttgattttaaactgcgtgtacctttaagtgataaa
ctggtagttacaggtagtttggaaaatctctttaatcagcgttatcagttgtttcctggt
tttcctgacggaggtagaggttttcaaattggtttgagtgctacgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system