Desulfoscipio gibsoniae: Desgi_2859
Help
Entry
Desgi_2859 CDS
T02657
Name
(GenBank) putative ATPase
Organism
dgi
Desulfoscipio gibsoniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Pkinase
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PK_Tyr_Ser-Thr
GAF
Hpt
GAF_2
GAF_3
KAP_NTPase
ATPase_2
APH
Kinase-like
ABC1
BrxC_BrxD
AAA_22
nSTAND1
Kdo
NPHP3_N
NTPase_1
Zeta_toxin
NACHT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGL02260
UniProt:
R4KNX1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2910287..2916448)
Genome browser
AA seq
2053 aa
AA seq
DB search
MINIPNFRIVEQLYNKRSIVCRAVSDIDNQPVILKVLNTKHSVPDEIMRFKREYEIICHL
RSKGVVTAYGLEEYQNYLFMVLEDTGGTSLDKILPFETIDWPTFINLAVKTTSLLGDIHR
CGIVHKDINPSNITWNRENGRVQIIDFGLSSVLTLENSATGNPQNPEGTLAYIAPEQTGR
MNRPVDFRADLYSLGVTFYEMLTGGLPFVAGDVLELVHSHIAKTPLSPHMVSSNIPEAIS
NIIMKLLAKNVEERYQSAVGVEEDLQMCLDQLQTYGKIKVFELGSQDISGRFQISPKIYG
RDKEINTLLDGFERVSRGAVELILVAGYTGIGKTSLINEIVEPVQKRGYFVAGKFDQFQR
NIPYASLIQAIRKLVRQILGENEEQIALWKDKILKAFGPNGQIIIDLIPEIELITGPQPF
VHKLPPLESQNRFQLVLIKFLQVFAAQAHPLVIFIDDLQWSDTASMQQINYIINNNEIKY
LLLIAAYRDNELTDTHPLLALVREMKKSRVPVHEIKLEPLNQSCIEQLLVETLNCTEQAA
YPLAEALFQKSAGNPFYTKQLLHDIFENGSLYFNWRERSWKWDISGLQQLKARDNVIELV
INRVQKLPARTREVLKFAACVGRVFELKMLSLIMRQSIEQITGDILPAVHMGVIQPVAAS
PKHSNTGGKEMKSLVYTPESCEFLHDRVYQAVSSLWPGEEKNRIQHRIGRIMLQQTEQVF
PEKNIFKIVDYLNVGPELITEQRERVKLAEYNLMAARKAKISTAFEAALHYLEAGEKFLP
SDAWNGQYRLTFELHLELCQCLYQCGKAAEGDCLFEKLLARAKSKPDRSDVLAMKALIAA
NALKYADIFKFGLMGLKELGFKLPQHPDKFSVLKEVLWLKGRLPAQKIKNLLALPVMNDL
RVIKIMDQLNNLVPAASLSNPQLFILMLLKMSGLSLKYGNTDHSALAYAGYGIIAGGILQ
DFKAVRELQSVSMKLADRDNNYPVKCRVYYTVAVYLNHWGEHLHKSIDYLTRAKQYALDA
GEFYMVAGITGRMVQNKIVLGEHLEGIYEESISYLEFTDRFKLENTSRFFLLAQRFVKYL
RGESPQPFLSGEKDTLTREIIEQRNGMAVMAYYLFKMQSFYFEGEYIKALEVLREIDLDI
TNSVRGMPLATEYVLWQSLIITASYGQLNKKQKKNYLKIIKKNQRQLKKWAASCPQNYLH
KYYLVAAETVRITGKETAAAIELYDQAIASAGENEYIQNAALGNELAARFWLAAGKANIA
GPYMQKACVEYRTWGAERIADNLEQMLPQLFSATAGLTGTGASQLDLASIVKVSQVLSGE
IVLDRLLQKMMKIILENVGAQKGYFIMESEGGLSIEASVSTNGEDMPLNSSSGDGGTGEG
PPVIRVSVPLRQCGYLSEAIVYYVFRTGEFVVLHDAAREGIFTQDEYISKYRPKSVICLP
VIGKGKTTGILYLENNLFTGAFTPGRVEMLRLLSSQIAISIENARLYANLEKSRDQISRW
SQTLEQTVTERTSQLQQANQQLKQAKDEADAANRAKSDFLAVMSHEIRTPLHGIIGMTEL
MLQTSLNKEQREYISIVKESSDLLMTVIDDILDFRKIEEGKLKLEVTDFDLPSLEKTVIT
SLIPKANSKGIALKSHLAPEIPAWLRGDPVRLSQVLLNLVGNAVKFTDQGEVSLHVLLEK
