Desulfoscipio gibsoniae: Desgi_2085
Help
Entry
Desgi_2085 CDS
T02657
Name
(GenBank) ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
dgi
Desulfoscipio gibsoniae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dgi02000
]
Desgi_2085
Transporters [BR:
dgi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
Desgi_2085
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGL01519
UniProt:
R4KG16
LinkDB
All DBs
Position
complement(2129981..2132395)
Genome browser
AA seq
804 aa
AA seq
DB search
MKNYLALAPQYLSAHKKKTRLAMISVALSVALITGIFSMLDVFLQFEKLQVIHDYGNYHL
AIIDASEEEMSVIRNRIDVRNSGRWKDLGDGNINEIPCKLGALDEAFAENMNVKVIQGKY
PIANNEIMLEQWATEKLYLNVNIGDRVKISFADNNQGEFIVSGIYNDLGNMKAAGVPGVF
LSMSGASEITSGKMNLYLVEFKEKVNINQVVSDIKRVLNIADDRVELNNHLLAVIGQSTH
KAAVGLYTIGAILFCIVLVAGVVMIYNTFNISVMDRVRQFGLLRCVGASQSQIKKLVKRE
GLIITLRAIPLGILAGMLMTFICSAILKYYNNTLFGEIPLFSISITGISSGIVIAFLTVF
MASLLPAQKAARVSPVNAVMGSNHIKISKRKKKGFLTKILHAEIAMGINNAIMKKKTLFL
MSSSIALSIIMFLGFNVLIDFMYASLKTTKPYTPDISMTSEQGLNDELYQKLSEIDGVEI
IYGRMLGYVDATFNASRLTDTYKDIVKGITLKDNGLFMPPEKSWLISYDKNQLNWAKEDL
MAGELSEDKMNEQNGVIAVARNLRGSVSTETANLQLGDKVYVKTPGGTKELTVMGILRSL
PFSSAEPTLTAFITTEALFTDIAGESKYKAIDIQLKNKKDERAVEAIKSSVDDTVTFLDQ
RQKNAEMNQIFLTMAVFVYGFVAVITLISFLNIINTMNTSIASKTRYLGVMRAVGMSGAQ
LNKMVLVEAATYSLTGCLVGCTLGVILQGVLIANYLSNFHVPWEFPLVQIILILILTVLV
IMFSVISPLKRIKSKGISEVVNSL
NT seq
2415 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaattacctggcacttgctccccaatacctgtcggcacataaaaagaagacaaga
ttggctatgattagtgtggcgctatcggttgctcttatcaccggaatattctccatgctg
gatgtttttctgcagtttgaaaagctgcaggtgattcatgattatggaaattatcatctt
gccattatagatgcttccgaagaagaaatgtctgtcattagaaaccgcattgatgttcgg
aattcgggaagatggaaggaccttggagatggaaacataaacgaaatcccttgcaaactt
ggggcgctggatgaagcttttgctgaaaatatgaatgttaaagtaatacaaggaaaatat
ccaatcgccaacaatgaaataatgctcgaacaatgggcaactgaaaaactatatttaaat
gtgaatattggtgatagagttaagatttcttttgctgacaataatcaaggagaattcata
gtaagcggaatttataatgatttgggtaacatgaaggcggcgggtgtgccgggggtattc
ttatctatgtccggtgccagtgagataacgtctgggaaaatgaatttgtatcttgttgaa
tttaaggaaaaagtgaatattaaccaggtagtaagtgacattaaaagggtgctgaacatt
gctgatgatagggtggaactaaataatcatttgcttgcggtaataggacaaagtacacac
aaggctgcagttgggctgtataccataggcgctattttgttttgtatagtcctcgtggca
ggcgtagtgatgatatacaataccttcaatatttcggtaatggatagggtgcggcagttc
gggctcttaaggtgcgtcggcgcgtcacagtcacagataaaaaagctggttaaaagagaa
gggcttataataacccttcgggcaatccctttggggatccttgcaggcatgctgatgact
tttatttgttccgctatactaaagtattataataatactcttttcggagaaattcccttg
ttcagcataagtataacaggtataagttccgggatagtcatcgcttttctgaccgtattt
atggcttctttattaccagctcaaaaagccgcacgggtttcgccagtaaatgctgtaatg
ggtagtaatcatataaaaatttcaaaaagaaagaaaaagggttttttaacgaaaattctc
catgctgaaattgctatgggcataaacaatgccattatgaaaaagaaaacactcttttta
atgtccagctccattgcgctcagtatcatcatgttcttgggctttaacgtgttgatcgat
tttatgtatgcttctcttaaaactaccaaaccctacacgcctgatatttctatgacatct
gaacaaggcctgaatgacgaactataccaaaaattatcggaaattgatggtgttgaaata
atttatggaagaatgctcggctatgttgacgctacctttaatgcatcgaggctgaccgat
acatataaggatattgtgaaagggattacattaaaggacaatggtttatttatgcctcct
gaaaagtcctggcttatttcctatgataaaaaccaattaaactgggcaaaagaagatttg
atggccggagagctttcagaggataaaatgaatgagcagaacggggttatagcggttgcc
cggaatttaagaggcagcgtttcgacagaaactgctaatttgcaattaggcgataaggtt
tacgttaaaacccctggtggaacgaaagagttaacagttatgggaattttgcgttccctg
ccctttagcagtgcggaaccgacattaactgcatttattacaacagaggcattattcacc
gatatagctggtgaatctaaatataaagcaatagatatccaacttaaaaataaaaaagat
gagcgggctgttgaggcaataaagagcagtgtggatgataccgtaactttccttgatcag
cgccaaaaaaacgccgagatgaaccagatttttttaacaatggctgtgtttgtttatggc
tttgttgcggtaataactttgataagctttttgaacatcatcaacaccatgaacacaagc
attgcgtctaaaaccaggtatttaggggttatgcgggctgttggtatgtcgggcgcgcaa
ttaaataaaatggttctggttgaagctgcgacatacagcctgaccggctgccttgtcgga
tgtaccctgggagttatactgcaaggagtattgattgcaaattatctttccaactttcat
gtaccctgggaatttcctctggtgcaaattattttgatattaattcttaccgtattagtg
ataatgttttctgttattagtcctttaaagcgaataaaatcaaagggtatttcagaggtt
gtcaattcactttaa
DBGET
integrated database retrieval system