EEPEHVILRYEVRDTGIGIPPQAKKDLFQPFYQVGHTSTRRHGGSGLGLAICKRLVELMN
GQIGFESLEGRGTTFWFTVPLQLGHAAVKPAENNDPAGLTVELMKGKNKSGTILVVEDNA
INQKLIVSQLKQLGLCAEIVNNGKEAVEAVSSAKYTLVLLDCQMPVMDGYETAGAIRRLE
ATGGGRRTPIIATTAGVMTGEREKCLSAGMDDYLSKPVRLADLQKILARWLPDYDITLAQ
DEPVPDRTVSRVVDSYLAAFVDPGRRREFLDIIGGDEDFLVELVETFLQDMPDKLTALRN
AFQRWDAAALRLQAHGMKSSGYLLGAAGFAELCKKLEILAAAGELEAATELIETVEEEYQ
RLEKRLKAFLANN
NT seq
6162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaatattcccaactttcgcatagtggaacaactttataataaaaggtcgattgtt
tgccgcgcggtttccgatattgataaccaaccggttatccttaaggttttaaacaccaaa
cattccgtacctgatgaaataatgcgtttcaaacgggagtatgaaattatttgtcacctg
cggtcgaaaggcgttgtaacagcgtatgggttggaagaataccaaaattacctgtttatg
gtcctggaagataccggcggtacatcgttggataaaatactgcctttcgagacaattgat
tggcctacttttatcaacctcgccgttaaaactaccagtttacttggcgatattcaccgg
tgcggtatcgtgcacaaggatatcaacccgtccaatatcacctggaaccgggaaaacggc
cgggtgcaaattattgatttcggcctttcttcagtattaaccctggaaaactctgcaaca
ggcaacccccaaaaccccgagggaacgcttgcctatatagccccggaacagacaggcaga
atgaaccggcctgtggatttcagggccgatctgtactcgctgggcgtaactttttatgaa
atgttaacgggcgggctgccttttgttgccggtgatgtgctggaactggtgcattcccat
atagccaaaacgcccctgtcaccacatatggttagttccaacatacctgaagcaatctca
aatataataatgaaactactggccaagaatgtggaagagcgataccaaagtgccgtcggt
gtagaagaagatttgcaaatgtgtctcgaccagcttcaaacatacggcaaaataaaggtt
tttgaacttggcagccaggatatttccggcagatttcaaatatcacccaaaatttatggt
cgggacaaagaaataaacactctcctggatggctttgagcgagtgagccggggtgccgtg
gaattgatattggttgccgggtatacggggataggcaaaacttcattaataaatgaaata
gttgaacctgtacaaaagcgtggttattttgttgcagggaagtttgatcaatttcaacgc
aacattccttacgcttcattgattcaagccatacgaaaacttgttcggcaaatcctggga
gaaaacgaagaacaaattgccttgtggaaagataaaattttaaaagctttcggacccaac
gggcaaattattattgatttaattccggaaatagaattgattacaggcccgcaacctttc
gtccacaaattacccccccttgaatcgcaaaaccgtttccagcttgtgttaatcaagttt
ttacaagtgtttgccgcgcaagctcaccccctggtcatctttatagacgatttgcaatgg
tccgataccgcctctatgcagcaaataaattacataattaataataatgaaataaagtac
cttctgttgattgccgcttaccgggataacgagttgacagatactcacccgttgctggca
ttagtcagagaaatgaaaaaatccagggtgcctgttcatgaaatcaagctggagccgtta
aatcaaagttgcatcgagcagttgctggtagaaacccttaattgtacggagcaagctgct
tatcccctggcagaggcattgtttcaaaaatcagccggtaaccccttttacaccaagcaa
ttgttgcatgatatctttgaaaatggctctctgtattttaactggcgggaacgtagctgg
aaatgggatatcagcggtctgcaacagctcaaggcccgggataacgtaatcgaactggta
ataaacagagtacaaaaactccctgcaagaactagggaagtattaaagtttgccgcctgt
gtcggtagagtttttgaattaaagatgttatctctgatcatgaggcaatcaattgagcaa
ataaccggcgatattttgccggccgtacacatgggagttatacaacccgttgccgcttcc
ccgaaacacagtaataccggtggtaaggaaatgaagtctttggtctatactccggaatcc
tgtgaatttttgcatgaccgtgtgtaccaggcggtgagttctctttggcccggcgaagag
aaaaaccggatccagcataggataggaagaataatgctgcagcaaacggaacaggttttc
ccggaaaagaacattttcaaaatagttgattaccttaatgtcgggccggaattgattact
gaacagagagagagggttaaactggccgaatacaatttaatggcggccagaaaagctaaa
atctcaaccgcatttgaagcggctctgcactatttggaggcgggtgaaaaatttttaccg
tcagacgcctggaacgggcagtaccgcctgacctttgagctgcatctggaactctgccag
tgtctttaccagtgcggaaaagcggctgagggggactgtttgtttgaaaagttactggcc
agggccaaatccaagccggacagatccgatgtgttggccatgaaagcccttattgccgcc
aatgctttaaaatacgcggatatatttaaattcggtctcatgggtcttaaggaactggga
tttaaattaccccaacaccccgataaatttagtgttttaaaagaagttctatggctcaag
gggcgtctgcctgctcaaaagattaaaaacttgcttgcattaccggtaatgaatgatctg
cgtgttatcaaaataatggaccagcttaacaacctggttccggccgccagtttaagcaac
ccccaattgtttatactcatgctgttgaaaatgtccggcctttctcttaaatatggtaat
acggatcattccgccctggcttacgccgggtacggtatcattgccggcgggatattgcag
gactttaaggctgtacgggaactgcaatcagtatcaatgaaactggccgacagggataac
aattacccggttaagtgcagggtttattatacggtggccgtatacctcaaccattgggga
gaacatttgcataaaagcattgattacttaacccgggcaaagcaatatgctctggatgcc
ggtgaattttacatggtcgcgggtataacgggacgcatggtgcaaaataaaattgtatta
ggggagcatctggaagggatttatgaggaaagcatttcatatctggaatttaccgacagg
ttcaagcttgaaaatacgtcaaggttttttctcttggcccagaggtttgtaaagtatctc
aggggtgaatctccccaaccttttctttccggtgaaaaagatactttgacccgggaaata
atcgaacaacgaaacggtatggctgttatggcttattatttgtttaaaatgcaatccttc
tattttgaaggtgagtatataaaagctttagaggtgctgcgggagattgatttagacatt
accaattcagttcggggtatgcctctggccacagagtatgtattatggcaatcattgatt
ataactgcctcttacgggcaattaaataagaagcaaaaaaagaattacttgaaaataatc
aaaaaaaaccagcggcagttgaaaaaatgggccgcttcctgcccgcagaattatttgcac
aagtattacctggtggcggctgaaacggtacggataaccggtaaagaaactgctgccgca
atagaactctacgaccaagccattgcgtccgcgggagaaaacgaatatatacaaaacgca
gccctgggcaatgaactggcggccaggttctggctggcggcgggcaaagcgaacattgcc
gggccttatatgcaaaaggcatgtgtggaataccgtacctggggtgctgaacggatagcg
gacaacctggagcaaatgttgcctcaattgttctcggcaaccgccggacttaccggaaca
ggagcaagtcaactggacctggcttcaatagtaaaggtctcacaggtgctttccggagaa
attgttctggaccggctgctgcaaaaaatgatgaaaataatcttggagaacgtcggagcg
caaaaaggctattttatcatggagagtgaaggtgggctcagcatagaagcatcggtctcc
acaaacggggaagacatgcccctgaactcgtcttcaggagacggaggtacgggcgaaggg
ccgccggttatccgggtatccgttcctctcagacaatgcgggtatctttccgaggctatc
gtatattacgtgttccggaccggggaatttgtagtgctccatgatgctgcgcgggaagga
atattcacccaggatgaatatatctccaaataccgtcccaagtcggtaatttgcctgccc
gttatcggcaagggaaagacaaccggcatactttacctggaaaacaacctgttcacgggc
gcatttacccctggccgggtggaaatgttgaggttattgtcttcccaaatagccatttcc
attgaaaacgcccggttgtacgccaacctggaaaaatccagggatcagatatccaggtgg
agccagaccctggaacaaacggttacagaaagaacaagccagttgcagcaggccaatcaa
caactaaaacaggccaaagacgaggctgatgcggcgaaccgcgctaaaagcgatttcctg
gcggtgatgagccatgaaatacggacacccctgcacggcattatcggtatgaccgaactg
atgctgcaaacgtcgctcaataaagaacagcgggaatacatatctattgttaaagaatca
tccgatttgctcatgacggtaattgatgacatcctggactttagaaagatcgaagagggc
aaattaaaactggaagtgacggattttgatcttccatccctggaaaaaaccgtgattact
tctttaattcctaaagccaacagcaagggcattgccctcaaatcccatctcgccccggag
atccccgcctggttgcggggcgacccggtgcgcctgagccaggtgctgttaaatttagtg
ggcaatgccgttaaatttaccgatcaaggcgaagtgtcgctgcatgtcttgctggaaaaa
gaggagccggaacacgtaatccttcgttatgaagttagggataccggtatcgggataccg
ccacaggctaaaaaagatttatttcagcctttttaccaggttggtcatacgagtaccagg
agacacgggggctcgggcttgggcttggctatttgtaagcgactggtggaactgatgaac
ggtcaaattggttttgaaagcctggaaggccggggtacaactttctggtttacagttccc
ttgcaactaggccatgccgctgttaaaccggctgaaaacaatgacccggccggattgact
gtggagctgatgaaagggaaaaataaatcgggcactattctggtggtggaggacaatgcc
attaaccagaagttaattgtttcccagttaaaacagctcggcctgtgtgctgaaattgtt
aataacggcaaggaggcggtggaagccgtttcctctgctaaatataccctggtattgctg
gattgccagatgcccgttatggacggctacgagacggcgggcgctatccgccggcttgag
gctaccggaggaggacggcgaacccccattattgcaacgacagcgggcgtcatgacggga
gagagggaaaaatgtttgagcgccgggatggatgattatttaagcaaaccggtccggctg
gcggatttacaaaaaattctggcccgctggctgcctgattatgatatcaccctggcgcaa
gatgagccggttccggataggacggtaagcagggttgtggattcctacctggcagcgttt
gttgaccctggcaggcgccgggagtttctggatattatcggcggggatgaggattttctc
gtggaattagttgaaacattcttacaagatatgcctgacaaattaaccgcgctccggaat
gccttccaacgctgggatgcggcagctttgcgcctgcaggcccacggtatgaaatccagc
ggttacttgctgggcgccgccggatttgcggaactgtgcaaaaagctggaaattttggct
gcagccggtgaattagaggcagcaaccgagctgatagaaacagttgaagaggaatatcaa
cggctggagaaaaggttaaaggcttttctggcaaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
